FuNGI

R1GEM0

Protein Details

Accession

R1GEM0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
41-62	MADKKVSKRMNARQMQKQKDVD	Hydrophilic
129-158	AVFSRKGSKVVRERRQQRERQQQAKESTNM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, pero 7, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011709 DEAD-box_helicase_OB_fold IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR002464 DNA/RNA_helicase_DEAH_CS IPR007502 Helicase-assoc_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR036457 PPM-type-like_dom_sf IPR001932 PPM-type_phosphatase-like_dom
Gene Ontology	GO:1990904 C:ribonucleoprotein complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0004386 F:helicase activity GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003676 F:nucleic acid binding
KEGG	npa:UCRNP2_3204 -
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF04408 HA2 PF00271 Helicase_C PF07717 OB_NTP_bind
PROSITE	View protein in PROSITE PS00690 DEAH_ATP_HELICASE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER PS51746 PPM_2
CDD	cd18791 SF2_C_RHA

Amino Acid Sequences

MALDRDWYGGEEYGGHSLGDETHNPFGEDSTWLDKQREAAMADKKVSKRMNARQMQKQKDVDAWETNRMLTSGVAQRRDFSGDFEDDDEGTRIHLLVHDLKPPFLDGRKVFTKQLDPVSAVKDPQSDMAVFSRKGSKVVRERRQQRERQQQAKESTNMAGTALGNIMGVKDDDGDSAAPAAPGLPEEPKKGGSQFSEHLKKSEGQSAFSKSKSLREQREYLPAFAVREELLRVIRDNQVIIVVGQTGSGKTTQLTQFLHEDGYGKFGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMEVKLGGLVGYAIRFEDCTSNDTVIKYMTDGVLLRESLVQPDLDKYSVIIMDEAHERALNTDVLMGLIKKVLSRRKDLKLIVTSATMNAERFSRFYGGAPEFFIPGRTFPVDIQFSRSPCEDYVDSAVRQVLAIHVSQGPGDILVFMTGQEDIECTCELVDERLKQLVDPPKLSILPIYSQMPADLQAKIFEKAAPGVRKVIVATNIAETSLTVDGIMYVVDSGFSKLKVYNPRMGMDTLQITPISQANASQRAGRAGRTGPGKCFHLYTERAFKEEFYVQTIPEIQRTNLSNTVLLLKSLGVKDLLDFDFMDPPPQETISTSLFDLWALGALDNLGELTPLGRTMTAFPMDPPLAKLIITAVEYGCSEEMLTIVSMLSVPNVFYRPKERLEEADAAREKFCVPESDHLTLLHVYSQWKANRYSDGWCIKHFLHPKALRRGKEIREQLEDIMKQQKMTLTSCGTDWDIIRKCICSGYYHQAAQVKGIGEYINLRTSVTVQLHPTSALHGLGILPDYVIYHELILTSREYMSYVTAVDPHWLADLGGVFYSIKEKGYSARDKRVTEIEFNKKAELEAKMAEDKEREAQRVAKEQQARTAVRRPTTALLRRRPSPAKHSATSPPTLVIRLHPAAAAAAAWQQPRAYAHSAAAREPKTGSGTTTPVPDEAAAVRARSKSPFYFEAGYALYAKRPSRPFPPPFLSYPSGSFSDPLSTHNRSRDRRSFVNGEMIRGITNGDDAVLVTDNFIGANDGVGAWAARERGHAALWSRLILHFWALEAEKDGYGFGRGEPNPVEYLHSAFEQTKQATSDPNEWHGTTTACSALLGADPGDPPHPILYVTQLGDSQVLVLRPRDREVVYKTAEQWHWFDCPRQLGTNSPDTPRENAVLDRVQIEEDDVVLAMSDGVVDNLWEHEVLENVVDSMHKWENGEADFSDGEKKDEKSYADGMQYVAQELVKAARTIAEDPFAESPYMEKAVDEGLSIEGGKLDDISVVAAICKRRKS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.14
3	0.12
4	0.12
5	0.13
6	0.15
7	0.17
8	0.18
9	0.22
10	0.23
11	0.24
12	0.23
13	0.22
14	0.2
15	0.2
16	0.19
17	0.22
18	0.26
19	0.28
20	0.29
21	0.29
22	0.31
23	0.33
24	0.34
25	0.29
26	0.32
27	0.37
28	0.41
29	0.44
30	0.49
31	0.47
32	0.51
33	0.53
34	0.54
35	0.56
36	0.61
37	0.67
38	0.69
39	0.75
40	0.78
41	0.84
42	0.85
43	0.83
44	0.77
45	0.7
46	0.66
47	0.63
48	0.58
49	0.57
50	0.52
51	0.5
52	0.46
53	0.43
54	0.38
55	0.33
56	0.28
57	0.19
58	0.22
59	0.23
60	0.28
61	0.33
62	0.33
63	0.34
64	0.36
65	0.41
66	0.35
67	0.3
68	0.3
69	0.27
70	0.28
71	0.28
72	0.27
73	0.22
74	0.24
75	0.21
76	0.15
77	0.14
78	0.12
79	0.11
80	0.1
81	0.11
82	0.13
83	0.2
84	0.23
85	0.29
86	0.29
87	0.3
88	0.3
89	0.31
90	0.31
91	0.27
92	0.33
93	0.28
94	0.35
95	0.42
96	0.44
97	0.45
98	0.46
99	0.48
100	0.46
101	0.51
102	0.47
103	0.42
104	0.42
105	0.43
106	0.4
107	0.35
108	0.31
109	0.27
110	0.25
111	0.24
112	0.23
113	0.19
114	0.19
115	0.24
116	0.27
117	0.25
118	0.27
119	0.32
120	0.3
121	0.35
122	0.37
123	0.4
124	0.46
125	0.56
126	0.63
127	0.67
128	0.76
129	0.82
130	0.89
131	0.89
132	0.89
133	0.9
134	0.91
135	0.89
136	0.88
137	0.86
138	0.83
139	0.8
140	0.72
141	0.63
142	0.55
143	0.46
144	0.38
145	0.29
146	0.23
147	0.16
148	0.14
149	0.11
150	0.09
151	0.08
152	0.07
153	0.07
154	0.06
155	0.06
156	0.06
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.09
161	0.09
162	0.08
163	0.09
164	0.09
165	0.08
166	0.07
167	0.07
168	0.06
169	0.07
170	0.08
171	0.13
172	0.15
173	0.18
174	0.21
175	0.22
176	0.25
177	0.26
178	0.29
179	0.26
180	0.29
181	0.31
182	0.39
183	0.46
184	0.44
185	0.44
186	0.43
187	0.43
188	0.41
189	0.45
190	0.36
191	0.31
192	0.35
193	0.4
194	0.41
195	0.39
196	0.4
197	0.33
198	0.4
199	0.46
200	0.51
201	0.53
202	0.56
203	0.61
204	0.6
205	0.7
206	0.64
207	0.55
208	0.49
209	0.42
210	0.36
211	0.3
212	0.27
213	0.17
214	0.15
215	0.15
216	0.13
217	0.13
218	0.13
219	0.15
220	0.17
221	0.21
222	0.21
223	0.2
224	0.18
225	0.17
226	0.16
227	0.15
228	0.12
229	0.08
230	0.07
231	0.07
232	0.08
233	0.07
234	0.07
235	0.08
236	0.08
237	0.07
238	0.13
239	0.15
240	0.2
241	0.2
242	0.22
243	0.24
244	0.25
245	0.25
246	0.19
247	0.19
248	0.14
249	0.17
250	0.14
251	0.11
252	0.11
253	0.12
254	0.13
255	0.12
256	0.16
257	0.17
258	0.23
259	0.25
260	0.26
261	0.26
262	0.27
263	0.27
264	0.25
265	0.26
266	0.3
267	0.32
268	0.36
269	0.36
270	0.33
271	0.32
272	0.31
273	0.27
274	0.22
275	0.21
276	0.16
277	0.18
278	0.18
279	0.18
280	0.17
281	0.15
282	0.1
283	0.08
284	0.06
285	0.04
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.07
292	0.1
293	0.11
294	0.13
295	0.15
296	0.17
297	0.18
298	0.18
299	0.18
300	0.15
301	0.14
302	0.12
303	0.12
304	0.1
305	0.1
306	0.1
307	0.11
308	0.12
309	0.11
310	0.11
311	0.12
312	0.12
313	0.12
314	0.13
315	0.11
316	0.1
317	0.12
318	0.13
319	0.12
320	0.12
321	0.1
322	0.11
323	0.12
324	0.11
325	0.09
326	0.08
327	0.09
328	0.11
329	0.11
330	0.1
331	0.1
332	0.1
333	0.1
334	0.12
335	0.1
336	0.08
337	0.08
338	0.08
339	0.08
340	0.08
341	0.07
342	0.06
343	0.07
344	0.07
345	0.08
346	0.14
347	0.21
348	0.25
349	0.33
350	0.41
351	0.46
352	0.53
353	0.54
354	0.56
355	0.54
356	0.52
357	0.45
358	0.39
359	0.33
360	0.26
361	0.26
362	0.19
363	0.14
364	0.12
365	0.13
366	0.12
367	0.12
368	0.14
369	0.13
370	0.13
371	0.14
372	0.2
373	0.21
374	0.21
375	0.22
376	0.2
377	0.19
378	0.18
379	0.19
380	0.13
381	0.11
382	0.14
383	0.13
384	0.13
385	0.13
386	0.19
387	0.21
388	0.21
389	0.27
390	0.27
391	0.27
392	0.28
393	0.29
394	0.25
395	0.21
396	0.26
397	0.19
398	0.18
399	0.22
400	0.23
401	0.22
402	0.2
403	0.2
404	0.16
405	0.15
406	0.13
407	0.09
408	0.08
409	0.07
410	0.08
411	0.09
412	0.09
413	0.09
414	0.09
415	0.08
416	0.06
417	0.06
418	0.05
419	0.04
420	0.04
421	0.04
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.05
428	0.04
429	0.06
430	0.06
431	0.06
432	0.05
433	0.06
434	0.06
435	0.09
436	0.13
437	0.12
438	0.14
439	0.16
440	0.16
441	0.16
442	0.23
443	0.28
444	0.28
445	0.28
446	0.28
447	0.28
448	0.28
449	0.28
450	0.23
451	0.16
452	0.13
453	0.15
454	0.15
455	0.13
456	0.13
457	0.13
458	0.12
459	0.13
460	0.13
461	0.11
462	0.1
463	0.12
464	0.14
465	0.14
466	0.15
467	0.13
468	0.12
469	0.14
470	0.2
471	0.2
472	0.19
473	0.21
474	0.21
475	0.21
476	0.21
477	0.2
478	0.16
479	0.15
480	0.15
481	0.14
482	0.13
483	0.13
484	0.12
485	0.09
486	0.09
487	0.08
488	0.07
489	0.05
490	0.05
491	0.05
492	0.05
493	0.05
494	0.03
495	0.02
496	0.02
497	0.03
498	0.03
499	0.05
500	0.06
501	0.06
502	0.07
503	0.08
504	0.14
505	0.23
506	0.26
507	0.31
508	0.33
509	0.34
510	0.35
511	0.34
512	0.3
513	0.23
514	0.21
515	0.15
516	0.14
517	0.12
518	0.1
519	0.1
520	0.11
521	0.09
522	0.07
