Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1GEN2

Protein Details
Accession R1GEN2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-72GGDSTRPSRERSRNGSRRPSGSRVCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
711-723FKGNEKQKGNKRK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008936  Rho_GTPase_activation_prot  
IPR000198  RhoGAP_dom  
IPR001781  Znf_LIM  
Gene Ontology GO:0005096  F:GTPase activator activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0007165  P:signal transduction  
KEGG npa:UCRNP2_3173  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00412  LIM  
PF00620  RhoGAP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00478  LIM_DOMAIN_1  
PS50023  LIM_DOMAIN_2  
PS50238  RHOGAP  
CDD cd09391  LIM1_Lrg1p_like  
cd09392  LIM2_Lrg1p_like  
cd04397  RhoGAP_fLRG1  
Amino Acid Sequences MAAPAEGPPSRDGLGPPNDAALGPGDAGQNSLQMAADERERSRRLDNGGDSTRPSRERSRNGSRRPSGSRVCGKCGGHLTGQFVRALGDTFHLECFTCHDCDKIVASKFFPVPEQGPNQYPLCETDYFRRLDLLCFSCGGALRGSYITALDRKYHIEHFTCSVCPTVFGAQDSYYEHDGSVYCHFHYSTKFAQRCNGCQTAILKQFVEIFRNGQNQHWHPECYMIHKFWNVRLHTTGQPVVEKALAGEEDTHALRKDVRLEEEKIEERVNWIWKTLSAFEERSATCISDMLLHVSNGAYFDGVLAARRFIVHIDLLFEGADTLDKMLAEQTPKGLSYSREAKLLCKKVVAFFQLLAQSQDTGVRRLGVTQELLSLVTGLAHYLKLLIRICLQGALKLERETGSAQGLSGFMDQINSLESKLEQDTSIDTSGESTALVHRTADTCPICDKPVEDNGALPHTSDDPNLMDYDSNSGHRVSPANSEQAAEPPLLRSDTRSKSYTGHNNEKATPSSYEQTLGDIRRLRSTRLDKHLSNTMKRARTSRIMDGPEGMTIRPGSAGEAHGGNGQGSMTIEQGRDYSENGPLTFGTNGGIALDDIPRLVAAEQAKDQRPNAAKYARDHLVGQEPRPKLVNGHRRDVSGGLELEKAAAGEGHYGKKYFSELTALEYFIVRHVAVLSMEPLLEGHFNQEELLELIENQKRPTFWNKFGKAFKGNEKQKGNKRKGVFGKNLEYVVEKDGAESTDCVGPGTLKVPALVQDAVSAMRTMDMSVEGVFRKNGNIKRLRELTEEIDAKGGDAVDLTRESPVQVAALLKKFLRELPDPVMTFKLHRLFITGAKIPDEDKRRRVLHLTCCLMPKVHRDTMEVLFTFLNWVSSFHTVDEETGSKMDIHNLATVIAPNILYSSTKSPDMDSSFLAIEAVHSLIECNESMCEVPEDLQSILADSSMFDLNAELTTKEILKRVGELGKIPQATIQGPGQLANRNSGSRSSAPVVARIESDPASYQAESSVRHFQRPGQGVGVTGAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.31
3 0.3
4 0.29
5 0.28
6 0.26
7 0.25
8 0.19
9 0.13
10 0.1
11 0.12
12 0.12
13 0.11
14 0.13
15 0.12
16 0.11
17 0.11
18 0.11
19 0.09
20 0.08
21 0.11
22 0.12
23 0.16
24 0.2
25 0.22
26 0.3
27 0.32
28 0.35
29 0.37
30 0.4
31 0.41
32 0.46
33 0.48
34 0.49
35 0.52
36 0.51
37 0.51
38 0.49
39 0.5
40 0.45
41 0.45
42 0.46
43 0.51
44 0.58
45 0.63
46 0.71
47 0.75
48 0.82
49 0.88
50 0.85
51 0.83
52 0.81
53 0.8
54 0.76
55 0.76
56 0.76
57 0.69
58 0.69
59 0.67
60 0.61
61 0.58
62 0.56
63 0.5
64 0.45
65 0.43
66 0.42
67 0.4
68 0.4
69 0.35
70 0.29
71 0.26
72 0.22
73 0.2
74 0.14
75 0.12
76 0.13
77 0.14
78 0.15
79 0.15
80 0.15
81 0.14
82 0.18
83 0.19
84 0.19
85 0.19
86 0.19
87 0.2
88 0.22
89 0.26
90 0.28
91 0.3
92 0.3
93 0.31
94 0.35
95 0.36
96 0.35
97 0.33
98 0.3
99 0.27
100 0.3
101 0.35
102 0.33
103 0.35
104 0.38
105 0.37
106 0.34
107 0.32
108 0.29
109 0.27
110 0.26
111 0.25
112 0.29
113 0.34
114 0.34
115 0.34
116 0.35
117 0.31
118 0.31
119 0.36
120 0.31
121 0.26
122 0.25
123 0.25
124 0.23
125 0.23
126 0.21
127 0.15
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.1
133 0.1
134 0.12
135 0.15
136 0.16
137 0.17
138 0.18
139 0.22
140 0.25
141 0.29
142 0.32
143 0.31
144 0.32
145 0.33
146 0.34
147 0.32
148 0.29
149 0.27
150 0.21
151 0.2
152 0.19
153 0.19
154 0.18
155 0.18
156 0.19
157 0.17
158 0.18
159 0.19
160 0.21
161 0.19
162 0.18
163 0.16
164 0.15
165 0.15
166 0.16
167 0.19
168 0.17
169 0.15
170 0.17
171 0.18
172 0.19
173 0.21
174 0.25
175 0.28
176 0.36
177 0.39
178 0.39
179 0.47
180 0.49
181 0.52
182 0.54
183 0.5
184 0.4
185 0.4
186 0.41
187 0.42
188 0.43
189 0.4
190 0.32
191 0.29
192 0.35
193 0.33
194 0.33
195 0.25
196 0.22
197 0.25
198 0.32
199 0.32
200 0.31
201 0.38
202 0.38
203 0.44
204 0.45
205 0.41
206 0.35
207 0.41
208 0.37
209 0.36
210 0.38
211 0.32
212 0.32
213 0.35
214 0.36
215 0.36
216 0.43
217 0.38
218 0.36
219 0.38
220 0.39
221 0.38
222 0.41
223 0.37
224 0.31
225 0.3
226 0.27
227 0.25
228 0.21
229 0.17
230 0.12
231 0.11
232 0.1
233 0.08
234 0.09
235 0.08
236 0.1
237 0.11
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.12
242 0.14
243 0.2
244 0.21
245 0.26
246 0.29
247 0.32
248 0.35
249 0.39
250 0.39
251 0.34
252 0.32
253 0.26
254 0.24
255 0.25
256 0.28
257 0.23
258 0.22
259 0.21
260 0.21
261 0.24
262 0.24
263 0.22
264 0.2
265 0.21
266 0.21
267 0.25
268 0.24
269 0.23
270 0.22
271 0.19
272 0.15
273 0.15
274 0.14
275 0.12
276 0.12
277 0.13
278 0.13
279 0.12
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.09
284 0.09
285 0.06
286 0.04
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.09
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.05
313 0.06
314 0.08
315 0.09
316 0.09
317 0.11
318 0.11
319 0.12
320 0.13
321 0.13
322 0.13
323 0.17
324 0.24
325 0.24
326 0.27
327 0.27
328 0.32
329 0.4
330 0.44
331 0.39
332 0.35
333 0.35
334 0.34
335 0.38
336 0.34
337 0.26
338 0.2
339 0.22
340 0.22
341 0.22
342 0.2
343 0.16
344 0.13
345 0.12
346 0.16
347 0.14
348 0.13
349 0.13
350 0.13
351 0.13
352 0.14
353 0.15
354 0.12
355 0.12
356 0.1
357 0.11
358 0.1
359 0.1
360 0.09
361 0.08
362 0.06
363 0.05
364 0.05
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.06
371 0.1
372 0.1
373 0.11
374 0.12
375 0.13
376 0.13
377 0.15
378 0.15
379 0.13
380 0.15
381 0.17
382 0.17
383 0.17
384 0.17
385 0.14
386 0.16
387 0.14
388 0.13
389 0.12
390 0.1
391 0.1
392 0.09
393 0.09
394 0.08
395 0.07
396 0.06
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.06
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.06
406 0.07
407 0.08
408 0.09
409 0.08
410 0.08
411 0.09
412 0.11
413 0.11
414 0.1
415 0.09
416 0.09
417 0.09
418 0.08
419 0.07
420 0.05
421 0.06
422 0.08
423 0.08
424 0.07
425 0.08
426 0.09
427 0.09
428 0.15
429 0.14
430 0.14
431 0.16
432 0.17
433 0.17
434 0.16
435 0.17
436 0.14
437 0.19
438 0.2
439 0.18
440 0.18
441 0.18
442 0.2
443 0.18
444 0.15
445 0.11
446 0.1
447 0.11
448 0.1
449 0.1
450 0.09
451 0.09
452 0.1
453 0.09
454 0.07
455 0.07
456 0.09
457 0.09
458 0.09
459 0.1
460 0.1
461 0.1
462 0.11
463 0.12
464 0.11
465 0.15
466 0.16
467 0.18
468 0.17
469 0.18
470 0.17
471 0.17
472 0.17
473 0.12
474 0.1
475 0.08
476 0.08
477 0.09
478 0.09
479 0.11
480 0.18
481 0.22
482 0.25
483 0.26
484 0.27
485 0.28
486 0.34
487 0.4
488 0.4
489 0.45
490 0.45
491 0.46
492 0.46
493 0.46
494 0.41
495 0.34
496 0.28
497 0.21
498 0.18
499 0.17
500 0.16
501 0.14
502 0.15
503 0.16
504 0.15
505 0.16
506 0.18
507 0.19
508 0.24
509 0.25
510 0.24
511 0.29
512 0.36
513 0.4
514 0.44
515 0.49
516 0.44
517 0.46
518 0.53
519 0.49
520 0.43
521 0.43
522 0.42
523 0.41
524 0.41
525 0.41
526 0.37
527 0.4
528 0.42
529 0.41
530 0.4
531 0.38
532 0.37
533 0.35
534 0.31
535 0.25
536 0.21
537 0.15
538 0.1
539 0.08
540 0.08
541 0.07
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.07
546 0.07
547 0.07
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.08
552 0.07
553 0.06
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.05
558 0.06
559 0.06
560 0.07
561 0.07
562 0.08
563 0.08
564 0.1
565 0.1
566 0.12
567 0.13
568 0.13
569 0.13
570 0.12
571 0.13
572 0.12
573 0.1
574 0.07
575 0.06
576 0.06
577 0.05
578 0.05
579 0.04
580 0.05
581 0.05
582 0.04
583 0.04
584 0.04
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.07
589 0.07
590 0.09
591 0.12
592 0.17
593 0.19
594 0.21
595 0.21
596 0.25
597 0.28
598 0.29
599 0.32
600 0.31
601 0.32
602 0.33
603 0.39
604 0.34
605 0.31
606 0.29
607 0.25
608 0.3
609 0.29
610 0.29
611 0.31
612 0.3
613 0.29
614 0.31
615 0.29
616 0.24
617 0.32
618 0.39
619 0.36
620 0.43
621 0.43
622 0.42
623 0.43
624 0.39
625 0.31
626 0.25
627 0.21
628 0.15
629 0.14
630 0.13
631 0.12
632 0.11
633 0.09
634 0.05
635 0.05
636 0.04
637 0.07
638 0.09
639 0.11
640 0.12
641 0.13
642 0.13
643 0.13
644 0.15
645 0.12
646 0.11
647 0.12
648 0.12
649 0.17
650 0.18
651 0.17
652 0.16
653 0.15
654 0.15
655 0.11
656 0.12
657 0.07
658 0.06
659 0.06
660 0.07
661 0.07
662 0.07
663 0.07
664 0.06
665 0.06
666 0.06
667 0.06
668 0.06
669 0.06
670 0.06
671 0.07
672 0.07
673 0.07
674 0.08
675 0.08
676 0.07
677 0.07
678 0.08
679 0.05
680 0.05
681 0.1
682 0.14
683 0.15
684 0.15
685 0.16
686 0.17
687 0.2
688 0.3
689 0.32
690 0.38
691 0.48
692 0.52
693 0.57
694 0.61
695 0.63
696 0.6
697 0.57
698 0.57
699 0.58
700 0.6
701 0.61
702 0.65
703 0.68
704 0.71
705 0.78
706 0.76
707 0.73
708 0.69
709 0.69
710 0.71
711 0.71
712 0.7
713 0.66
714 0.64
715 0.59
716 0.57
717 0.48
718 0.4
719 0.32
720 0.26
721 0.21
722 0.15
723 0.13
724 0.13
725 0.13
726 0.12
727 0.11
728 0.11
729 0.11
730 0.11
731 0.1
732 0.1
733 0.09
734 0.09
735 0.1
736 0.1
737 0.09
738 0.09
739 0.09
740 0.11
741 0.14
742 0.13
743 0.12
744 0.11
745 0.11
746 0.11
747 0.11
748 0.09
749 0.06
750 0.06
751 0.06
752 0.06
753 0.06
754 0.06
755 0.06
756 0.07
757 0.09
758 0.09
759 0.1
760 0.11
761 0.11
762 0.14
763 0.21
764 0.25
765 0.33
766 0.41
767 0.43
768 0.51
769 0.56
770 0.56
771 0.52
772 0.51
773 0.45
774 0.45
775 0.43
776 0.34
777 0.31
778 0.27
779 0.23
780 0.2
781 0.16
782 0.08
783 0.07
784 0.06
785 0.07
786 0.08
787 0.08
788 0.08
789 0.08
790 0.09
791 0.09
792 0.09
793 0.07
794 0.08
795 0.1
796 0.14
797 0.16
798 0.18
799 0.18
800 0.19
801 0.2
802 0.21
803 0.24
804 0.22
805 0.25
806 0.28
807 0.35
808 0.34
809 0.35
810 0.35
811 0.3
812 0.29
813 0.31
814 0.3
815 0.25
816 0.25
817 0.26
818 0.26
819 0.29
820 0.34
821 0.32
822 0.27
823 0.27
824 0.28
825 0.26
826 0.31
827 0.36
828 0.37
829 0.38
830 0.46
831 0.46
832 0.49
833 0.55
834 0.56
835 0.57
836 0.59
837 0.58
838 0.53
839 0.54
840 0.51
841 0.46
842 0.41
843 0.4
844 0.38
845 0.38
846 0.37
847 0.37
848 0.4
849 0.42
850 0.44
851 0.36
852 0.3
853 0.25
854 0.23
855 0.22
856 0.17
857 0.15
858 0.1
859 0.11
860 0.13
861 0.16
862 0.17
863 0.15
864 0.17
865 0.16
866 0.16
867 0.19
868 0.16
869 0.15
870 0.14
871 0.15
872 0.13
873 0.13
874 0.16
875 0.15
876 0.15
877 0.16
878 0.16
879 0.16
880 0.16
881 0.16
882 0.13
883 0.12
884 0.1
885 0.08
886 0.08
887 0.09
888 0.09
889 0.11
890 0.15
891 0.17
892 0.2
893 0.2
894 0.22
895 0.27
896 0.3
897 0.3
898 0.26
899 0.25
900 0.23
901 0.22
902 0.2
903 0.14
904 0.1
905 0.1
906 0.09
907 0.06
908 0.06
909 0.06
910 0.07
911 0.09
912 0.08
913 0.08
914 0.08
915 0.09
916 0.09
917 0.11
918 0.12
919 0.11
920 0.12
921 0.13
922 0.15
923 0.14
924 0.15
925 0.13
926 0.13
927 0.12
928 0.11
929 0.09
930 0.07
931 0.1
932 0.09
933 0.09
934 0.08
935 0.08
936 0.09
937 0.1
938 0.11
939 0.09
940 0.09
941 0.11
942 0.13
943 0.15
944 0.18
945 0.19
946 0.19
947 0.22
948 0.27
949 0.29
950 0.29
951 0.3
952 0.33
953 0.37
954 0.36
955 0.33
956 0.3
957 0.28
958 0.27
959 0.28
960 0.23
961 0.19
962 0.19
963 0.22
964 0.23
965 0.27
966 0.27
967 0.29
968 0.31
969 0.29
970 0.31
971 0.31
972 0.33
973 0.29
974 0.34
975 0.32
976 0.35
977 0.34
978 0.38
979 0.38
980 0.33
981 0.33
982 0.28
983 0.28
984 0.23
985 0.24
986 0.2
987 0.2
988 0.22
989 0.2
990 0.19
991 0.2
992 0.22
993 0.22
994 0.25
995 0.33
996 0.31
997 0.36
998 0.37
999 0.39
1000 0.46
1001 0.5
1002 0.49
1003 0.42
1004 0.4
1005 0.37