FuNGI

R1GM17

Protein Details

Accession

R1GM17

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
35-64	RRLCIFKGIYPREPRNRKKANKSASHSTTF	Hydrophilic
595-623	SGEANQKKKGEARKRKAKKDKAEEEELER	Basic
627-665	MMSRSKRKLLEKMTYSNKKKDEQAEKLRSKRRKIEKNKA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
51-52	RK
600-665	QKKKGEARKRKAKKDKAEEEELERQKMMMSRSKRKLLEKMTYSNKKKDEQAEKLRSKRRKIEKNKA

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001357 BRCT_dom IPR036420 BRCT_dom_sf IPR010613 PES
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005654 C:nucleoplasm GO:0030687 C:preribosome, large subunit precursor GO:0043021 F:ribonucleoprotein complex binding GO:0000466 P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000463 P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
KEGG	npa:UCRNP2_6254 -
Pfam	View protein in Pfam PF06732 Pescadillo_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50172 BRCT
CDD	cd17709 BRCT_pescadillo_like

Amino Acid Sequences

MTKRKEKKGQSGAAKNYITRTQAVRKLQISLPDFRRLCIFKGIYPREPRNRKKANKSASHSTTFYYTRDIQYLLHEPLLNKFRDHKALAKKISRALGRGEVGDAARLEKNLTPRMTLDHIIKERYPTFVDALRDLDDCLSMLFLFANLPSTTAVPAKTIALCKRLTLEFEHYLITSHSLRKSFLSIKGIYYQATIQGQDILWLVPYKFVQRVTNDVDFRIMGTFVEFYTTLLGFVNFRLYNSLGLVYPPKFNKESDDQGGELGAFTLQGKGIGEQPAIEAAPATNGDTKASKAAQAAADKVAKLAEPDAEMADAEEVDEESKPSDAIDKFEATGEDADELPQPQASSSEAAALFEKFTFYLSRETPREPLEFILKAFGCKRVGWDPVLGDGAFTTNEADPAITHQIVDRPNVPVPTLPESEQTGSEANASQRLRPGTRVPGRTYVQPQWVWDCANQGKLLRPDLYAPGATLPPHLSPWVKAKKGEYDPTKSLEEQEREGEAEEAEEESEEESEEAAPKKVKENLLLDMSDEVEAGEGMDVAGSEDDDSEEDEDENEEEEDAGEEEVDSDLSDSEAARIQHQRELEAEAKGKPFTSGEANQKKKGEARKRKAKKDKAEEEELERQKMMMSRSKRKLLEKMTYSNKKKDEQAEKLRSKRRKIEKNKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.76
2	0.67
3	0.61
4	0.56
5	0.48
6	0.42
7	0.41
8	0.41
9	0.47
10	0.52
11	0.55
12	0.52
13	0.55
14	0.54
15	0.56
16	0.51
17	0.52
18	0.5
19	0.52
20	0.51
21	0.46
22	0.51
23	0.45
24	0.43
25	0.44
26	0.41
27	0.36
28	0.47
29	0.53
30	0.54
31	0.61
32	0.68
33	0.69
34	0.78
35	0.82
36	0.82
37	0.86
38	0.88
39	0.89
40	0.9
41	0.89
42	0.89
43	0.88
44	0.87
45	0.83
46	0.78
47	0.68
48	0.6
49	0.55
50	0.47
51	0.4
52	0.36
53	0.33
54	0.3
55	0.31
56	0.3
57	0.25
58	0.29
59	0.33
60	0.29
61	0.28
62	0.28
63	0.26
64	0.33
65	0.39
66	0.34
67	0.3
68	0.34
69	0.37
70	0.42
71	0.45
72	0.45
73	0.5
74	0.58
75	0.65
76	0.65
77	0.64
78	0.63
79	0.67
80	0.61
81	0.52
82	0.48
83	0.45
84	0.4
85	0.36
86	0.31
87	0.27
88	0.24
89	0.24
90	0.19
91	0.15
92	0.15
93	0.14
94	0.16
95	0.16
96	0.22
97	0.27
98	0.27
99	0.26
100	0.26
101	0.31
102	0.33
103	0.33
104	0.31
105	0.33
106	0.35
107	0.37
108	0.37
109	0.38
110	0.35
111	0.34
112	0.33
113	0.26
114	0.25
115	0.26
116	0.27
117	0.24
118	0.25
119	0.23
120	0.22
121	0.2
122	0.18
123	0.14
124	0.11
125	0.1
126	0.08
127	0.06
128	0.06
129	0.05
130	0.05
131	0.05
132	0.05
133	0.08
134	0.07
135	0.08
136	0.09
137	0.1
138	0.11
139	0.13
140	0.13
141	0.11
142	0.12
143	0.13
144	0.14
145	0.19
146	0.21
147	0.24
148	0.24
149	0.24
150	0.27
151	0.26
152	0.26
153	0.25
154	0.28
155	0.26
156	0.27
157	0.27
158	0.23
159	0.22
160	0.21
161	0.2
162	0.16
163	0.17
164	0.2
165	0.2
166	0.21
167	0.22
168	0.27
169	0.28
170	0.31
171	0.32
172	0.3
173	0.31
174	0.34
175	0.33
176	0.28
177	0.25
178	0.2
179	0.18
180	0.18
181	0.16
182	0.12
183	0.13
184	0.12
185	0.12
186	0.12
187	0.09
188	0.08
189	0.09
190	0.09
191	0.09
192	0.1
193	0.12
194	0.14
195	0.16
196	0.2
197	0.2
198	0.26
199	0.3
200	0.36
201	0.34
202	0.32
203	0.3
204	0.26
205	0.25
206	0.2
207	0.14
208	0.07
209	0.07
210	0.07
211	0.06
212	0.08
213	0.07
214	0.07
215	0.09
216	0.09
217	0.08
218	0.08
219	0.08
220	0.07
221	0.07
222	0.12
223	0.1
224	0.1
225	0.12
226	0.13
227	0.13
228	0.13
229	0.14
230	0.09
231	0.1
232	0.13
233	0.12
234	0.16
235	0.16
236	0.2
237	0.2
238	0.2
239	0.24
240	0.26
241	0.3
242	0.3
243	0.31
244	0.27
245	0.26
246	0.25
247	0.2
248	0.15
249	0.09
250	0.06
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.05
257	0.05
258	0.08
259	0.09
260	0.09
261	0.09
262	0.09
263	0.09
264	0.09
265	0.08
266	0.05
267	0.04
268	0.05
269	0.05
270	0.06
271	0.07
272	0.08
273	0.09
274	0.09
275	0.1
276	0.12
277	0.12
278	0.12
279	0.11
280	0.13
281	0.15
282	0.15
283	0.16
284	0.16
285	0.17
286	0.15
287	0.15
288	0.13
289	0.1
290	0.09
291	0.08
292	0.06
293	0.06
294	0.07
295	0.07
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.05
300	0.04
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.03
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.09
312	0.09
313	0.11
314	0.13
315	0.13
316	0.13
317	0.14
318	0.14
319	0.1
320	0.09
321	0.08
322	0.07
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.07
327	0.06
328	0.06
329	0.06
330	0.05
331	0.06
332	0.06
333	0.07
334	0.06
335	0.09
336	0.09
337	0.09
338	0.1
339	0.09
340	0.09
341	0.08
342	0.08
343	0.05
344	0.06
345	0.06
346	0.07
347	0.11
348	0.12
349	0.18
350	0.2
351	0.22
352	0.24
353	0.26
354	0.25
355	0.22
356	0.22
357	0.21
358	0.19
359	0.17
360	0.19
361	0.16
362	0.17
363	0.17
364	0.19
365	0.17
366	0.16
367	0.2
368	0.19
369	0.22
370	0.21
371	0.22
372	0.18
373	0.18
374	0.19
375	0.15
376	0.11
377	0.09
378	0.08
379	0.07
380	0.06
381	0.06
382	0.05
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.05
387	0.08
388	0.11
389	0.09
390	0.09
391	0.1
392	0.14
393	0.15
394	0.17
395	0.16
396	0.16
397	0.18
398	0.18
399	0.18
400	0.15
401	0.17
402	0.21
403	0.21
404	0.19
405	0.19
406	0.21
407	0.21
408	0.2
409	0.18
410	0.14
411	0.12
412	0.12
413	0.12
414	0.1
415	0.16
416	0.16
417	0.15
418	0.19
419	0.22
420	0.22
421	0.24
422	0.27
423	0.31
424	0.38
425	0.42
426	0.42
427	0.46
428	0.46
429	0.49
430	0.5
431	0.45
432	0.44
433	0.4
434	0.38
435	0.34
436	0.34
437	0.31
438	0.25
439	0.27
440	0.22
441	0.23
442	0.23
443	0.21
444	0.25
445	0.26
446	0.29
447	0.24
448	0.23
449	0.23
450	0.24
451	0.24
452	0.19
453	0.16
454	0.15
455	0.14
456	0.14
457	0.13
458	0.13
459	0.11
460	0.12
461	0.14
462	0.13
463	0.15
464	0.25
465	0.32
466	0.33
467	0.35
468	0.37
469	0.44
470	0.49
471	0.56
472	0.53
473	0.51
474	0.52
475	0.53
476	0.53
477	0.44
478	0.42
479	0.41
480	0.37
481	0.32
482	0.31
483	0.29
484	0.26
485	0.27
486	0.22
487	0.14
488	0.12
489	0.1
490	0.08
491	0.07
492	0.06
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.06
497	0.05
498	0.05
499	0.06
500	0.09
501	0.1
502	0.12
503	0.15
504	0.16
505	0.2
506	0.26
507	0.28
508	0.32
509	0.34
510	0.36
511	0.37
512	0.36
513	0.32
514	0.27
515	0.25
516	0.18
517	0.15
518	0.1
519	0.06
520	0.06
521	0.05
522	0.04
523	0.04
524	0.03
525	0.03
526	0.03
527	0.04
528	0.04
529	0.04
530	0.04
531	0.04
532	0.05
533	0.05
534	0.06
535	0.07
536	0.08
537	0.08
538	0.08
539	0.09
540	0.09
541	0.09
542	0.09
543	0.08
544	0.07
545	0.07
546	0.08
547	0.07
548	0.07
549	0.06
550	0.05
551	0.06
552	0.06
553	0.06
554	0.05
555	0.05
556	0.05
557	0.05
558	0.06
559	0.05
560	0.06
561	0.1
562	0.11
563	0.15
564	0.21
565	0.23
566	0.26
567	0.27
568	0.28
569	0.25
570	0.31
571	0.29
572	0.28
573	0.29
574	0.28
575	0.3
576	0.29
577	0.28
578	0.23
579	0.21
580	0.19
581	0.24
582	0.27
583	0.36
584	0.46
585	0.52
586	0.56
587	0.58
588	0.59
589	0.59
590	0.63
591	0.63
592	0.64
593	0.69
594	0.74
595	0.83
596	0.9
597	0.94
598	0.94
599	0.94
600	0.94
601	0.93
602	0.9
603	0.89
604	0.81
605	0.78
606	0.78
607	0.71
608	0.62
609	0.51
610	0.43
611	0.37
612	0.37
613	0.34
614	0.33
615	0.38
616	0.46
617	0.55
618	0.64
619	0.67
620	0.71
621	0.76
622	0.76
623	0.77
624	0.73
625	0.74
626	0.76
627	0.8
628	0.8
629	0.79
630	0.76
631	0.71
632	0.72
633	0.73
634	0.72
635	0.72
636	0.76
637	0.78
638	0.82
639	0.86
640	0.89
641	0.87
642	0.87
643	0.86
644	0.86
645	0.86

R1GM17

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer