FuNGI

R1ET01

Protein Details

Accession

R1ET01

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
433-455	EFSSKNGHMKRGKKQNGYKDGLA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
344-344	K
467-472	ARLKKS

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
KEGG	npa:UCRNP2_2502 -
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPRRKFIDKKTAQNFHLVYRAQNDPRIHDPDAPDMVFAEVAAPNTHKNRNNSNNAGEGSVRGGKIKSRHDLESEFGDGVRPNEGEAANYGIFYDDSEYDYMQHLRDMGGSGDATFIPAKDKDAEKKGGKSKMKLEDMLRGMTVDEDGRSEAGVSVSSTASSSAADLFGEDLAPSEFYRRTTYQDQQDVPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEAYVEDEDDIFNELAKDRQEVDPQSWEMMGDFLDDDDDGWATDDTVKADNKTKFEAPSPTGAVSDEGVMLPPVEGHAGEEGDDHGDGDWMAEFSKFKKDAKAQKTQKKVGAPSDLQSFVTGASSVTGGRHKKRKGALTSTSNYSMTSSALARTDQLSLLDERFEKYEQEYADDGYGADDNMSMASGMTGMSGMSGLSVYSKASTSSQAGGLRSDFDSILDEFSSKNGHMKRGKKQNGYKDGLAQLDEVRKGLGPARLKKSPKAY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.68
2	0.6
3	0.59
4	0.49
5	0.42
6	0.38
7	0.45
8	0.4
9	0.46
10	0.44
11	0.42
12	0.48
13	0.51
14	0.49
15	0.46
16	0.45
17	0.45
18	0.47
19	0.42
20	0.35
21	0.29
22	0.27
23	0.21
24	0.18
25	0.13
26	0.09
27	0.1
28	0.11
29	0.12
30	0.17
31	0.23
32	0.31
33	0.35
34	0.41
35	0.5
36	0.59
37	0.67
38	0.68
39	0.66
40	0.64
41	0.58
42	0.54
43	0.43
44	0.34
45	0.29
46	0.26
47	0.23
48	0.19
49	0.19
50	0.22
51	0.29
52	0.35
53	0.4
54	0.4
55	0.43
56	0.46
57	0.48
58	0.46
59	0.43
60	0.38
61	0.29
62	0.25
63	0.23
64	0.19
65	0.18
66	0.17
67	0.13
68	0.11
69	0.14
70	0.14
71	0.13
72	0.13
73	0.17
74	0.14
75	0.14
76	0.14
77	0.11
78	0.11
79	0.1
80	0.12
81	0.08
82	0.1
83	0.11
84	0.11
85	0.11
86	0.14
87	0.15
88	0.13
89	0.13
90	0.12
91	0.11
92	0.12
93	0.12
94	0.1
95	0.1
96	0.09
97	0.09
98	0.09
99	0.09
100	0.09
101	0.09
102	0.08
103	0.1
104	0.1
105	0.13
106	0.16
107	0.2
108	0.25
109	0.32
110	0.4
111	0.41
112	0.48
113	0.54
114	0.59
115	0.61
116	0.59
117	0.61
118	0.62
119	0.62
120	0.59
121	0.53
122	0.52
123	0.49
124	0.45
125	0.36
126	0.27
127	0.23
128	0.18
129	0.17
130	0.09
131	0.07
132	0.07
133	0.07
134	0.07
135	0.07
136	0.07
137	0.07
138	0.06
139	0.06
140	0.06
141	0.07
142	0.07
143	0.07
144	0.07
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.06
149	0.05
150	0.05
151	0.05
152	0.05
153	0.05
154	0.05
155	0.05
156	0.04
157	0.04
158	0.05
159	0.06
160	0.06
161	0.08
162	0.09
163	0.1
164	0.16
165	0.16
166	0.22
167	0.27
168	0.34
169	0.38
170	0.44
171	0.43
172	0.4
173	0.42
174	0.37
175	0.31
176	0.26
177	0.18
178	0.12
179	0.12
180	0.1
181	0.07
182	0.06
183	0.07
184	0.06
185	0.08
186	0.08
187	0.08
188	0.09
189	0.12
190	0.12
191	0.12
192	0.12
193	0.11
194	0.11
195	0.11
196	0.11
197	0.07
198	0.07
199	0.07
200	0.06
201	0.06
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.06
213	0.07
214	0.08
215	0.08
216	0.09
217	0.11
218	0.14
219	0.15
220	0.17
221	0.18
222	0.18
223	0.17
224	0.15
225	0.13
226	0.1
227	0.09
228	0.07
229	0.04
230	0.04
231	0.03
232	0.04
233	0.03
234	0.04
235	0.03
236	0.03
237	0.03
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.05
242	0.05
243	0.06
244	0.09
245	0.1
246	0.1
247	0.17
248	0.2
249	0.21
250	0.24
251	0.25
252	0.24
253	0.26
254	0.29
255	0.24
256	0.25
257	0.25
258	0.22
259	0.2
260	0.19
261	0.17
262	0.12
263	0.11
264	0.08
265	0.06
266	0.06
267	0.05
268	0.05
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.06
281	0.06
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.05
291	0.06
292	0.07
293	0.14
294	0.16
295	0.17
296	0.24
297	0.32
298	0.42
299	0.48
300	0.58
301	0.61
302	0.67
303	0.76
304	0.75
305	0.72
306	0.68
307	0.65
308	0.6
309	0.58
310	0.51
311	0.44
312	0.43
313	0.38
314	0.32
315	0.28
316	0.22
317	0.15
318	0.14
319	0.11
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.07
325	0.13
326	0.18
327	0.26
328	0.35
329	0.37
330	0.44
331	0.51
332	0.58
333	0.6
334	0.63
335	0.64
336	0.64
337	0.65
338	0.63
339	0.58
340	0.5
341	0.42
342	0.34
343	0.26
344	0.18
345	0.16
346	0.12
347	0.11
348	0.12
349	0.12
350	0.12
351	0.12
352	0.13
353	0.12
354	0.12
355	0.13
356	0.13
357	0.14
358	0.15
359	0.15
360	0.15
361	0.16
362	0.17
363	0.16
364	0.16
365	0.2
366	0.18
367	0.21
368	0.21
369	0.2
370	0.19
371	0.18
372	0.16
373	0.12
374	0.12
375	0.08
376	0.07
377	0.06
378	0.06
379	0.05
380	0.06
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.04
396	0.05
397	0.06
398	0.07
399	0.07
400	0.09
401	0.11
402	0.14
403	0.16
404	0.17
405	0.22
406	0.24
407	0.24
408	0.25
409	0.24
410	0.23
411	0.21
412	0.21
413	0.16
414	0.13
415	0.15
416	0.14
417	0.15
418	0.13
419	0.13
420	0.11
421	0.12
422	0.15
423	0.12
424	0.19
425	0.21
426	0.3
427	0.38
428	0.46
429	0.56
430	0.64
431	0.74
432	0.77
433	0.83
434	0.84
435	0.86
436	0.85
437	0.78
438	0.73
439	0.68
440	0.6
441	0.51
442	0.42
443	0.36
444	0.35
445	0.33
446	0.26
447	0.22
448	0.21
449	0.21
450	0.24
451	0.26
452	0.3
453	0.38
454	0.46
455	0.54
456	0.58

R1ET01

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer