FuNGI

R4X9Y2

Protein Details

Accession

R4X9Y2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
38-63	AQQAKSNAGRKGRKQKMGNKIKMGHG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
45-58	AGRKGRKQKMGNKI

Subcellular Location(s)

cyto 14.5, cyto_nucl 12.166, cyto_mito 9.499, nucl 7.5, mito_nucl 5.999

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024072 DHFR-like_dom_sf IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR002501 PsdUridine_synth_N IPR002734 RibDG_C IPR014780 tRNA_psdUridine_synth_TruB IPR032819 TruB_C
Gene Ontology	GO:0008703 F:5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase activity GO:0009982 F:pseudouridine synthase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0009231 P:riboflavin biosynthetic process GO:0008033 P:tRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF01872 RibD_C PF16198 TruB_C_2 PF01509 TruB_N

Amino Acid Sequences

MSGLFAVNKPSGISSAGLLNDLQHVLKVSSLFEQEIKAQQAKSNAGRKGRKQKMGNKIKMGHGGTLDPLASGVLVVGTGRGTKDLGKFLHCSKDYEAIALFGCSTDTYDSEGKVVHRRPWKHITEEKLESILSQFRGDIMQTPPIYSALKMQGKPLYEYAREGKPLPAEIKARPATVSRFEITKFTTNHEWKNPSEEASTEIVLSAEALEQLRPASEARPTGAEGPSLTAGADLAQPGVLKDDIPSPKNNENDVGQDSIEPPAKRQRRESPVSTVQTHTEDTQADSGSLAVHISMTVSSGTYVRSLIHDLGLAMGSAAHMVALVRKRVGEFNLEDAIPWSAFEQDTWQETLKTRLDFSNEPIHEQVYDGTEAELELNSLTPAEVQVAAFLQPCMPFTRTLTYAQSLDAKISGPNSSPLTISCPESFRVTHELRRRHDLILVGVGTAVSDDPGLNARDSAGKAYPLEGQPIPVILDPSGRFELTNDSKMIKNVRSKTGKPPLQLVHESRRGHCKTLARVIYVKDKIETAENVFRFAWSDIFNALEPYGKSIMIEGGSNIIQEVLQRGIADHIIITIAPTFVGPGSGLALHSPVNLAKVRSEIFGRDTVLVAQRRSIPTSAANRGTSQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.16
3	0.16
4	0.16
5	0.15
6	0.14
7	0.15
8	0.15
9	0.14
10	0.11
11	0.13
12	0.12
13	0.14
14	0.14
15	0.13
16	0.16
17	0.18
18	0.18
19	0.18
20	0.19
21	0.21
22	0.26
23	0.29
24	0.3
25	0.29
26	0.31
27	0.35
28	0.4
29	0.45
30	0.48
31	0.49
32	0.55
33	0.63
34	0.7
35	0.75
36	0.78
37	0.79
38	0.81
39	0.84
40	0.86
41	0.88
42	0.87
43	0.85
44	0.8
45	0.76
46	0.75
47	0.67
48	0.59
49	0.49
50	0.41
51	0.33
52	0.29
53	0.24
54	0.15
55	0.13
56	0.1
57	0.08
58	0.06
59	0.05
60	0.03
61	0.03
62	0.03
63	0.04
64	0.04
65	0.05
66	0.06
67	0.07
68	0.08
69	0.12
70	0.16
71	0.22
72	0.23
73	0.26
74	0.29
75	0.33
76	0.41
77	0.39
78	0.39
79	0.36
80	0.42
81	0.39
82	0.37
83	0.33
84	0.25
85	0.24
86	0.2
87	0.17
88	0.09
89	0.09
90	0.07
91	0.08
92	0.08
93	0.08
94	0.12
95	0.14
96	0.14
97	0.15
98	0.16
99	0.18
100	0.25
101	0.29
102	0.32
103	0.4
104	0.44
105	0.51
106	0.59
107	0.62
108	0.62
109	0.65
110	0.64
111	0.64
112	0.64
113	0.57
114	0.49
115	0.43
116	0.35
117	0.3
118	0.27
119	0.2
120	0.16
121	0.14
122	0.13
123	0.14
124	0.14
125	0.16
126	0.14
127	0.2
128	0.19
129	0.2
130	0.2
131	0.21
132	0.22
133	0.18
134	0.2
135	0.22
136	0.28
137	0.28
138	0.31
139	0.33
140	0.34
141	0.36
142	0.36
143	0.33
144	0.28
145	0.31
146	0.31
147	0.31
148	0.32
149	0.3
150	0.29
151	0.25
152	0.28
153	0.26
154	0.26
155	0.26
156	0.26
157	0.33
158	0.32
159	0.31
160	0.29
161	0.3
162	0.28
163	0.3
164	0.32
165	0.25
166	0.25
167	0.25
168	0.26
169	0.27
170	0.3
171	0.26
172	0.27
173	0.35
174	0.38
175	0.43
176	0.47
177	0.48
178	0.42
179	0.47
180	0.44
181	0.36
182	0.32
183	0.27
184	0.24
185	0.22
186	0.21
187	0.15
188	0.14
189	0.11
190	0.1
191	0.1
192	0.06
193	0.04
194	0.05
195	0.05
196	0.05
197	0.05
198	0.05
199	0.06
200	0.06
201	0.07
202	0.07
203	0.1
204	0.11
205	0.11
206	0.13
207	0.14
208	0.16
209	0.16
210	0.15
211	0.12
212	0.13
213	0.12
214	0.11
215	0.1
216	0.07
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.05
221	0.04
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.06
226	0.06
227	0.05
228	0.06
229	0.13
230	0.16
231	0.18
232	0.21
233	0.25
234	0.3
235	0.33
236	0.33
237	0.28
238	0.26
239	0.27
240	0.26
241	0.22
242	0.17
243	0.15
244	0.14
245	0.15
246	0.18
247	0.15
248	0.15
249	0.24
250	0.29
251	0.32
252	0.38
253	0.45
254	0.49
255	0.55
256	0.57
257	0.56
258	0.58
259	0.6
260	0.55
261	0.46
262	0.4
263	0.35
264	0.32
265	0.24
266	0.18
267	0.14
268	0.13
269	0.13
270	0.11
271	0.1
272	0.08
273	0.08
274	0.06
275	0.06
276	0.05
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.03
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.04
286	0.04
287	0.05
288	0.05
289	0.06
290	0.06
291	0.07
292	0.08
293	0.08
294	0.08
295	0.08
296	0.07
297	0.07
298	0.07
299	0.05
300	0.04
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.03
305	0.02
306	0.02
307	0.02
308	0.05
309	0.07
310	0.08
311	0.08
312	0.09
313	0.1
314	0.11
315	0.12
316	0.14
317	0.13
318	0.15
319	0.17
320	0.16
321	0.15
322	0.14
323	0.14
324	0.1
325	0.09
326	0.06
327	0.06
328	0.06
329	0.06
330	0.08
331	0.08
332	0.1
333	0.11
334	0.12
335	0.12
336	0.13
337	0.18
338	0.19
339	0.18
340	0.18
341	0.18
342	0.22
343	0.21
344	0.24
345	0.29
346	0.26
347	0.27
348	0.26
349	0.25
350	0.21
351	0.2
352	0.17
353	0.09
354	0.1
355	0.08
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.06
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.03
368	0.04
369	0.04
370	0.05
371	0.04
372	0.05
373	0.05
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.07
378	0.06
379	0.08
380	0.1
381	0.11
382	0.12
383	0.13
384	0.17
385	0.18
386	0.2
387	0.22
388	0.21
389	0.2
390	0.2
391	0.22
392	0.18
393	0.17
394	0.15
395	0.13
396	0.11
397	0.12
398	0.12
399	0.09
400	0.12
401	0.13
402	0.14
403	0.13
404	0.13
405	0.17
406	0.17
407	0.2
408	0.18
409	0.18
410	0.19
411	0.21
412	0.21
413	0.19
414	0.25
415	0.25
416	0.31
417	0.37
418	0.44
419	0.46
420	0.53
421	0.52
422	0.46
423	0.46
424	0.4
425	0.34
426	0.29
427	0.26
428	0.18
429	0.15
430	0.14
431	0.11
432	0.09
433	0.07
434	0.03
435	0.03
436	0.03
437	0.04
438	0.07
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.09
443	0.12
444	0.13
445	0.15
446	0.13
447	0.14
448	0.14
449	0.16
450	0.2
451	0.17
452	0.21
453	0.18
454	0.18
455	0.17
456	0.17
457	0.17
458	0.13
459	0.13
460	0.09
461	0.14
462	0.13
463	0.17
464	0.18
465	0.17
466	0.17
467	0.16
468	0.25
469	0.26
470	0.28
471	0.25
472	0.25
473	0.27
474	0.3
475	0.35
476	0.32
477	0.36
478	0.38
479	0.47
480	0.52
481	0.54
482	0.62
483	0.67
484	0.66
485	0.6
486	0.62
487	0.57
488	0.57
489	0.6
490	0.55
491	0.53
492	0.56
493	0.57
494	0.52
495	0.58
496	0.54
497	0.5
498	0.5
499	0.48
500	0.47
501	0.55
502	0.55
503	0.49
504	0.49
505	0.49
506	0.53
507	0.5
508	0.44
509	0.35
510	0.32
511	0.29
512	0.3
513	0.29
514	0.25
515	0.3
516	0.29
517	0.31
518	0.3
519	0.29
520	0.27
521	0.25
522	0.22
523	0.15
524	0.16
525	0.14
526	0.16
527	0.16
528	0.15
529	0.14
530	0.15
531	0.13
532	0.16
533	0.17
534	0.15
535	0.15
536	0.14
537	0.16
538	0.13
539	0.14
540	0.1
541	0.11
542	0.11
543	0.11
544	0.11
545	0.08
546	0.08
547	0.08
548	0.1
549	0.09
550	0.09
551	0.1
552	0.1
553	0.12
554	0.12
555	0.12
556	0.09
557	0.08
558	0.08
559	0.08
560	0.08
561	0.07
562	0.06
563	0.06
564	0.06
565	0.06
566	0.06
567	0.07
568	0.06
569	0.06
570	0.07
571	0.08
572	0.09
573	0.08
574	0.1
575	0.09
576	0.09
577	0.11
578	0.1
579	0.13
580	0.16
581	0.17
582	0.17
583	0.21
584	0.22
585	0.23
586	0.25
587	0.24
588	0.25
589	0.27
590	0.28
591	0.25
592	0.25
593	0.26
594	0.31
595	0.32
596	0.29
597	0.3
598	0.34
599	0.37
600	0.4
601	0.37
602	0.33
603	0.36
604	0.44
605	0.48
606	0.48

R4X9Y2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer