Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1E7L3

Protein Details
Accession R1E7L3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
268-337LDTANRKDSKKGNNDRRNDKKPKGPNPNWTDKQKQRYKDRLYITYSSDKHFSPKYPENPRNKKEEKQSSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
274-292KDSKKGNNDRRNDKKPKGP
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
KEGG npa:UCRNP2_9884  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MAPGSQMEVDPAEGHVQDAQGLAQPAQQTEPTRAELVQLIEELKAQNARLIAHTTKRSATKVKVAAPEKFDGDRKKLQSFLLQMQRYLQFNQAQFDSPAEAVLFASTYLRGTVEAWMEPYLRDHLANEGTPDQRRSKTKEIFDTYEGFVKNLRATFNDRDEVRKASNDIITIRQIGSVAIYATKFQQLAAYLEWSDETFRDLFYKGLKDDVKKHMVTYNYPATFQKMVDLASQIDGRMYEWKMGSRTANTSKPRRERTTLEGGDAIALDTANRKDSKKGNNDRRNDKKPKGPNPNWTDKQKQRYKDRLYITYSSDKHFSPKYPENPRNKKEEKQSSSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.12
4 0.11
5 0.11
6 0.1
7 0.11
8 0.13
9 0.12
10 0.13
11 0.14
12 0.15
13 0.16
14 0.2
15 0.19
16 0.23
17 0.26
18 0.27
19 0.27
20 0.26
21 0.26
22 0.25
23 0.24
24 0.2
25 0.18
26 0.16
27 0.14
28 0.16
29 0.14
30 0.13
31 0.14
32 0.13
33 0.14
34 0.15
35 0.15
36 0.16
37 0.21
38 0.23
39 0.28
40 0.32
41 0.33
42 0.36
43 0.39
44 0.42
45 0.43
46 0.44
47 0.46
48 0.48
49 0.52
50 0.56
51 0.57
52 0.57
53 0.54
54 0.52
55 0.46
56 0.43
57 0.43
58 0.4
59 0.41
60 0.44
61 0.45
62 0.45
63 0.45
64 0.43
65 0.43
66 0.42
67 0.44
68 0.46
69 0.42
70 0.39
71 0.4
72 0.42
73 0.38
74 0.35
75 0.31
76 0.27
77 0.28
78 0.3
79 0.27
80 0.25
81 0.24
82 0.23
83 0.19
84 0.14
85 0.13
86 0.11
87 0.09
88 0.08
89 0.07
90 0.06
91 0.04
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.06
98 0.06
99 0.08
100 0.09
101 0.09
102 0.1
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.12
107 0.12
108 0.11
109 0.11
110 0.1
111 0.12
112 0.14
113 0.14
114 0.15
115 0.15
116 0.17
117 0.19
118 0.22
119 0.23
120 0.26
121 0.3
122 0.36
123 0.42
124 0.46
125 0.5
126 0.55
127 0.57
128 0.55
129 0.53
130 0.48
131 0.4
132 0.37
133 0.32
134 0.23
135 0.19
136 0.17
137 0.16
138 0.14
139 0.14
140 0.12
141 0.18
142 0.21
143 0.23
144 0.26
145 0.25
146 0.27
147 0.28
148 0.29
149 0.24
150 0.22
151 0.2
152 0.18
153 0.19
154 0.17
155 0.16
156 0.15
157 0.15
158 0.15
159 0.13
160 0.11
161 0.1
162 0.08
163 0.07
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.1
176 0.1
177 0.11
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.08
183 0.06
184 0.08
185 0.06
186 0.07
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.11
191 0.13
192 0.12
193 0.18
194 0.2
195 0.22
196 0.28
197 0.34
198 0.38
199 0.35
200 0.37
201 0.35
202 0.34
203 0.34
204 0.33
205 0.34
206 0.29
207 0.3
208 0.29
209 0.29
210 0.28
211 0.26
212 0.22
213 0.15
214 0.15
215 0.15
216 0.15
217 0.12
218 0.13
219 0.13
220 0.11
221 0.1
222 0.09
223 0.09
224 0.12
225 0.12
226 0.13
227 0.14
228 0.17
229 0.18
230 0.2
231 0.22
232 0.2
233 0.26
234 0.3
235 0.37
236 0.42
237 0.49
238 0.56
239 0.64
240 0.7
241 0.7
242 0.7
243 0.67
244 0.67
245 0.69
246 0.61
247 0.53
248 0.45
249 0.38
250 0.33
251 0.27
252 0.2
253 0.09
254 0.08
255 0.05
256 0.08
257 0.09
258 0.13
259 0.15
260 0.17
261 0.23
262 0.31
263 0.41
264 0.49
265 0.59
266 0.66
267 0.73
268 0.81
269 0.85
270 0.88
271 0.89
272 0.88
273 0.85
274 0.83
275 0.84
276 0.86
277 0.87
278 0.84
279 0.84
280 0.83
281 0.86
282 0.84
283 0.81
284 0.81
285 0.78
286 0.81
287 0.79
288 0.8
289 0.8
290 0.83
291 0.84
292 0.82
293 0.81
294 0.78
295 0.76
296 0.71
297 0.66
298 0.65
299 0.58
300 0.53
301 0.48
302 0.41
303 0.4
304 0.41
305 0.39
306 0.39
307 0.47
308 0.53
309 0.61
310 0.7
311 0.75
312 0.82
313 0.82
314 0.84
315 0.81
316 0.8
317 0.79
318 0.81