Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1EFW2

Protein Details
Accession R1EFW2    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-39STTTVEVSKKERKEKKDKKEKKKSRKSKTESSPAADEBasic
45-67DEAPTPSKDSRKRKRTALPEDGEHydrophilic
345-372AEKADGAEKKKKRKKARKWFVNRLGGRDBasic
408-430VHPSRQRQMGKGRREPRKVDARTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-30KKERKEKKDKKEKKKSRKSK
84-98RLAKKGKLDPNTKAS
351-363AEKKKKRKKARKW
417-425GKGRREPRK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG npa:UCRNP2_6601  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MASTTTVEVSKKERKEKKDKKEKKKSRKSKTESSPAADEPTATADEAPTPSKDSRKRKRTALPEDGELEVDITAPEPLSKREQRLAKKGKLDPNTKASKAPKPAATSDNDSSDNEDNERPAAKKDGSKAAAADKKPEKSAHGVWIGNLPWSATRESLRDFFTKHAGIEDSRIARVHMPAPDKAAVANMRVKPHNKGFAYVDFDGPAAVAAAIDASETLMGGRPVLIKNASNFDGRPKKKEGEGEGGLTKLSKTAAVQAGGGKEPSKRVFVGNLSFEVTKEDLVEHYSKCGEVLDVHVATFQDTGKCKGFAWVTFETIDAAAAAVTGYTMIPADDDDDSDEEMEDAEKADGAEKKKKRKKARKWFVNRLGGRDLRVEFAEDASTRYKKRFGKDKEGGNAGADGEEFGEVHPSRQRQMGKGRREPRKVDARTIAPGAALAHAPRSTGAIVESKGKKITFDT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.75
3 0.83
4 0.87
5 0.89
6 0.92
7 0.93
8 0.95
9 0.96
10 0.96
11 0.97
12 0.97
13 0.96
14 0.97
15 0.94
16 0.93
17 0.92
18 0.92
19 0.87
20 0.82
21 0.76
22 0.67
23 0.63
24 0.52
25 0.42
26 0.32
27 0.27
28 0.22
29 0.17
30 0.15
31 0.11
32 0.14
33 0.16
34 0.17
35 0.15
36 0.19
37 0.22
38 0.31
39 0.4
40 0.49
41 0.58
42 0.66
43 0.72
44 0.77
45 0.83
46 0.85
47 0.86
48 0.85
49 0.78
50 0.73
51 0.68
52 0.59
53 0.5
54 0.39
55 0.29
56 0.18
57 0.14
58 0.09
59 0.06
60 0.06
61 0.05
62 0.07
63 0.08
64 0.11
65 0.2
66 0.26
67 0.3
68 0.38
69 0.46
70 0.53
71 0.63
72 0.69
73 0.68
74 0.72
75 0.75
76 0.76
77 0.77
78 0.75
79 0.7
80 0.7
81 0.7
82 0.62
83 0.62
84 0.59
85 0.58
86 0.59
87 0.59
88 0.55
89 0.52
90 0.55
91 0.52
92 0.5
93 0.49
94 0.44
95 0.41
96 0.38
97 0.33
98 0.33
99 0.31
100 0.28
101 0.24
102 0.22
103 0.19
104 0.19
105 0.21
106 0.18
107 0.17
108 0.21
109 0.22
110 0.25
111 0.29
112 0.36
113 0.35
114 0.35
115 0.34
116 0.38
117 0.42
118 0.38
119 0.42
120 0.39
121 0.4
122 0.42
123 0.42
124 0.36
125 0.35
126 0.38
127 0.36
128 0.36
129 0.33
130 0.3
131 0.33
132 0.3
133 0.25
134 0.22
135 0.16
136 0.12
137 0.13
138 0.14
139 0.12
140 0.13
141 0.14
142 0.17
143 0.2
144 0.21
145 0.21
146 0.22
147 0.22
148 0.25
149 0.24
150 0.21
151 0.2
152 0.18
153 0.17
154 0.18
155 0.2
156 0.17
157 0.17
158 0.17
159 0.16
160 0.15
161 0.16
162 0.17
163 0.18
164 0.19
165 0.19
166 0.22
167 0.23
168 0.21
169 0.19
170 0.19
171 0.16
172 0.15
173 0.21
174 0.21
175 0.23
176 0.27
177 0.28
178 0.31
179 0.34
180 0.4
181 0.34
182 0.34
183 0.33
184 0.33
185 0.37
186 0.33
187 0.29
188 0.21
189 0.2
190 0.17
191 0.14
192 0.11
193 0.05
194 0.04
195 0.03
196 0.02
197 0.02
198 0.02
199 0.02
200 0.02
201 0.02
202 0.02
203 0.02
204 0.02
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.04
209 0.06
210 0.06
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.13
216 0.14
217 0.14
218 0.14
219 0.21
220 0.3
221 0.3
222 0.34
223 0.35
224 0.35
225 0.38
226 0.42
227 0.38
228 0.36
229 0.36
230 0.34
231 0.3
232 0.28
233 0.25
234 0.2
235 0.15
236 0.08
237 0.07
238 0.05
239 0.05
240 0.1
241 0.12
242 0.12
243 0.13
244 0.14
245 0.15
246 0.15
247 0.15
248 0.11
249 0.1
250 0.13
251 0.14
252 0.15
253 0.14
254 0.15
255 0.18
256 0.2
257 0.23
258 0.21
259 0.2
260 0.2
261 0.19
262 0.18
263 0.18
264 0.15
265 0.11
266 0.1
267 0.09
268 0.08
269 0.11
270 0.13
271 0.11
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.11
277 0.09
278 0.07
279 0.1
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.13
284 0.12
285 0.12
286 0.13
287 0.11
288 0.11
289 0.12
290 0.16
291 0.17
292 0.18
293 0.18
294 0.21
295 0.23
296 0.21
297 0.25
298 0.23
299 0.23
300 0.22
301 0.22
302 0.19
303 0.16
304 0.14
305 0.08
306 0.06
307 0.04
308 0.04
309 0.03
310 0.03
311 0.02
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.04
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.08
323 0.08
324 0.09
325 0.09
326 0.09
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.09
336 0.14
337 0.18
338 0.28
339 0.34
340 0.45
341 0.53
342 0.63
343 0.71
344 0.78
345 0.85
346 0.87
347 0.92
348 0.92
349 0.94
350 0.96
351 0.95
352 0.94
353 0.85
354 0.79
355 0.75
356 0.66
357 0.57
358 0.5
359 0.41
360 0.33
361 0.31
362 0.28
363 0.2
364 0.19
365 0.2
366 0.15
367 0.17
368 0.2
369 0.24
370 0.24
371 0.26
372 0.34
373 0.37
374 0.46
375 0.54
376 0.57
377 0.64
378 0.7
379 0.75
380 0.75
381 0.73
382 0.65
383 0.55
384 0.47
385 0.36
386 0.29
387 0.2
388 0.12
389 0.08
390 0.08
391 0.06
392 0.06
393 0.12
394 0.12
395 0.15
396 0.2
397 0.22
398 0.24
399 0.31
400 0.35
401 0.36
402 0.47
403 0.54
404 0.59
405 0.67
406 0.75
407 0.78
408 0.83
409 0.81
410 0.8
411 0.81
412 0.76
413 0.74
414 0.72
415 0.66
416 0.63
417 0.59
418 0.5
419 0.39
420 0.35
421 0.27
422 0.2
423 0.17
424 0.13
425 0.14
426 0.14
427 0.14
428 0.14
429 0.15
430 0.14
431 0.13
432 0.15
433 0.16
434 0.17
435 0.26
436 0.29
437 0.31
438 0.35
439 0.35