Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4X820

Protein Details
Accession R4X820    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-56DGDPWMPSPKKRKDLARILSSEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027267  AH/BAR_dom_sf  
IPR001683  PX_dom  
IPR036871  PX_dom_sf  
IPR028662  SNX8/Mvp1  
IPR035704  SNX8/Mvp1_PX  
IPR045734  Snx8_BAR_dom  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0035091  F:phosphatidylinositol binding  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
Pfam View protein in Pfam  
PF00787  PX  
PF19566  Snx8_BAR_dom  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50195  PX  
CDD cd06866  PX_SNX8_Mvp1p_like  
Amino Acid Sequences MSLFGDEEVPSQKASALFGDASPERSQERGLFGDDGDPWMPSPKKRKDLARILSSEDAPEIYVDIFEDYAISSVLPLTGLRRLMEDAALKKHDKELIVSILVPTDSTQAGLNRGEGNLAIFLIALAQQGEEISLDAVDDRKSRAYPIPNIERLPSLSGDSNGERPLPEPTPREEREEQQSTLDNFVIRPTSQKSASRSENGPTAKVRIDKQKADLGDPWSPQESTTHTPQYAHSEHIESGPTTYDQSLLSNNTLHIDAVTVRALDGKEGLPLWKHINYELTSAKRKSSVVRRYSDFAWLLECLLKQYPFRQIPLLPPKRLAVNGIHIHLGKQADVAFLEKRRRGLSRFVNALERHPVLRADQLVTTFLTVPTELAVWRKQASVTIKEEFEDRYLSPDLEGSLPQGIDEWMSRTISSLKGAIDTFNSLTSLQERLIRRQEATSTDLLRFSLSINTLCEQEQEDYVIFSKENGPGIVHGLKAVSKHHSKSHQLIENECRKAEDTLLEDLKRHRDTLIALSELFVRHSKYSGDNIPAIEKRISATQNKLISLNAKLDAKEADKNKLTSNIENDKVSIQKLENRKIFIRECVWHELQYFAAQQVHMSRLVNDMAAARYQFAKKHADIAAAFVGDVEGMP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.16
4 0.16
5 0.15
6 0.21
7 0.2
8 0.23
9 0.22
10 0.23
11 0.22
12 0.22
13 0.25
14 0.22
15 0.26
16 0.24
17 0.26
18 0.25
19 0.24
20 0.26
21 0.23
22 0.24
23 0.19
24 0.17
25 0.15
26 0.22
27 0.25
28 0.29
29 0.39
30 0.45
31 0.54
32 0.61
33 0.7
34 0.73
35 0.8
36 0.83
37 0.81
38 0.74
39 0.71
40 0.68
41 0.59
42 0.49
43 0.39
44 0.29
45 0.2
46 0.17
47 0.12
48 0.08
49 0.08
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.06
54 0.07
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.11
66 0.13
67 0.14
68 0.15
69 0.17
70 0.17
71 0.2
72 0.24
73 0.24
74 0.28
75 0.32
76 0.32
77 0.32
78 0.35
79 0.36
80 0.31
81 0.3
82 0.29
83 0.28
84 0.28
85 0.27
86 0.23
87 0.2
88 0.19
89 0.16
90 0.12
91 0.1
92 0.09
93 0.09
94 0.11
95 0.11
96 0.14
97 0.15
98 0.16
99 0.15
100 0.15
101 0.15
102 0.13
103 0.13
104 0.1
105 0.09
106 0.07
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.05
117 0.05
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.05
123 0.06
124 0.08
125 0.09
126 0.11
127 0.13
128 0.14
129 0.17
130 0.23
131 0.29
132 0.34
133 0.42
134 0.49
135 0.51
136 0.52
137 0.5
138 0.45
139 0.4
140 0.35
141 0.27
142 0.21
143 0.18
144 0.17
145 0.19
146 0.19
147 0.2
148 0.18
149 0.18
150 0.16
151 0.15
152 0.19
153 0.19
154 0.23
155 0.23
156 0.27
157 0.36
158 0.37
159 0.44
160 0.42
161 0.44
162 0.47
163 0.5
164 0.45
165 0.39
166 0.42
167 0.35
168 0.34
169 0.31
170 0.22
171 0.17
172 0.18
173 0.17
174 0.12
175 0.15
176 0.16
177 0.2
178 0.23
179 0.28
180 0.31
181 0.37
182 0.41
183 0.42
184 0.41
185 0.39
186 0.41
187 0.38
188 0.36
189 0.3
190 0.28
191 0.27
192 0.29
193 0.3
194 0.34
195 0.39
196 0.39
197 0.42
198 0.44
199 0.41
200 0.4
201 0.4
202 0.35
203 0.33
204 0.3
205 0.29
206 0.25
207 0.24
208 0.22
209 0.19
210 0.19
211 0.19
212 0.23
213 0.25
214 0.24
215 0.24
216 0.26
217 0.31
218 0.28
219 0.26
220 0.22
221 0.21
222 0.21
223 0.21
224 0.21
225 0.14
226 0.13
227 0.12
228 0.11
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.09
234 0.1
235 0.11
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.08
250 0.08
251 0.07
252 0.08
253 0.07
254 0.08
255 0.08
256 0.09
257 0.07
258 0.09
259 0.12
260 0.14
261 0.14
262 0.14
263 0.18
264 0.18
265 0.21
266 0.23
267 0.24
268 0.28
269 0.28
270 0.28
271 0.26
272 0.26
273 0.29
274 0.35
275 0.41
276 0.42
277 0.45
278 0.47
279 0.48
280 0.48
281 0.46
282 0.36
283 0.27
284 0.21
285 0.17
286 0.15
287 0.13
288 0.12
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.12
294 0.2
295 0.2
296 0.21
297 0.22
298 0.22
299 0.29
300 0.4
301 0.44
302 0.36
303 0.36
304 0.36
305 0.35
306 0.34
307 0.28
308 0.18
309 0.19
310 0.2
311 0.2
312 0.21
313 0.19
314 0.19
315 0.19
316 0.18
317 0.1
318 0.1
319 0.09
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.09
324 0.13
325 0.18
326 0.19
327 0.2
328 0.23
329 0.25
330 0.26
331 0.33
332 0.37
333 0.38
334 0.4
335 0.4
336 0.43
337 0.41
338 0.4
339 0.36
340 0.29
341 0.23
342 0.2
343 0.2
344 0.14
345 0.16
346 0.15
347 0.12
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.12
352 0.12
353 0.1
354 0.08
355 0.08
356 0.07
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.08
362 0.09
363 0.1
364 0.11
365 0.12
366 0.11
367 0.16
368 0.2
369 0.23
370 0.26
371 0.26
372 0.26
373 0.26
374 0.27
375 0.23
376 0.2
377 0.16
378 0.12
379 0.14
380 0.15
381 0.14
382 0.13
383 0.13
384 0.13
385 0.11
386 0.11
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.08
396 0.08
397 0.09
398 0.09
399 0.1
400 0.12
401 0.12
402 0.13
403 0.12
404 0.11
405 0.13
406 0.13
407 0.13
408 0.12
409 0.13
410 0.12
411 0.11
412 0.11
413 0.09
414 0.1
415 0.11
416 0.11
417 0.1
418 0.16
419 0.17
420 0.23
421 0.29
422 0.31
423 0.31
424 0.31
425 0.33
426 0.3
427 0.32
428 0.3
429 0.25
430 0.24
431 0.24
432 0.22
433 0.19
434 0.16
435 0.13
436 0.12
437 0.12
438 0.12
439 0.13
440 0.14
441 0.15
442 0.15
443 0.15
444 0.14
445 0.14
446 0.13
447 0.13
448 0.12
449 0.11
450 0.12
451 0.12
452 0.1
453 0.1
454 0.12
455 0.13
456 0.14
457 0.14
458 0.13
459 0.13
460 0.18
461 0.18
462 0.15
463 0.13
464 0.12
465 0.13
466 0.13
467 0.16
468 0.18
469 0.22
470 0.26
471 0.32
472 0.39
473 0.44
474 0.5
475 0.56
476 0.57
477 0.53
478 0.56
479 0.59
480 0.6
481 0.57
482 0.5
483 0.42
484 0.36
485 0.35
486 0.31
487 0.25
488 0.2
489 0.24
490 0.28
491 0.27
492 0.28
493 0.3
494 0.36
495 0.34
496 0.32
497 0.26
498 0.23
499 0.26
500 0.3
501 0.31
502 0.25
503 0.23
504 0.23
505 0.25
506 0.23
507 0.22
508 0.17
509 0.15
510 0.14
511 0.16
512 0.18
513 0.19
514 0.25
515 0.28
516 0.31
517 0.3
518 0.3
519 0.35
520 0.34
521 0.34
522 0.29
523 0.24
524 0.22
525 0.26
526 0.29
527 0.28
528 0.33
529 0.37
530 0.4
531 0.41
532 0.41
533 0.36
534 0.35
535 0.32
536 0.3
537 0.26
538 0.24
539 0.23
540 0.24
541 0.26
542 0.26
543 0.3
544 0.3
545 0.34
546 0.37
547 0.39
548 0.4
549 0.45
550 0.46
551 0.44
552 0.5
553 0.5
554 0.48
555 0.47
556 0.45
557 0.4
558 0.39
559 0.34
560 0.3
561 0.24
562 0.28
563 0.37
564 0.45
565 0.47
566 0.5
567 0.52
568 0.56
569 0.56
570 0.55
571 0.52
572 0.48
573 0.49
574 0.52
575 0.5
576 0.46
577 0.44
578 0.38
579 0.33
580 0.31
581 0.27
582 0.21
583 0.21
584 0.18
585 0.19
586 0.21
587 0.22
588 0.21
589 0.21
590 0.19
591 0.2
592 0.21
593 0.19
594 0.16
595 0.16
596 0.15
597 0.17
598 0.17
599 0.15
600 0.19
601 0.22
602 0.24
603 0.27
604 0.33
605 0.31
606 0.38
607 0.38
608 0.39
609 0.36
610 0.38
611 0.36
612 0.28
613 0.27
614 0.2
615 0.18