Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1GKM1

Protein Details
Accession R1GKM1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
216-238LSLSSKSKQSREKEKEKKKVLEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
226-233REKEKEKK
Subcellular Location(s) cyto 16.5, cyto_nucl 14.333, cyto_mito 10.332, nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG npa:UCRNP2_4396  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
Amino Acid Sequences MPSQQRAFIHALAEDFGLDSESMDPEPHRHVVVYKTPRFVSAPTKTVGECVRIRYNQRAATGAVATTTDTSKKLKASNVVGDPYNGFLLSNPRFALTIEELRTAIRPVTDTIPIAQFDIAFLPSDEVVLKANAALSERDLETTLKNVKAGLSREVRSHALGSIQLCRVDSSLNILRRETDSVANGGWSQVAAKAAAPARARPQQTTRAGSNSFTVLSLSSKSKQSREKEKEKKKVLEETVDDWEMAEAMEEEKERLESGEASKVASGAATEDEAEGGEREEDRAGESSVIDAEASGAVVEAEASGPTESDENRVDEATVASDAGAAAETTVSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.11
3 0.1
4 0.09
5 0.08
6 0.08
7 0.08
8 0.09
9 0.09
10 0.1
11 0.11
12 0.13
13 0.18
14 0.19
15 0.19
16 0.19
17 0.21
18 0.27
19 0.36
20 0.43
21 0.44
22 0.47
23 0.47
24 0.49
25 0.47
26 0.45
27 0.44
28 0.41
29 0.39
30 0.35
31 0.37
32 0.34
33 0.37
34 0.35
35 0.32
36 0.28
37 0.3
38 0.36
39 0.39
40 0.44
41 0.49
42 0.54
43 0.52
44 0.51
45 0.47
46 0.4
47 0.38
48 0.34
49 0.25
50 0.18
51 0.14
52 0.12
53 0.11
54 0.12
55 0.1
56 0.12
57 0.14
58 0.16
59 0.2
60 0.23
61 0.26
62 0.32
63 0.36
64 0.41
65 0.43
66 0.43
67 0.39
68 0.37
69 0.33
70 0.27
71 0.22
72 0.14
73 0.1
74 0.08
75 0.16
76 0.17
77 0.19
78 0.18
79 0.18
80 0.18
81 0.18
82 0.22
83 0.18
84 0.22
85 0.21
86 0.22
87 0.21
88 0.21
89 0.22
90 0.18
91 0.15
92 0.1
93 0.09
94 0.1
95 0.13
96 0.14
97 0.14
98 0.14
99 0.16
100 0.15
101 0.15
102 0.13
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.08
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.1
128 0.09
129 0.12
130 0.15
131 0.13
132 0.13
133 0.13
134 0.14
135 0.17
136 0.18
137 0.21
138 0.22
139 0.23
140 0.24
141 0.27
142 0.26
143 0.23
144 0.21
145 0.16
146 0.12
147 0.12
148 0.12
149 0.13
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.12
154 0.11
155 0.1
156 0.09
157 0.11
158 0.16
159 0.2
160 0.21
161 0.21
162 0.21
163 0.22
164 0.24
165 0.2
166 0.17
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.12
171 0.11
172 0.09
173 0.07
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.08
181 0.1
182 0.14
183 0.15
184 0.15
185 0.2
186 0.26
187 0.27
188 0.28
189 0.31
190 0.35
191 0.4
192 0.43
193 0.4
194 0.39
195 0.38
196 0.36
197 0.32
198 0.25
199 0.19
200 0.15
201 0.13
202 0.09
203 0.09
204 0.11
205 0.13
206 0.14
207 0.2
208 0.23
209 0.29
210 0.36
211 0.43
212 0.52
213 0.59
214 0.67
215 0.72
216 0.8
217 0.84
218 0.85
219 0.85
220 0.79
221 0.79
222 0.72
223 0.68
224 0.61
225 0.54
226 0.5
227 0.43
228 0.37
229 0.27
230 0.23
231 0.16
232 0.12
233 0.09
234 0.04
235 0.04
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.1
245 0.12
246 0.17
247 0.17
248 0.17
249 0.17
250 0.17
251 0.15
252 0.13
253 0.11
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.1
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.11
277 0.08
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.03
288 0.04
289 0.04
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.09
295 0.09
296 0.13
297 0.16
298 0.17
299 0.19
300 0.19
301 0.19
302 0.17
303 0.18
304 0.15
305 0.13
306 0.11
307 0.09
308 0.09
309 0.08
310 0.08
311 0.07
312 0.05
313 0.05