FuNGI

R1ER45

Protein Details

Accession

R1ER45

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
105-124	GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
413-436	KRRKETEDRREAAQKRRKLQDERR
1057-1092	GGGGGGGGGRRDGGGRGGRRGGGGGHGGGGRPYDRR

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto 8, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
KEGG	npa:UCRNP2_3228 -
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSQKYPKIVSNVVEAEPTEFEDGTVQPVDTTKPNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCSHPEDKDPPANEEEMMLEIFKYTDRVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAKQKDADAAEFAKLLASQKKKQSGLDDSAEAQIVKKTWDSNSITPGTPFMDILAQSLRYWCAYKLNTDPGWEKLKIIISDATVPGEGEHKIMEFVRSQRRSQFHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLGTHEPHFRVLREDVFFNDAKPRTCRRCGQTGHYADQCRGEIKKKEDDLDIKQNKVTKKPFIWLHVSVLREYLAAELKVDNQGFAFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIREGGIDTLITIWRDNLASMGGYVTKDGHVDLARAQVILQGLAKLEDGIFKRRKETEDRREAAQKRRKLQDERRNGGGRFNAGGNGNQQDNSPAARKGKKGETAEDFANLPMFSPGELQSKEARAMTHENFVNRKAIFQGQADQANTANKSAAAVLKESLLNKKPDSVTVAAGVNGGGDDAPMPDTPGNDVTATPPSALGKRKAELLEEESSTPGRNTPDAGSPAAKPNEPPIDDVRMWEEGYTDRYYEQKFHVDPKDFEFRHQVARDYVEGLAWVLLYYFQGCPSWTWYYPHHYAPFAQDFVDLDKMELKFEKGQPFRPYEQLMGVLPAASNHAIPEAFRPLMENEDSDIIDFYPEDFVVDLNGKKMAWQGVAILPFIDEKRLLKAMNTKYPLLTAEEHARNAFGKDVLLFSTRHPLYEEVANQWYSKKQGEPQHQLDPQISEGLSGVVEKNEDYLPQSALVFPLETKGMPDLEEDQSISVHYEMPKSTNIHKSMLLRGVKFPKPALSQDEILSVRSRAENNNRRGGGHGFGGGGRGFHSHNENRWNGGPPRGNRNNNGHNGRGGHHHNNGGPPNGPNFNSNNPVAGFLNPNFDPQAFIQRGGPPPPPHVAAQMNGWQPPPPPQFGGAFPPPGMPAGYGGYGGPQGNGGHGGPRGGGYGSGGGRQDDNYRPGGGGGRQDDNYRPGGYGGGGGGGGGGGGGGGRRDGGGRGGRRGGGGGHGGGGRPYDRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.55
3	0.55
4	0.56
5	0.51
6	0.5
7	0.46
8	0.41
9	0.36
10	0.32
11	0.28
12	0.24
13	0.24
14	0.18
15	0.15
16	0.14
17	0.15
18	0.15
19	0.16
20	0.16
21	0.14
22	0.13
23	0.14
24	0.17
25	0.19
26	0.23
27	0.28
28	0.35
29	0.39
30	0.41
31	0.43
32	0.45
33	0.44
34	0.46
35	0.4
36	0.35
37	0.32
38	0.29
39	0.27
40	0.22
41	0.19
42	0.13
43	0.1
44	0.08
45	0.09
46	0.09
47	0.09
48	0.1
49	0.13
50	0.18
51	0.21
52	0.22
53	0.28
54	0.35
55	0.4
56	0.48
57	0.47
58	0.46
59	0.46
60	0.45
61	0.39
62	0.32
63	0.27
64	0.2
65	0.18
66	0.13
67	0.1
68	0.09
69	0.09
70	0.09
71	0.09
72	0.09
73	0.13
74	0.13
75	0.17
76	0.2
77	0.28
78	0.37
79	0.44
80	0.46
81	0.45
82	0.46
83	0.45
84	0.44
85	0.39
86	0.32
87	0.29
88	0.27
89	0.25
90	0.24
91	0.21
92	0.2
93	0.18
94	0.15
95	0.1
96	0.13
97	0.19
98	0.26
99	0.37
100	0.46
101	0.55
102	0.66
103	0.74
104	0.79
105	0.81
106	0.78
107	0.74
108	0.75
109	0.75
110	0.74
111	0.77
112	0.73
113	0.68
114	0.66
115	0.6
116	0.5
117	0.42
118	0.33
119	0.26
120	0.22
121	0.19
122	0.16
123	0.16
124	0.15
125	0.14
126	0.16
127	0.21
128	0.26
129	0.32
130	0.4
131	0.48
132	0.51
133	0.54
134	0.57
135	0.57
136	0.57
137	0.54
138	0.48
139	0.41
140	0.39
141	0.36
142	0.29
143	0.22
144	0.18
145	0.14
146	0.14
147	0.14
148	0.16
149	0.17
150	0.25
151	0.3
152	0.31
153	0.37
154	0.39
155	0.37
156	0.35
157	0.35
158	0.28
159	0.23
160	0.19
161	0.13
162	0.13
163	0.12
164	0.13
165	0.14
166	0.14
167	0.13
168	0.15
169	0.15
170	0.14
171	0.16
172	0.15
173	0.21
174	0.21
175	0.26
176	0.3
177	0.37
178	0.37
179	0.39
180	0.4
181	0.38
182	0.42
183	0.38
184	0.33
185	0.28
186	0.33
187	0.29
188	0.29
189	0.26
190	0.21
191	0.24
192	0.24
193	0.21
194	0.16
195	0.15
196	0.13
197	0.13
198	0.12
199	0.09
200	0.09
201	0.08
202	0.1
203	0.1
204	0.12
205	0.13
206	0.2
207	0.3
208	0.33
209	0.36
210	0.42
211	0.47
212	0.53
213	0.59
214	0.62
215	0.61
216	0.68
217	0.69
218	0.69
219	0.72
220	0.64
221	0.55
222	0.45
223	0.37
224	0.27
225	0.27
226	0.19
227	0.12
228	0.11
229	0.1
230	0.09
231	0.08
232	0.06
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.04
238	0.05
239	0.07
240	0.08
241	0.11
242	0.13
243	0.14
244	0.18
245	0.2
246	0.24
247	0.25
248	0.26
249	0.24
250	0.26
251	0.26
252	0.22
253	0.27
254	0.25
255	0.26
256	0.31
257	0.38
258	0.41
259	0.48
260	0.55
261	0.52
262	0.59
263	0.61
264	0.62
265	0.64
266	0.62
267	0.61
268	0.59
269	0.55
270	0.47
271	0.45
272	0.38
273	0.31
274	0.29
275	0.31
276	0.32
277	0.35
278	0.43
279	0.43
280	0.45
281	0.47
282	0.5
283	0.49
284	0.53
285	0.52
286	0.45
287	0.44
288	0.46
289	0.44
290	0.47
291	0.46
292	0.42
293	0.41
294	0.47
295	0.49
296	0.5
297	0.53
298	0.46
299	0.46
300	0.42
301	0.41
302	0.33
303	0.3
304	0.25
305	0.18
306	0.16
307	0.12
308	0.11
309	0.09
310	0.1
311	0.1
312	0.11
313	0.15
314	0.15
315	0.13
316	0.1
317	0.11
318	0.11
319	0.11
320	0.11
321	0.07
322	0.07
323	0.07
324	0.08
325	0.08
326	0.08
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.07
331	0.07
332	0.06
333	0.06
334	0.05
335	0.05
336	0.06
337	0.07
338	0.06
339	0.06
340	0.08
341	0.07
342	0.08
343	0.08
344	0.08
345	0.08
346	0.08
347	0.11
348	0.12
349	0.12
350	0.11
351	0.12
352	0.11
353	0.11
354	0.1
355	0.06
356	0.04
357	0.05
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.07
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.07
376	0.07
377	0.09
378	0.08
379	0.09
380	0.09
381	0.12
382	0.12
383	0.11
384	0.11
385	0.11
386	0.1
387	0.1
388	0.09
389	0.07
390	0.07
391	0.07
392	0.07
393	0.05
394	0.05
395	0.09
396	0.1
397	0.18
398	0.23
399	0.24
400	0.28
401	0.31
402	0.35
403	0.41
404	0.5
405	0.52
406	0.58
407	0.59
408	0.59
409	0.65
410	0.67
411	0.67
412	0.65
413	0.61
414	0.58
415	0.64
416	0.68
417	0.69
418	0.74
419	0.74
420	0.76
421	0.73
422	0.74
423	0.71
424	0.63
425	0.57
426	0.48
427	0.39
428	0.29
429	0.25
430	0.2
431	0.16
432	0.16
433	0.15
434	0.15
435	0.13
436	0.12
437	0.12
438	0.11
439	0.11
440	0.12
441	0.12
442	0.13
443	0.19
444	0.22
445	0.25
446	0.29
447	0.33
448	0.39
449	0.39
450	0.41
451	0.4
452	0.39
453	0.38
454	0.34
455	0.28
456	0.21
457	0.2
458	0.14
459	0.1
460	0.07
461	0.07
462	0.06
463	0.07
464	0.08
465	0.12
466	0.12
467	0.14
468	0.16
469	0.17
470	0.18
471	0.17
472	0.16
473	0.14
474	0.19
475	0.18
476	0.22
477	0.22
478	0.23
479	0.24
480	0.25
481	0.26
482	0.21
483	0.2
484	0.16
485	0.17
486	0.17
487	0.16
488	0.19
489	0.18
490	0.21
491	0.2
492	0.19
493	0.18
494	0.18
495	0.17
496	0.14
497	0.11
498	0.08
499	0.08
500	0.08
501	0.09
502	0.08
503	0.08
504	0.08
505	0.09
506	0.1
507	0.11
508	0.14
509	0.16
510	0.18
511	0.18
512	0.21
513	0.2
514	0.2
515	0.23
516	0.2
517	0.17
518	0.16
519	0.16
520	0.13
521	0.12
522	0.11
523	0.07
524	0.06
525	0.05
526	0.03
527	0.02
528	0.02
529	0.02
530	0.04
531	0.04
532	0.05
533	0.05
534	0.06
535	0.07
536	0.07
537	0.08
538	0.07
539	0.08
540	0.08
541	0.1
542	0.1
543	0.09
544	0.08
545	0.09
546	0.12
547	0.15
548	0.18
549	0.18
550	0.18
551	0.22
552	0.22
553	0.22
554	0.21
555	0.22
556	0.2
557	0.19
558	0.19
559	0.16
560	0.16
561	0.15
562	0.13
563	0.1
564	0.09
565	0.09
566	0.1
567	0.11
568	0.14
569	0.16
570	0.17
571	0.16
572	0.16
573	0.21
574	0.21
575	0.2
576	0.16
577	0.19
578	0.23
579	0.22
580	0.24
581	0.21
582	0.25
583	0.25
584	0.25
585	0.23
586	0.19
587	0.18
588	0.16
589	0.14
590	0.09
591	0.13
592	0.13
593	0.11
594	0.1
595	0.13
596	0.14
597	0.16
598	0.17
599	0.19
600	0.19
601	0.26
602	0.31
603	0.32
604	0.32
605	0.35
606	0.43
607	0.38
608	0.38
609	0.38
610	0.33
611	0.36
612	0.36
613	0.34
614	0.25
615	0.27
616	0.26
617	0.21
618	0.19
619	0.12
620	0.11
621	0.09
622	0.08
623	0.05
624	0.05
625	0.03
626	0.03
627	0.03
628	0.05
629	0.05
630	0.05
631	0.06
632	0.06
633	0.07
634	0.12
635	0.16
636	0.16
637	0.18
638	0.2
639	0.27
640	0.3
641	0.33
642	0.3
643	0.27
644	0.27
645	0.29
646	0.3
647	0.23
648	0.2
649	0.17
650	0.15
651	0.16
652	0.18
653	0.13
654	0.1
655	0.13
656	0.13
657	0.14
658	0.14
659	0.14
660	0.16
661	0.21
662	0.3
663	0.28
664	0.35
665	0.39
666	0.44
667	0.44
668	0.43
669	0.41
670	0.33
671	0.31
672	0.26
673	0.22
674	0.17
675	0.15
676	0.11
677	0.09
678	0.07
679	0.08
680	0.07
681	0.06
682	0.05
683	0.06
684	0.06
685	0.07
686	0.09
687	0.11
688	0.11
689	0.11
690	0.12
691	0.12
692	0.15
693	0.16
694	0.14
695	0.11
696	0.13
697	0.13
698	0.11
699	0.11
700	0.08
701	0.08
702	0.07
703	0.06
704	0.06
705	0.06
706	0.05
707	0.05
708	0.05
709	0.06
710	0.09
711	0.08
712	0.08
713	0.09
714	0.09
715	0.09
716	0.12
717	0.12
718	0.1
719	0.1
720	0.11
721	0.14
722	0.15
723	0.14
724	0.12
725	0.1
726	0.11
727	0.11
728	0.1
729	0.08
730	0.08
731	0.12
732	0.14
733	0.14
734	0.15
735	0.24
736	0.3
737	0.37
738	0.39
739	0.37
740	0.35
741	0.36
742	0.34
743	0.28
744	0.24
745	0.18
746	0.23
747	0.25
748	0.25
749	0.24
750	0.24
751	0.21
752	0.2
753	0.19
754	0.11
755	0.09
756	0.09
757	0.09
758	0.1
759	0.11
760	0.11
761	0.11
762	0.2
763	0.2
764	0.2
765	0.21
766	0.2
767	0.21
768	0.25
769	0.26
770	0.2
771	0.23
772	0.23
773	0.22
774	0.22
775	0.22
776	0.2
777	0.21
778	0.21
779	0.25
780	0.33
781	0.42
782	0.5
783	0.53
784	0.59
785	0.58
786	0.57
787	0.52
788	0.44
789	0.35
790	0.28
791	0.23
792	0.14
793	0.12
794	0.11
795	0.09
796	0.08
797	0.08
798	0.06
799	0.06
800	0.06
801	0.08
802	0.08
803	0.08
804	0.1
805	0.11
806	0.12
807	0.12
808	0.13
809	0.11
810	0.11
811	0.12
812	0.1
813	0.08
814	0.09
815	0.09
816	0.08
817	0.09
818	0.1
819	0.09
820	0.09
821	0.11
822	0.14
823	0.15
824	0.16
825	0.15
826	0.14
827	0.13
828	0.13
829	0.13
830	0.09
831	0.1
832	0.11
833	0.13
834	0.13
835	0.16
836	0.19
837	0.22
838	0.27
839	0.33
840	0.34
841	0.34
842	0.37
843	0.38
844	0.4
845	0.44
846	0.42
847	0.36
848	0.4
849	0.46
850	0.46
851	0.45
852	0.41
853	0.4
854	0.39
855	0.41
856	0.41
857	0.37
858	0.36
859	0.34
860	0.38
861	0.32
862	0.3
863	0.27
864	0.21
865	0.19
866	0.19
867	0.21
868	0.23
869	0.34
870	0.42
871	0.47
872	0.56
873	0.55
874	0.52
875	0.54
876	0.49
877	0.4
878	0.32
879	0.26
880	0.18
881	0.17
882	0.18
883	0.15
884	0.12
885	0.1
886	0.11
887	0.1
888	0.12
889	0.2
890	0.23
891	0.28
892	0.36
893	0.37
894	0.39
895	0.41
896	0.46
897	0.41
898	0.45
899	0.47
900	0.43
901	0.53
902	0.59
903	0.61
904	0.61
905	0.68
906	0.68
907	0.7
908	0.71
909	0.63
910	0.57
911	0.54
912	0.49
913	0.47
914	0.45
915	0.42
916	0.41
917	0.43
918	0.41
919	0.46
920	0.47
921	0.43
922	0.37
923	0.33
924	0.34
925	0.33
926	0.32
927	0.29
928	0.3
929	0.32
930	0.35
931	0.33
932	0.31
933	0.28
934	0.29
935	0.27
936	0.24
937	0.24
938	0.2
939	0.25
940	0.23
941	0.24
942	0.23
943	0.22
944	0.23
945	0.19
946	0.29
947	0.24
948	0.25
949	0.27
950	0.31
951	0.36
952	0.37
953	0.43
954	0.36
955	0.39
956	0.42
957	0.41
958	0.36
959	0.38
960	0.36
961	0.3
962	0.31
963	0.34
964	0.33
965	0.32
966	0.32
967	0.28
968	0.26
969	0.35
970	0.35
971	0.32
972	0.31
973	0.31
974	0.33
975	0.34
976	0.4
977	0.34
978	0.32
979	0.29
980	0.28
981	0.26
982	0.24
983	0.22
984	0.15
985	0.13
986	0.13
987	0.13
988	0.12
989	0.11
990	0.11
991	0.13
992	0.13
993	0.11
994	0.11
995	0.11
996	0.11
997	0.14
998	0.13
999	0.13
1000	0.14
1001	0.14
1002	0.12
1003	0.13
1004	0.13
1005	0.11
1006	0.11
1007	0.09
1008	0.14
1009	0.14
1010	0.17
1011	0.17
1012	0.17
1013	0.18
1014	0.19
1015	0.24
1016	0.25
1017	0.28
1018	0.27
1019	0.27
1020	0.26
1021	0.27
1022	0.29
1023	0.27
1024	0.28
1025	0.29
1026	0.31
1027	0.31
1028	0.34
1029	0.37
1030	0.36
1031	0.36
1032	0.3
1033	0.26
1034	0.22
1035	0.22
1036	0.19
1037	0.17
1038	0.13
1039	0.1
1040	0.09
1041	0.08
1042	0.07
1043	0.06
1044	0.05
1045	0.03
1046	0.03
1047	0.02
1048	0.02
1049	0.03
1050	0.03
1051	0.04
1052	0.04
1053	0.05
1054	0.07
1055	0.08
1056	0.15
1057	0.23
1058	0.27
1059	0.32
1060	0.36
1061	0.36
1062	0.36
1063	0.36
1064	0.3
1065	0.26
1066	0.25
1067	0.19
1068	0.18
1069	0.18
1070	0.18
1071	0.17
1072	0.18

R1ER45

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer