FuNGI

F4RFB6

Protein Details

Accession

F4RFB6

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
40-61	VERPNEIKSKRKHQGQSRSELE	Hydrophilic
543-565	KAEVKMERAARRQEKKNTKVSFV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
532-559	RNEDKESKKLRKAEVKMERAARRQEKKN

Subcellular Location(s)

nucl 26

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
KEGG	mlr:MELLADRAFT_84321 -
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MAPKSIFRGPDAKHYAVVHRSQRDPLINDPEAGDRVLYEVERPNEIKSKRKHQGQSRSELESSLGSQTTSIRPNVGEATMYDIFYDDSEYDYMQHLKPVGVSKDAILLNKPEARQEKPKSFGLREENPSSASSSSSRLPNSVLPTPNEQILSYKDHLEFALPSNSALSDGLIPAINDPSIREIMEALEDDAFVEEEANDAFFGQIVKDGERDDGDEPEWINELKDQPVELTQWDRTVGQFKQSTKERQVSDDGRSDVSSNDQDHLQFSRSGKDVGKKKSGSSQFGSKAGSAFSMSSSAMYRNEGLSNLDDRFDKIEKEYEDSDEDSDTASENSNQTATPNTMYEEREDFEEIMNDFLDRFEVLGGKMKPILKGKTPLEKLDTLRKEILIEDEDRDEDLERRLMKEKILIRLDEEEKKEMRRVVKETEVLEFETIEDRHNKWDCESILSTYSNVENHPRVIRIRDTLDHVKKQTEVATKVEIDRLTGFPVVNGQIVRGTINTQETKDDEEEDSDDDSDAETSVPIRETIKRDRNEDKESKKLRKAEVKMERAARRQEKKNTKVSFVDERNKQQKIAQRLAIRKASDVAGLGGKSIVALL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.5
3	0.48
4	0.54
5	0.52
6	0.51
7	0.52
8	0.52
9	0.57
10	0.56
11	0.54
12	0.53
13	0.54
14	0.48
15	0.46
16	0.43
17	0.4
18	0.34
19	0.3
20	0.23
21	0.13
22	0.13
23	0.14
24	0.13
25	0.13
26	0.18
27	0.2
28	0.25
29	0.27
30	0.29
31	0.37
32	0.41
33	0.46
34	0.49
35	0.57
36	0.62
37	0.71
38	0.76
39	0.78
40	0.85
41	0.84
42	0.85
43	0.79
44	0.76
45	0.66
46	0.57
47	0.48
48	0.39
49	0.32
50	0.25
51	0.2
52	0.14
53	0.14
54	0.16
55	0.2
56	0.22
57	0.21
58	0.2
59	0.2
60	0.23
61	0.24
62	0.22
63	0.18
64	0.14
65	0.2
66	0.2
67	0.2
68	0.17
69	0.15
70	0.15
71	0.14
72	0.16
73	0.08
74	0.09
75	0.1
76	0.1
77	0.11
78	0.13
79	0.17
80	0.15
81	0.17
82	0.16
83	0.16
84	0.19
85	0.24
86	0.24
87	0.23
88	0.23
89	0.21
90	0.26
91	0.28
92	0.26
93	0.21
94	0.21
95	0.24
96	0.27
97	0.27
98	0.28
99	0.31
100	0.36
101	0.44
102	0.51
103	0.54
104	0.55
105	0.61
106	0.61
107	0.59
108	0.61
109	0.59
110	0.58
111	0.57
112	0.56
113	0.5
114	0.45
115	0.43
116	0.37
117	0.29
118	0.23
119	0.18
120	0.17
121	0.19
122	0.22
123	0.22
124	0.21
125	0.23
126	0.25
127	0.29
128	0.32
129	0.32
130	0.3
131	0.35
132	0.35
133	0.35
134	0.32
135	0.27
136	0.22
137	0.22
138	0.25
139	0.21
140	0.24
141	0.22
142	0.22
143	0.22
144	0.21
145	0.19
146	0.16
147	0.19
148	0.16
149	0.15
150	0.15
151	0.15
152	0.14
153	0.13
154	0.1
155	0.06
156	0.06
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.07
161	0.08
162	0.07
163	0.07
164	0.07
165	0.09
166	0.1
167	0.1
168	0.09
169	0.09
170	0.09
171	0.1
172	0.1
173	0.08
174	0.07
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.06
179	0.05
180	0.05
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.04
190	0.04
191	0.07
192	0.08
193	0.08
194	0.09
195	0.1
196	0.11
197	0.11
198	0.13
199	0.11
200	0.12
201	0.12
202	0.12
203	0.12
204	0.11
205	0.12
206	0.1
207	0.09
208	0.1
209	0.11
210	0.11
211	0.11
212	0.1
213	0.1
214	0.11
215	0.12
216	0.11
217	0.13
218	0.12
219	0.12
220	0.13
221	0.13
222	0.13
223	0.17
224	0.16
225	0.19
226	0.23
227	0.23
228	0.3
229	0.35
230	0.4
231	0.41
232	0.47
233	0.42
234	0.41
235	0.46
236	0.42
237	0.41
238	0.39
239	0.34
240	0.29
241	0.28
242	0.25
243	0.19
244	0.18
245	0.17
246	0.13
247	0.13
248	0.13
249	0.13
250	0.14
251	0.15
252	0.13
253	0.14
254	0.13
255	0.16
256	0.16
257	0.18
258	0.19
259	0.25
260	0.31
261	0.34
262	0.41
263	0.38
264	0.38
265	0.45
266	0.47
267	0.45
268	0.4
269	0.41
270	0.36
271	0.37
272	0.37
273	0.29
274	0.24
275	0.2
276	0.17
277	0.11
278	0.08
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.08
285	0.08
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.09
290	0.09
291	0.09
292	0.1
293	0.11
294	0.11
295	0.11
296	0.1
297	0.11
298	0.13
299	0.13
300	0.12
301	0.11
302	0.16
303	0.15
304	0.18
305	0.19
306	0.17
307	0.18
308	0.18
309	0.18
310	0.13
311	0.13
312	0.1
313	0.09
314	0.07
315	0.06
316	0.06
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.07
323	0.09
324	0.09
325	0.09
326	0.09
327	0.1
328	0.12
329	0.13
330	0.15
331	0.15
332	0.14
333	0.14
334	0.15
335	0.14
336	0.11
337	0.13
338	0.11
339	0.1
340	0.09
341	0.08
342	0.07
343	0.06
344	0.06
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.05
349	0.05
350	0.12
351	0.12
352	0.13
353	0.16
354	0.18
355	0.21
356	0.26
357	0.28
358	0.26
359	0.33
360	0.36
361	0.42
362	0.43
363	0.42
364	0.41
365	0.42
366	0.41
367	0.44
368	0.42
369	0.37
370	0.35
371	0.33
372	0.29
373	0.26
374	0.26
375	0.18
376	0.17
377	0.15
378	0.15
379	0.15
380	0.14
381	0.14
382	0.12
383	0.11
384	0.11
385	0.14
386	0.13
387	0.16
388	0.2
389	0.2
390	0.2
391	0.25
392	0.28
393	0.32
394	0.35
395	0.32
396	0.31
397	0.35
398	0.39
399	0.38
400	0.37
401	0.33
402	0.31
403	0.33
404	0.35
405	0.34
406	0.35
407	0.35
408	0.36
409	0.38
410	0.41
411	0.43
412	0.4
413	0.39
414	0.35
415	0.3
416	0.26
417	0.2
418	0.15
419	0.15
420	0.14
421	0.14
422	0.16
423	0.16
424	0.23
425	0.26
426	0.27
427	0.24
428	0.31
429	0.29
430	0.31
431	0.32
432	0.27
433	0.26
434	0.26
435	0.25
436	0.2
437	0.21
438	0.16
439	0.16
440	0.19
441	0.18
442	0.21
443	0.23
444	0.24
445	0.25
446	0.28
447	0.31
448	0.3
449	0.33
450	0.32
451	0.37
452	0.44
453	0.49
454	0.51
455	0.49
456	0.47
457	0.44
458	0.43
459	0.43
460	0.4
461	0.35
462	0.32
463	0.34
464	0.33
465	0.34
466	0.36
467	0.29
468	0.23
469	0.23
470	0.21
471	0.19
472	0.19
473	0.18
474	0.14
475	0.17
476	0.16
477	0.16
478	0.15
479	0.13
480	0.12
481	0.13
482	0.14
483	0.11
484	0.11
485	0.12
486	0.18
487	0.2
488	0.2
489	0.22
490	0.23
491	0.27
492	0.27
493	0.27
494	0.22
495	0.21
496	0.22
497	0.21
498	0.21
499	0.16
500	0.15
501	0.13
502	0.12
503	0.1
504	0.09
505	0.08
506	0.06
507	0.07
508	0.08
509	0.09
510	0.09
511	0.12
512	0.18
513	0.24
514	0.34
515	0.43
516	0.46
517	0.52
518	0.61
519	0.66
520	0.7
521	0.73
522	0.7
523	0.71
524	0.76
525	0.79
526	0.78
527	0.77
528	0.77
529	0.77
530	0.77
531	0.77
532	0.78
533	0.76
534	0.75
535	0.77
536	0.75
537	0.72
538	0.76
539	0.75
540	0.74
541	0.76
542	0.8
543	0.82
544	0.83
545	0.86
546	0.8
547	0.77
548	0.72
549	0.69
550	0.69
551	0.67
552	0.68
553	0.66
554	0.71
555	0.73
556	0.7
557	0.65
558	0.6
559	0.6
560	0.6
561	0.6
562	0.57
563	0.57
564	0.63
565	0.7
566	0.71
567	0.64
568	0.56
569	0.51
570	0.44
571	0.37
572	0.3
573	0.24
574	0.21
575	0.2
576	0.18
577	0.15
578	0.14

F4RFB6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer