Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1ETE4

Protein Details
Accession R1ETE4    Localization Confidence Low Confidence Score 6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-54TSPEDPPKDKPHRPTLFRQTFNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 14, cyto 8, cyto_nucl 6.5, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008928  6-hairpin_glycosidase_sf  
IPR012341  6hp_glycosidase-like_sf  
IPR035396  Bac_rhamnosid6H  
IPR013737  Bac_rhamnosid_N  
IPR008979  Galactose-bd-like_sf  
IPR008902  Rhamnosid_concanavalin  
Gene Ontology GO:0030596  F:alpha-L-rhamnosidase activity  
GO:0005975  P:carbohydrate metabolic process  
KEGG npa:UCRNP2_2176  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05592  Bac_rhamnosid  
PF17389  Bac_rhamnosid6H  
PF08531  Bac_rhamnosid_N  
Amino Acid Sequences MAKPAAGIPRKGIGANVEAGLLQRSDWAANFITSPEDPPKDKPHRPTLFRQTFNAKSLANARARLYITSLGVYEAHINGRRVGDLQMTPGWTSYRHRLQYQVYDVTSLLQEGENAIGVEVAEGWYAGRLRWGEGVRNFYGDRLGVLAQLEIQLDDGSRQQVISDDGWRTHQSSLPARLLDFPKIDLILPDVPPVRVTETLEPREIFKSKSGKTLVDFGQNLVGKIFIRSLQKPDGHTLKIRHAEVLENGELGTRPLRNARAEDTVVFSKQPLKDWSPRFTFHGFRYVQIEGWSLDDEAPPAKGNISALVMHSDMQRTGHFHCSNDLVNKLHQNVVWSMRGNFLSIPTDCPQRDERLGWTGDIQVFSPTASYLYSSGGLLANWLQDVAAEQADAGGIVPLVVPDVLSGTTWPSVPQAVWDDAAILVPWTLYRWTGDAAVLRRQLPSMRAHLDAAVRRGPDGLWDAALWQLGDWLDPAAPPREPGLARTDGTLVADAYLVRVTDTVAQVCAAVGEHALAARYRADHARLRAVFAAKYVAPSGLLVGDTQTALALALCFSLHDGGDEQVRVAADRLARLVRYSKFRVSTGFAGTPLVLAALSGAGHVQLAYRQKDEDGVWVGSGSHQKESAYEPPGQWPPKAMYTQFKEGLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.22
4 0.18
5 0.16
6 0.16
7 0.16
8 0.13
9 0.1
10 0.09
11 0.1
12 0.11
13 0.11
14 0.14
15 0.14
16 0.15
17 0.15
18 0.14
19 0.17
20 0.16
21 0.2
22 0.24
23 0.28
24 0.3
25 0.35
26 0.45
27 0.51
28 0.59
29 0.63
30 0.67
31 0.72
32 0.76
33 0.8
34 0.81
35 0.81
36 0.77
37 0.74
38 0.72
39 0.67
40 0.64
41 0.58
42 0.46
43 0.4
44 0.42
45 0.45
46 0.4
47 0.38
48 0.37
49 0.39
50 0.4
51 0.37
52 0.34
53 0.29
54 0.26
55 0.23
56 0.22
57 0.17
58 0.16
59 0.16
60 0.15
61 0.13
62 0.17
63 0.2
64 0.21
65 0.23
66 0.24
67 0.24
68 0.23
69 0.23
70 0.23
71 0.19
72 0.22
73 0.21
74 0.22
75 0.21
76 0.21
77 0.2
78 0.18
79 0.22
80 0.27
81 0.34
82 0.37
83 0.39
84 0.44
85 0.49
86 0.56
87 0.57
88 0.54
89 0.45
90 0.42
91 0.39
92 0.35
93 0.29
94 0.2
95 0.14
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.1
115 0.1
116 0.12
117 0.18
118 0.2
119 0.25
120 0.29
121 0.35
122 0.32
123 0.35
124 0.33
125 0.28
126 0.28
127 0.2
128 0.17
129 0.12
130 0.12
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.12
149 0.12
150 0.15
151 0.16
152 0.17
153 0.2
154 0.22
155 0.22
156 0.21
157 0.22
158 0.24
159 0.28
160 0.34
161 0.34
162 0.33
163 0.31
164 0.36
165 0.35
166 0.33
167 0.28
168 0.22
169 0.2
170 0.2
171 0.19
172 0.14
173 0.15
174 0.15
175 0.14
176 0.16
177 0.16
178 0.16
179 0.16
180 0.17
181 0.16
182 0.14
183 0.17
184 0.21
185 0.28
186 0.3
187 0.33
188 0.32
189 0.31
190 0.34
191 0.32
192 0.27
193 0.26
194 0.31
195 0.3
196 0.37
197 0.37
198 0.35
199 0.35
200 0.4
201 0.35
202 0.34
203 0.33
204 0.26
205 0.3
206 0.28
207 0.27
208 0.2
209 0.19
210 0.12
211 0.13
212 0.13
213 0.11
214 0.15
215 0.17
216 0.21
217 0.27
218 0.3
219 0.31
220 0.36
221 0.37
222 0.35
223 0.38
224 0.36
225 0.37
226 0.4
227 0.39
228 0.34
229 0.3
230 0.29
231 0.26
232 0.27
233 0.2
234 0.14
235 0.14
236 0.13
237 0.12
238 0.11
239 0.11
240 0.07
241 0.08
242 0.11
243 0.15
244 0.16
245 0.18
246 0.21
247 0.23
248 0.24
249 0.23
250 0.24
251 0.22
252 0.21
253 0.19
254 0.16
255 0.17
256 0.17
257 0.2
258 0.21
259 0.24
260 0.32
261 0.37
262 0.42
263 0.41
264 0.41
265 0.42
266 0.41
267 0.4
268 0.33
269 0.37
270 0.32
271 0.29
272 0.31
273 0.27
274 0.24
275 0.21
276 0.21
277 0.12
278 0.13
279 0.12
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.11
305 0.19
306 0.19
307 0.19
308 0.2
309 0.22
310 0.23
311 0.23
312 0.23
313 0.16
314 0.16
315 0.19
316 0.18
317 0.17
318 0.16
319 0.16
320 0.16
321 0.18
322 0.18
323 0.16
324 0.16
325 0.17
326 0.16
327 0.15
328 0.13
329 0.12
330 0.12
331 0.12
332 0.15
333 0.14
334 0.19
335 0.18
336 0.21
337 0.22
338 0.23
339 0.25
340 0.22
341 0.23
342 0.23
343 0.23
344 0.2
345 0.19
346 0.18
347 0.17
348 0.16
349 0.14
350 0.1
351 0.09
352 0.09
353 0.08
354 0.06
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.06
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.04
371 0.04
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.03
381 0.02
382 0.02
383 0.02
384 0.02
385 0.02
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.02
390 0.03
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.05
395 0.06
396 0.06
397 0.07
398 0.07
399 0.08
400 0.07
401 0.09
402 0.11
403 0.12
404 0.12
405 0.12
406 0.11
407 0.1
408 0.11
409 0.08
410 0.05
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.05
416 0.05
417 0.06
418 0.07
419 0.08
420 0.09
421 0.1
422 0.14
423 0.16
424 0.2
425 0.22
426 0.22
427 0.21
428 0.22
429 0.22
430 0.22
431 0.23
432 0.23
433 0.24
434 0.25
435 0.25
436 0.26
437 0.28
438 0.28
439 0.27
440 0.24
441 0.22
442 0.2
443 0.2
444 0.18
445 0.16
446 0.16
447 0.14
448 0.11
449 0.11
450 0.11
451 0.11
452 0.12
453 0.09
454 0.06
455 0.07
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.09
463 0.09
464 0.1
465 0.1
466 0.12
467 0.16
468 0.16
469 0.18
470 0.21
471 0.23
472 0.23
473 0.23
474 0.23
475 0.18
476 0.19
477 0.18
478 0.12
479 0.08
480 0.09
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.06
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.1
489 0.11
490 0.11
491 0.11
492 0.11
493 0.11
494 0.11
495 0.1
496 0.07
497 0.05
498 0.05
499 0.04
500 0.04
501 0.05
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.07
506 0.08
507 0.11
508 0.14
509 0.19
510 0.24
511 0.27
512 0.36
513 0.35
514 0.37
515 0.39
516 0.38
517 0.33
518 0.28
519 0.29
520 0.19
521 0.21
522 0.18
523 0.14
524 0.12
525 0.12
526 0.12
527 0.09
528 0.09
529 0.07
530 0.07
531 0.08
532 0.07
533 0.07
534 0.06
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.04
540 0.04
541 0.04
542 0.05
543 0.05
544 0.07
545 0.06
546 0.07
547 0.08
548 0.09
549 0.12
550 0.12
551 0.12
552 0.12
553 0.13
554 0.12
555 0.12
556 0.14
557 0.13
558 0.14
559 0.17
560 0.17
561 0.17
562 0.2
563 0.25
564 0.28
565 0.34
566 0.38
567 0.43
568 0.44
569 0.45
570 0.46
571 0.45
572 0.44
573 0.43
574 0.39
575 0.32
576 0.3
577 0.28
578 0.24
579 0.18
580 0.14
581 0.07
582 0.05
583 0.05
584 0.04
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.05
591 0.05
592 0.09
593 0.17
594 0.2
595 0.22
596 0.23
597 0.24
598 0.27
599 0.28
600 0.29
601 0.27
602 0.24
603 0.23
604 0.22
605 0.22
606 0.22
607 0.27
608 0.23
609 0.21
610 0.21
611 0.21
612 0.23
613 0.29
614 0.32
615 0.29
616 0.31
617 0.3
618 0.37
619 0.45
620 0.46
621 0.41
622 0.39
623 0.4
624 0.42
625 0.47
626 0.44
627 0.45
628 0.49
629 0.57