Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

R1ELX9

Protein Details
Accession R1ELX9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-129EVDERMDRRRKARREAREKAEREEBasic
162-182VGDLTGKNRRQKQNLRQRFYAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
113-125RRRKARREAREKA
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 8.5, cyto_mito 7, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG npa:UCRNP2_4735  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13428  TPR_14  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSGRRDFLNQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEEQIKEALAKRAAALGQAPPTAYGATGKDDDDDDDRFQDPDNEQGLFANGTYDRDDDEADRIYQEVDERMDRRRKARREAREKAEREEYERNNPKIQQQFADLKRALGSVSEEDWANLPEVGDLTGKNRRQKQNLRQRFYAVPDSVIASARDSTQLDTSIAAGEGENADGTMTNFADIGAAREKVLQVRLDQATQNSGTETTAGTATSIDPKGYLTSLSKSELSAGEVQVGDIKRVRELLESVIKTNPKHGPGWIAAARLEEVAGRIVAARNVIARGCEHCPKSIDCWLENIRLNDNHNAKIIAANAIKHNNSSARLWQAAADLETDLRAKKRVLRHALDAVPQSVDLWKSAIALEEDPADARLMLAKATEIIPLSVELWLALARLETPENAQVVLNKARKAVPTSHEIWRAAAALQEQMGKTDMVFKVMERGIKSLAKESAMLKREEWIAEAEKCEDDGMVISCQAIIKETLSWSLDEDDDRKEIFMEDARGSIARGKYETARAIYAYALRIFPTSKTLWTAAVALERNHGTKDALWNLLEKAVEACPSAQELWLLFAREREQAGELDEARDVIHRAFRQNPNNEDIWLAAVKMEADHGNHDKARELLMVARREAGTNRVWYRSVAYERQLGNLEAALDLVTQGLQLFPKEPKLYMQKGQIYESLNKTPQAREAYTTGTRQCPQSVPLYLLLSRLEERAGVIVKARSVLDRARLAVKKNAELWTESVRLERRAGNLPAAQNIMAQALQEVPNSGLLWAEKIWHLEARTQRKPRSLEAIKKVDNDPILFVAVARIFWGERRLEKAASWFEKAILLDADLGDTWAWYYKFVCQHGTDEKREEVISKCVLSEPKHGEVWQSIAKDPKNWGKGAEEILKLVAAKIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.29
3 0.24
4 0.22
5 0.18
6 0.16
7 0.13
8 0.13
9 0.12
10 0.12
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.29
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.27
37 0.28
38 0.27
39 0.3
40 0.29
41 0.25
42 0.23
43 0.21
44 0.22
45 0.22
46 0.22
47 0.18
48 0.19
49 0.18
50 0.16
51 0.14
52 0.12
53 0.15
54 0.17
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.2
59 0.2
60 0.21
61 0.19
62 0.2
63 0.21
64 0.2
65 0.2
66 0.23
67 0.21
68 0.25
69 0.25
70 0.23
71 0.23
72 0.23
73 0.23
74 0.18
75 0.17
76 0.13
77 0.11
78 0.12
79 0.14
80 0.14
81 0.14
82 0.14
83 0.16
84 0.14
85 0.17
86 0.18
87 0.17
88 0.17
89 0.15
90 0.15
91 0.14
92 0.15
93 0.14
94 0.15
95 0.2
96 0.21
97 0.3
98 0.38
99 0.42
100 0.5
101 0.57
102 0.63
103 0.69
104 0.77
105 0.79
106 0.82
107 0.87
108 0.88
109 0.88
110 0.83
111 0.78
112 0.78
113 0.69
114 0.65
115 0.64
116 0.59
117 0.6
118 0.65
119 0.63
120 0.59
121 0.59
122 0.6
123 0.59
124 0.57
125 0.49
126 0.46
127 0.52
128 0.49
129 0.55
130 0.47
131 0.4
132 0.38
133 0.35
134 0.29
135 0.2
136 0.2
137 0.14
138 0.15
139 0.15
140 0.14
141 0.14
142 0.15
143 0.15
144 0.13
145 0.11
146 0.09
147 0.08
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.12
153 0.2
154 0.25
155 0.33
156 0.42
157 0.5
158 0.59
159 0.7
160 0.76
161 0.8
162 0.86
163 0.85
164 0.79
165 0.75
166 0.69
167 0.64
168 0.61
169 0.5
170 0.41
171 0.34
172 0.33
173 0.29
174 0.26
175 0.2
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.15
180 0.14
181 0.14
182 0.14
183 0.15
184 0.14
185 0.14
186 0.13
187 0.11
188 0.11
189 0.09
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.09
207 0.1
208 0.11
209 0.11
210 0.12
211 0.13
212 0.15
213 0.18
214 0.17
215 0.15
216 0.22
217 0.23
218 0.24
219 0.25
220 0.23
221 0.23
222 0.22
223 0.22
224 0.16
225 0.15
226 0.13
227 0.12
228 0.11
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.12
240 0.13
241 0.12
242 0.14
243 0.11
244 0.13
245 0.15
246 0.17
247 0.17
248 0.16
249 0.18
250 0.16
251 0.17
252 0.17
253 0.15
254 0.14
255 0.14
256 0.13
257 0.16
258 0.16
259 0.14
260 0.15
261 0.15
262 0.14
263 0.15
264 0.16
265 0.13
266 0.14
267 0.18
268 0.23
269 0.24
270 0.25
271 0.28
272 0.3
273 0.28
274 0.33
275 0.32
276 0.27
277 0.28
278 0.27
279 0.27
280 0.26
281 0.32
282 0.27
283 0.24
284 0.21
285 0.21
286 0.2
287 0.16
288 0.14
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.12
305 0.15
306 0.21
307 0.22
308 0.23
309 0.26
310 0.27
311 0.3
312 0.32
313 0.31
314 0.26
315 0.3
316 0.3
317 0.33
318 0.35
319 0.32
320 0.3
321 0.29
322 0.32
323 0.33
324 0.33
325 0.29
326 0.27
327 0.25
328 0.22
329 0.21
330 0.19
331 0.17
332 0.15
333 0.15
334 0.17
335 0.2
336 0.2
337 0.19
338 0.2
339 0.17
340 0.18
341 0.19
342 0.19
343 0.19
344 0.19
345 0.19
346 0.18
347 0.17
348 0.15
349 0.14
350 0.11
351 0.08
352 0.07
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.1
358 0.1
359 0.16
360 0.23
361 0.32
362 0.39
363 0.41
364 0.45
365 0.49
366 0.5
367 0.47
368 0.41
369 0.32
370 0.25
371 0.21
372 0.17
373 0.12
374 0.1
375 0.07
376 0.07
377 0.06
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.06
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.06
398 0.07
399 0.06
400 0.05
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.05
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.03
412 0.03
413 0.04
414 0.05
415 0.05
416 0.06
417 0.08
418 0.08
419 0.09
420 0.09
421 0.09
422 0.12
423 0.19
424 0.2
425 0.19
426 0.2
427 0.21
428 0.22
429 0.24
430 0.26
431 0.21
432 0.23
433 0.26
434 0.29
435 0.32
436 0.31
437 0.28
438 0.24
439 0.22
440 0.17
441 0.15
442 0.11
443 0.07
444 0.08
445 0.09
446 0.08
447 0.08
448 0.09
449 0.07
450 0.07
451 0.12
452 0.12
453 0.12
454 0.12
455 0.12
456 0.15
457 0.17
458 0.19
459 0.14
460 0.15
461 0.16
462 0.17
463 0.18
464 0.16
465 0.16
466 0.15
467 0.15
468 0.16
469 0.2
470 0.21
471 0.22
472 0.19
473 0.2
474 0.2
475 0.19
476 0.18
477 0.13
478 0.14
479 0.14
480 0.14
481 0.14
482 0.12
483 0.12
484 0.11
485 0.09
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.05
497 0.05
498 0.06
499 0.06
500 0.08
501 0.08
502 0.08
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.09
507 0.11
508 0.1
509 0.11
510 0.11
511 0.1
512 0.09
513 0.09
514 0.09
515 0.1
516 0.11
517 0.1
518 0.1
519 0.11
520 0.11
521 0.1
522 0.14
523 0.13
524 0.11
525 0.11
526 0.12
527 0.14
528 0.17
529 0.19
530 0.16
531 0.16
532 0.15
533 0.15
534 0.14
535 0.14
536 0.12
537 0.11
538 0.1
539 0.1
540 0.1
541 0.11
542 0.1
543 0.13
544 0.13
545 0.12
546 0.15
547 0.15
548 0.15
549 0.15
550 0.15
551 0.12
552 0.14
553 0.15
554 0.13
555 0.14
556 0.14
557 0.14
558 0.14
559 0.14
560 0.11
561 0.11
562 0.16
563 0.17
