Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1EJ97

Protein Details
Accession R1EJ97    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
242-264LRDRGRMPRKGHPTKKKAKAAAABasic
380-401EVAKKVLKHLKAKRAERLREAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
227-261KKAAKAHAARDAVRWLRDRGRMPRKGHPTKKKAKA
376-396NAKEEVAKKVLKHLKAKRAER
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_mito 11, mito 9.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014720  dsRBD_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG npa:UCRNP2_5375  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50137  DS_RBD  
Amino Acid Sequences MASQAFPQKITGLGASQAQSIEDWEAQMADASKQELASTAAAHAVPSSSDPPPPFKAGRVWSSEPVATFNNLCLKHAVANAYDYAQTRPSPPGWAVTLNFRYGQLIGGGEDFNVSLAGPYGSKKEAKAAAAEEGVKLLTEALAKAATNKRKKADDDTGVNDDAQEGSDDENENWIGLLCEYCQAAGKARPMFQEFSLGANYSMECTLSSEEGADRPFGDRHALFNNKKAAKAHAARDAVRWLRDRGRMPRKGHPTKKKAKAAAAAAVSIPLPAGLAPLPAPMPIGGVDANAPAPAAGAEESDGSSAGSPDHKDRSLGEQVMMLCSRLGVAQPVYRITPDPRVPSMWSGAAFFPHDPAMAPPGQAVGEVANIYGKKNAKEEVAKKVLKHLKAKRAERLREAEGVLAGVGAASG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.19
4 0.18
5 0.16
6 0.15
7 0.15
8 0.16
9 0.13
10 0.12
11 0.11
12 0.11
13 0.11
14 0.13
15 0.12
16 0.1
17 0.11
18 0.12
19 0.13
20 0.12
21 0.12
22 0.12
23 0.13
24 0.12
25 0.12
26 0.11
27 0.12
28 0.12
29 0.12
30 0.11
31 0.09
32 0.09
33 0.11
34 0.14
35 0.13
36 0.18
37 0.2
38 0.26
39 0.29
40 0.35
41 0.34
42 0.33
43 0.39
44 0.41
45 0.44
46 0.46
47 0.47
48 0.45
49 0.47
50 0.45
51 0.38
52 0.35
53 0.31
54 0.25
55 0.21
56 0.2
57 0.24
58 0.23
59 0.23
60 0.22
61 0.21
62 0.22
63 0.25
64 0.24
65 0.17
66 0.19
67 0.19
68 0.18
69 0.2
70 0.17
71 0.17
72 0.17
73 0.17
74 0.18
75 0.21
76 0.2
77 0.22
78 0.21
79 0.23
80 0.22
81 0.25
82 0.24
83 0.28
84 0.3
85 0.28
86 0.27
87 0.24
88 0.23
89 0.2
90 0.19
91 0.12
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.07
99 0.06
100 0.05
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.05
105 0.05
106 0.06
107 0.09
108 0.11
109 0.13
110 0.13
111 0.18
112 0.21
113 0.22
114 0.23
115 0.22
116 0.22
117 0.22
118 0.22
119 0.16
120 0.13
121 0.12
122 0.1
123 0.08
124 0.06
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.11
132 0.19
133 0.26
134 0.33
135 0.38
136 0.41
137 0.46
138 0.49
139 0.52
140 0.54
141 0.52
142 0.5
143 0.5
144 0.49
145 0.44
146 0.41
147 0.32
148 0.24
149 0.17
150 0.13
151 0.08
152 0.05
153 0.05
154 0.07
155 0.08
156 0.07
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.09
172 0.12
173 0.16
174 0.17
175 0.19
176 0.21
177 0.23
178 0.24
179 0.22
180 0.23
181 0.19
182 0.18
183 0.17
184 0.15
185 0.13
186 0.12
187 0.11
188 0.08
189 0.07
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.11
206 0.1
207 0.12
208 0.18
209 0.26
210 0.25
211 0.3
212 0.38
213 0.36
214 0.37
215 0.36
216 0.33
217 0.34
218 0.38
219 0.36
220 0.36
221 0.37
222 0.36
223 0.37
224 0.39
225 0.33
226 0.32
227 0.3
228 0.26
229 0.29
230 0.34
231 0.38
232 0.43
233 0.51
234 0.56
235 0.58
236 0.64
237 0.69
238 0.74
239 0.79
240 0.79
241 0.79
242 0.81
243 0.87
244 0.86
245 0.8
246 0.75
247 0.7
248 0.63
249 0.58
250 0.48
251 0.38
252 0.3
253 0.25
254 0.2
255 0.13
256 0.1
257 0.05
258 0.04
259 0.03
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.06
294 0.08
295 0.1
296 0.14
297 0.18
298 0.19
299 0.2
300 0.21
301 0.27
302 0.32
303 0.31
304 0.28
305 0.26
306 0.26
307 0.28
308 0.27
309 0.2
310 0.13
311 0.11
312 0.11
313 0.08
314 0.09
315 0.08
316 0.1
317 0.12
318 0.14
319 0.16
320 0.17
321 0.18
322 0.2
323 0.21
324 0.27
325 0.3
326 0.34
327 0.35
328 0.37
329 0.38
330 0.38
331 0.38
332 0.32
333 0.27
334 0.24
335 0.22
336 0.21
337 0.21
338 0.18
339 0.16
340 0.14
341 0.14
342 0.12
343 0.13
344 0.16
345 0.15
346 0.15
347 0.13
348 0.14
349 0.14
350 0.13
351 0.12
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.1
357 0.11
358 0.12
359 0.17
360 0.2
361 0.22
362 0.25
363 0.28
364 0.31
365 0.4
366 0.45
367 0.49
368 0.55
369 0.56
370 0.53
371 0.61
372 0.62
373 0.6
374 0.66
375 0.65
376 0.65
377 0.72
378 0.8
379 0.8
380 0.82
381 0.82
382 0.81
383 0.78
384 0.73
385 0.67
386 0.61
387 0.52
388 0.42
389 0.34
390 0.25
391 0.18
392 0.13