Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1GM08

Protein Details
Accession R1GM08    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
117-138LIADHCKKLKYKRKIILVTNARHydrophilic
512-539SAGDVKRVPPRQKGRKRTREFEKPLSGLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
518-530RVPPRQKGRKRTR
Subcellular Location(s) cyto 13, nucl 7.5, cysk 5, mito_nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006164  Ku70/Ku80_beta-barrel_dom  
IPR024193  Ku80  
IPR036494  Ku_C_sf  
IPR005161  Ku_N  
IPR014893  Ku_PK_bind  
IPR016194  SPOC-like_C_dom_sf  
IPR036465  vWFA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000781  C:chromosome, telomeric region  
GO:0043564  C:Ku70:Ku80 complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0042162  F:telomeric DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006303  P:double-strand break repair via nonhomologous end joining  
GO:0000723  P:telomere maintenance  
KEGG npa:UCRNP2_491  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02735  Ku  
PF03731  Ku_N  
PF08785  Ku_PK_bind  
CDD cd00873  KU80  
Amino Acid Sequences MADKEATVYIVDVGKSMGEKNGGRGETDLEWCMKYVWDKITTAMATGRKTLFQSVVALRSDKTENPLSEEDGYENISVLQSLSPMYMPQLRELREKIRPSNTDEGDAISALVVAIQLIADHCKKLKYKRKIILVTNARGSIDSDGLGEIAKKVQGENIELVILGPDFDDPDYGLKEEDKDPVKATNEQTLQQLANGCDGVFGTIAQAIAELETPRVKLTKPVASYRGLLTLGDPSKYDTAMTIDVERYPRTMQQRPPTASSYAVRSDLAPGESQAQSSMTVANGDGELDQNDLAAVKQNTSYHIIDPTAPGGKRDVDREDTAKGYAYGSTAVPISESDRDVTDFESFASLDIIGFVPGNKLDRYMEMSKANIIIPQKANQKASMALSSFIHALYELESYAVARFVPKENKEPAILLLVPEIKADYECLIDTELPFAEDMRGYRFPPLDRVVTVSGKEIHTHKNLPSQDLMKSMSDYIDNMDLSTAGQDEDGYMKPPEHLLKQAQPFLDAMVSAGDVKRVPPRQKGRKRTREFEKPLSGLNVEELLGREKRVKISAENAVPEFKQALNMTDNVEDIKGIAKQLSGIIQDYIRHSMGDNGYQRAVEAIRVMKEEMLELEEPGVFNDFLKDLKKKIFAEELGGDRKEMWYRIRVNKLGLIDKRATSLSDVTEEESKKFLSSSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.13
4 0.14
5 0.17
6 0.18
7 0.23
8 0.3
9 0.3
10 0.3
11 0.3
12 0.31
13 0.28
14 0.31
15 0.28
16 0.22
17 0.22
18 0.22
19 0.21
20 0.2
21 0.2
22 0.22
23 0.25
24 0.27
25 0.27
26 0.29
27 0.34
28 0.32
29 0.3
30 0.3
31 0.29
32 0.27
33 0.3
34 0.3
35 0.27
36 0.28
37 0.3
38 0.27
39 0.24
40 0.28
41 0.27
42 0.31
43 0.3
44 0.3
45 0.26
46 0.28
47 0.3
48 0.26
49 0.28
50 0.3
51 0.29
52 0.34
53 0.36
54 0.36
55 0.34
56 0.33
57 0.29
58 0.23
59 0.24
60 0.17
61 0.15
62 0.12
63 0.11
64 0.09
65 0.09
66 0.08
67 0.06
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.1
73 0.15
74 0.15
75 0.21
76 0.27
77 0.29
78 0.35
79 0.39
80 0.43
81 0.47
82 0.52
83 0.54
84 0.57
85 0.58
86 0.59
87 0.64
88 0.59
89 0.54
90 0.47
91 0.42
92 0.33
93 0.3
94 0.23
95 0.13
96 0.11
97 0.07
98 0.07
99 0.04
100 0.03
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.04
105 0.08
106 0.09
107 0.11
108 0.13
109 0.18
110 0.25
111 0.35
112 0.45
113 0.52
114 0.62
115 0.69
116 0.78
117 0.8
118 0.81
119 0.81
120 0.79
121 0.73
122 0.67
123 0.6
124 0.49
125 0.42
126 0.37
127 0.28
128 0.19
129 0.14
130 0.11
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.11
141 0.12
142 0.15
143 0.16
144 0.15
145 0.14
146 0.14
147 0.13
148 0.11
149 0.09
150 0.06
151 0.05
152 0.04
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.08
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.13
163 0.14
164 0.2
165 0.2
166 0.21
167 0.22
168 0.26
169 0.28
170 0.31
171 0.32
172 0.33
173 0.33
174 0.33
175 0.33
176 0.31
177 0.28
178 0.24
179 0.25
180 0.18
181 0.17
182 0.16
183 0.14
184 0.11
185 0.11
186 0.1
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.08
201 0.09
202 0.1
203 0.1
204 0.15
205 0.2
206 0.26
207 0.28
208 0.33
209 0.36
210 0.37
211 0.38
212 0.33
213 0.31
214 0.24
215 0.2
216 0.16
217 0.19
218 0.18
219 0.17
220 0.16
221 0.15
222 0.16
223 0.16
224 0.15
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.12
229 0.11
230 0.11
231 0.13
232 0.15
233 0.14
234 0.14
235 0.14
236 0.18
237 0.23
238 0.3
239 0.35
240 0.42
241 0.5
242 0.52
243 0.54
244 0.52
245 0.47
246 0.43
247 0.37
248 0.32
249 0.25
250 0.23
251 0.19
252 0.17
253 0.17
254 0.15
255 0.15
256 0.11
257 0.1
258 0.13
259 0.12
260 0.12
261 0.11
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.1
285 0.11
286 0.13
287 0.18
288 0.19
289 0.15
290 0.16
291 0.16
292 0.15
293 0.15
294 0.15
295 0.15
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.15
300 0.16
301 0.18
302 0.2
303 0.19
304 0.21
305 0.22
306 0.23
307 0.21
308 0.2
309 0.17
310 0.14
311 0.11
312 0.09
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.07
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.07
322 0.07
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.09
330 0.08
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.06
335 0.06
336 0.05
337 0.04
338 0.05
339 0.05
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.05
345 0.07
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.14
351 0.16
352 0.18
353 0.18
354 0.18
355 0.18
356 0.18
357 0.18
358 0.14
359 0.13
360 0.14
361 0.15
362 0.2
363 0.25
364 0.28
365 0.29
366 0.27
367 0.27
368 0.25
369 0.25
370 0.22
371 0.16
372 0.14
373 0.13
374 0.13
375 0.12
376 0.1
377 0.08
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.04
389 0.05
390 0.06
391 0.11
392 0.18
393 0.2
394 0.26
395 0.29
396 0.31
397 0.31
398 0.3
399 0.26
400 0.22
401 0.2
402 0.15
403 0.13
404 0.12
405 0.12
406 0.11
407 0.1
408 0.07
409 0.07
410 0.08
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.08
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.06
424 0.07
425 0.08
426 0.11
427 0.13
428 0.14
429 0.17
430 0.19
431 0.19
432 0.23
433 0.26
434 0.23
435 0.21
436 0.24
437 0.25
438 0.24
439 0.24
440 0.21
441 0.21
442 0.19
443 0.21
444 0.21
445 0.23
446 0.25
447 0.28
448 0.28
449 0.33
450 0.34
451 0.34
452 0.35
453 0.31
454 0.29
455 0.28
456 0.28
457 0.21
458 0.21
459 0.19
460 0.16
461 0.14
462 0.13
463 0.11
464 0.12
465 0.11
466 0.1
467 0.09
468 0.09
469 0.08
470 0.08
471 0.07
472 0.04
473 0.05
474 0.04
475 0.05
476 0.07
477 0.08
478 0.1
479 0.1
480 0.1
481 0.11
482 0.14
483 0.17
484 0.17
485 0.21
486 0.24
487 0.31
488 0.36
489 0.39
490 0.36
491 0.34
492 0.32
493 0.28
494 0.23
495 0.15
496 0.1
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.07
502 0.07
503 0.09
504 0.17
505 0.24
506 0.3
507 0.39
508 0.5
509 0.6
510 0.7
511 0.8
512 0.83
513 0.87
514 0.9
515 0.9
516 0.89
517 0.89
518 0.87
519 0.85
520 0.81
521 0.72
522 0.66
523 0.59
524 0.49
525 0.38
526 0.31
527 0.23
528 0.15
529 0.14
530 0.12
531 0.13
532 0.14
533 0.15
534 0.18
535 0.2
536 0.23
537 0.26
538 0.28
539 0.27
540 0.33
541 0.4
542 0.39
543 0.4
544 0.38
545 0.36
546 0.33
547 0.31
548 0.27
549 0.18
550 0.2
551 0.17
552 0.19
553 0.19
554 0.2
555 0.21
556 0.2
557 0.2
558 0.16
559 0.15
560 0.12
561 0.1
562 0.11
563 0.1
564 0.1
565 0.1
566 0.09
567 0.1
568 0.12
569 0.14
570 0.13
571 0.14
572 0.15
573 0.15
574 0.18
575 0.2
576 0.22
577 0.2
578 0.18
579 0.17
580 0.22
581 0.24
582 0.29
583 0.3
584 0.29
585 0.29
586 0.29
587 0.28
588 0.24
589 0.22
590 0.15
591 0.15
592 0.16
593 0.18
594 0.19
595 0.2
596 0.19
597 0.19
598 0.19
599 0.16
600 0.16
601 0.14
602 0.13
603 0.13
604 0.13
605 0.13
606 0.12
607 0.14
608 0.1
609 0.1
610 0.11
611 0.11
612 0.13
613 0.18
614 0.21
615 0.23
616 0.29
617 0.37
618 0.36
619 0.41
620 0.47
621 0.42
622 0.45
623 0.46
624 0.46
625 0.45
626 0.44
627 0.39
628 0.32
629 0.34
630 0.32
631 0.3
632 0.28
633 0.3
634 0.39
635 0.48
636 0.57
637 0.57
638 0.56
639 0.58
640 0.59
641 0.6
642 0.55
643 0.52
644 0.47
645 0.44
646 0.43
647 0.39
648 0.35
649 0.29
650 0.28
651 0.24
652 0.23
653 0.23
654 0.23
655 0.3
656 0.3
657 0.28
658 0.27
659 0.25
660 0.22