Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XE53

Protein Details
Accession R4XE53    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
161-183ASASTEKKKRTRKPKSSAPSSDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
167-175KKKRTRKPK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 10.499, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSVSIDTNSLAQQIKDVTLSAVSTVKDAVVGESASEPATTDDKHRVFIGNLNSETTEDQLKSLFSQAGEVLNVTLSSKRKNRSNGAQASGIAFIEYSTDGEAQKAIETLNGKSLNERELNVAIARPQSQKPPRRQTAAKSGSAQETSQNSIAVPGDIDGTASASTEKKKRTRKPKSSAPSSDDKPTESSTETNGAQPSKTRSPRASREKGPPADGVPSTTTLFVAGLKNKTTDAELKELFSKYNPTSAHVALRPIPRFMIKKLAEKGEQRLSRGFGFVTFADQEAQTAALNAMDGYKAGERELAVKVAVDSPEKNDSTPAAVEAAT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.16
4 0.14
5 0.13
6 0.13
7 0.13
8 0.14
9 0.13
10 0.13
11 0.13
12 0.11
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.09
17 0.09
18 0.09
19 0.1
20 0.1
21 0.1
22 0.09
23 0.09
24 0.1
25 0.12
26 0.12
27 0.15
28 0.24
29 0.25
30 0.27
31 0.27
32 0.28
33 0.26
34 0.31
35 0.35
36 0.33
37 0.33
38 0.33
39 0.32
40 0.31
41 0.3
42 0.25
43 0.21
44 0.14
45 0.14
46 0.13
47 0.13
48 0.13
49 0.15
50 0.15
51 0.11
52 0.13
53 0.13
54 0.14
55 0.13
56 0.12
57 0.1
58 0.09
59 0.09
60 0.08
61 0.11
62 0.12
63 0.19
64 0.25
65 0.31
66 0.38
67 0.46
68 0.53
69 0.59
70 0.67
71 0.67
72 0.64
73 0.6
74 0.53
75 0.47
76 0.4
77 0.29
78 0.19
79 0.12
80 0.08
81 0.07
82 0.07
83 0.06
84 0.06
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.06
93 0.08
94 0.09
95 0.1
96 0.16
97 0.17
98 0.17
99 0.18
100 0.2
101 0.21
102 0.21
103 0.21
104 0.17
105 0.16
106 0.17
107 0.16
108 0.15
109 0.12
110 0.12
111 0.14
112 0.15
113 0.16
114 0.24
115 0.33
116 0.41
117 0.5
118 0.59
119 0.61
120 0.65
121 0.67
122 0.63
123 0.65
124 0.63
125 0.56
126 0.48
127 0.45
128 0.4
129 0.38
130 0.32
131 0.24
132 0.2
133 0.19
134 0.18
135 0.16
136 0.13
137 0.13
138 0.13
139 0.09
140 0.07
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.06
151 0.09
152 0.13
153 0.19
154 0.27
155 0.37
156 0.45
157 0.56
158 0.67
159 0.74
160 0.79
161 0.83
162 0.85
163 0.85
164 0.82
165 0.75
166 0.7
167 0.62
168 0.59
169 0.49
170 0.41
171 0.33
172 0.29
173 0.26
174 0.21
175 0.19
176 0.15
177 0.18
178 0.17
179 0.17
180 0.18
181 0.17
182 0.15
183 0.17
184 0.21
185 0.27
186 0.31
187 0.33
188 0.37
189 0.45
190 0.55
191 0.63
192 0.64
193 0.61
194 0.66
195 0.71
196 0.68
197 0.62
198 0.54
199 0.45
200 0.41
201 0.35
202 0.28
203 0.2
204 0.19
205 0.17
206 0.16
207 0.14
208 0.11
209 0.11
210 0.1
211 0.12
212 0.14
213 0.16
214 0.17
215 0.17
216 0.17
217 0.18
218 0.19
219 0.21
220 0.2
221 0.24
222 0.23
223 0.24
224 0.27
225 0.27
226 0.25
227 0.21
228 0.24
229 0.19
230 0.24
231 0.23
232 0.23
233 0.27
234 0.28
235 0.32
236 0.28
237 0.3
238 0.29
239 0.36
240 0.35
241 0.32
242 0.32
243 0.32
244 0.34
245 0.33
246 0.38
247 0.34
248 0.41
249 0.45
250 0.49
251 0.5
252 0.51
253 0.55
254 0.55
255 0.54
256 0.48
257 0.46
258 0.44
259 0.39
260 0.36
261 0.29
262 0.2
263 0.2
264 0.17
265 0.18
266 0.15
267 0.15
268 0.15
269 0.14
270 0.14
271 0.12
272 0.12
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.06
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.12
287 0.12
288 0.15
289 0.18
290 0.17
291 0.14
292 0.14
293 0.15
294 0.17
295 0.19
296 0.19
297 0.18
298 0.21
299 0.28
300 0.29
301 0.28
302 0.26
303 0.26
304 0.26
305 0.26
306 0.22