Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1GHY4

Protein Details
Accession R1GHY4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MATRASKRRKVKDTNGSRSNSLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11, mito 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR001578  Peptidase_C12_UCH  
IPR036959  Peptidase_C12_UCH_sf  
Gene Ontology GO:0004843  F:cysteine-type deubiquitinase activity  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG npa:UCRNP2_5354  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01088  Peptidase_C12  
CDD cd09617  Peptidase_C12_UCH37_BAP1  
Amino Acid Sequences MATRASKRRKVKDTNGSRSNSLPEDRVFPNDASVAASADDKRKWQGFCEIENDPAFFNVMIQEFGVQGVKVQEVFGLDEALLAMLPKPVYGLIFLFRYVEDDFIQQESTCPEHVWFSNQTTGNACATVALLNIIMNIPDIELGENLRSFKDFTQDFTPATRGEQIVHYEFVKNIHNSFARKIDMMNIDLNMKNDATSKSKASKSASKKSKNNDAAFHFIAFMPIAGEVWKLDGLDRQPQRLEKIEEGMDWLEVVAPNLEARMAQYEEGQIEFGLLSLVRDPLLDHRQHLAENIKLIRACEDRLAQVNPDWNAFAITEDGAGDSVLTGPSSEYSLTIADILQANIPTATQRRINADDDITTLIDLRQKAVTDQAGLRAAIRDEEMTAAADREKAESRRHDYGPAIQTWLRMLAEEGVLKDLIQEVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.89
3 0.83
4 0.75
5 0.68
6 0.62
7 0.56
8 0.48
9 0.42
10 0.35
11 0.36
12 0.36
13 0.37
14 0.35
15 0.3
16 0.29
17 0.26
18 0.25
19 0.21
20 0.19
21 0.15
22 0.12
23 0.15
24 0.15
25 0.19
26 0.21
27 0.22
28 0.28
29 0.32
30 0.33
31 0.34
32 0.41
33 0.41
34 0.43
35 0.45
36 0.41
37 0.41
38 0.41
39 0.38
40 0.28
41 0.24
42 0.21
43 0.15
44 0.14
45 0.11
46 0.11
47 0.1
48 0.1
49 0.1
50 0.09
51 0.1
52 0.11
53 0.08
54 0.08
55 0.09
56 0.1
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.11
62 0.1
63 0.09
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.07
68 0.06
69 0.05
70 0.05
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.07
76 0.07
77 0.08
78 0.09
79 0.1
80 0.11
81 0.11
82 0.12
83 0.11
84 0.13
85 0.13
86 0.13
87 0.12
88 0.12
89 0.13
90 0.13
91 0.14
92 0.11
93 0.12
94 0.12
95 0.13
96 0.13
97 0.12
98 0.12
99 0.14
100 0.15
101 0.19
102 0.2
103 0.2
104 0.27
105 0.27
106 0.28
107 0.27
108 0.28
109 0.24
110 0.21
111 0.18
112 0.11
113 0.11
114 0.1
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.16
138 0.15
139 0.17
140 0.22
141 0.23
142 0.23
143 0.23
144 0.25
145 0.19
146 0.19
147 0.18
148 0.14
149 0.13
150 0.15
151 0.17
152 0.16
153 0.17
154 0.17
155 0.15
156 0.15
157 0.16
158 0.18
159 0.16
160 0.15
161 0.18
162 0.2
163 0.21
164 0.23
165 0.24
166 0.21
167 0.2
168 0.2
169 0.21
170 0.2
171 0.2
172 0.18
173 0.16
174 0.17
175 0.17
176 0.18
177 0.14
178 0.12
179 0.1
180 0.11
181 0.13
182 0.15
183 0.16
184 0.18
185 0.23
186 0.25
187 0.28
188 0.3
189 0.37
190 0.41
191 0.49
192 0.56
193 0.59
194 0.63
195 0.65
196 0.72
197 0.71
198 0.66
199 0.61
200 0.55
201 0.51
202 0.46
203 0.4
204 0.31
205 0.22
206 0.19
207 0.14
208 0.1
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.03
215 0.04
216 0.05
217 0.04
218 0.05
219 0.07
220 0.09
221 0.17
222 0.18
223 0.19
224 0.21
225 0.23
226 0.25
227 0.28
228 0.29
229 0.22
230 0.24
231 0.23
232 0.21
233 0.21
234 0.18
235 0.13
236 0.1
237 0.09
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.08
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.07
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.11
269 0.18
270 0.19
271 0.2
272 0.22
273 0.23
274 0.24
275 0.26
276 0.24
277 0.19
278 0.23
279 0.22
280 0.22
281 0.21
282 0.21
283 0.23
284 0.2
285 0.2
286 0.19
287 0.2
288 0.2
289 0.23
290 0.24
291 0.21
292 0.21
293 0.25
294 0.23
295 0.22
296 0.2
297 0.16
298 0.15
299 0.14
300 0.13
301 0.08
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.05
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.07
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.07
324 0.08
325 0.09
326 0.09
327 0.1
328 0.1
329 0.1
330 0.09
331 0.1
332 0.11
333 0.13
334 0.16
335 0.19
336 0.21
337 0.27
338 0.31
339 0.34
340 0.34
341 0.33
342 0.3
343 0.28
344 0.27
345 0.21
346 0.17
347 0.15
348 0.13
349 0.15
350 0.14
351 0.15
352 0.15
353 0.15
354 0.16
355 0.21
356 0.21
357 0.21
358 0.22
359 0.25
360 0.25
361 0.24
362 0.24
363 0.21
364 0.2
365 0.17
366 0.17
367 0.13
368 0.12
369 0.13
370 0.12
371 0.12
372 0.12
373 0.12
374 0.12
375 0.13
376 0.13
377 0.15
378 0.21
379 0.24
380 0.31
381 0.39
382 0.46
383 0.51
384 0.53
385 0.54
386 0.51
387 0.56
388 0.54
389 0.47
390 0.45
391 0.39
392 0.38
393 0.35
394 0.35
395 0.25
396 0.19
397 0.19
398 0.16
399 0.18
400 0.19
401 0.18
402 0.17
403 0.17
404 0.16
405 0.15