Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1ELX9

Protein Details
Accession R1ELX9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-129EVDERMDRRRKARREAREKAEREEBasic
162-182VGDLTGKNRRQKQNLRQRFYAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
113-125RRRKARREAREKA
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 8.5, cyto_mito 7, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG npa:UCRNP2_4735  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13428  TPR_14  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSGRRDFLNQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEEQIKEALAKRAAALGQAPPTAYGATGKDDDDDDDRFQDPDNEQGLFANGTYDRDDDEADRIYQEVDERMDRRRKARREAREKAEREEYERNNPKIQQQFADLKRALGSVSEEDWANLPEVGDLTGKNRRQKQNLRQRFYAVPDSVIASARDSTQLDTSIAAGEGENADGTMTNFADIGAAREKVLQVRLDQATQNSGTETTAGTATSIDPKGYLTSLSKSELSAGEVQVGDIKRVRELLESVIKTNPKHGPGWIAAARLEEVAGRIVAARNVIARGCEHCPKSIDCWLENIRLNDNHNAKIIAANAIKHNNSSARLWQAAADLETDLRAKKRVLRHALDAVPQSVDLWKSAIALEEDPADARLMLAKATEIIPLSVELWLALARLETPENAQVVLNKARKAVPTSHEIWRAAAALQEQMGKTDMVFKVMERGIKSLAKESAMLKREEWIAEAEKCEDDGMVISCQAIIKETLSWSLDEDDDRKEIFMEDARGSIARGKYETARAIYAYALRIFPTSKTLWTAAVALERNHGTKDALWNLLEKAVEACPSAQELWLLFAREREQAGELDEARDVIHRAFRQNPNNEDIWLAAVKMEADHGNHDKARELLMVARREAGTNRVWYRSVAYERQLGNLEAALDLVTQGLQLFPKEPKLYMQKGQIYESLNKTPQAREAYTTGTRQCPQSVPLYLLLSRLEERAGVIVKARSVLDRARLAVKKNAELWTESVRLERRAGNLPAAQNIMAQALQEVPNSGLLWAEKIWHLEARTQRKPRSLEAIKKVDNDPILFVAVARIFWGERRLEKAASWFEKAILLDADLGDTWAWYYKFVCQHGTDEKREEVISKCVLSEPKHGEVWQSIAKDPKNWGKGAEEILKLVAAKIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.29
3 0.24
4 0.22
5 0.18
6 0.16
7 0.13
8 0.13
9 0.12
10 0.12
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.29
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.27
37 0.28
38 0.27
39 0.3
40 0.29
41 0.25
42 0.23
43 0.21
44 0.22
45 0.22
46 0.22
47 0.18
48 0.19
49 0.18
50 0.16
51 0.14
52 0.12
53 0.15
54 0.17
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.2
59 0.2
60 0.21
61 0.19
62 0.2
63 0.21
64 0.2
65 0.2
66 0.23
67 0.21
68 0.25
69 0.25
70 0.23
71 0.23
72 0.23
73 0.23
74 0.18
75 0.17
76 0.13
77 0.11
78 0.12
79 0.14
80 0.14
81 0.14
82 0.14
83 0.16
84 0.14
85 0.17
86 0.18
87 0.17
88 0.17
89 0.15
90 0.15
91 0.14
92 0.15
93 0.14
94 0.15
95 0.2
96 0.21
97 0.3
98 0.38
99 0.42
100 0.5
101 0.57
102 0.63
103 0.69
104 0.77
105 0.79
106 0.82
107 0.87
108 0.88
109 0.88
110 0.83
111 0.78
112 0.78
113 0.69
114 0.65
115 0.64
116 0.59
117 0.6
118 0.65
119 0.63
120 0.59
121 0.59
122 0.6
123 0.59
124 0.57
125 0.49
126 0.46
127 0.52
128 0.49
129 0.55
130 0.47
131 0.4
132 0.38
133 0.35
134 0.29
135 0.2
136 0.2
137 0.14
138 0.15
139 0.15
140 0.14
141 0.14
142 0.15
143 0.15
144 0.13
145 0.11
146 0.09
147 0.08
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.12
153 0.2
154 0.25
155 0.33
156 0.42
157 0.5
158 0.59
159 0.7
160 0.76
161 0.8
162 0.86
163 0.85
164 0.79
165 0.75
166 0.69
167 0.64
168 0.61
169 0.5
170 0.41
171 0.34
172 0.33
173 0.29
174 0.26
175 0.2
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.15
180 0.14
181 0.14
182 0.14
183 0.15
184 0.14
185 0.14
186 0.13
187 0.11
188 0.11
189 0.09
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.09
207 0.1
208 0.11
209 0.11
210 0.12
211 0.13
212 0.15
213 0.18
214 0.17
215 0.15
216 0.22
217 0.23
218 0.24
219 0.25
220 0.23
221 0.23
222 0.22
223 0.22
224 0.16
225 0.15
226 0.13
227 0.12
228 0.11
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.12
240 0.13
241 0.12
242 0.14
243 0.11
244 0.13
245 0.15
246 0.17
247 0.17
248 0.16
249 0.18
250 0.16
251 0.17
252 0.17
253 0.15
254 0.14
255 0.14
256 0.13
257 0.16
258 0.16
259 0.14
260 0.15
261 0.15
262 0.14
263 0.15
264 0.16
265 0.13
266 0.14
267 0.18
268 0.23
269 0.24
270 0.25
271 0.28
272 0.3
273 0.28
274 0.33
275 0.32
276 0.27
277 0.28
278 0.27
279 0.27
280 0.26
281 0.32
282 0.27
283 0.24
284 0.21
285 0.21
286 0.2
287 0.16
288 0.14
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.12
305 0.15
306 0.21
307 0.22
308 0.23
309 0.26
310 0.27
311 0.3
312 0.32
313 0.31
314 0.26
315 0.3
316 0.3
317 0.33
318 0.35
319 0.32
320 0.3
321 0.29
322 0.32
323 0.33
324 0.33
325 0.29
326 0.27
327 0.25
328 0.22
329 0.21
330 0.19
331 0.17
332 0.15
333 0.15
334 0.17
335 0.2
336 0.2
337 0.19
338 0.2
339 0.17
340 0.18
341 0.19
342 0.19
343 0.19
344 0.19
345 0.19
346 0.18
347 0.17
348 0.15
349 0.14
350 0.11
351 0.08
352 0.07
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.1
358 0.1
359 0.16
360 0.23
361 0.32
362 0.39
363 0.41
364 0.45
365 0.49
366 0.5
367 0.47
368 0.41
369 0.32
370 0.25
371 0.21
372 0.17
373 0.12
374 0.1
375 0.07
376 0.07
377 0.06
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.06
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.06
398 0.07
399 0.06
400 0.05
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.05
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.03
412 0.03
413 0.04
414 0.05
415 0.05
416 0.06
417 0.08
418 0.08
419 0.09
420 0.09
421 0.09
422 0.12
423 0.19
424 0.2
425 0.19
426 0.2
427 0.21
428 0.22
429 0.24
430 0.26
431 0.21
432 0.23
433 0.26
434 0.29
435 0.32
436 0.31
437 0.28
438 0.24
439 0.22
440 0.17
441 0.15
442 0.11
443 0.07
444 0.08
445 0.09
446 0.08
447 0.08
448 0.09
449 0.07
450 0.07
451 0.12
452 0.12
453 0.12
454 0.12
455 0.12
456 0.15
457 0.17
458 0.19
459 0.14
460 0.15
461 0.16
462 0.17
463 0.18
464 0.16
465 0.16
466 0.15
467 0.15
468 0.16
469 0.2
470 0.21
471 0.22
472 0.19
473 0.2
474 0.2
475 0.19
476 0.18
477 0.13
478 0.14
479 0.14
480 0.14
481 0.14
482 0.12
483 0.12
484 0.11
485 0.09
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.05
497 0.05
498 0.06
499 0.06
500 0.08
501 0.08
502 0.08
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.09
507 0.11
508 0.1
509 0.11
510 0.11
511 0.1
512 0.09
513 0.09
514 0.09
515 0.1
516 0.11
517 0.1
518 0.1
519 0.11
520 0.11
521 0.1
522 0.14
523 0.13
524 0.11
525 0.11
526 0.12
527 0.14
528 0.17
529 0.19
530 0.16
531 0.16
532 0.15
533 0.15
534 0.14
535 0.14
536 0.12
537 0.11
538 0.1
539 0.1
540 0.1
541 0.11
542 0.1
543 0.13
544 0.13
545 0.12
546 0.15
547 0.15
548 0.15
549 0.15
550 0.15
551 0.12
552 0.14
553 0.15
554 0.13
555 0.14
556 0.14
557 0.14
558 0.14
559 0.14
560 0.11
561 0.11
562 0.16
563 0.17
564 0.18
565 0.17
566 0.18
567 0.18
568 0.19
569 0.17
570 0.12
571 0.11
572 0.1
573 0.1
574 0.09
575 0.09
576 0.07
577 0.09
578 0.09
579 0.08
580 0.08
581 0.07
582 0.09
583 0.1
584 0.11
585 0.1
586 0.11
587 0.13
588 0.14
589 0.15
590 0.13
591 0.13
592 0.13
593 0.15
594 0.16
595 0.14
596 0.13
597 0.12
598 0.11
599 0.1
600 0.11
601 0.09
602 0.08
603 0.13
604 0.13
605 0.17
606 0.25
607 0.33
608 0.41
609 0.47
610 0.49
611 0.48
612 0.48
613 0.44
614 0.37
615 0.29
616 0.22
617 0.15
618 0.12
619 0.08
620 0.07
621 0.07
622 0.06
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.11
627 0.14
628 0.17
629 0.18
630 0.19
631 0.18
632 0.18
633 0.19
634 0.15
635 0.13
636 0.15
637 0.21
638 0.23
639 0.22
640 0.23
641 0.22
642 0.23
643 0.23
644 0.21
645 0.19
646 0.24
647 0.26
648 0.26
649 0.27
650 0.26
651 0.28
652 0.31
653 0.32
654 0.29
655 0.29
656 0.33
657 0.33
658 0.35
659 0.34
660 0.28
661 0.23
662 0.19
663 0.17
664 0.1
665 0.1
666 0.07
667 0.05
668 0.05
669 0.04
670 0.04
671 0.03
672 0.03
673 0.04
674 0.05
675 0.05
676 0.08
677 0.1
678 0.16
679 0.17
680 0.17
681 0.23
682 0.31
683 0.35
684 0.38
685 0.45
686 0.45
687 0.46
688 0.48
689 0.46
690 0.42
691 0.42
692 0.41
693 0.38
694 0.34
695 0.35
696 0.35
697 0.32
698 0.35
699 0.35
700 0.32
701 0.3
702 0.3
703 0.33
704 0.34
705 0.37
706 0.34
707 0.33
708 0.34
709 0.33
710 0.34
711 0.3
712 0.29
713 0.31
714 0.29
715 0.26
716 0.27
717 0.28
718 0.25
719 0.24
720 0.22
721 0.19
722 0.18
723 0.16
724 0.13
725 0.11
726 0.11
727 0.13
728 0.13
729 0.11
730 0.13
731 0.14
732 0.14
733 0.16
734 0.16
735 0.14
736 0.16
737 0.19
738 0.22
739 0.23
740 0.25
741 0.31
742 0.34
743 0.37
744 0.4
745 0.41
746 0.39
747 0.41
748 0.44
749 0.37
750 0.36
751 0.36
752 0.34
753 0.33
754 0.29
755 0.3
756 0.28
757 0.29
758 0.3
759 0.3
760 0.28
761 0.33
762 0.35
763 0.34
764 0.36
765 0.35
766 0.34
767 0.33
768 0.29
769 0.22
770 0.21
771 0.17
772 0.12
773 0.11
774 0.09
775 0.1
776 0.11
777 0.1
778 0.11
779 0.1
780 0.12
781 0.12
782 0.12
783 0.1
784 0.1
785 0.11
786 0.1
787 0.12
788 0.11
789 0.13
790 0.15
791 0.17
792 0.18
793 0.23
794 0.32
795 0.4
796 0.48
797 0.55
798 0.59
799 0.64
800 0.66
801 0.65
802 0.67
803 0.67
804 0.67
805 0.68
806 0.72
807 0.68
808 0.68
809 0.65
810 0.59
811 0.53
812 0.44
813 0.36
814 0.28
815 0.25
816 0.2
817 0.19
818 0.17
819 0.14
820 0.13
821 0.11
822 0.11
823 0.1
824 0.12
825 0.17
826 0.18
827 0.21
828 0.27
829 0.3
830 0.3
831 0.31
832 0.37
833 0.42
834 0.42
835 0.42
836 0.37
837 0.34
838 0.36
839 0.35
840 0.3
841 0.21
842 0.17
843 0.14
844 0.14
845 0.14
846 0.1
847 0.11
848 0.08
849 0.07
850 0.07
851 0.11
852 0.11
853 0.11
854 0.13
855 0.19
856 0.25
857 0.28
858 0.33
859 0.3
860 0.36
861 0.46
862 0.52
863 0.51
864 0.49
865 0.49
866 0.46
867 0.45
868 0.42
869 0.35
870 0.34
871 0.32
872 0.28
873 0.27
874 0.29
875 0.34
876 0.34
877 0.4
878 0.4
879 0.4
880 0.43
881 0.42
882 0.41
883 0.38
884 0.4
885 0.36
886 0.32
887 0.31
888 0.36
889 0.38
890 0.38
891 0.44
892 0.48
893 0.48
894 0.47
895 0.46
896 0.42
897 0.45
898 0.48
899 0.47
900 0.39
901 0.34
902 0.34
903 0.32
904 0.28