Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1EHD0

Protein Details
Accession R1EHD0    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-81AGPATTSPTQTKKRKYTKKEKAGQGSSAHydrophilic
304-327LTPPMHYVRKRRFRKRVSTRTIEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
65-97KKRKYTKKEKAGQGSSAAAGPAAPKQSKKRARE
313-318KRRFRK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 9.166, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018247  EF_Hand_1_Ca_BS  
IPR002048  EF_hand_dom  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG npa:UCRNP2_6070  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00018  EF_HAND_1  
PS50222  EF_HAND_2  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MKLKFGAPKPPADASAQSPAATTPGGSGLKLSFKPKSAANTPVTETAPALPAPAGPATTSPTQTKKRKYTKKEKAGQGSSAAAGPAAPKQSKKRAREDEVGGAPSTTKKSKPSLSLKTSNAGAPLAPQRTHSISLKLKTGTPKTPSVPQRIKVKHVGQPPKRELGVGYDSEAEDAEVDPTIEHQFVLRMAPGPDCDYLHKAITEKRVGLSLKEGGADIHFRFFDKEGRRACVTIQGHHYAACMVDLPCIVEGMKSWEKKSGWYKTADICQMLLVHTKVDSEEKAKDAPLPREVDDKTWQYPHGLTPPMHYVRKRRFRKRVSTRTIEAVEEEVERLLALDEKAVEQGGSCNYELADLNRQDRDEASSQVGDEDAMGELVDAEGYADADADADGEIDADELARMMEMEFNDEDQPITSIEAPPGSGIIDAAHALAQHALADSGIPSSAIVGSPLVETPVGTPGASASAEPETEQDDEDDDDDDDDEDEIDEAAAAAQEMKAQLREEVTDLEREVENAKQQMERQNNPLLKQRLMAKFKSLQSDLELKKASLGDDDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.42
3 0.38
4 0.32
5 0.29
6 0.27
7 0.25
8 0.21
9 0.17
10 0.1
11 0.14
12 0.15
13 0.15
14 0.16
15 0.17
16 0.23
17 0.26
18 0.3
19 0.28
20 0.31
21 0.34
22 0.36
23 0.42
24 0.41
25 0.46
26 0.46
27 0.46
28 0.46
29 0.48
30 0.45
31 0.38
32 0.33
33 0.27
34 0.24
35 0.2
36 0.17
37 0.13
38 0.12
39 0.13
40 0.13
41 0.11
42 0.1
43 0.11
44 0.14
45 0.17
46 0.2
47 0.23
48 0.31
49 0.41
50 0.49
51 0.58
52 0.65
53 0.73
54 0.8
55 0.86
56 0.89
57 0.91
58 0.93
59 0.93
60 0.92
61 0.91
62 0.86
63 0.78
64 0.69
65 0.6
66 0.5
67 0.41
68 0.3
69 0.2
70 0.14
71 0.12
72 0.12
73 0.16
74 0.17
75 0.22
76 0.31
77 0.42
78 0.51
79 0.57
80 0.65
81 0.69
82 0.74
83 0.77
84 0.74
85 0.72
86 0.67
87 0.61
88 0.51
89 0.41
90 0.34
91 0.28
92 0.27
93 0.22
94 0.21
95 0.24
96 0.3
97 0.36
98 0.45
99 0.52
100 0.57
101 0.62
102 0.68
103 0.65
104 0.62
105 0.58
106 0.49
107 0.41
108 0.31
109 0.23
110 0.19
111 0.23
112 0.23
113 0.22
114 0.23
115 0.25
116 0.28
117 0.33
118 0.31
119 0.32
120 0.35
121 0.37
122 0.4
123 0.37
124 0.38
125 0.42
126 0.45
127 0.43
128 0.42
129 0.44
130 0.43
131 0.5
132 0.53
133 0.55
134 0.57
135 0.56
136 0.62
137 0.61
138 0.63
139 0.63
140 0.63
141 0.59
142 0.61
143 0.66
144 0.63
145 0.69
146 0.68
147 0.64
148 0.59
149 0.53
150 0.43
151 0.39
152 0.36
153 0.26
154 0.23
155 0.19
156 0.19
157 0.18
158 0.18
159 0.11
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.07
172 0.08
173 0.09
174 0.08
175 0.09
176 0.1
177 0.11
178 0.11
179 0.13
180 0.14
181 0.14
182 0.16
183 0.16
184 0.17
185 0.17
186 0.17
187 0.17
188 0.2
189 0.25
190 0.25
191 0.23
192 0.22
193 0.26
194 0.25
195 0.24
196 0.23
197 0.19
198 0.17
199 0.16
200 0.16
201 0.11
202 0.12
203 0.14
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.1
208 0.12
209 0.13
210 0.19
211 0.21
212 0.28
213 0.28
214 0.33
215 0.33
216 0.32
217 0.32
218 0.33
219 0.3
220 0.27
221 0.28
222 0.27
223 0.26
224 0.25
225 0.25
226 0.16
227 0.15
228 0.11
229 0.09
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.11
240 0.17
241 0.17
242 0.18
243 0.23
244 0.24
245 0.3
246 0.38
247 0.38
248 0.36
249 0.37
250 0.39
251 0.37
252 0.41
253 0.37
254 0.29
255 0.22
256 0.2
257 0.17
258 0.15
259 0.14
260 0.09
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.16
273 0.19
274 0.2
275 0.22
276 0.24
277 0.23
278 0.27
279 0.28
280 0.27
281 0.27
282 0.27
283 0.25
284 0.24
285 0.24
286 0.2
287 0.21
288 0.19
289 0.19
290 0.2
291 0.18
292 0.19
293 0.25
294 0.28
295 0.31
296 0.32
297 0.36
298 0.43
299 0.54
300 0.61
301 0.65
302 0.72
303 0.77
304 0.86
305 0.88
306 0.89
307 0.87
308 0.84
309 0.76
310 0.71
311 0.63
312 0.52
313 0.41
314 0.31
315 0.23
316 0.17
317 0.14
318 0.08
319 0.07
320 0.06
321 0.06
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.05
332 0.06
333 0.07
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.1
339 0.11
340 0.11
341 0.17
342 0.16
343 0.19
344 0.2
345 0.2
346 0.2
347 0.2
348 0.23
349 0.18
350 0.18
351 0.18
352 0.17
353 0.16
354 0.16
355 0.15
356 0.1
357 0.08
358 0.07
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.03
366 0.02
367 0.02
368 0.02
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.03
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.06
391 0.06
392 0.09
393 0.09
394 0.11
395 0.12
396 0.12
397 0.12
398 0.1
399 0.11
400 0.08
401 0.09
402 0.09
403 0.09
404 0.1
405 0.1
406 0.1
407 0.09
408 0.09
409 0.08
410 0.06
411 0.06
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.06
416 0.06
417 0.05
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.04
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.04
430 0.04
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.06
435 0.05
436 0.06
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.1
444 0.1
445 0.09
446 0.09
447 0.09
448 0.11
449 0.11
450 0.1
451 0.09
452 0.1
453 0.1
454 0.1
455 0.11
456 0.12
457 0.12
458 0.13
459 0.11
460 0.11
461 0.12
462 0.12
463 0.13
464 0.1
465 0.1
466 0.1
467 0.1
468 0.09
469 0.08
470 0.08
471 0.07
472 0.07
473 0.06
474 0.06
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.06
483 0.07
484 0.09
485 0.11
486 0.12
487 0.14
488 0.15
489 0.16
490 0.17
491 0.2
492 0.2
493 0.21
494 0.2
495 0.21
496 0.2
497 0.19
498 0.19
499 0.18
500 0.21
501 0.22
502 0.23
503 0.24
504 0.29
505 0.37
506 0.44
507 0.46
508 0.47
509 0.53
510 0.55
511 0.56
512 0.61
513 0.56
514 0.49
515 0.49
516 0.52
517 0.53
518 0.55
519 0.54
520 0.52
521 0.55
522 0.58
523 0.61
524 0.54
525 0.46
526 0.45
527 0.52
528 0.47
529 0.47
530 0.44
531 0.36
532 0.38
533 0.37
534 0.32
535 0.26