Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1H238

Protein Details
Accession R1H238    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-134DAKSWLAGQKKRQKKIEKTRKLEQELAHydrophilic
281-308IDPSEVKIKKPKKKKSKSARKKAADEDDBasic
356-375RRAALKKRKKVKPEDLARQLBasic
616-641GKGSGKQKTEKRLKKIEEEKKREAMSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
79-85KKDAIKK
117-127KKRQKKIEKTR
287-302KIKKPKKKKSKSARKK
356-367RRAALKKRKKVK
617-637KGSGKQKTEKRLKKIEEEKKR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG npa:UCRNP2_722  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MDAVSIEEANKIRVAMGMKPLPVPGKEDTSGPVFKEPQANDDDSDEEPASTLETRSAAAYDNWKKIEEANAAKAKLQAKKDAIKKAREQAQRFAKLEGQGLGEGDDLDAKSWLAGQKKRQKKIEKTRKLEQELAEREAELQAEYTAADLAGVKVAHELDQLGEGEEHILTLKDAAVDDEEDGDELENLDLADNEKLQARLESKKRKRAYDPNDMDESGQRTILAQYDEEIDGKKRKAFTLDGQGRTVEETQRATGGSSAGPSKVKISLDLFQEDTPISDYIDPSEVKIKKPKKKKSKSARKKAADEDDIFPMPTPVVPQENGGMDLDQPEAAPKKKFVDDNIIDDEDLQANLALQRRAALKKRKKVKPEDLARQLREEASATPGVVDSVENPDEEPGLVIDETSEFVANLQGPAERPDRPRNKSSQPRSRAVSESANAVDEEGDVDMDQSYAEVEEAEERKAREQREGRSTSVPEMTTTGLDEEETVDRGLGATLNLLRQRGQIQEDNGSDLNKRNIEHQRFLAEKHKMESEAEMRAKLQRERDRRSGRLEHMSAREREAMAQKANQDRDRLESRKMADIFNKEYKPNVELKYVDEFGRRMNQKEAFKHLSHQFHGKGSGKQKTEKRLKKIEEEKKREAMSSLDSSQHTAMNTAMEGTAKKNRQAGVRLQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.26
4 0.29
5 0.29
6 0.3
7 0.33
8 0.34
9 0.32
10 0.33
11 0.28
12 0.3
13 0.3
14 0.3
15 0.3
16 0.32
17 0.33
18 0.31
19 0.33
20 0.29
21 0.31
22 0.38
23 0.36
24 0.35
25 0.38
26 0.38
27 0.33
28 0.33
29 0.32
30 0.25
31 0.29
32 0.24
33 0.18
34 0.16
35 0.15
36 0.15
37 0.13
38 0.13
39 0.11
40 0.11
41 0.12
42 0.12
43 0.13
44 0.13
45 0.14
46 0.24
47 0.3
48 0.35
49 0.36
50 0.36
51 0.36
52 0.37
53 0.42
54 0.4
55 0.38
56 0.41
57 0.45
58 0.45
59 0.46
60 0.49
61 0.47
62 0.46
63 0.44
64 0.44
65 0.44
66 0.52
67 0.59
68 0.64
69 0.65
70 0.67
71 0.7
72 0.71
73 0.74
74 0.75
75 0.71
76 0.71
77 0.73
78 0.74
79 0.68
80 0.62
81 0.57
82 0.5
83 0.48
84 0.4
85 0.31
86 0.23
87 0.22
88 0.19
89 0.15
90 0.13
91 0.1
92 0.1
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.09
99 0.13
100 0.19
101 0.24
102 0.34
103 0.44
104 0.54
105 0.63
106 0.7
107 0.77
108 0.81
109 0.87
110 0.88
111 0.89
112 0.87
113 0.88
114 0.88
115 0.84
116 0.79
117 0.72
118 0.71
119 0.64
120 0.6
121 0.51
122 0.41
123 0.35
124 0.29
125 0.25
126 0.15
127 0.11
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.04
136 0.05
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.07
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.13
185 0.15
186 0.23
187 0.32
188 0.43
189 0.5
190 0.59
191 0.65
192 0.68
193 0.74
194 0.76
195 0.75
196 0.75
197 0.73
198 0.68
199 0.66
200 0.59
201 0.51
202 0.43
203 0.38
204 0.27
205 0.21
206 0.15
207 0.12
208 0.13
209 0.14
210 0.12
211 0.09
212 0.09
213 0.11
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.13
218 0.17
219 0.18
220 0.21
221 0.2
222 0.21
223 0.24
224 0.27
225 0.28
226 0.35
227 0.42
228 0.41
229 0.41
230 0.4
231 0.36
232 0.34
233 0.3
234 0.21
235 0.15
236 0.14
237 0.13
238 0.14
239 0.14
240 0.12
241 0.11
242 0.1
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.11
250 0.13
251 0.13
252 0.14
253 0.16
254 0.18
255 0.2
256 0.22
257 0.22
258 0.18
259 0.19
260 0.17
261 0.15
262 0.12
263 0.1
264 0.09
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.11
269 0.11
270 0.1
271 0.17
272 0.18
273 0.2
274 0.29
275 0.38
276 0.44
277 0.54
278 0.64
279 0.68
280 0.77
281 0.85
282 0.87
283 0.9
284 0.93
285 0.94
286 0.94
287 0.9
288 0.86
289 0.82
290 0.78
291 0.71
292 0.63
293 0.54
294 0.46
295 0.39
296 0.32
297 0.25
298 0.18
299 0.12
300 0.09
301 0.08
302 0.06
303 0.08
304 0.08
305 0.09
306 0.1
307 0.1
308 0.11
309 0.1
310 0.09
311 0.07
312 0.08
313 0.07
314 0.06
315 0.05
316 0.06
317 0.08
318 0.1
319 0.11
320 0.12
321 0.14
322 0.17
323 0.19
324 0.19
325 0.27
326 0.27
327 0.3
328 0.32
329 0.29
330 0.26
331 0.25
332 0.23
333 0.14
334 0.12
335 0.08
336 0.04
337 0.04
338 0.06
339 0.08
340 0.08
341 0.07
342 0.09
343 0.13
344 0.17
345 0.25
346 0.34
347 0.41
348 0.49
349 0.6
350 0.65
351 0.7
352 0.76
353 0.78
354 0.78
355 0.79
356 0.8
357 0.8
358 0.8
359 0.72
360 0.64
361 0.54
362 0.44
363 0.36
364 0.27
365 0.17
366 0.13
367 0.12
368 0.1
369 0.1
370 0.09
371 0.08
372 0.08
373 0.07
374 0.05
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.09
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.04
384 0.05
385 0.05
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.04
393 0.04
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.07
400 0.1
401 0.12
402 0.15
403 0.2
404 0.3
405 0.39
406 0.44
407 0.49
408 0.52
409 0.61
410 0.67
411 0.73
412 0.73
413 0.71
414 0.71
415 0.69
416 0.66
417 0.59
418 0.52
419 0.46
420 0.36
421 0.32
422 0.27
423 0.24
424 0.2
425 0.17
426 0.13
427 0.08
428 0.08
429 0.05
430 0.05
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.04
440 0.03
441 0.03
442 0.08
443 0.09
444 0.11
445 0.13
446 0.14
447 0.19
448 0.24
449 0.25
450 0.3
451 0.35
452 0.41
453 0.48
454 0.52
455 0.49
456 0.5
457 0.5
458 0.44
459 0.41
460 0.34
461 0.25
462 0.23
463 0.21
464 0.16
465 0.15
466 0.12
467 0.09
468 0.08
469 0.08
470 0.08
471 0.08
472 0.09
473 0.08
474 0.08
475 0.07
476 0.08
477 0.08
478 0.06
479 0.05
480 0.06
481 0.07
482 0.11
483 0.12
484 0.13
485 0.14
486 0.15
487 0.18
488 0.19
489 0.23
490 0.24
491 0.25
492 0.31
493 0.3
494 0.32
495 0.3
496 0.28
497 0.25
498 0.24
499 0.26
500 0.23
501 0.23
502 0.28
503 0.37
504 0.43
505 0.46
506 0.45
507 0.46
508 0.45
509 0.48
510 0.49
511 0.45
512 0.4
513 0.39
514 0.39
515 0.33
516 0.33
517 0.35
518 0.29
519 0.31
520 0.3
521 0.28
522 0.27
523 0.3
524 0.34
525 0.33
526 0.4
527 0.42
528 0.5
529 0.57
530 0.66
531 0.71
532 0.71
533 0.75
534 0.73
535 0.7
536 0.7
537 0.65
538 0.61
539 0.6
540 0.62
541 0.55
542 0.5
543 0.47
544 0.38
545 0.39
546 0.38
547 0.35
548 0.32
549 0.33
550 0.36
551 0.4
552 0.47
553 0.46
554 0.44
555 0.41
556 0.44
557 0.5
558 0.47
559 0.44
560 0.43
561 0.43
562 0.48
563 0.48
564 0.45
565 0.43
566 0.46
567 0.48
568 0.51
569 0.51
570 0.43
571 0.46
572 0.44
573 0.41
574 0.43
575 0.39
576 0.36
577 0.33
578 0.36
579 0.39
580 0.39
581 0.37
582 0.32
583 0.3
584 0.28
585 0.37
586 0.37
587 0.33
588 0.39
589 0.44
590 0.49
591 0.54
592 0.59
593 0.56
594 0.54
595 0.58
596 0.59
597 0.58
598 0.54
599 0.57
600 0.51
601 0.47
602 0.54
603 0.51
604 0.5
605 0.52
606 0.57
607 0.54
608 0.6
609 0.64
610 0.67
611 0.74
612 0.75
613 0.76
614 0.78
615 0.79
616 0.82
617 0.85
618 0.85
619 0.85
620 0.85
621 0.83
622 0.81
623 0.76
624 0.67
625 0.58
626 0.5
627 0.46
628 0.43
629 0.38
630 0.35
631 0.33
632 0.35
633 0.34
634 0.33
635 0.26
636 0.21
637 0.19
638 0.16
639 0.15
640 0.13
641 0.12
642 0.12
643 0.13
644 0.16
645 0.25
646 0.28
647 0.32
648 0.36
649 0.4
650 0.45