Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1E5T1

Protein Details
Accession R1E5T1    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
243-275SDSDSDADKKKKKKKKTVKKEKTPKKEAKDESSBasic
371-393VTKGKGFTKEKNKGKRGSYRGGLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-26KKAAKTAGKVTKSKADSKSKIH
127-133LKKKAKK
251-270KKKKKKKKTVKKEKTPKKEA
378-386TKEKNKGKR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
KEGG npa:UCRNP2_10266  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MAKDKKAAKTAGKVTKSKADSKSKIHPKAPAALLDLVNAFLVDHGYEKTAQELQSEAGQRDSAWKDAAKGKPKLASIFEEWEEDREIDEEIKEEHGKAKKEEDSDASSDSESSGSDSDSSDSEDKPLKKKAKKEAAPSGSSDESSSSSDEDSADSDSDSESDAESVASASSSSSSSSASSKASASSSSSSGSSSSSSSSSSSSSSSSAGSKKSAASASSSDSDSDSNSGSSSSSSDSDSDSSSDSDSDADKKKKKKKKTVKKEKTPKKEAKDESSASSNSSSDGSDTISSGSPAPNTTPSNKRKRDASAADTPSNTTSGADTSDNGNGNKRAKTNEPFSRIPKDIYVDPKFSSNAYVPYDYAQRAHEKLIVTKGKGFTKEKNKGKRGSYRGGLIDTNAVNGIRFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.68
3 0.66
4 0.66
5 0.65
6 0.66
7 0.65
8 0.68
9 0.74
10 0.75
11 0.79
12 0.76
13 0.74
14 0.68
15 0.69
16 0.66
17 0.58
18 0.52
19 0.47
20 0.42
21 0.36
22 0.32
23 0.23
24 0.19
25 0.15
26 0.11
27 0.06
28 0.07
29 0.06
30 0.07
31 0.07
32 0.09
33 0.1
34 0.11
35 0.14
36 0.17
37 0.18
38 0.17
39 0.18
40 0.17
41 0.22
42 0.25
43 0.22
44 0.19
45 0.19
46 0.18
47 0.24
48 0.25
49 0.22
50 0.21
51 0.21
52 0.24
53 0.32
54 0.4
55 0.42
56 0.44
57 0.46
58 0.49
59 0.51
60 0.51
61 0.46
62 0.43
63 0.38
64 0.39
65 0.35
66 0.33
67 0.31
68 0.29
69 0.27
70 0.22
71 0.19
72 0.14
73 0.14
74 0.12
75 0.12
76 0.11
77 0.1
78 0.13
79 0.13
80 0.13
81 0.19
82 0.24
83 0.27
84 0.28
85 0.34
86 0.35
87 0.37
88 0.39
89 0.37
90 0.36
91 0.35
92 0.34
93 0.29
94 0.24
95 0.21
96 0.19
97 0.15
98 0.1
99 0.09
100 0.08
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.12
107 0.13
108 0.12
109 0.15
110 0.21
111 0.24
112 0.28
113 0.36
114 0.42
115 0.47
116 0.55
117 0.63
118 0.67
119 0.7
120 0.74
121 0.76
122 0.73
123 0.69
124 0.62
125 0.56
126 0.46
127 0.39
128 0.31
129 0.21
130 0.17
131 0.16
132 0.15
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.04
154 0.04
155 0.03
156 0.03
157 0.04
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.07
163 0.08
164 0.1
165 0.09
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.11
170 0.1
171 0.11
172 0.11
173 0.12
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.08
181 0.09
182 0.08
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.12
194 0.13
195 0.13
196 0.14
197 0.14
198 0.13
199 0.15
200 0.15
201 0.13
202 0.13
203 0.13
204 0.15
205 0.15
206 0.15
207 0.14
208 0.13
209 0.13
210 0.11
211 0.11
212 0.09
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.13
235 0.19
236 0.26
237 0.32
238 0.42
239 0.52
240 0.6
241 0.7
242 0.76
243 0.81
244 0.85
245 0.9
246 0.92
247 0.94
248 0.96
249 0.96
250 0.96
251 0.95
252 0.94
253 0.92
254 0.88
255 0.87
256 0.82
257 0.78
258 0.74
259 0.66
260 0.58
261 0.53
262 0.46
263 0.37
264 0.32
265 0.25
266 0.18
267 0.17
268 0.13
269 0.09
270 0.1
271 0.1
272 0.09
273 0.09
274 0.1
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.11
279 0.1
280 0.1
281 0.12
282 0.15
283 0.18
284 0.23
285 0.32
286 0.4
287 0.51
288 0.56
289 0.58
290 0.59
291 0.63
292 0.67
293 0.64
294 0.62
295 0.61
296 0.6
297 0.6
298 0.54
299 0.49
300 0.4
301 0.34
302 0.27
303 0.17
304 0.12
305 0.1
306 0.12
307 0.11
308 0.11
309 0.13
310 0.17
311 0.19
312 0.19
313 0.23
314 0.26
315 0.29
316 0.33
317 0.33
318 0.34
319 0.39
320 0.45
321 0.5
322 0.54
323 0.57
324 0.58
325 0.61
326 0.64
327 0.59
328 0.54
329 0.48
330 0.43
331 0.42
332 0.46
333 0.46
334 0.41
335 0.4
336 0.41
337 0.38
338 0.34
339 0.32
340 0.25
341 0.26
342 0.27
343 0.27
344 0.25
345 0.27
346 0.31
347 0.28
348 0.27
349 0.25
350 0.27
351 0.27
352 0.29
353 0.3
354 0.27
355 0.31
356 0.39
357 0.41
358 0.38
359 0.42
360 0.46
361 0.48
362 0.53
363 0.54
364 0.54
365 0.58
366 0.67
367 0.71
368 0.76
369 0.79
370 0.79
371 0.84
372 0.85
373 0.82
374 0.81
375 0.77
376 0.73
377 0.68
378 0.63
379 0.55
380 0.46
381 0.43
382 0.34
383 0.29
384 0.24
385 0.2
386 0.17