Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R4XD42

Protein Details
Accession R4XD42    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
264-290DSPNQKRLKGQTQRRRQWRAREYNLLTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 15, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12243  RRM1_MSSP  
Amino Acid Sequences MKFDAELSELNENLETNITIPHSSDDSGPQAILKYGTMPPTPACSSPPSKQAKVLSMDTLKKLNAGGLIPPPVPSLFVGPSIEEALEQSLYNPNQTTNVYIRGLPPDTTDETLLAICERFGTISSSKAIVDIQTGLCKGFGFAFYNNEDDATACIAGLTHCGYQVSFAKESFSTRLKNLQDPQSTNLYLSNLPLHMHEKDLEDLFQPYKVVSNRILRDSNNMSRGVGFARLADRNSAEAVIDKFDNTCLAGSPDDLPLQVRFADSPNQKRLKGQTQRRRQWRAREYNLLTGHLGLEDLSPTIPGSDISQNCIFAPSSDTSYEHSQYNEDYLSACYRADYSCQAYAQAQFVPHANLEDGAHRLQPAEAIETSMARKLTI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.12
3 0.09
4 0.11
5 0.12
6 0.12
7 0.13
8 0.15
9 0.15
10 0.16
11 0.17
12 0.19
13 0.2
14 0.21
15 0.2
16 0.18
17 0.17
18 0.17
19 0.17
20 0.13
21 0.13
22 0.16
23 0.2
24 0.2
25 0.21
26 0.21
27 0.26
28 0.29
29 0.26
30 0.26
31 0.28
32 0.34
33 0.36
34 0.44
35 0.46
36 0.46
37 0.51
38 0.53
39 0.53
40 0.52
41 0.5
42 0.47
43 0.46
44 0.48
45 0.44
46 0.42
47 0.36
48 0.31
49 0.29
50 0.24
51 0.19
52 0.16
53 0.16
54 0.17
55 0.2
56 0.19
57 0.2
58 0.19
59 0.17
60 0.17
61 0.15
62 0.15
63 0.12
64 0.14
65 0.14
66 0.13
67 0.15
68 0.14
69 0.14
70 0.1
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.14
77 0.14
78 0.16
79 0.16
80 0.15
81 0.17
82 0.18
83 0.2
84 0.17
85 0.21
86 0.2
87 0.21
88 0.22
89 0.24
90 0.25
91 0.21
92 0.2
93 0.2
94 0.22
95 0.22
96 0.21
97 0.17
98 0.16
99 0.15
100 0.14
101 0.1
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.09
109 0.1
110 0.11
111 0.13
112 0.13
113 0.13
114 0.14
115 0.13
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.1
121 0.11
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.09
126 0.08
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.13
131 0.14
132 0.16
133 0.15
134 0.14
135 0.13
136 0.11
137 0.1
138 0.08
139 0.07
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.09
151 0.12
152 0.15
153 0.14
154 0.14
155 0.16
156 0.16
157 0.18
158 0.19
159 0.19
160 0.17
161 0.17
162 0.24
163 0.25
164 0.3
165 0.33
166 0.38
167 0.39
168 0.39
169 0.4
170 0.37
171 0.35
172 0.3
173 0.26
174 0.2
175 0.15
176 0.14
177 0.12
178 0.09
179 0.09
180 0.1
181 0.11
182 0.1
183 0.11
184 0.12
185 0.12
186 0.13
187 0.13
188 0.12
189 0.11
190 0.12
191 0.11
192 0.1
193 0.09
194 0.08
195 0.12
196 0.12
197 0.14
198 0.17
199 0.24
200 0.26
201 0.3
202 0.32
203 0.28
204 0.33
205 0.37
206 0.37
207 0.33
208 0.31
209 0.27
210 0.25
211 0.25
212 0.2
213 0.15
214 0.11
215 0.09
216 0.12
217 0.13
218 0.13
219 0.14
220 0.14
221 0.13
222 0.13
223 0.12
224 0.09
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.07
235 0.06
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.1
240 0.11
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.1
245 0.11
246 0.1
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.19
251 0.24
252 0.31
253 0.4
254 0.44
255 0.44
256 0.48
257 0.53
258 0.56
259 0.59
260 0.63
261 0.64
262 0.7
263 0.8
264 0.86
265 0.89
266 0.86
267 0.86
268 0.86
269 0.86
270 0.83
271 0.83
272 0.77
273 0.75
274 0.69
275 0.6
276 0.49
277 0.39
278 0.32
279 0.21
280 0.17
281 0.09
282 0.08
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.09
292 0.16
293 0.16
294 0.22
295 0.23
296 0.24
297 0.24
298 0.25
299 0.22
300 0.15
301 0.19
302 0.16
303 0.17
304 0.18
305 0.19
306 0.22
307 0.27
308 0.28
309 0.25
310 0.24
311 0.23
312 0.22
313 0.24
314 0.2
315 0.15
316 0.14
317 0.15
318 0.17
319 0.16
320 0.15
321 0.13
322 0.14
323 0.14
324 0.17
325 0.19
326 0.21
327 0.24
328 0.25
329 0.26
330 0.27
331 0.28
332 0.27
333 0.25
334 0.21
335 0.18
336 0.2
337 0.2
338 0.19
339 0.18
340 0.17
341 0.16
342 0.16
343 0.17
344 0.19
345 0.18
346 0.18
347 0.17
348 0.17
349 0.15
350 0.17
351 0.16
352 0.17
353 0.16
354 0.17
355 0.17
356 0.19
357 0.2
358 0.21