Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1EF35

Protein Details
Accession R1EF35    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
353-375DDERGARGPKQRRPRRDEYSDEEAcidic
417-436EQQSRRERRDSPKRTHADDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
295-328KKKKEAEAAERERERVAKLEERAKERQRMKNDRG
359-367RGPKQRRPR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007149  Leo1  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG npa:UCRNP2_7199  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04004  Leo1  
Amino Acid Sequences MASDSENNLFDDDAEATGAVAATNSPPPDQNDDDDDDVVTGRRTTAGAGAASDDDLNDDEPPLEDDDDLFGDGGDDDDEGEQAPAERTLDDEELDSGDDMGRDDRRQSQAGEEFEAMELKMAEASLPRHPVPEPSDNELYLMKVPRFLAVEPRSFVMEKWQPPTADHHSKEPSATFSPFKTAQTTHYEVEGKPLAPPQINPIKPTPTSIRDARKSGPTTYDPSRDSFTYLCTPNQSEQLVRVTNKVTAGLSVLPSKSTTDDSLERLQESLAAAAKARSGTGGAVAVFSLTDDPEKKKKEAEAAERERERVAKLEERAKERQRMKNDRGFGRSGMGRSGGYGSSRYGLSSGYDDDERGARGPKQRRPRRDEYSDEEEDAGPRSRFREDEYDEDDDFIAGSDEEPQTFEDDEDIDERLEQQSRRERRDSPKRTHADDDDDDDEVVAASSRKRRRVVDDDDDEDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.09
3 0.08
4 0.09
5 0.08
6 0.06
7 0.05
8 0.05
9 0.07
10 0.11
11 0.12
12 0.13
13 0.16
14 0.2
15 0.27
16 0.3
17 0.31
18 0.33
19 0.36
20 0.37
21 0.35
22 0.31
23 0.24
24 0.22
25 0.19
26 0.15
27 0.11
28 0.09
29 0.1
30 0.1
31 0.1
32 0.12
33 0.14
34 0.14
35 0.14
36 0.15
37 0.14
38 0.14
39 0.13
40 0.1
41 0.08
42 0.09
43 0.09
44 0.08
45 0.08
46 0.08
47 0.09
48 0.11
49 0.11
50 0.11
51 0.1
52 0.11
53 0.12
54 0.12
55 0.12
56 0.1
57 0.08
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.06
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.06
70 0.07
71 0.07
72 0.08
73 0.08
74 0.09
75 0.12
76 0.13
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.11
81 0.12
82 0.11
83 0.08
84 0.08
85 0.07
86 0.07
87 0.1
88 0.12
89 0.12
90 0.15
91 0.21
92 0.25
93 0.27
94 0.27
95 0.31
96 0.35
97 0.36
98 0.36
99 0.3
100 0.26
101 0.24
102 0.24
103 0.17
104 0.11
105 0.09
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.07
111 0.09
112 0.13
113 0.17
114 0.17
115 0.19
116 0.19
117 0.24
118 0.28
119 0.34
120 0.33
121 0.36
122 0.38
123 0.36
124 0.37
125 0.32
126 0.27
127 0.22
128 0.22
129 0.16
130 0.16
131 0.16
132 0.17
133 0.19
134 0.18
135 0.24
136 0.25
137 0.28
138 0.26
139 0.27
140 0.27
141 0.25
142 0.25
143 0.24
144 0.26
145 0.27
146 0.29
147 0.32
148 0.3
149 0.31
150 0.38
151 0.38
152 0.41
153 0.39
154 0.42
155 0.41
156 0.42
157 0.42
158 0.35
159 0.31
160 0.24
161 0.26
162 0.21
163 0.19
164 0.23
165 0.23
166 0.23
167 0.22
168 0.2
169 0.22
170 0.27
171 0.3
172 0.26
173 0.27
174 0.28
175 0.25
176 0.29
177 0.26
178 0.2
179 0.17
180 0.18
181 0.17
182 0.16
183 0.16
184 0.18
185 0.25
186 0.26
187 0.27
188 0.28
189 0.3
190 0.3
191 0.33
192 0.31
193 0.26
194 0.3
195 0.34
196 0.39
197 0.38
198 0.41
199 0.4
200 0.42
201 0.41
202 0.38
203 0.36
204 0.31
205 0.32
206 0.33
207 0.36
208 0.3
209 0.29
210 0.3
211 0.25
212 0.25
213 0.2
214 0.19
215 0.19
216 0.19
217 0.18
218 0.18
219 0.19
220 0.18
221 0.21
222 0.19
223 0.14
224 0.14
225 0.17
226 0.19
227 0.17
228 0.18
229 0.16
230 0.17
231 0.17
232 0.16
233 0.12
234 0.09
235 0.1
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.11
245 0.11
246 0.12
247 0.14
248 0.17
249 0.21
250 0.21
251 0.2
252 0.18
253 0.17
254 0.15
255 0.13
256 0.11
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.09
262 0.08
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.05
267 0.06
268 0.07
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.06
278 0.08
279 0.12
280 0.2
281 0.24
282 0.25
283 0.27
284 0.3
285 0.36
286 0.42
287 0.47
288 0.51
289 0.54
290 0.61
291 0.59
292 0.58
293 0.51
294 0.44
295 0.36
296 0.29
297 0.27
298 0.25
299 0.28
300 0.35
301 0.39
302 0.43
303 0.51
304 0.53
305 0.57
306 0.6
307 0.63
308 0.66
309 0.71
310 0.73
311 0.72
312 0.74
313 0.71
314 0.67
315 0.61
316 0.51
317 0.46
318 0.41
319 0.34
320 0.27
321 0.23
322 0.18
323 0.17
324 0.18
325 0.14
326 0.12
327 0.12
328 0.12
329 0.12
330 0.12
331 0.12
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.11
336 0.11
337 0.12
338 0.13
339 0.13
340 0.13
341 0.14
342 0.14
343 0.14
344 0.15
345 0.17
346 0.26
347 0.35
348 0.42
349 0.52
350 0.61
351 0.7
352 0.77
353 0.82
354 0.83
355 0.82
356 0.81
357 0.78
358 0.76
359 0.68
360 0.61
361 0.52
362 0.43
363 0.36
364 0.31
365 0.27
366 0.2
367 0.18
368 0.19
369 0.2
370 0.21
371 0.25
372 0.31
373 0.32
374 0.38
375 0.43
376 0.45
377 0.42
378 0.42
379 0.37
380 0.28
381 0.23
382 0.16
383 0.11
384 0.06
385 0.06
386 0.09
387 0.1
388 0.1
389 0.11
390 0.12
391 0.13
392 0.14
393 0.14
394 0.11
395 0.11
396 0.12
397 0.13
398 0.13
399 0.11
400 0.1
401 0.12
402 0.14
403 0.18
404 0.18
405 0.25
406 0.34
407 0.43
408 0.5
409 0.55
410 0.6
411 0.66
412 0.77
413 0.78
414 0.78
415 0.8
416 0.8
417 0.8
418 0.79
419 0.73
420 0.71
421 0.65
422 0.61
423 0.52
424 0.46
425 0.4
426 0.32
427 0.27
428 0.18
429 0.14
430 0.09
431 0.08
432 0.12
433 0.22
434 0.29
435 0.37
436 0.43
437 0.49
438 0.57
439 0.65
440 0.69
441 0.71
442 0.71
443 0.69