564 0.18
565 0.17
566 0.18
567 0.18
568 0.19
569 0.17
570 0.12
571 0.11
572 0.1
573 0.1
574 0.09
575 0.09
576 0.07
577 0.09
578 0.09
579 0.08
580 0.08
581 0.07
582 0.09
583 0.1
584 0.11
585 0.1
586 0.11
587 0.13
588 0.14
589 0.15
590 0.13
591 0.13
592 0.13
593 0.15
594 0.16
595 0.14
596 0.13
597 0.12
598 0.11
599 0.1
600 0.11
601 0.09
602 0.08
603 0.13
604 0.13
605 0.17
606 0.25
607 0.33
608 0.41
609 0.47
610 0.49
611 0.48
612 0.48
613 0.44
614 0.37
615 0.29
616 0.22
617 0.15
618 0.12
619 0.08
620 0.07
621 0.07
622 0.06
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.11
627 0.14
628 0.17
629 0.18
630 0.19
631 0.18
632 0.18
633 0.19
634 0.15
635 0.13
636 0.15
637 0.21
638 0.23
639 0.22
640 0.23
641 0.22
642 0.23
643 0.23
644 0.21
645 0.19
646 0.24
647 0.26
648 0.26
649 0.27
650 0.26
651 0.28
652 0.31
653 0.32
654 0.29
655 0.29
656 0.33
657 0.33
658 0.35
659 0.34
660 0.28
661 0.23
662 0.19
663 0.17
664 0.1
665 0.1
666 0.07
667 0.05
668 0.05
669 0.04
670 0.04
671 0.03
672 0.03
673 0.04
674 0.05
675 0.05
676 0.08
677 0.1
678 0.16
679 0.17
680 0.17
681 0.23
682 0.31
683 0.35
684 0.38
685 0.45
686 0.45
687 0.46
688 0.48
689 0.46
690 0.42
691 0.42
692 0.41
693 0.38
694 0.34
695 0.35
696 0.35
697 0.32
698 0.35
699 0.35
700 0.32
701 0.3
702 0.3
703 0.33
704 0.34
705 0.37
706 0.34
707 0.33
708 0.34
709 0.33
710 0.34
711 0.3
712 0.29
713 0.31
714 0.29
715 0.26
716 0.27
717 0.28
718 0.25
719 0.24
720 0.22
721 0.19
722 0.18
723 0.16
724 0.13
725 0.11
726 0.11
727 0.13
728 0.13
729 0.11
730 0.13
731 0.14
732 0.14
733 0.16
734 0.16
735 0.14
736 0.16
737 0.19
738 0.22
739 0.23
740 0.25
741 0.31
742 0.34
743 0.37
744 0.4
745 0.41
746 0.39
747 0.41
748 0.44
749 0.37
750 0.36
751 0.36
752 0.34
753 0.33
754 0.29
755 0.3
756 0.28
757 0.29
758 0.3
759 0.3
760 0.28
761 0.33
762 0.35
763 0.34
764 0.36
765 0.35
766 0.34
767 0.33
768 0.29
769 0.22
770 0.21
771 0.17
772 0.12
773 0.11
774 0.09
775 0.1
776 0.11
777 0.1
778 0.11
779 0.1
780 0.12
781 0.12
782 0.12
783 0.1
784 0.1
785 0.11
786 0.1
787 0.12
788 0.11
789 0.13
790 0.15
791 0.17
792 0.18
793 0.23
794 0.32
795 0.4
796 0.48
797 0.55
798 0.59
799 0.64
800 0.66
801 0.65
802 0.67
803 0.67
804 0.67
805 0.68
806 0.72
807 0.68
808 0.68
809 0.65
810 0.59
811 0.53
812 0.44
813 0.36
814 0.28
815 0.25
816 0.2
817 0.19
818 0.17
819 0.14
820 0.13
821 0.11
822 0.11
823 0.1
824 0.12
825 0.17
826 0.18
827 0.21
828 0.27
829 0.3
830 0.3
831 0.31
832 0.37
833 0.42
834 0.42
835 0.42
836 0.37
837 0.34
838 0.36
839 0.35
840 0.3
841 0.21
842 0.17
843 0.14
844 0.14
845 0.14
846 0.1
847 0.11
848 0.08
849 0.07
850 0.07
851 0.11
852 0.11
853 0.11
854 0.13
855 0.19
856 0.25
857 0.28
858 0.33
859 0.3
860 0.36
861 0.46
862 0.52
863 0.51
864 0.49
865 0.49
866 0.46
867 0.45
868 0.42
869 0.35
870 0.34
871 0.32
872 0.28
873 0.27
874 0.29
875 0.34
876 0.34
877 0.4
878 0.4
879 0.4
880 0.43
881 0.42
882 0.41
883 0.38
884 0.4
885 0.36
886 0.32
887 0.31
888 0.36
889 0.38
890 0.38
891 0.44
892 0.48
893 0.48
894 0.47
895 0.46
896 0.42
897 0.45
898 0.48
899 0.47
900 0.39
901 0.34
902 0.34
903 0.32
904 0.28