FuNGI

R1GMP5

Protein Details

Accession

R1GMP5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
417-441	ERKYEQERIKKRTKRAAKNSENGSV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
424-434	RIKKRTKRAAK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007900 TAF4_C
Gene Ontology	GO:0005669 C:transcription factor TFIID complex GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
KEGG	npa:UCRNP2_3641 -
Pfam	View protein in Pfam PF05236 TAF4

Amino Acid Sequences

MQPPPQPPQRPYSPYPPTASSPVQMSPGGMAMPPANKRQRLSPNPGSPYTPYHNSPYSSMPNTPAQSHTPLPFNQPQPPEQNFDASRGAPPGSMGPPQRPADKQEKPEKEKATDINDLSDVIGASGIDLREEENYLAQTYQNQHQNNSFNTSFSQSPATLSPNTSFNALSQGSFGSHPAFQGAGPVSQPPVSQKSVEEELFEKHKAAARSLAEKSQQELNFPFCRGNTIRHKIGRHTYDQGVKFNVDGLYDRINKDQPQAVSGTQAAGPDGTGIVKAQAAALLDANAPLTEILTLLSLATKERLRGILEDAYALSRSRQLSSHGVVPPEFADIATGNGAPKSVTAVPTSVTKTAWDQPESAVSPMTVPTKRPLDSDTSKNDPSRLPTPPTDTPPTPQPTVSFASDLASTLKKLQSEERKYEQERIKKRTKRAAKNSENGSVPGTPGDKSSPAELTAPLKLTKKERERIAKAGQTDEVLHKAANTTANMAMGGFGKKYSWLSGGGGGGGGGGGGSGASTPSRLNTSVGGASGGGGSGGGTQDRSLAARDRKWGDWREDGPKGKGIQMRDLIAALEQDGNEKKTLARALVRLKSDN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.66
2	0.67
3	0.63
4	0.58
5	0.57
6	0.54
7	0.45
8	0.4
9	0.36
10	0.34
11	0.3
12	0.26
13	0.2
14	0.18
15	0.16
16	0.13
17	0.12
18	0.12
19	0.17
20	0.2
21	0.29
22	0.36
23	0.4
24	0.42
25	0.5
26	0.59
27	0.62
28	0.69
29	0.7
30	0.72
31	0.73
32	0.74
33	0.68
34	0.6
35	0.57
36	0.54
37	0.49
38	0.43
39	0.43
40	0.45
41	0.43
42	0.43
43	0.43
44	0.43
45	0.42
46	0.41
47	0.39
48	0.41
49	0.41
50	0.41
51	0.38
52	0.34
53	0.35
54	0.37
55	0.36
56	0.34
57	0.34
58	0.39
59	0.43
60	0.43
61	0.46
62	0.46
63	0.48
64	0.51
65	0.53
66	0.51
67	0.45
68	0.48
69	0.42
70	0.42
71	0.4
72	0.33
73	0.31
74	0.27
75	0.26
76	0.18
77	0.18
78	0.18
79	0.17
80	0.22
81	0.23
82	0.25
83	0.32
84	0.34
85	0.39
86	0.37
87	0.41
88	0.46
89	0.51
90	0.56
91	0.59
92	0.67
93	0.69
94	0.76
95	0.75
96	0.68
97	0.67
98	0.63
99	0.59
100	0.55
101	0.48
102	0.42
103	0.37
104	0.33
105	0.27
106	0.22
107	0.16
108	0.09
109	0.08
110	0.06
111	0.05
112	0.07
113	0.07
114	0.06
115	0.06
116	0.07
117	0.08
118	0.09
119	0.09
120	0.09
121	0.1
122	0.1
123	0.11
124	0.1
125	0.14
126	0.16
127	0.23
128	0.29
129	0.29
130	0.31
131	0.36
132	0.41
133	0.39
134	0.42
135	0.36
136	0.29
137	0.3
138	0.31
139	0.26
140	0.22
141	0.23
142	0.16
143	0.18
144	0.19
145	0.21
146	0.18
147	0.2
148	0.2
149	0.19
150	0.19
151	0.19
152	0.17
153	0.14
154	0.18
155	0.16
156	0.15
157	0.13
158	0.13
159	0.13
160	0.13
161	0.13
162	0.1
163	0.1
164	0.1
165	0.1
166	0.1
167	0.08
168	0.11
169	0.11
170	0.1
171	0.1
172	0.11
173	0.11
174	0.12
175	0.12
176	0.12
177	0.16
178	0.17
179	0.18
180	0.18
181	0.22
182	0.25
183	0.25
184	0.23
185	0.2
186	0.21
187	0.23
188	0.23
189	0.18
190	0.16
191	0.2
192	0.19
193	0.19
194	0.22
195	0.21
196	0.26
197	0.27
198	0.29
199	0.29
200	0.29
201	0.3
202	0.32
203	0.3
204	0.27
205	0.27
206	0.28
207	0.27
208	0.27
209	0.26
210	0.18
211	0.23
212	0.22
213	0.28
214	0.33
215	0.37
216	0.43
217	0.47
218	0.49
219	0.48
220	0.55
221	0.52
222	0.46
223	0.44
224	0.42
225	0.44
226	0.44
227	0.41
228	0.35
229	0.31
230	0.26
231	0.24
232	0.2
233	0.13
234	0.11
235	0.11
236	0.15
237	0.17
238	0.18
239	0.18
240	0.2
241	0.21
242	0.22
243	0.24
244	0.19
245	0.18
246	0.19
247	0.17
248	0.16
249	0.16
250	0.14
251	0.1
252	0.1
253	0.09
254	0.07
255	0.06
256	0.05
257	0.05
258	0.04
259	0.03
260	0.03
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.05
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.04
274	0.04
275	0.03
276	0.03
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.03
282	0.03
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.06
287	0.07
288	0.07
289	0.08
290	0.1
291	0.1
292	0.11
293	0.14
294	0.14
295	0.13
296	0.13
297	0.12
298	0.11
299	0.11
300	0.1
301	0.08
302	0.09
303	0.1
304	0.11
305	0.11
306	0.15
307	0.18
308	0.19
309	0.25
310	0.23
311	0.23
312	0.22
313	0.22
314	0.18
315	0.15
316	0.14
317	0.08
318	0.07
319	0.06
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.05
327	0.05
328	0.07
329	0.08
330	0.09
331	0.1
332	0.1
333	0.11
334	0.14
335	0.16
336	0.14
337	0.13
338	0.12
339	0.15
340	0.2
341	0.22
342	0.21
343	0.2
344	0.19
345	0.23
346	0.23
347	0.21
348	0.15
349	0.12
350	0.11
351	0.12
352	0.16
353	0.13
354	0.13
355	0.18
356	0.22
357	0.22
358	0.23
359	0.24
360	0.27
361	0.31
362	0.36
363	0.37
364	0.38
365	0.41
366	0.41
367	0.41
368	0.34
369	0.35
370	0.34
371	0.32
372	0.31
373	0.3
374	0.36
375	0.38
376	0.42
377	0.43
378	0.39
379	0.38
380	0.41
381	0.43
382	0.37
383	0.34
384	0.3
385	0.28
386	0.3
387	0.29
388	0.22
389	0.17
390	0.17
391	0.16
392	0.16
393	0.14
394	0.11
395	0.1
396	0.13
397	0.14
398	0.14
399	0.16
400	0.24
401	0.32
402	0.39
403	0.45
404	0.48
405	0.55
406	0.56
407	0.64
408	0.63
409	0.62
410	0.64
411	0.65
412	0.7
413	0.69
414	0.75
415	0.77
416	0.8
417	0.81
418	0.83
419	0.86
420	0.85
421	0.85
422	0.82
423	0.77
424	0.68
425	0.58
426	0.49
427	0.38
428	0.29
429	0.23
430	0.19
431	0.14
432	0.14
433	0.15
434	0.14
435	0.15
436	0.17
437	0.16
438	0.16
439	0.17
440	0.18
441	0.18
442	0.19
443	0.2
444	0.21
445	0.23
446	0.25
447	0.31
448	0.39
449	0.45
450	0.5
451	0.57
452	0.64
453	0.67
454	0.71
455	0.72
456	0.67
457	0.6
458	0.56
459	0.48
460	0.39
461	0.35
462	0.3
463	0.24
464	0.2
465	0.18
466	0.15
467	0.15
468	0.16
469	0.17
470	0.15
471	0.15
472	0.15
473	0.15
474	0.15
475	0.14
476	0.12
477	0.11
478	0.11
479	0.09
480	0.09
481	0.09
482	0.11
483	0.12
484	0.13
485	0.13
486	0.14
487	0.15
488	0.18
489	0.18
490	0.16
491	0.15
492	0.12
493	0.1
494	0.08
495	0.06
496	0.03
497	0.02
498	0.02
499	0.02
500	0.02
501	0.02
502	0.03
503	0.04
504	0.05
505	0.06
506	0.08
507	0.11
508	0.13
509	0.14
510	0.15
511	0.18
512	0.18
513	0.18
514	0.17
515	0.14
516	0.13
517	0.11
518	0.1
519	0.06
520	0.05
521	0.04
522	0.05
523	0.05
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.08
528	0.09
529	0.1
530	0.12
531	0.2
532	0.27
533	0.31
534	0.39
535	0.42
536	0.47
537	0.55
538	0.59
539	0.57
540	0.59
541	0.6
542	0.61
543	0.65
544	0.65
545	0.6
546	0.59
547	0.54
548	0.52
549	0.5
550	0.45
551	0.45
552	0.44
553	0.43
554	0.37
555	0.36
556	0.29
557	0.26
558	0.23
559	0.16
560	0.14
561	0.11
562	0.15
563	0.19
564	0.2
565	0.2
566	0.21
567	0.2
568	0.24
569	0.27
570	0.28
571	0.3
572	0.35
573	0.44
574	0.5

R1GMP5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer