Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1GAR1

Protein Details
Accession R1GAR1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-66FSSPEKSPPKRANARQQDKTLTHydrophilic
223-248DVDKPKRPGRHTTSRKRTNKKSVSVIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
162-180PPSPPKARGKARRRIDFRK
226-242KPKRPGRHTTSRKRTNK
Subcellular Location(s) cyto 11, mito 7, nucl 4, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028386  CENP-C/Mif2/cnp3  
IPR025974  Mif2/CENP-C_cupin  
IPR028929  Mif2_N  
IPR014710  RmlC-like_jellyroll  
Gene Ontology GO:0000776  C:kinetochore  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0019237  F:centromeric DNA binding  
GO:0051382  P:kinetochore assembly  
KEGG npa:UCRNP2_10332  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11699  CENP-C_C  
PF15624  Mif2_N  
Amino Acid Sequences MAPAASKTRDNQFFNVGVQGRKTGITLKDTGVRDEYGMEPIDGIFSSPEKSPPKRANARQQDKTLTSSDMDVQQISPARGKKRIHESVVDEETMLEESELQVNGVGADSPLPAGGDESLQMLEEDDDATVADEEEEEEEVQYSTEIAEPEPESEQEPTPPPPPSPPKARGKARRRIDFRKVIQRGGASEITGRISAKPVEFWRNERIEYAHDGTKKEIVRAEDVDKPKRPGRHTTSRKRTNKKSVSVIEEEEEEELEPEDWEVNEGVLHGFVNGWDEKNHAIIDEGARPEELAYSAARLQTKEVAGATFRYAKIVGLPYFGAGMVDIPPNGCKRLKNSRRMFMAFCLMFGKVAVTVGDSEFSISKGGVWMVPRGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.48
3 0.41
4 0.35
5 0.32
6 0.31
7 0.27
8 0.26
9 0.25
10 0.24
11 0.25
12 0.27
13 0.28
14 0.29
15 0.35
16 0.36
17 0.38
18 0.34
19 0.31
20 0.26
21 0.26
22 0.24
23 0.2
24 0.2
25 0.16
26 0.14
27 0.13
28 0.14
29 0.11
30 0.1
31 0.08
32 0.08
33 0.1
34 0.11
35 0.18
36 0.25
37 0.29
38 0.39
39 0.45
40 0.55
41 0.64
42 0.72
43 0.76
44 0.79
45 0.85
46 0.83
47 0.82
48 0.79
49 0.71
50 0.65
51 0.56
52 0.47
53 0.38
54 0.32
55 0.28
56 0.24
57 0.22
58 0.19
59 0.17
60 0.18
61 0.2
62 0.2
63 0.22
64 0.25
65 0.28
66 0.36
67 0.38
68 0.43
69 0.5
70 0.57
71 0.56
72 0.56
73 0.56
74 0.56
75 0.57
76 0.49
77 0.38
78 0.3
79 0.27
80 0.21
81 0.16
82 0.08
83 0.05
84 0.06
85 0.08
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.06
90 0.07
91 0.07
92 0.06
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.12
142 0.12
143 0.14
144 0.15
145 0.18
146 0.18
147 0.18
148 0.23
149 0.29
150 0.32
151 0.38
152 0.43
153 0.49
154 0.57
155 0.65
156 0.69
157 0.72
158 0.77
159 0.78
160 0.8
161 0.79
162 0.78
163 0.77
164 0.76
165 0.73
166 0.74
167 0.67
168 0.59
169 0.53
170 0.45
171 0.37
172 0.32
173 0.26
174 0.16
175 0.14
176 0.13
177 0.12
178 0.12
179 0.11
180 0.07
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.11
185 0.14
186 0.2
187 0.21
188 0.24
189 0.3
190 0.31
191 0.31
192 0.29
193 0.27
194 0.23
195 0.26
196 0.25
197 0.22
198 0.22
199 0.23
200 0.23
201 0.27
202 0.25
203 0.22
204 0.22
205 0.2
206 0.21
207 0.22
208 0.25
209 0.26
210 0.31
211 0.35
212 0.36
213 0.39
214 0.4
215 0.44
216 0.45
217 0.47
218 0.51
219 0.56
220 0.63
221 0.7
222 0.77
223 0.82
224 0.88
225 0.87
226 0.89
227 0.89
228 0.87
229 0.82
230 0.8
231 0.74
232 0.7
233 0.64
234 0.56
235 0.46
236 0.38
237 0.32
238 0.23
239 0.18
240 0.11
241 0.09
242 0.08
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.06
250 0.06
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.07
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.11
264 0.11
265 0.13
266 0.13
267 0.1
268 0.1
269 0.11
270 0.13
271 0.16
272 0.17
273 0.15
274 0.15
275 0.15
276 0.15
277 0.13
278 0.11
279 0.08
280 0.07
281 0.09
282 0.11
283 0.14
284 0.15
285 0.15
286 0.16
287 0.2
288 0.2
289 0.2
290 0.19
291 0.17
292 0.16
293 0.17
294 0.19
295 0.19
296 0.19
297 0.19
298 0.18
299 0.17
300 0.2
301 0.25
302 0.22
303 0.19
304 0.19
305 0.18
306 0.18
307 0.18
308 0.13
309 0.07
310 0.08
311 0.07
312 0.08
313 0.08
314 0.09
315 0.12
316 0.14
317 0.18
318 0.21
319 0.23
320 0.29
321 0.41
322 0.5
323 0.57
324 0.65
325 0.7
326 0.75
327 0.76
328 0.71
329 0.64
330 0.64
331 0.53
332 0.45
333 0.38
334 0.3
335 0.25
336 0.22
337 0.18
338 0.09
339 0.1
340 0.09
341 0.08
342 0.09
343 0.1
344 0.11
345 0.1
346 0.11
347 0.11
348 0.11
349 0.11
350 0.1
351 0.09
352 0.1
353 0.12
354 0.12
355 0.14