FuNGI

R1GF71

Protein Details

Accession

R1GF71

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
681-705	ASEMPRDPRYRKNRGKKKAVSGKDI	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
688-699	PRYRKNRGKKKA

Subcellular Location(s)

cyto 15.5, cyto_mito 10.5, mito 4.5, nucl 3, pero 2, cysk 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
KEGG	npa:UCRNP2_6354 -
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MQKMGITSALHTKPMEALMWQWYTAMVPLFKEEFKNINKAYEDEAAEADERLITGPFLEAFTPEKLAATSLIVTVSTFGAPDMAGGMKVSQIAMAIGKQLAMEHSLMVTQTIQANHSLYRSISERRLRTLIKYSKTIDPSREKPPQDGGDGEDIDKKYEGLKHLEWAPMIKAKVGALCLSKILEAAKIPVTREERETRKQLTANEPAFYHATVYSAGRKSGMIRLHQIVLDKLRREPLRGSFGTKYPMVVEPLPWTGYKEGGYLRYPEPVIKEKSNDDSQKIYAMAAIEKGDMDQVLAGLSVLGKTAWKINRDVFKVVIEAWNTGEPIGKLAPENPKMEYPPEPSPEAPKKEYALWLKEKKRIDNAKGGYHSQRCFQNFQLEVARAFRDEAFYFPHNMDFRGRAYPIPPLLNHLGADLSRGLLTFAKGKPLGSVGLTWLKIHLANVFGYDKASLTDREAFAMEHINDIYDSCQNPLTGRKWWLKAEDPWQCLATCFELKNAFDSPDPSSYISHLPVHQDGTCNGLQHYAALGGDKAGAAQVNLEPGDRPSDIYSAVADIVKKEVASDAKAGGAFAKILDGRITRKVVKQTVMTNVYGVTFIGARAQVIKQLEAVLSEEEQKAGLLGMGAYVAKLIFKALGQMFNGAQEIQDWLGVCANRITTSLTPEQIDMIEKQSTTGTASEMPRDPRYRKNRGKKKAVSGKDIHSQFRTTVIWTTPLRMPVVQPYRKSLSREITTVLQYLSIVQPKATDATDKRKQLQAFPPNFIHSLDATHMLLSALKCDELGLSFASVHDSFWTHAADIPLMNRILRDAFVRMHSEDIIGRLHEEFCIRYKDCMYLASVSPKSPLAKLIQNHRAENSLPNSNKKINQTLLDELVIERTRHRLLQSEDPEERAKGAAMITPSVLYETAKQEEVELGGEPLDLQTGDEAPIARLGDISVEQAAKGKAKSTAISEDAVEAEAVDANEDDEELLKGIMDDGSSHAAAAAPLADEGAMDPEALQRPNKNKGTRELKVRFWLPLDFPPVPKKGDFDVTRLKESTYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.25
3	0.16
4	0.17
5	0.21
6	0.22
7	0.21
8	0.19
9	0.17
10	0.17
11	0.18
12	0.19
13	0.14
14	0.13
15	0.18
16	0.2
17	0.22
18	0.24
19	0.26
20	0.31
21	0.33
22	0.42
23	0.39
24	0.42
25	0.42
26	0.42
27	0.42
28	0.4
29	0.38
30	0.3
31	0.29
32	0.25
33	0.23
34	0.22
35	0.17
36	0.11
37	0.1
38	0.09
39	0.09
40	0.07
41	0.07
42	0.08
43	0.08
44	0.09
45	0.09
46	0.1
47	0.13
48	0.15
49	0.16
50	0.15
51	0.15
52	0.14
53	0.15
54	0.14
55	0.13
56	0.12
57	0.11
58	0.11
59	0.1
60	0.1
61	0.1
62	0.1
63	0.08
64	0.07
65	0.07
66	0.07
67	0.07
68	0.07
69	0.07
70	0.06
71	0.07
72	0.07
73	0.07
74	0.07
75	0.08
76	0.08
77	0.07
78	0.06
79	0.07
80	0.08
81	0.08
82	0.09
83	0.09
84	0.09
85	0.09
86	0.09
87	0.09
88	0.1
89	0.1
90	0.09
91	0.09
92	0.1
93	0.1
94	0.1
95	0.09
96	0.09
97	0.12
98	0.13
99	0.14
100	0.15
101	0.17
102	0.17
103	0.18
104	0.18
105	0.14
106	0.17
107	0.2
108	0.24
109	0.31
110	0.38
111	0.4
112	0.44
113	0.51
114	0.5
115	0.51
116	0.56
117	0.57
118	0.53
119	0.56
120	0.55
121	0.56
122	0.61
123	0.6
124	0.58
125	0.58
126	0.57
127	0.61
128	0.65
129	0.6
130	0.56
131	0.6
132	0.55
133	0.49
134	0.45
135	0.4
136	0.37
137	0.36
138	0.33
139	0.31
140	0.27
141	0.25
142	0.24
143	0.21
144	0.18
145	0.21
146	0.24
147	0.25
148	0.26
149	0.29
150	0.32
151	0.34
152	0.32
153	0.29
154	0.29
155	0.28
156	0.27
157	0.23
158	0.2
159	0.19
160	0.2
161	0.2
162	0.19
163	0.16
164	0.17
165	0.17
166	0.16
167	0.15
168	0.14
169	0.13
170	0.12
171	0.11
172	0.13
173	0.17
174	0.18
175	0.19
176	0.25
177	0.29
178	0.29
179	0.35
180	0.41
181	0.43
182	0.49
183	0.55
184	0.52
185	0.54
186	0.55
187	0.55
188	0.55
189	0.57
190	0.51
191	0.47
192	0.42
193	0.39
194	0.36
195	0.31
196	0.24
197	0.14
198	0.13
199	0.12
200	0.14
201	0.18
202	0.18
203	0.19
204	0.18
205	0.19
206	0.2
207	0.25
208	0.28
209	0.24
210	0.28
211	0.3
212	0.31
213	0.32
214	0.31
215	0.28
216	0.31
217	0.33
218	0.3
219	0.29
220	0.35
221	0.35
222	0.37
223	0.39
224	0.38
225	0.41
226	0.41
227	0.44
228	0.4
229	0.41
230	0.42
231	0.37
232	0.31
233	0.25
234	0.25
235	0.23
236	0.2
237	0.19
238	0.18
239	0.2
240	0.2
241	0.18
242	0.18
243	0.16
244	0.17
245	0.16
246	0.15
247	0.16
248	0.18
249	0.19
250	0.21
251	0.21
252	0.23
253	0.23
254	0.22
255	0.25
256	0.28
257	0.32
258	0.31
259	0.34
260	0.33
261	0.39
262	0.46
263	0.44
264	0.4
265	0.38
266	0.36
267	0.35
268	0.32
269	0.25
270	0.18
271	0.16
272	0.14
273	0.12
274	0.11
275	0.09
276	0.09
277	0.09
278	0.08
279	0.07
280	0.06
281	0.05
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.03
290	0.03
291	0.04
292	0.04
293	0.11
294	0.15
295	0.17
296	0.2
297	0.26
298	0.33
299	0.37
300	0.38
301	0.33
302	0.3
303	0.29
304	0.27
305	0.24
306	0.18
307	0.15
308	0.15
309	0.14
310	0.13
311	0.13
312	0.13
313	0.1
314	0.11
315	0.1
316	0.09
317	0.09
318	0.13
319	0.21
320	0.23
321	0.25
322	0.25
323	0.27
324	0.28
325	0.3
326	0.3
327	0.27
328	0.29
329	0.31
330	0.31
331	0.3
332	0.37
333	0.42
334	0.43
335	0.4
336	0.37
337	0.36
338	0.35
339	0.41
340	0.39
341	0.38
342	0.41
343	0.48
344	0.51
345	0.56
346	0.58
347	0.55
348	0.6
349	0.62
350	0.57
351	0.58
352	0.56
353	0.56
354	0.55
355	0.54
356	0.51
357	0.48
358	0.44
359	0.39
360	0.41
361	0.38
362	0.38
363	0.37
364	0.38
365	0.33
366	0.35
367	0.34
368	0.29
369	0.27
370	0.26
371	0.24
372	0.16
373	0.16
374	0.14
375	0.13
376	0.12
377	0.12
378	0.15
379	0.16
380	0.17
381	0.16
382	0.21
383	0.18
384	0.19
385	0.2
386	0.17
387	0.18
388	0.19
389	0.2
390	0.16
391	0.17
392	0.2
393	0.21
394	0.21
395	0.19
396	0.2
397	0.21
398	0.21
399	0.2
400	0.16
401	0.14
402	0.12
403	0.13
404	0.08
405	0.07
406	0.06
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.07
411	0.11
412	0.11
413	0.15
414	0.16
415	0.16
416	0.16
417	0.16
418	0.16
419	0.12
420	0.12
421	0.1
422	0.13
423	0.14
424	0.13
425	0.12
426	0.12
427	0.12
428	0.12
429	0.1
430	0.08
431	0.08
432	0.1
433	0.1
434	0.09
435	0.09
436	0.09
437	0.08
438	0.08
439	0.09
440	0.08
441	0.09
