Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1ESN3

Protein Details
Accession R1ESN3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
142-164DTGGRRAAPKKKRQTDAEKNEPIHydrophilic
399-418IVQRTFIRPKRKAGRGPMGVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-154GRRAAPKKKR
Subcellular Location(s) mito 10, cyto 9, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007133  RNA_pol_II-assoc_Paf1  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG npa:UCRNP2_2401  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03985  Paf1  
Amino Acid Sequences MASGGRVYHQDYIARIRYSNALPPPPNPPKLLEIPNTGLASGQYTSAGFASRLAREQPLNVEADAELGMPIDLVGLPAVFEGDDSVLLAPDNPIPLHPHDRALLRPLSTLGKPSSIAGGVSFLRRTEYMTAAGGGGHGGLRDTGGRRAAPKKKRQTDAEKNEPINILRSILKGFDIAHPEDAYKGQDTVQNLRAEEITPEERRAWDNPKHPTNPSLKLVDSYPVLPDLDAITETGGYIVAKFQTNPIANQGAAYDDRVDVSILRVLEPTAEQEEAYRQRLAEHEAEAEGGVRAPPQRDYDYEFFLPASGEAVRGIKRKFSATDPERDDEELYDYVNPETGKRCFRFDRVRFYETYQQAGNPQEPYEDTVAVALHDPELDVGAVPGERSRLQKGAYYYPIVQRTFIRPKRKAGRGPMGVMSQGGEEAENRVDVLEIEVRDLDEREAAVKSEFREKLETEVEGVDLDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.35
3 0.32
4 0.36
5 0.36
6 0.41
7 0.4
8 0.42
9 0.42
10 0.45
11 0.53
12 0.56
13 0.57
14 0.52
15 0.48
16 0.46
17 0.51
18 0.55
19 0.5
20 0.47
21 0.47
22 0.5
23 0.47
24 0.4
25 0.33
26 0.26
27 0.24
28 0.18
29 0.14
30 0.1
31 0.09
32 0.1
33 0.11
34 0.11
35 0.09
36 0.12
37 0.15
38 0.17
39 0.19
40 0.21
41 0.24
42 0.24
43 0.27
44 0.28
45 0.27
46 0.27
47 0.24
48 0.22
49 0.18
50 0.18
51 0.16
52 0.11
53 0.08
54 0.06
55 0.06
56 0.05
57 0.05
58 0.04
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.04
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.09
79 0.08
80 0.09
81 0.13
82 0.18
83 0.24
84 0.24
85 0.26
86 0.28
87 0.3
88 0.31
89 0.33
90 0.31
91 0.26
92 0.25
93 0.25
94 0.25
95 0.24
96 0.26
97 0.22
98 0.2
99 0.2
100 0.19
101 0.19
102 0.15
103 0.15
104 0.11
105 0.12
106 0.11
107 0.13
108 0.13
109 0.11
110 0.13
111 0.13
112 0.15
113 0.15
114 0.16
115 0.16
116 0.16
117 0.16
118 0.14
119 0.14
120 0.11
121 0.08
122 0.06
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.06
129 0.08
130 0.11
131 0.13
132 0.14
133 0.19
134 0.29
135 0.38
136 0.45
137 0.54
138 0.63
139 0.69
140 0.75
141 0.79
142 0.81
143 0.82
144 0.83
145 0.83
146 0.79
147 0.71
148 0.66
149 0.58
150 0.48
151 0.4
152 0.3
153 0.22
154 0.16
155 0.16
156 0.14
157 0.13
158 0.13
159 0.11
160 0.12
161 0.13
162 0.16
163 0.16
164 0.17
165 0.16
166 0.16
167 0.16
168 0.16
169 0.14
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.12
174 0.14
175 0.17
176 0.22
177 0.23
178 0.22
179 0.22
180 0.22
181 0.2
182 0.18
183 0.17
184 0.16
185 0.15
186 0.16
187 0.16
188 0.17
189 0.19
190 0.22
191 0.25
192 0.28
193 0.34
194 0.4
195 0.46
196 0.48
197 0.47
198 0.5
199 0.49
200 0.47
201 0.43
202 0.38
203 0.31
204 0.29
205 0.28
206 0.24
207 0.19
208 0.14
209 0.11
210 0.1
211 0.1
212 0.08
213 0.08
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.03
224 0.03
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.12
231 0.13
232 0.14
233 0.16
234 0.16
235 0.16
236 0.16
237 0.15
238 0.11
239 0.1
240 0.1
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.06
247 0.06
248 0.08
249 0.07
250 0.08
251 0.08
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.08
260 0.13
261 0.16
262 0.18
263 0.17
264 0.16
265 0.16
266 0.18
267 0.21
268 0.18
269 0.16
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.13
274 0.12
275 0.08
276 0.06
277 0.05
278 0.06
279 0.07
280 0.08
281 0.1
282 0.13
283 0.16
284 0.17
285 0.23
286 0.25
287 0.28
288 0.28
289 0.26
290 0.22
291 0.2
292 0.19
293 0.12
294 0.11
295 0.06
296 0.06
297 0.07
298 0.09
299 0.12
300 0.16
301 0.17
302 0.19
303 0.21
304 0.23
305 0.25
306 0.27
307 0.35
308 0.34
309 0.43
310 0.44
311 0.45
312 0.43
313 0.42
314 0.38
315 0.28
316 0.27
317 0.19
318 0.15
319 0.13
320 0.13
321 0.11
322 0.13
323 0.13
324 0.11
325 0.15
326 0.19
327 0.26
328 0.27
329 0.33
330 0.35
331 0.43
332 0.52
333 0.54
334 0.61
335 0.6
336 0.62
337 0.57
338 0.59
339 0.6
340 0.51
341 0.48
342 0.37
343 0.31
344 0.32
345 0.33
346 0.3
347 0.22
348 0.21
349 0.19
350 0.19
351 0.21
352 0.19
353 0.16
354 0.14
355 0.13
356 0.13
357 0.12
358 0.12
359 0.09
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.08
373 0.11
374 0.14
375 0.18
376 0.21
377 0.22
378 0.27
379 0.31
380 0.36
381 0.37
382 0.38
383 0.38
384 0.42
385 0.47
386 0.43
387 0.41
388 0.37
389 0.42
390 0.48
391 0.53
392 0.57
393 0.55
394 0.65
395 0.73
396 0.79
397 0.79
398 0.78
399 0.81
400 0.76
401 0.75
402 0.69
403 0.61
404 0.52
405 0.43
406 0.33
407 0.23
408 0.17
409 0.13
410 0.09
411 0.07
412 0.09
413 0.1
414 0.09
415 0.09
416 0.09
417 0.09
418 0.09
419 0.11
420 0.14
421 0.13
422 0.14
423 0.15
424 0.16
425 0.17
426 0.18
427 0.15
428 0.12
429 0.12
430 0.13
431 0.13
432 0.14
433 0.15
434 0.17
435 0.19
436 0.27
437 0.29
438 0.3
439 0.34
440 0.34
441 0.38
442 0.39
443 0.37
444 0.29
445 0.28
446 0.25