Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XCK0

Protein Details
Accession R4XCK0    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-58TDESPQQAKKKQRKAAKTTATVTHydrophilic
75-99EEIKPVSPTKEKKKKEKSASDLAAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-53KKKQRKAAKT
61-66SPRSRV
82-91PTKEKKKKEK
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 10, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
Gene Ontology GO:0000702  F:oxidized base lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MPKRAASSVDGPLRRSTRRSAVLYKDESSSTEAEVTDESPQQAKKKQRKAAKTTATVTARSPRSRVKKEEDSEDEEIKPVSPTKEKKKKEKSASDLAAQKLRKLTSFVASPYPNFAHPTPGECERVVELLSRLHGPAVRPEGRPIDDTSAGAACGQVPSVLDALVRTILSQNTTSKNSTAAKRRLDETFGKGNWRAMHEAPAGDVEDAIRVGGLAPSKTATIKNVLKTAMETYGTFSLDHLHAVPNDEAMRELVSFKGVGPKTASCVLLFCMARDSFAVDTHVFRLSKALGWVPRTAGREETYGHLDLKIPAEFKYPLHTLLITHGKRCGRCSAHRKSGLLDPADCPLIGLSKTVKEEGGPIKKEEEEEEEEEEDDDDGQEVVVGGQVEVPEELRATMTKIEDGARQEARDKDGMAIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.5
3 0.49
4 0.49
5 0.55
6 0.59
7 0.6
8 0.64
9 0.68
10 0.68
11 0.63
12 0.57
13 0.49
14 0.44
15 0.39
16 0.31
17 0.24
18 0.21
19 0.18
20 0.17
21 0.17
22 0.16
23 0.16
24 0.17
25 0.17
26 0.19
27 0.23
28 0.28
29 0.35
30 0.44
31 0.51
32 0.6
33 0.67
34 0.73
35 0.8
36 0.83
37 0.86
38 0.86
39 0.83
40 0.76
41 0.76
42 0.7
43 0.61
44 0.54
45 0.52
46 0.5
47 0.45
48 0.45
49 0.46
50 0.53
51 0.6
52 0.65
53 0.65
54 0.68
55 0.7
56 0.75
57 0.72
58 0.69
59 0.65
60 0.6
61 0.52
62 0.42
63 0.38
64 0.29
65 0.24
66 0.2
67 0.19
68 0.25
69 0.33
70 0.43
71 0.53
72 0.61
73 0.71
74 0.79
75 0.85
76 0.87
77 0.89
78 0.86
79 0.86
80 0.81
81 0.77
82 0.72
83 0.64
84 0.6
85 0.5
86 0.45
87 0.39
88 0.36
89 0.3
90 0.28
91 0.27
92 0.25
93 0.27
94 0.26
95 0.28
96 0.29
97 0.28
98 0.29
99 0.28
100 0.25
101 0.25
102 0.24
103 0.24
104 0.23
105 0.26
106 0.25
107 0.27
108 0.29
109 0.26
110 0.27
111 0.21
112 0.21
113 0.18
114 0.16
115 0.13
116 0.11
117 0.13
118 0.12
119 0.11
120 0.11
121 0.13
122 0.12
123 0.16
124 0.23
125 0.26
126 0.25
127 0.29
128 0.32
129 0.32
130 0.33
131 0.29
132 0.26
133 0.23
134 0.22
135 0.21
136 0.17
137 0.15
138 0.13
139 0.11
140 0.06
141 0.05
142 0.05
143 0.04
144 0.04
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.06
155 0.07
156 0.08
157 0.1
158 0.13
159 0.16
160 0.19
161 0.19
162 0.18
163 0.22
164 0.25
165 0.29
166 0.36
167 0.39
168 0.41
169 0.42
170 0.44
171 0.41
172 0.41
173 0.39
174 0.35
175 0.34
176 0.3
177 0.31
178 0.3
179 0.31
180 0.28
181 0.27
182 0.25
183 0.19
184 0.23
185 0.2
186 0.19
187 0.17
188 0.16
189 0.14
190 0.11
191 0.1
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.04
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.14
209 0.18
210 0.2
211 0.22
212 0.22
213 0.21
214 0.21
215 0.21
216 0.16
217 0.13
218 0.12
219 0.11
220 0.13
221 0.13
222 0.12
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.12
231 0.12
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.09
237 0.09
238 0.07
239 0.08
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.15
245 0.14
246 0.15
247 0.17
248 0.17
249 0.2
250 0.22
251 0.23
252 0.15
253 0.15
254 0.15
255 0.18
256 0.18
257 0.15
258 0.16
259 0.16
260 0.16
261 0.16
262 0.16
263 0.11
264 0.12
265 0.15
266 0.11
267 0.12
268 0.13
269 0.18
270 0.16
271 0.15
272 0.17
273 0.15
274 0.16
275 0.16
276 0.19
277 0.18
278 0.21
279 0.22
280 0.22
281 0.27
282 0.27
283 0.27
284 0.26
285 0.24
286 0.23
287 0.23
288 0.24
289 0.23
290 0.22
291 0.21
292 0.19
293 0.18
294 0.18
295 0.19
296 0.18
297 0.15
298 0.14
299 0.17
300 0.18
301 0.17
302 0.21
303 0.2
304 0.2
305 0.2
306 0.2
307 0.17
308 0.22
309 0.32
310 0.27
311 0.27
312 0.32
313 0.35
314 0.37
315 0.4
316 0.42
317 0.39
318 0.48
319 0.56
320 0.61
321 0.66
322 0.7
323 0.68
324 0.63
325 0.63
326 0.6
327 0.53
328 0.44
329 0.35
330 0.32
331 0.31
332 0.28
333 0.21
334 0.14
335 0.14
336 0.12
337 0.13
338 0.12
339 0.16
340 0.18
341 0.19
342 0.19
343 0.16
344 0.23
345 0.3
346 0.37
347 0.36
348 0.36
349 0.38
350 0.39
351 0.4
352 0.36
353 0.33
354 0.3
355 0.3
356 0.32
357 0.29
358 0.28
359 0.27
360 0.25
361 0.19
362 0.13
363 0.11
364 0.08
365 0.07
366 0.06
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.07
371 0.07
372 0.06
373 0.07
374 0.08
375 0.08
376 0.09
377 0.09
378 0.08
379 0.08
380 0.09
381 0.09
382 0.1
383 0.11
384 0.15
385 0.15
386 0.16
387 0.17
388 0.19
389 0.23
390 0.26
391 0.31
392 0.31
393 0.31
394 0.36
395 0.38
396 0.4
397 0.39
398 0.36