523	0.09
524	0.11
525	0.15
526	0.16
527	0.16
528	0.16
529	0.19
530	0.2
531	0.18
532	0.18
533	0.15
534	0.19
535	0.24
536	0.25
537	0.23
538	0.25
539	0.27
540	0.25
541	0.25
542	0.22
543	0.22
544	0.23
545	0.24
546	0.31
547	0.29
548	0.3
549	0.29
550	0.28
551	0.26
552	0.26
553	0.23
554	0.18
555	0.18
556	0.17
557	0.17
558	0.2
559	0.17
560	0.18
561	0.18
562	0.14
563	0.17
564	0.19
565	0.21
566	0.21
567	0.21
568	0.17
569	0.17
570	0.2
571	0.16
572	0.14
573	0.11
574	0.08
575	0.1
576	0.1
577	0.1
578	0.07
579	0.07
580	0.07
581	0.1
582	0.1
583	0.09
584	0.09
585	0.09
586	0.13
587	0.13
588	0.15
589	0.11
590	0.12
591	0.12
592	0.12
593	0.12
594	0.08
595	0.12
596	0.11
597	0.12
598	0.11
599	0.1
600	0.1
601	0.1
602	0.09
603	0.06
604	0.05
605	0.04
606	0.04
607	0.04
608	0.04
609	0.03
610	0.03
611	0.03
612	0.02
613	0.02
614	0.02
615	0.02
616	0.02
617	0.03
618	0.03
619	0.03
620	0.04
621	0.05
622	0.07
623	0.08
624	0.08
625	0.08
626	0.11
627	0.12
628	0.11
629	0.11
630	0.1
631	0.09
632	0.09
633	0.09
634	0.06
635	0.07
636	0.07
637	0.07
638	0.06
639	0.06
640	0.06
641	0.07
642	0.06
643	0.05
644	0.04
645	0.04
646	0.04
647	0.04
648	0.03
649	0.03
650	0.03
651	0.03
652	0.03
653	0.03
654	0.03
655	0.03
656	0.04
657	0.04
658	0.06
659	0.07
660	0.08
661	0.12
662	0.15
663	0.18
664	0.21
665	0.22
666	0.23
667	0.27
668	0.32
669	0.28
670	0.32
671	0.31
672	0.29
673	0.28
674	0.25
675	0.21
676	0.16
677	0.16
678	0.11
679	0.12
680	0.17
681	0.22
682	0.23
683	0.24
684	0.23
685	0.23
686	0.2
687	0.19
688	0.13
689	0.1
690	0.09
691	0.09
692	0.15
693	0.16
694	0.19
695	0.2
696	0.21
697	0.23
698	0.24
699	0.26
700	0.28
701	0.33
702	0.32
703	0.3
704	0.32
705	0.29
706	0.34
707	0.37
708	0.32
709	0.34
710	0.38
711	0.45
712	0.53
713	0.58
714	0.53
715	0.54
716	0.59
717	0.54
718	0.57
719	0.56
720	0.49
721	0.47
722	0.47
723	0.42
724	0.39
725	0.35
726	0.28
727	0.29
728	0.25
729	0.21
730	0.2
731	0.21
732	0.19
733	0.2
734	0.21
735	0.16
736	0.17
737	0.17
738	0.17
739	0.16
740	0.15
741	0.13
742	0.17
743	0.18
744	0.19
745	0.19
746	0.18
747	0.18
748	0.19
749	0.19
750	0.15
751	0.18
752	0.23
753	0.26
754	0.26
755	0.28
756	0.3
757	0.29
758	0.27
759	0.24
760	0.18
761	0.14
762	0.14
763	0.12
764	0.08
765	0.1
766	0.11
767	0.1
768	0.1
769	0.1
770	0.09
771	0.11
772	0.15
773	0.15
774	0.15
775	0.15
776	0.16
777	0.17
778	0.17
779	0.16
780	0.13
781	0.12
782	0.1
783	0.08
784	0.07
785	0.06
786	0.06
787	0.07
788	0.05
789	0.04
790	0.04
791	0.04
792	0.04
793	0.05
794	0.05
795	0.05
796	0.05
797	0.05
798	0.06
799	0.07
800	0.07
801	0.07
802	0.07
803	0.07
804	0.07
805	0.08
806	0.08
807	0.07
808	0.07
809	0.07
810	0.08
811	0.08
812	0.09
813	0.08
814	0.08
815	0.08
816	0.07
817	0.07
818	0.06
819	0.07
820	0.06
821	0.06
822	0.06
823	0.05
824	0.05
825	0.07
826	0.07
827	0.07
828	0.07
829	0.08
830	0.12
831	0.2
832	0.29
833	0.32
834	0.41
835	0.47
836	0.47
837	0.5
838	0.52
839	0.47
840	0.44
841	0.48
842	0.48
843	0.47
844	0.47
845	0.46
846	0.39
847	0.37
848	0.34
849	0.28
850	0.2
851	0.16
852	0.18
853	0.2
854	0.2
855	0.21
856	0.18
857	0.17
858	0.22
859	0.23
860	0.22
861	0.22
862	0.26
863	0.28
864	0.36
865	0.37
866	0.37
867	0.41
868	0.4
869	0.44
870	0.46
871	0.45
872	0.4
873	0.46
874	0.44
875	0.4
876	0.41
877	0.37
878	0.35
879	0.42
880	0.46
881	0.46
882	0.51
883	0.54
884	0.56
885	0.61
886	0.63
887	0.59
888	0.59
889	0.61
890	0.58
891	0.55
892	0.56
893	0.56
894	0.53
895	0.5
896	0.43
897	0.34
898	0.28
899	0.28
900	0.24
901	0.18
902	0.2
903	0.19
904	0.18
905	0.16
906	0.15
907	0.14
908	0.13
909	0.11
910	0.06
911	0.08
912	0.1
913	0.1
914	0.1
915	0.1
916	0.12
917	0.13
918	0.17
919	0.18
920	0.16
921	0.19
922	0.23
923	0.24
924	0.26
925	0.32
926	0.29
927	0.26
928	0.26
929	0.25
930	0.23
931	0.23
932	0.22
933	0.18
934	0.2
935	0.2
936	0.22
937	0.21
938	0.17
939	0.18
940	0.15
941	0.13
942	0.11
943	0.13
944	0.11
945	0.11
946	0.14
947	0.15
948	0.17
949	0.18
950	0.22
951	0.21
952	0.26
953	0.28
954	0.29
955	0.3
956	0.29
957	0.29
958	0.25
959	0.24
960	0.2
961	0.18
962	0.16
963	0.18
964	0.19
965	0.23
966	0.26
967	0.29
968	0.36
969	0.45
970	0.49
971	0.53
972	0.58
973	0.55
974	0.54
975	0.57
976	0.52
977	0.44
978	0.41
979	0.36
980	0.31
981	0.27
982	0.25
983	0.19
984	0.21
985	0.19
986	0.2
987	0.24
988	0.26
989	0.3
990	0.38
991	0.47
992	0.48
993	0.57
994	0.62
995	0.63
996	0.63
997	0.66
998	0.63
999	0.56
1000	0.61
1001	0.52
1002	0.46
1003	0.39
1004	0.35
1005	0.28
1006	0.22
1007	0.2
1008	0.09
1009	0.09
1010	0.07
1011	0.06
1012	0.05
1013	0.05
1014	0.06
1015	0.07
1016	0.06
1017	0.06
1018	0.06
1019	0.06
1020	0.06
1021	0.06
1022	0.06
1023	0.05
1024	0.05
1025	0.05
1026	0.05
1027	0.05
1028	0.05
1029	0.05
1030	0.04
1031	0.06
1032	0.06
1033	0.06
1034	0.08
1035	0.1
1036	0.11
1037	0.12
1038	0.15
1039	0.16
1040	0.2
1041	0.21
1042	0.2
1043	0.2
1044	0.19
1045	0.19
1046	0.16
1047	0.15
1048	0.1
1049	0.1
1050	0.12
1051	0.11
1052	0.11
1053	0.13
1054	0.14
1055	0.12
1056	0.12
1057	0.12
1058	0.1
1059	0.11
1060	0.11
1061	0.1
1062	0.17
1063	0.17
1064	0.2
1065	0.21
1066	0.23
1067	0.23
1068	0.23
1069	0.25
1070	0.18
1071	0.2
1072	0.18
1073	0.17
1074	0.17
1075	0.17
1076	0.2
1077	0.22
1078	0.22
1079	0.22
1080	0.22
1081	0.23
1082	0.27
1083	0.3
1084	0.34
1085	0.32
1086	0.36
1087	0.37
1088	0.35
1089	0.36
1090	0.32
1091	0.29
1092	0.22
1093	0.2
1094	0.16
1095	0.13
1096	0.13
1097	0.11
1098	0.1
1099	0.09
1100	0.09
1101	0.07
1102	0.08
1103	0.08
1104	0.09
1105	0.11
1106	0.1
1107	0.11
1108	0.11
1109	0.11
1110	0.11
1111	0.11
1112	0.15
1113	0.18
1114	0.18
1115	0.18
1116	0.17
1117	0.18
1118	0.17
1119	0.16
1120	0.13
1121	0.11
1122	0.12
1123	0.13
1124	0.17
1125	0.21
1126	0.23
1127	0.26
1128	0.29
1129	0.29
1130	0.34
1131	0.38
1132	0.42
1133	0.41
1134	0.43
1135	0.43
1136	0.47
1137	0.48
1138	0.44
1139	0.41
1140	0.35
1141	0.37
1142	0.35
1143	0.36
1144	0.34
1145	0.37
1146	0.37
1147	0.39
1148	0.38
1149	0.39
1150	0.43
1151	0.48
1152	0.46
1153	0.43
1154	0.45
1155	0.43
1156	0.45
1157	0.41
1158	0.38
1159	0.31
1160	0.29
1161	0.31
1162	0.29
1163	0.27
1164	0.25
1165	0.23
1166	0.21
1167	0.19
1168	0.19
1169	0.13
1170	0.1
1171	0.09
1172	0.08
1173	0.07
1174	0.06
1175	0.06
1176	0.04
1177	0.04
1178	0.04
1179	0.04
1180	0.04
1181	0.04
1182	0.04
1183	0.05
1184	0.06
1185	0.07
1186	0.07
1187	0.07
1188	0.07
1189	0.09
1190	0.09
1191	0.09
1192	0.08
1193	0.08
1194	0.08
1195	0.08
1196	0.08
1197	0.12
1198	0.15
1199	0.16
1200	0.17
1201	0.18
1202	0.22
1203	0.23
1204	0.25
1205	0.2
1206	0.2
1207	0.19
1208	0.19
1209	0.25
1210	0.21
1211	0.22
1212	0.24
1213	0.26
1214	0.27
1215	0.31
1216	0.33
1217	0.31
1218	0.35
1219	0.36
1220	0.35
1221	0.34
1222	0.3
1223	0.3
1224	0.28
1225	0.24
1226	0.21
1227	0.16
1228	0.14
1229	0.13
1230	0.16
1231	0.14
1232	0.14
1233	0.13
1234	0.15
1235	0.18
1236	0.2
1237	0.21
1238	0.22
1239	0.2
1240	0.23
1241	0.25
1242	0.24
1243	0.21
1244	0.19
1245	0.18
1246	0.18
1247	0.2
1248	0.17
1249	0.14
1250	0.14
1251	0.16
1252	0.16
1253	0.15
1254	0.12
1255	0.1
1256	0.11
1257	0.11
1258	0.1
1259	0.09
1260	0.09
1261	0.09
1262	0.08
1263	0.07
1264	0.07
1265	0.07
1266	0.08
1267	0.07
1268	0.07
1269	0.09
1270	0.12
1271	0.19

R1GEM0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer