Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4S622

Protein Details
Accession F4S622    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
124-151VPTPIKEKKEKLDKKSKSKSKDATKENTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
116-204VKPSAPKVVPTPIKEKKEKLDKKSKSKSKDATKENTPSKKETTKDKKAFGEPLKTKSASPSKPAALSESGKKSKSSKSTNGAKAKPSKK
584-643PGGDRGGRGGGRGGGRGFGGGRGGGGRGGGFGGGRGGGGRGGGFGGGRGGGGRGGGRGGG
Subcellular Location(s) cyto 12, cyto_nucl 10.333, cyto_mito 7.833, nucl 7.5, extr 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034276  Gar2_RRM2  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG mlr:MELLADRAFT_118186  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12447  RRM1_gar2  
cd12448  RRM2_gar2  
Amino Acid Sequences MPYFSQKFNLIQFAEVTSACIHLPQRNLEISKNFQYQPQLIPSDPPSNLILFIPHFFKPSSPLPFSHYLDRLLCDVRTTSSTTPSLQLIVPMGSKSKTAAPVDKKATSSSQPSSKVKPSAPKVVPTPIKEKKEKLDKKSKSKSKDATKENTPSKKETTKDKKAFGEPLKTKSASPSKPAALSESGKKSKSSKSTNGAKAKPSKKPVSESDSDSDDSDSSEPEEKSKASTVKPVKAAKASDSDSDSDDSDDDSEVPAAKPAPAALNGNKTKASTKAAESSEDSDDSDSSEDEDAKAAPTKANAASASTKAAAKDDSSDSDDSDDSDESAPAKTAAAPAPVVAKDASSGSDSDSGSESESDTEMSDPKPETPVAQNGKNKRKGDTEDGSAKKAKTDDASGDIKNLFVGGLSWNVDDDWLKKEFEKFGEVISARVITERGTERSKGFGYVDFASPEDARKAVEAMAGTEIDGRTINVDFSAPKPERPPQEKRSFGQEELSAPTTTLFIGNLPFSATQDSVYEAFSEYGDINSVRLPTDPETERIKGFGYVEFATQEAATAAVNVGRGDGIYIDQRQARLDYSQPRAPGGDRGGRGGGRGGGRGFGGGRGGGGRGGGFGGGRGGGGRGGGFGGGRGGGGRGGGRGGGDSGWGARAKVTGAMVESAGTKKKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.23
3 0.21
4 0.15
5 0.15
6 0.13
7 0.16
8 0.17
9 0.19
10 0.24
11 0.27
12 0.31
13 0.37
14 0.39
15 0.41
16 0.45
17 0.47
18 0.5
19 0.52
20 0.48
21 0.45
22 0.49
23 0.47
24 0.46
25 0.46
26 0.42
27 0.36
28 0.4
29 0.41
30 0.42
31 0.38
32 0.36
33 0.31
34 0.28
35 0.28
36 0.24
37 0.21
38 0.16
39 0.19
40 0.2
41 0.18
42 0.2
43 0.19
44 0.2
45 0.23
46 0.28
47 0.34
48 0.34
49 0.34
50 0.38
51 0.45
52 0.48
53 0.5
54 0.45
55 0.41
56 0.4
57 0.4
58 0.37
59 0.32
60 0.28
61 0.23
62 0.22
63 0.2
64 0.2
65 0.23
66 0.22
67 0.25
68 0.27
69 0.27
70 0.28
71 0.26
72 0.26
73 0.21
74 0.21
75 0.16
76 0.16
77 0.15
78 0.14
79 0.15
80 0.14
81 0.14
82 0.15
83 0.18
84 0.23
85 0.26
86 0.34
87 0.39
88 0.47
89 0.53
90 0.54
91 0.51
92 0.47
93 0.48
94 0.43
95 0.43
96 0.41
97 0.42
98 0.46
99 0.49
100 0.52
101 0.55
102 0.56
103 0.55
104 0.58
105 0.57
106 0.6
107 0.59
108 0.58
109 0.54
110 0.58
111 0.59
112 0.54
113 0.58
114 0.56
115 0.61
116 0.62
117 0.63
118 0.63
119 0.68
120 0.73
121 0.73
122 0.75
123 0.77
124 0.82
125 0.88
126 0.87
127 0.84
128 0.85
129 0.84
130 0.84
131 0.84
132 0.81
133 0.78
134 0.77
135 0.79
136 0.78
137 0.77
138 0.7
139 0.65
140 0.64
141 0.63
142 0.58
143 0.6
144 0.61
145 0.64
146 0.67
147 0.69
148 0.68
149 0.66
150 0.72
151 0.67
152 0.67
153 0.6
154 0.58
155 0.58
156 0.53
157 0.48
158 0.47
159 0.51
160 0.43
161 0.43
162 0.44
163 0.4
164 0.42
165 0.42
166 0.37
167 0.32
168 0.32
169 0.34
170 0.37
171 0.39
172 0.37
173 0.39
174 0.4
175 0.43
176 0.49
177 0.5
178 0.49
179 0.54
180 0.63
181 0.7
182 0.75
183 0.71
184 0.69
185 0.71
186 0.7
187 0.69
188 0.68
189 0.66
190 0.61
191 0.64
192 0.63
193 0.61
194 0.57
195 0.54
196 0.48
197 0.43
198 0.4
199 0.34
200 0.28
201 0.21
202 0.18
203 0.14
204 0.12
205 0.1
206 0.14
207 0.14
208 0.14
209 0.16
210 0.15
211 0.16
212 0.21
213 0.22
214 0.19
215 0.28
216 0.33
217 0.37
218 0.44
219 0.45
220 0.44
221 0.44
222 0.44
223 0.37
224 0.37
225 0.33
226 0.28
227 0.27
228 0.25
229 0.22
230 0.22
231 0.2
232 0.15
233 0.13
234 0.11
235 0.09
236 0.09
237 0.07
238 0.06
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.09
249 0.12
250 0.13
251 0.22
252 0.23
253 0.25
254 0.25
255 0.24
256 0.24
257 0.24
258 0.25
259 0.19
260 0.2
261 0.25
262 0.25
263 0.26
264 0.26
265 0.27
266 0.24
267 0.22
268 0.2
269 0.14
270 0.13
271 0.12
272 0.11
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.11
286 0.11
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.13
291 0.13
292 0.14
293 0.13
294 0.13
295 0.11
296 0.12
297 0.1
298 0.09
299 0.11
300 0.11
301 0.12
302 0.14
303 0.14
304 0.14
305 0.14
306 0.14
307 0.12
308 0.12
309 0.1
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.06
318 0.05
319 0.07
320 0.07
321 0.08
322 0.07
323 0.08
324 0.09
325 0.09
326 0.1
327 0.08
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.1
336 0.1
337 0.11
338 0.11
339 0.11
340 0.1
341 0.1
342 0.09
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.07
350 0.09
351 0.09
352 0.09
353 0.11
354 0.11
355 0.12
356 0.13
357 0.21
358 0.23
359 0.29
360 0.35
361 0.42
362 0.51
363 0.58
364 0.56
365 0.51
366 0.53
367 0.51
368 0.53
369 0.48
370 0.44
371 0.45
372 0.45
373 0.45
374 0.43
375 0.38
376 0.32
377 0.29
378 0.25
379 0.17
380 0.18
381 0.17
382 0.19
383 0.22
384 0.2
385 0.22
386 0.2
387 0.18
388 0.15
389 0.14
390 0.08
391 0.05
392 0.05
393 0.04
394 0.06
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.08
401 0.08
402 0.1
403 0.11
404 0.11
405 0.12
406 0.15
407 0.17
408 0.18
409 0.2
410 0.17
411 0.16
412 0.22
413 0.21
414 0.19
415 0.17
416 0.16
417 0.12
418 0.13
419 0.12
420 0.07
421 0.1
422 0.13
423 0.16
424 0.18
425 0.2
426 0.2
427 0.24
428 0.24
429 0.22
430 0.2
431 0.18
432 0.19
433 0.19
434 0.2
435 0.17
436 0.16
437 0.17
438 0.16
439 0.15
440 0.13
441 0.11
442 0.1
443 0.1
444 0.1
445 0.08
446 0.1
447 0.09
448 0.09
449 0.1
450 0.09
451 0.09
452 0.1
453 0.09
454 0.08
455 0.08
456 0.07
457 0.07
458 0.08
459 0.08
460 0.06
461 0.07
462 0.08
463 0.09
464 0.18
465 0.18
466 0.2
467 0.24
468 0.3
469 0.39
470 0.46
471 0.54
472 0.55
473 0.64
474 0.68
475 0.65
476 0.69
477 0.64
478 0.57
479 0.52
480 0.44
481 0.36
482 0.34
483 0.35
484 0.25
485 0.2
486 0.19
487 0.16
488 0.14
489 0.12
490 0.08
491 0.06
492 0.08
493 0.08
494 0.08
495 0.09
496 0.09
497 0.09
498 0.12
499 0.11
500 0.11
501 0.11
502 0.13
503 0.12
504 0.12
505 0.12
506 0.1
507 0.11
508 0.1
509 0.11
510 0.09
511 0.08
512 0.09
513 0.09
514 0.08
515 0.09
516 0.1
517 0.09
518 0.1
519 0.13
520 0.14
521 0.2
522 0.22
523 0.24
524 0.3
525 0.31
526 0.31
527 0.29
528 0.27
529 0.23
530 0.22
531 0.2
532 0.18
533 0.17
534 0.17
535 0.17
536 0.16
537 0.14
538 0.13
539 0.11
540 0.07
541 0.07
542 0.06
543 0.05
544 0.06
545 0.06
546 0.07
547 0.06
548 0.07
549 0.06
550 0.06
551 0.06
552 0.06
553 0.07
554 0.1
555 0.12
556 0.15
557 0.17
558 0.18
559 0.2
560 0.21
561 0.21
562 0.2
563 0.26
564 0.31
565 0.36
566 0.39
567 0.38
568 0.38
569 0.38
570 0.37
571 0.36
572 0.34
573 0.35
574 0.32
575 0.34
576 0.36
577 0.34
578 0.33
579 0.29
580 0.27
581 0.21
582 0.23
583 0.2
584 0.18
585 0.18
586 0.18
587 0.17
588 0.13
589 0.13
590 0.1
591 0.1
592 0.1
593 0.1
594 0.09
595 0.09
596 0.08
597 0.07
598 0.07
599 0.07
600 0.06
601 0.06
602 0.07
603 0.06
604 0.06
605 0.06
606 0.06
607 0.06
608 0.07
609 0.07
610 0.06
611 0.06
612 0.07
613 0.06
614 0.06
615 0.07
616 0.06
617 0.06
618 0.06
619 0.06
620 0.06
621 0.08
622 0.08
623 0.08
624 0.08
625 0.09
626 0.09
627 0.09
628 0.1
629 0.09
630 0.09
631 0.09
632 0.09
633 0.12
634 0.13
635 0.12
636 0.12
637 0.13
638 0.13
639 0.16
640 0.16
641 0.14
642 0.15
643 0.16
644 0.15
645 0.15
646 0.16
647 0.17