442	0.13
443	0.13
444	0.13
445	0.14
446	0.13
447	0.12
448	0.15
449	0.13
450	0.1
451	0.1
452	0.09
453	0.09
454	0.09
455	0.09
456	0.08
457	0.08
458	0.09
459	0.1
460	0.1
461	0.11
462	0.16
463	0.17
464	0.18
465	0.23
466	0.27
467	0.3
468	0.32
469	0.34
470	0.33
471	0.35
472	0.4
473	0.42
474	0.39
475	0.37
476	0.36
477	0.32
478	0.28
479	0.25
480	0.19
481	0.14
482	0.13
483	0.13
484	0.15
485	0.15
486	0.17
487	0.16
488	0.15
489	0.13
490	0.15
491	0.15
492	0.14
493	0.16
494	0.14
495	0.14
496	0.14
497	0.15
498	0.15
499	0.14
500	0.13
501	0.14
502	0.14
503	0.15
504	0.14
505	0.14
506	0.12
507	0.15
508	0.15
509	0.13
510	0.13
511	0.12
512	0.11
513	0.1
514	0.1
515	0.06
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.04
520	0.04
521	0.04
522	0.03
523	0.03
524	0.03
525	0.03
526	0.04
527	0.04
528	0.05
529	0.05
530	0.05
531	0.05
532	0.06
533	0.09
534	0.08
535	0.09
536	0.09
537	0.09
538	0.09
539	0.1
540	0.09
541	0.07
542	0.07
543	0.07
544	0.06
545	0.06
546	0.07
547	0.07
548	0.06
549	0.06
550	0.08
551	0.08
552	0.09
553	0.1
554	0.09
555	0.1
556	0.1
557	0.1
558	0.08
559	0.07
560	0.06
561	0.05
562	0.06
563	0.05
564	0.06
565	0.07
566	0.08
567	0.1
568	0.14
569	0.17
570	0.18
571	0.21
572	0.27
573	0.29
574	0.3
575	0.31
576	0.31
577	0.35
578	0.35
579	0.32
580	0.26
581	0.23
582	0.2
583	0.17
584	0.14
585	0.07
586	0.05
587	0.04
588	0.06
589	0.05
590	0.05
591	0.06
592	0.07
593	0.1
594	0.1
595	0.1
596	0.09
597	0.1
598	0.1
599	0.09
600	0.1
601	0.07
602	0.07
603	0.09
604	0.09
605	0.09
606	0.08
607	0.08
608	0.07
609	0.06
610	0.06
611	0.03
612	0.03
613	0.03
614	0.03
615	0.03
616	0.03
617	0.03
618	0.03
619	0.03
620	0.03
621	0.03
622	0.03
623	0.03
624	0.08
625	0.09
626	0.11
627	0.11
628	0.13
629	0.13
630	0.13
631	0.14
632	0.09
633	0.08
634	0.06
635	0.07
636	0.06
637	0.07
638	0.06
639	0.06
640	0.09
641	0.09
642	0.09
643	0.09
644	0.09
645	0.09
646	0.09
647	0.12
648	0.1
649	0.15
650	0.16
651	0.17
652	0.17
653	0.17
654	0.17
655	0.14
656	0.15
657	0.11
658	0.12
659	0.12
660	0.11
661	0.12
662	0.11
663	0.11
664	0.11
665	0.1
666	0.09
667	0.12
668	0.13
669	0.16
670	0.19
671	0.23
672	0.27
673	0.32
674	0.35
675	0.4
676	0.49
677	0.56
678	0.64
679	0.71
680	0.77
681	0.81
682	0.88
683	0.86
684	0.88
685	0.87
686	0.82
687	0.79
688	0.73
689	0.67
690	0.65
691	0.6
692	0.52
693	0.44
694	0.39
695	0.32
696	0.31
697	0.26
698	0.2
699	0.19
700	0.17
701	0.21
702	0.2
703	0.23
704	0.22
705	0.24
706	0.24
707	0.21
708	0.21
709	0.25
710	0.34
711	0.36
712	0.35
713	0.38
714	0.43
715	0.46
716	0.49
717	0.46
718	0.45
719	0.42
720	0.42
721	0.39
722	0.37
723	0.34
724	0.31
725	0.25
726	0.17
727	0.14
728	0.14
729	0.15
730	0.15
731	0.13
732	0.12
733	0.13
734	0.13
735	0.15
736	0.14
737	0.17
738	0.18
739	0.27
740	0.35
741	0.39
742	0.41
743	0.45
744	0.46
745	0.48
746	0.54
747	0.55
748	0.52
749	0.53
750	0.52
751	0.48
752	0.48
753	0.41
754	0.32
755	0.22
756	0.2
757	0.16
758	0.16
759	0.14
760	0.12
761	0.12
762	0.1
763	0.12
764	0.11
765	0.11
766	0.09
767	0.09
768	0.09
769	0.09
770	0.09
771	0.07
772	0.09
773	0.07
774	0.07
775	0.07
776	0.07
777	0.11
778	0.11
779	0.1
780	0.1
781	0.11
782	0.11
783	0.13
784	0.14
785	0.1
786	0.13
787	0.13
788	0.13
789	0.13
790	0.13
791	0.14
792	0.14
793	0.14
794	0.11
795	0.12
796	0.12
797	0.12
798	0.13
799	0.12
800	0.14
801	0.17
802	0.2
803	0.2
804	0.2
805	0.2
806	0.19
807	0.17
808	0.17
809	0.15
810	0.12
811	0.12
812	0.12
813	0.12
814	0.12
815	0.13
816	0.12
817	0.15
818	0.21
819	0.22
820	0.23
821	0.24
822	0.26
823	0.26
824	0.26
825	0.24
826	0.21
827	0.22
828	0.28
829	0.27
830	0.25
831	0.26
832	0.27
833	0.26
834	0.24
835	0.25
836	0.21
837	0.27
838	0.31
839	0.39
840	0.45
841	0.48
842	0.5
843	0.47
844	0.46
845	0.41
846	0.43
847	0.37
848	0.38
849	0.36
850	0.4
851	0.44
852	0.47
853	0.51
854	0.5
855	0.52
856	0.47
857	0.48
858	0.47
859	0.45
860	0.42
861	0.37
862	0.32
863	0.25
864	0.27
865	0.24
866	0.2
867	0.17
868	0.2
869	0.22
870	0.24
871	0.25
872	0.27
873	0.3
874	0.4
875	0.45
876	0.48
877	0.48
878	0.49
879	0.49
880	0.42
881	0.38
882	0.28
883	0.22
884	0.15
885	0.14
886	0.13
887	0.13
888	0.13
889	0.13
890	0.12
891	0.12
892	0.12
893	0.11
894	0.1
895	0.12
896	0.16
897	0.18
898	0.19
899	0.19
900	0.18
901	0.19
902	0.19
903	0.16
904	0.12
905	0.1
906	0.09
907	0.09
908	0.08
909	0.07
910	0.07
911	0.06
912	0.05
913	0.06
914	0.07
915	0.08
916	0.09
917	0.1
918	0.09
919	0.12
920	0.12
921	0.11
922	0.11
923	0.1
924	0.1
925	0.1
926	0.11
927	0.11
928	0.11
929	0.11
930	0.14
931	0.16
932	0.18
933	0.18
934	0.19
935	0.21
936	0.24
937	0.26
938	0.27
939	0.31
940	0.29
941	0.3
942	0.28
943	0.25
944	0.23
945	0.21
946	0.16
947	0.1
948	0.08
949	0.09
950	0.08
951	0.08
952	0.07
953	0.07
954	0.07
955	0.07
956	0.07
957	0.06
958	0.07
959	0.07
960	0.06
961	0.06
962	0.06
963	0.07
964	0.07
965	0.06
966	0.07
967	0.09
968	0.12
969	0.12
970	0.12
971	0.11
972	0.11
973	0.11
974	0.11
975	0.09
976	0.06
977	0.06
978	0.06
979	0.05
980	0.05
981	0.06
982	0.08
983	0.07
984	0.07
985	0.07
986	0.12
987	0.16
988	0.18
989	0.22
990	0.27
991	0.34
992	0.44
993	0.53
994	0.56
995	0.58
996	0.66
997	0.73
998	0.72
999	0.76
1000	0.72
1001	0.71
1002	0.72
1003	0.69
1004	0.62
1005	0.55
1006	0.53
1007	0.46
1008	0.46
1009	0.47
1010	0.41
1011	0.43
1012	0.46
1013	0.47
1014	0.45
1015	0.42
1016	0.4
1017	0.37
1018	0.44
1019	0.42
1020	0.42
1021	0.49
1022	0.5
1023	0.54
1024	0.51
1025	0.48
1026	0.43

R1GF71

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer