Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

R4XD58

Protein Details
Accession R4XD58    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
134-159ALAENKSMAQRRKRRRSSSLSRSSDSHydrophilic
180-204SDCEDNRRARRTKRLSPHARTFKSEHydrophilic
971-1000GSVFYRPKDKQKAADEKKKKFNQPEGDHLTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
144-149RRKRRR
189-192RRTK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011709  DEAD-box_helicase_OB_fold  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR002464  DNA/RNA_helicase_DEAH_CS  
IPR007502  Helicase-assoc_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR022967  S1_dom  
IPR003029  S1_domain  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF04408  HA2  
PF00271  Helicase_C  
PF07717  OB_NTP_bind  
PF00575  S1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00690  DEAH_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS50126  S1  
CDD cd05684  S1_DHX8_helicase  
cd18791  SF2_C_RHA  
Amino Acid Sequences MEDLEQLEKLNLVSKVTQELANHVGIHEKILAEYIINQHEESADFKDFKSRIGGDFPDAFVETIDRFILTMHPKHLRKLPSSTKASDGAVHNEPDTKARIFKGLCLPDQVIKYEDEPHTEDSRDIGDALNQLEALAENKSMAQRRKRRRSSSLSRSSDSCTQFSNGLNKRPSSLSPTRSSDCEDNRRARRTKRLSPHARTFKSEHSARLRAPVDTSPVLFHIYTGRISNLKDFGAFVSLDNMNRDGLVHVSNIQSEGRVNHPADLLGRGQVVWVKVIRLDGSRISLSMKDVDQASGRDLNPNQQLTAELAVDRLNNSRKPVPVVEDDENSNGKYRMSSRKRLTSPERWEIKQLIASGVVPASQYPDIDDEYNMHINGEVESDADEEFDVEIREEEPPFLQGQTRQSLELSPIRVIKAPDGSMNRAAMSGGQFAKDRREAKEQAMKEQALAESRAASNGQSTGAVPASDVNHIPAHLRIVKTETQFSAPRNALEWREATNPKNAPVGRNTSMSIQQQRESLPVYALRAPFIRAITENQLLIVVGETGSGKTTQLTQYLAEEGFTHNGKIACTQPRRVAAMSVAKRVSEEVGCRLGQEVGYTIRFEDCTSTATKIKYCTDGMLQRECLLDPDLKQYSVIILDEAHERTIATDVLFGLLKKSLQRRPDLKLIVTSATLDSEKFSHYFFDCPIFTIPGRTFPVEVLHTKEPESDYLEAALMAVMQIHLSEPPGDILLFLTGQEEIDTSCEVLYERMKSLGPSVPELLILPIYSSLPSETQARVFEPAPPGSRKVVIATNIAETSITIDGIYYVIDPGFVKQNAYDPKLGMDSLIVTPISQAQARQRSGRAGRTGPGKCYRLYTEAAYRNEMLPNSVPEIQRQNLSLTILMLKAMGINDLIRFDFMDPPPTQTLLTALEQLYTLGALDNEGLLTRMGRKMADFPMEPYLAKVLLASVDMGCSEEILTIIAMLSTGGSVFYRPKDKQKAADEKKKKFNQPEGDHLTLLTVYNAWKSAGYSKSWCQENYINGRGMKRAQDIRNQLEGIMDRYKHQIVSSGRNYNKVRRALISGFFTHAAKKDPQEGYKTVVEGTPVYLHPSSALFGKPTEWVIYHELIATTKEYMHCITAIEPKWLPELAPAFFKTADANKVSKAKARDKIVPLHDRFAEKDDWRISKQRKMDRGGQGNTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.23
3 0.25
4 0.28
5 0.22
6 0.26
7 0.27
8 0.27
9 0.26
10 0.21
11 0.24
12 0.21
13 0.22
14 0.2
15 0.16
16 0.14
17 0.15
18 0.15
19 0.11
20 0.14
21 0.17
22 0.19
23 0.21
24 0.2
25 0.19
26 0.2
27 0.21
28 0.2
29 0.2
30 0.2
31 0.2
32 0.2
33 0.29
34 0.28
35 0.29
36 0.33
37 0.31
38 0.3
39 0.35
40 0.37
41 0.33
42 0.36
43 0.34
44 0.3
45 0.28
46 0.25
47 0.19
48 0.19
49 0.14
50 0.13
51 0.13
52 0.1
53 0.09
54 0.09
55 0.16
56 0.2
57 0.24
58 0.3
59 0.39
60 0.41
61 0.47
62 0.54
63 0.55
64 0.54
65 0.6
66 0.64
67 0.64
68 0.69
69 0.66
70 0.63
71 0.58
72 0.54
73 0.49
74 0.42
75 0.38
76 0.35
77 0.34
78 0.31
79 0.31
80 0.31
81 0.28
82 0.29
83 0.25
84 0.25
85 0.25
86 0.31
87 0.28
88 0.34
89 0.41
90 0.43
91 0.42
92 0.43
93 0.44
94 0.42
95 0.43
96 0.39
97 0.31
98 0.26
99 0.26
100 0.29
101 0.28
102 0.27
103 0.29
104 0.32
105 0.33
106 0.32
107 0.31
108 0.25
109 0.25
110 0.21
111 0.19
112 0.14
113 0.13
114 0.14
115 0.15
116 0.14
117 0.12
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.09
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.09
126 0.15
127 0.22
128 0.29
129 0.39
130 0.48
131 0.6
132 0.71
133 0.79
134 0.84
135 0.86
136 0.89
137 0.9
138 0.9
139 0.9
140 0.85
141 0.78
142 0.71
143 0.66
144 0.64
145 0.56
146 0.47
147 0.38
148 0.33
149 0.33
150 0.34
151 0.39
152 0.37
153 0.41
154 0.44
155 0.43
156 0.44
157 0.44
158 0.43
159 0.42
160 0.44
161 0.43
162 0.45
163 0.51
164 0.5
165 0.49
166 0.52
167 0.51
168 0.51
169 0.54
170 0.56
171 0.59
172 0.65
173 0.72
174 0.75
175 0.75
176 0.77
177 0.77
178 0.79
179 0.8
180 0.83
181 0.85
182 0.86
183 0.89
184 0.89
185 0.83
186 0.78
187 0.72
188 0.68
189 0.66
190 0.6
191 0.57
192 0.54
193 0.56
194 0.51
195 0.55
196 0.49
197 0.42
198 0.41
199 0.36
200 0.33
201 0.29
202 0.29
203 0.22
204 0.21
205 0.23
206 0.19
207 0.17
208 0.15
209 0.15
210 0.16
211 0.16
212 0.17
213 0.18
214 0.19
215 0.22
216 0.21
217 0.2
218 0.18
219 0.18
220 0.16
221 0.16
222 0.15
223 0.11
224 0.14
225 0.15
226 0.16
227 0.17
228 0.17
229 0.14
230 0.14
231 0.14
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.11
237 0.12
238 0.12
239 0.13
240 0.12
241 0.11
242 0.11
243 0.13
244 0.14
245 0.19
246 0.2
247 0.2
248 0.2
249 0.21
250 0.2
251 0.21
252 0.18
253 0.13
254 0.13
255 0.11
256 0.11
257 0.13
258 0.12
259 0.12
260 0.12
261 0.11
262 0.12
263 0.13
264 0.15
265 0.14
266 0.16
267 0.15
268 0.17
269 0.17
270 0.16
271 0.17
272 0.16
273 0.17
274 0.17
275 0.16
276 0.14
277 0.15
278 0.16
279 0.16
280 0.16
281 0.17
282 0.19
283 0.19
284 0.23
285 0.23
286 0.28
287 0.32
288 0.32
289 0.29
290 0.24
291 0.25
292 0.21
293 0.22
294 0.16
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.14
301 0.18
302 0.19
303 0.24
304 0.27
305 0.28
306 0.32
307 0.33
308 0.33
309 0.33
310 0.37
311 0.36
312 0.34
313 0.34
314 0.32
315 0.31
316 0.27
317 0.23
318 0.18
319 0.15
320 0.15
321 0.19
322 0.28
323 0.34
324 0.44
325 0.48
326 0.58
327 0.61
328 0.68
329 0.7
330 0.69
331 0.71
332 0.71
333 0.7
334 0.61
335 0.62
336 0.55
337 0.49
338 0.41
339 0.34
340 0.25
341 0.2
342 0.18
343 0.15
344 0.13
345 0.11
346 0.08
347 0.07
348 0.09
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.1
353 0.11
354 0.12
355 0.12
356 0.11
357 0.15
358 0.16
359 0.15
360 0.13
361 0.12
362 0.12
363 0.12
364 0.11
365 0.07
366 0.06
367 0.06
368 0.07
369 0.06
370 0.06
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.08
380 0.07
381 0.08
382 0.08
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.1
387 0.12
388 0.16
389 0.2
390 0.2
391 0.2
392 0.2
393 0.2
394 0.22
395 0.22
396 0.2
397 0.18
398 0.18
399 0.19
400 0.21
401 0.21
402 0.19
403 0.18
404 0.17
405 0.2
406 0.22
407 0.24
408 0.24
409 0.23
410 0.21
411 0.19
412 0.18
413 0.14
414 0.12
415 0.13
416 0.11
417 0.11
418 0.13
419 0.13
420 0.18
421 0.23
422 0.24
423 0.25
424 0.32
425 0.33
426 0.39
427 0.46
428 0.43
429 0.43
430 0.45
431 0.41
432 0.34
433 0.33
434 0.27
435 0.21
436 0.21
437 0.15
438 0.11
439 0.11
440 0.12
441 0.1
442 0.09
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.08
450 0.07
451 0.07
452 0.08
453 0.08
454 0.09
455 0.09
456 0.1
457 0.09
458 0.1
459 0.11
460 0.09
461 0.12
462 0.14
463 0.14
464 0.13
465 0.17
466 0.21
467 0.22
468 0.24
469 0.21
470 0.22
471 0.24
472 0.24
473 0.27
474 0.24
475 0.22
476 0.22
477 0.23
478 0.21
479 0.2
480 0.2
481 0.16
482 0.22
483 0.25
484 0.24
485 0.29
486 0.29
487 0.28
488 0.33
489 0.31
490 0.27
491 0.28
492 0.33
493 0.28
494 0.28
495 0.28
496 0.24
497 0.27
498 0.29
499 0.32
500 0.27
501 0.26
502 0.26
503 0.25
504 0.25
505 0.23
506 0.19
507 0.14
508 0.13
509 0.14
510 0.16
511 0.15
512 0.15
513 0.13
514 0.14
515 0.15
516 0.14
517 0.13
518 0.11
519 0.13
520 0.16
521 0.17
522 0.15
523 0.13
524 0.13
525 0.12
526 0.11
527 0.08
528 0.04
529 0.03
530 0.03
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.04
535 0.04
536 0.05
537 0.07
538 0.08
539 0.09
540 0.1
541 0.1
542 0.1
543 0.12
544 0.11
545 0.09
546 0.09
547 0.08
548 0.09
549 0.09
550 0.08
551 0.09
552 0.1
553 0.1
554 0.11
555 0.15
556 0.21
557 0.24
558 0.27
559 0.28
560 0.3
561 0.32
562 0.31
563 0.27
564 0.22
565 0.28
566 0.27
567 0.27
568 0.25
569 0.23
570 0.23
571 0.22
572 0.2
573 0.13
574 0.12
575 0.1
576 0.13
577 0.13
578 0.13
579 0.13
580 0.12
581 0.1
582 0.09
583 0.08
584 0.07
585 0.08
586 0.08
587 0.07
588 0.08
589 0.08
590 0.08
591 0.08
592 0.07
593 0.08
594 0.1
595 0.12
596 0.14
597 0.15
598 0.17
599 0.18
600 0.18
601 0.2
602 0.19
603 0.18
604 0.19
605 0.22
606 0.24
607 0.24
608 0.23
609 0.21
610 0.21
611 0.2
612 0.17
613 0.14
614 0.12
615 0.1
616 0.15
617 0.15
618 0.15
619 0.15
620 0.13
621 0.12
622 0.12
623 0.11
624 0.06
625 0.05
626 0.06
627 0.08
628 0.08
629 0.08
630 0.07
631 0.07
632 0.07
633 0.08
634 0.08
635 0.06
636 0.06
637 0.06
638 0.07
639 0.07
640 0.06
641 0.06
642 0.06
643 0.07
644 0.1
645 0.17
646 0.21
647 0.24
648 0.32
649 0.35
650 0.4
651 0.47
652 0.46
653 0.4
654 0.38
655 0.35
656 0.29
657 0.25
658 0.2
659 0.13
660 0.11
661 0.11
662 0.08
663 0.08
664 0.07
665 0.08
666 0.08
667 0.08
668 0.09
669 0.1
670 0.11
671 0.11
672 0.14
673 0.13
674 0.14
675 0.15
676 0.15
677 0.14
678 0.17
679 0.16
680 0.18
681 0.2
682 0.19
683 0.18
684 0.16
685 0.19
686 0.18
687 0.19
688 0.19
689 0.19
690 0.19
691 0.19
692 0.2
693 0.18
694 0.17
695 0.19
696 0.15
697 0.13
698 0.13
699 0.13
700 0.11
701 0.1
702 0.08
703 0.05
704 0.03
705 0.03
706 0.02
707 0.02
708 0.02
709 0.03
710 0.03
711 0.04
712 0.04
713 0.05
714 0.05
715 0.06
716 0.05
717 0.05
718 0.05
719 0.05
720 0.05
721 0.05
722 0.05
723 0.04
724 0.05
725 0.05
726 0.04
727 0.04
728 0.05
729 0.05
730 0.05
731 0.05
732 0.05
733 0.05
734 0.07
735 0.09
736 0.1
737 0.1
738 0.12
739 0.12
740 0.12
741 0.15
742 0.16
743 0.15
744 0.16
745 0.16
746 0.15
747 0.15
748 0.15
749 0.12
750 0.09
751 0.08
752 0.06
753 0.05
754 0.06
755 0.05
756 0.06
757 0.06
758 0.06
759 0.08
760 0.1
761 0.11
762 0.13
763 0.14
764 0.14
765 0.16
766 0.16
767 0.18
768 0.19
769 0.21
770 0.23
771 0.24
772 0.25
773 0.25
774 0.26
775 0.23
776 0.21
777 0.22
778 0.2
779 0.21
780 0.19
781 0.2
782 0.18
783 0.17
784 0.15
785 0.11
786 0.11
787 0.09
788 0.08
789 0.06
790 0.05
791 0.06
792 0.06
793 0.06
794 0.04
795 0.04
796 0.04
797 0.05
798 0.05
799 0.06
800 0.11
801 0.11
802 0.12
803 0.12
804 0.19
805 0.24
806 0.27
807 0.27
808 0.22
809 0.23
810 0.24
811 0.23
812 0.16
813 0.11
814 0.1
815 0.09
816 0.1
817 0.08
818 0.07
819 0.08
820 0.09
821 0.1
822 0.09
823 0.1
824 0.17
825 0.25
826 0.27
827 0.3
828 0.31
829 0.37
830 0.41
831 0.45
832 0.43
833 0.37
834 0.39
835 0.45
836 0.46
837 0.44
838 0.47
839 0.43
840 0.39
841 0.41
842 0.4
843 0.34
844 0.34
845 0.32
846 0.33
847 0.39
848 0.4
849 0.38
850 0.36
851 0.34
852 0.34
853 0.3
854 0.24
855 0.18
856 0.18
857 0.19
858 0.23
859 0.22
860 0.22
861 0.28
862 0.27
863 0.27
864 0.26
865 0.24
866 0.21
867 0.22
868 0.19
869 0.14
870 0.14
871 0.12
872 0.11
873 0.09
874 0.07
875 0.07
876 0.07
877 0.07
878 0.06
879 0.06
880 0.07
881 0.08
882 0.08
883 0.08
884 0.08
885 0.09
886 0.15
887 0.15
888 0.21
889 0.2
890 0.25
891 0.26
892 0.26
893 0.25
894 0.19
895 0.2
896 0.17
897 0.18
898 0.16
899 0.15
900 0.14
901 0.14
902 0.14
903 0.11
904 0.08
905 0.07
906 0.05
907 0.04
908 0.04
909 0.04
910 0.04
911 0.04
912 0.05
913 0.05
914 0.05
915 0.06
916 0.08
917 0.1
918 0.11
919 0.11
920 0.13
921 0.17
922 0.21
923 0.25
924 0.24
925 0.24
926 0.28
927 0.29
928 0.28
929 0.24
930 0.21
931 0.16
932 0.15
933 0.13
934 0.08
935 0.07
936 0.08
937 0.08
938 0.06
939 0.06
940 0.06
941 0.07
942 0.06
943 0.06
944 0.06
945 0.05
946 0.05
947 0.06
948 0.05
949 0.04
950 0.05
951 0.04
952 0.04
953 0.03
954 0.03
955 0.03
956 0.03
957 0.04
958 0.04
959 0.05
960 0.09
961 0.13
962 0.21
963 0.24
964 0.34
965 0.44
966 0.49
967 0.57
968 0.64
969 0.71
970 0.74
971 0.82
972 0.83
973 0.82
974 0.87
975 0.87
976 0.86
977 0.84
978 0.84
979 0.83
980 0.79
981 0.8
982 0.78
983 0.72
984 0.63
985 0.53
986 0.44
987 0.34
988 0.28
989 0.18
990 0.1
991 0.08
992 0.09
993 0.1
994 0.1
995 0.1
996 0.11
997 0.18
998 0.19
999 0.22
1000 0.26
1001 0.31
1002 0.37
1003 0.41
1004 0.4
1005 0.39
1006 0.41
1007 0.46
1008 0.49
1009 0.48
1010 0.47
1011 0.45
1012 0.46
1013 0.45
1014 0.44
1015 0.4
1016 0.4
1017 0.43
1018 0.43
1019 0.5
1020 0.56
1021 0.59
1022 0.6
1023 0.55
1024 0.48
1025 0.43
1026 0.39
1027 0.34
1028 0.32
1029 0.26
1030 0.23
1031 0.27
1032 0.29
1033 0.26
1034 0.25
1035 0.28
1036 0.28
1037 0.37
1038 0.43
1039 0.48
1040 0.48
1041 0.56
1042 0.61
1043 0.62
1044 0.65
1045 0.61
1046 0.57
1047 0.51
1048 0.55
1049 0.51
1050 0.53
1051 0.48
1052 0.42
1053 0.39
1054 0.37
1055 0.34
1056 0.3
1057 0.28
1058 0.27
1059 0.26
1060 0.28
1061 0.34
1062 0.38
1063 0.42
1064 0.45
1065 0.45
1066 0.46
1067 0.45
1068 0.42
1069 0.34
1070 0.29
1071 0.26
1072 0.2
1073 0.2
1074 0.18
1075 0.16
1076 0.2
1077 0.19
1078 0.18
1079 0.18
1080 0.18
1081 0.17
1082 0.16
1083 0.17
1084 0.14
1085 0.14
1086 0.16
1087 0.17
1088 0.18
1089 0.19
1090 0.17
1091 0.2
1092 0.23
1093 0.24
1094 0.23
1095 0.22
1096 0.21
1097 0.19
1098 0.2
1099 0.18
1100 0.14
1101 0.15
1102 0.16
1103 0.17
1104 0.18
1105 0.18
1106 0.17
1107 0.17
1108 0.19
1109 0.25
1110 0.26
1111 0.29
1112 0.28
1113 0.28
1114 0.3
1115 0.29
1116 0.26
1117 0.24
1118 0.26
1119 0.23
1120 0.27
1121 0.27
1122 0.27
1123 0.26
1124 0.27
1125 0.25
1126 0.26
1127 0.3
1128 0.29
1129 0.3
1130 0.33
1131 0.39
1132 0.41
1133 0.43
1134 0.47
1135 0.51
1136 0.55
1137 0.6
1138 0.63
1139 0.63
1140 0.69
1141 0.73
1142 0.75
1143 0.69
1144 0.67
1145 0.64
1146 0.58
1147 0.55
1148 0.5
1149 0.48
1150 0.39
1151 0.44
1152 0.45
1153 0.46
1154 0.48
1155 0.56
1156 0.58
1157 0.59
1158 0.67
1159 0.69
1160 0.7
1161 0.71
1162 0.76
1163 0.76
1164 0.79