FuNGI

R1GRF8

Protein Details

Accession

R1GRF8

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
23-60	NGSAPPGLRRPPKPKANPLVQPKKKRIGSKPAGQPGAK	Hydrophilic
448-471	AELKKKLEKSLRKKIVKREKNYNY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
28-62	PGLRRPPKPKANPLVQPKKKRIGSKPAGQPGAKPP
451-465	KKKLEKSLRKKIVKR
500-515	RKREEEKAAAEKGKGK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	npa:UCRNP2_2389 -

Amino Acid Sequences

MSASPAGPPGSTPTGARTSNTPNGSAPPGLRRPPKPKANPLVQPKKKRIGSKPAGQPGAKPPGPSSNGQAQQPKPAPSSNLYEEFKPPPGLETQVKTTPVFTTKRALLEGLRHHIIKFQSKHPIDPTDQAEFTRPIRLHRRDAALGASGAGADSGGEGEENDEEVKERLRIEALKEERRRNREEIQAQIAPKAKGRTFVDNKKKIQQVYERNDTPQSIKASRLRYEETLPWHLEDFDNKNTWVGAYEAALSDCHVMMFNEPQVNPQTGQVTERYRMVPIEKWYKFSAKDKAVTMSVEDIEKQEKGGFALSRWALQPQGTKKSAVPKWMREKEAEKELKKMAEDSAMRSKGLFLRSAGRGDEEEVKARRPDDDDWMKNDAAPDADVIDYDEKEDFADDEEGVNGLFEGDEETTKDAEDRIKREQLSANFFANKDDTDVWKQEEEEALEAELKKKLEKSLRKKIVKREKNYNYDVDDSDENPYSEESDSEDSEAERQKEEERKREEEKAAAEKGKGKAGETTEKTTSGTSTKGSNTPSNRPKTTDPLKTSSQALKRPGSPNLSEQSGNESSRKKQKKFGGSAGSDSDATDSGKPLASRVKPSAGSQAPTPGGSRAAHTAAASFGPPPSVEEIRAIIPPEGASMSRLISKFKGRFKQGSESQHQFIANVKAAGQYDKASKMIFRKP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.31
3	0.32
4	0.31
5	0.35
6	0.42
7	0.43
8	0.4
9	0.35
10	0.38
11	0.41
12	0.38
13	0.33
14	0.34
15	0.39
16	0.45
17	0.52
18	0.58
19	0.63
20	0.7
21	0.78
22	0.79
23	0.82
24	0.84
25	0.85
26	0.85
27	0.87
28	0.88
29	0.87
30	0.88
31	0.86
32	0.86
33	0.84
34	0.84
35	0.82
36	0.82
37	0.81
38	0.81
39	0.82
40	0.81
41	0.81
42	0.72
43	0.67
44	0.64
45	0.65
46	0.57
47	0.48
48	0.41
49	0.43
50	0.47
51	0.44
52	0.41
53	0.41
54	0.44
55	0.48
56	0.54
57	0.46
58	0.52
59	0.56
60	0.54
61	0.48
62	0.46
63	0.45
64	0.4
65	0.46
66	0.42
67	0.44
68	0.42
69	0.41
70	0.43
71	0.42
72	0.42
73	0.37
74	0.31
75	0.25
76	0.26
77	0.29
78	0.3
79	0.3
80	0.33
81	0.35
82	0.38
83	0.36
84	0.34
85	0.32
86	0.34
87	0.33
88	0.29
89	0.31
90	0.32
91	0.34
92	0.34
93	0.32
94	0.28
95	0.32
96	0.37
97	0.37
98	0.36
99	0.34
100	0.33
101	0.36
102	0.38
103	0.4
104	0.38
105	0.38
106	0.46
107	0.46
108	0.51
109	0.51
110	0.53
111	0.47
112	0.49
113	0.47
114	0.41
115	0.4
116	0.37
117	0.35
118	0.32
119	0.3
120	0.31
121	0.28
122	0.3
123	0.39
124	0.45
125	0.48
126	0.51
127	0.56
128	0.5
129	0.51
130	0.46
131	0.38
132	0.32
133	0.25
134	0.18
135	0.12
136	0.1
137	0.08
138	0.05
139	0.03
140	0.03
141	0.03
142	0.03
143	0.03
144	0.03
145	0.04
146	0.04
147	0.05
148	0.06
149	0.06
150	0.07
151	0.08
152	0.09
153	0.1
154	0.1
155	0.11
156	0.14
157	0.16
158	0.18
159	0.27
160	0.32
161	0.4
162	0.47
163	0.56
164	0.62
165	0.66
166	0.68
167	0.65
168	0.64
169	0.64
170	0.63
171	0.59
172	0.57
173	0.55
174	0.5
175	0.48
176	0.46
177	0.37
178	0.35
179	0.35
180	0.29
181	0.32
182	0.34
183	0.4
184	0.44
185	0.54
186	0.61
187	0.65
188	0.68
189	0.68
190	0.7
191	0.61
192	0.6
193	0.59
194	0.59
195	0.58
196	0.63
197	0.57
198	0.54
199	0.54
200	0.49
201	0.41
202	0.36
203	0.33
204	0.26
205	0.3
206	0.33
207	0.37
208	0.4
209	0.41
210	0.39
211	0.36
212	0.39
213	0.37
214	0.37
215	0.37
216	0.33
217	0.3
218	0.27
219	0.26
220	0.22
221	0.23
222	0.22
223	0.21
224	0.22
225	0.21
226	0.2
227	0.2
228	0.19
229	0.15
230	0.11
231	0.08
232	0.07
233	0.07
234	0.07
235	0.08
236	0.08
237	0.07
238	0.07
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.05
243	0.06
244	0.08
245	0.1
246	0.12
247	0.13
248	0.14
249	0.16
250	0.18
251	0.17
252	0.17
253	0.17
254	0.14
255	0.15
256	0.18
257	0.18
258	0.18
259	0.2
260	0.19
261	0.18
262	0.19
263	0.2
264	0.2
265	0.22
266	0.31
267	0.3
268	0.32
269	0.34
270	0.36
271	0.37
272	0.38
273	0.4
274	0.35
275	0.37
276	0.35
277	0.35
278	0.33
279	0.3
280	0.25
281	0.19
282	0.15
283	0.12
284	0.11
285	0.1
286	0.1
287	0.1
288	0.09
289	0.08
290	0.08
291	0.08
292	0.1
293	0.1
294	0.08
295	0.13
296	0.13
297	0.14
298	0.14
299	0.14
300	0.12
301	0.13
302	0.19
303	0.19
304	0.25
305	0.25
306	0.26
307	0.27
308	0.36
309	0.36
310	0.4
311	0.4
312	0.41
313	0.51
314	0.55
315	0.55
316	0.5
317	0.51
318	0.47
319	0.52
320	0.51
321	0.41
322	0.39
323	0.39
324	0.37
325	0.33
326	0.3
327	0.21
328	0.19
329	0.19
330	0.19
331	0.25
332	0.24
333	0.24
334	0.23
335	0.23
336	0.21
337	0.22
338	0.19
339	0.12
340	0.16
341	0.18
342	0.19
343	0.18
344	0.15
345	0.14
346	0.15
347	0.19
348	0.15
349	0.19
350	0.18
351	0.2
352	0.2
353	0.2
354	0.2
355	0.18
356	0.19
357	0.23
358	0.3
359	0.31
360	0.33
361	0.36
362	0.35
363	0.32
364	0.31
365	0.23
366	0.15
367	0.12
368	0.09
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.07
374	0.06
375	0.07
376	0.07
377	0.06
378	0.06
379	0.07
380	0.06
381	0.06
382	0.07
383	0.06
384	0.06
385	0.07
386	0.07
387	0.06
388	0.06
389	0.04
390	0.03
391	0.03
392	0.02
393	0.03
394	0.04
395	0.04
396	0.05
397	0.07
398	0.07
399	0.07
400	0.07
401	0.07
402	0.13
403	0.17
404	0.2
405	0.25
406	0.3
407	0.3
408	0.33
409	0.37
410	0.36
411	0.39
412	0.38
413	0.35
414	0.32
415	0.32
416	0.3
417	0.26
418	0.21
419	0.16
420	0.15
421	0.16
422	0.18
423	0.2
424	0.21
425	0.21
426	0.21
427	0.19
428	0.2
429	0.17
430	0.14
431	0.12
432	0.11
433	0.12
434	0.12
435	0.12
436	0.13
437	0.13
438	0.13
439	0.15
440	0.21
441	0.28
442	0.38
443	0.46
444	0.55
445	0.65
446	0.73
447	0.77
448	0.82
449	0.84
450	0.84
451	0.81
452	0.81
453	0.8
454	0.79
455	0.77
456	0.7
457	0.62
458	0.56
459	0.49
460	0.41
461	0.33
462	0.26
463	0.25
464	0.22
465	0.18
466	0.16
467	0.15
468	0.13
469	0.12
470	0.11
471	0.11
472	0.12
473	0.12
474	0.13
475	0.13
476	0.12
477	0.15
478	0.2
479	0.18
480	0.16
481	0.17
482	0.23
483	0.31
484	0.38
485	0.43
486	0.45
487	0.51
488	0.55
489	0.61
490	0.58
491	0.54
492	0.52
493	0.5
494	0.49
495	0.44
496	0.41
497	0.4
498	0.39
499	0.39
500	0.34
501	0.28
502	0.27
503	0.29
504	0.37
505	0.34
506	0.38
507	0.35
508	0.35
509	0.35
510	0.31
511	0.28
512	0.21
513	0.19
514	0.15
515	0.17
516	0.19
517	0.22
518	0.26
519	0.31
520	0.35
521	0.43
522	0.51
523	0.56
524	0.55
525	0.57
526	0.57
527	0.59
528	0.63
529	0.62
530	0.59
531	0.56
532	0.58
533	0.55
534	0.55
535	0.54
536	0.52
537	0.48
538	0.49
539	0.48
540	0.51
541	0.53
542	0.55
543	0.52
544	0.48
545	0.48
546	0.45
547	0.44
548	0.37
549	0.33
550	0.35
551	0.33
552	0.33
553	0.32
554	0.31
555	0.35
556	0.46
557	0.55
558	0.51
559	0.56
560	0.63
561	0.69
562	0.73
563	0.75
564	0.75
565	0.67
566	0.67
567	0.61
568	0.54
569	0.43
570	0.35
571	0.27
572	0.18
573	0.17
574	0.14
575	0.13
576	0.12
577	0.15
578	0.15
579	0.16
580	0.24
581	0.26
582	0.32
583	0.35
584	0.4
585	0.39
586	0.41
587	0.48
588	0.44
589	0.42
590	0.36
591	0.39
592	0.34
593	0.33
594	0.32
595	0.24
596	0.24
597	0.22
598	0.23
599	0.2
600	0.21
601	0.21
602	0.2
603	0.19
604	0.17
605	0.17
606	0.15
607	0.12
608	0.1
609	0.1
610	0.1
611	0.12
612	0.16
613	0.18
614	0.18
615	0.19
616	0.21
617	0.22
618	0.23
619	0.23
620	0.18
621	0.17
622	0.16
623	0.15
624	0.15
625	0.13
626	0.13
627	0.12
628	0.13
629	0.18
630	0.19
631	0.21
632	0.24
633	0.33
634	0.39
635	0.48
636	0.56
637	0.58
638	0.65
639	0.67
640	0.73
641	0.72
642	0.74
643	0.73
644	0.7
645	0.65
646	0.61
647	0.55
648	0.45
649	0.42
650	0.39
651	0.34
652	0.28
653	0.26
654	0.26
655	0.27
656	0.29
657	0.26
658	0.23
659	0.24
660	0.26
661	0.27
662	0.25
663	0.29

R1GRF8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer