Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1EMC6

Protein Details
Accession R1EMC6    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MAKRRVKKRTHVGAAVPKNAHydrophilic
362-403AMDKMWEKRRSEKEERKRIQKENVEKKKKEKAEKKARGEEVDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-8RVKK
368-398EKRRSEKEERKRIQKENVEKKKKEKAEKKAR
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG npa:UCRNP2_4302  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MAKRRVKKRTHVGAAVPKNAQKPNDGSPKSMVIRVGAGEVGSSVSQLVKDMRLVMEPGTATRLKERKSNKLRDYTTMAGPLGVTHLMLFSKSASGNTNLRLAKTPRGPTLHFRVEKYSLCKDVQRAQKHPRTGGHEYHTAPLLVMNNFTSSQASTADNPVPKHLESLTTTMFQSLFPPISPQATPLTSIRRVLLLNREPSPSDSNSYVINLRHYAITTKTVTKDMPKSLRRLDSSVKDKKRRGLPNLGKLEDAADYLLDPDAGGGYTSASESEVETDAEVEVLETTRKVLNRKDKQRAAAAREAGANAGAGGRSTNVEKKAVKLVELGPRMRLRLQKVEEGLCGGKVMWHESITKTAEEIKAMDKMWEKRRSEKEERKRIQKENVEKKKKEKAEKKARGEEVDEEDDEQDYDEDMSDEWDSEGLDDEGAGDVEDDEDEDMEDEEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.77
3 0.7
4 0.63
5 0.61
6 0.59
7 0.52
8 0.47
9 0.45
10 0.48
11 0.55
12 0.52
13 0.49
14 0.48
15 0.54
16 0.5
17 0.48
18 0.39
19 0.3
20 0.3
21 0.27
22 0.24
23 0.17
24 0.14
25 0.11
26 0.1
27 0.1
28 0.08
29 0.07
30 0.06
31 0.07
32 0.07
33 0.09
34 0.11
35 0.11
36 0.12
37 0.14
38 0.15
39 0.16
40 0.17
41 0.15
42 0.16
43 0.15
44 0.15
45 0.18
46 0.18
47 0.18
48 0.25
49 0.31
50 0.3
51 0.38
52 0.44
53 0.51
54 0.6
55 0.7
56 0.7
57 0.74
58 0.75
59 0.73
60 0.73
61 0.66
62 0.58
63 0.51
64 0.42
65 0.32
66 0.29
67 0.23
68 0.17
69 0.13
70 0.1
71 0.06
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.08
76 0.06
77 0.09
78 0.09
79 0.11
80 0.12
81 0.16
82 0.19
83 0.21
84 0.28
85 0.26
86 0.27
87 0.32
88 0.32
89 0.36
90 0.41
91 0.43
92 0.42
93 0.46
94 0.48
95 0.48
96 0.54
97 0.56
98 0.52
99 0.49
100 0.48
101 0.48
102 0.49
103 0.49
104 0.45
105 0.39
106 0.38
107 0.39
108 0.38
109 0.42
110 0.47
111 0.49
112 0.52
113 0.57
114 0.63
115 0.64
116 0.65
117 0.63
118 0.62
119 0.6
120 0.58
121 0.52
122 0.51
123 0.47
124 0.44
125 0.39
126 0.31
127 0.25
128 0.21
129 0.19
130 0.13
131 0.13
132 0.11
133 0.12
134 0.12
135 0.13
136 0.11
137 0.09
138 0.09
139 0.1
140 0.11
141 0.11
142 0.14
143 0.17
144 0.2
145 0.2
146 0.21
147 0.22
148 0.21
149 0.21
150 0.19
151 0.18
152 0.17
153 0.2
154 0.19
155 0.18
156 0.18
157 0.17
158 0.17
159 0.13
160 0.13
161 0.11
162 0.1
163 0.09
164 0.11
165 0.11
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.14
170 0.13
171 0.15
172 0.15
173 0.2
174 0.19
175 0.2
176 0.19
177 0.18
178 0.18
179 0.18
180 0.25
181 0.25
182 0.27
183 0.28
184 0.29
185 0.27
186 0.3
187 0.32
188 0.24
189 0.22
190 0.19
191 0.18
192 0.17
193 0.18
194 0.17
195 0.14
196 0.15
197 0.13
198 0.13
199 0.12
200 0.12
201 0.12
202 0.11
203 0.14
204 0.14
205 0.16
206 0.16
207 0.17
208 0.18
209 0.21
210 0.24
211 0.26
212 0.33
213 0.34
214 0.37
215 0.4
216 0.45
217 0.42
218 0.42
219 0.41
220 0.4
221 0.45
222 0.51
223 0.55
224 0.57
225 0.59
226 0.62
227 0.66
228 0.67
229 0.64
230 0.66
231 0.66
232 0.67
233 0.71
234 0.65
235 0.55
236 0.47
237 0.42
238 0.3
239 0.22
240 0.12
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.04
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.06
273 0.08
274 0.11
275 0.14
276 0.22
277 0.33
278 0.42
279 0.53
280 0.62
281 0.65
282 0.67
283 0.72
284 0.71
285 0.66
286 0.63
287 0.54
288 0.45
289 0.41
290 0.37
291 0.28
292 0.21
293 0.15
294 0.08
295 0.07
296 0.05
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.06
301 0.08
302 0.13
303 0.14
304 0.2
305 0.2
306 0.23
307 0.3
308 0.3
309 0.28
310 0.27
311 0.3
312 0.33
313 0.38
314 0.36
315 0.34
316 0.35
317 0.36
318 0.37
319 0.38
320 0.35
321 0.39
322 0.42
323 0.42
324 0.44
325 0.44
326 0.4
327 0.38
328 0.33
329 0.24
330 0.2
331 0.14
332 0.13
333 0.11
334 0.14
335 0.12
336 0.13
337 0.15
338 0.16
339 0.21
340 0.22
341 0.21
342 0.19
343 0.22
344 0.22
345 0.21
346 0.21
347 0.18
348 0.2
349 0.2
350 0.23
351 0.25
352 0.32
353 0.41
354 0.48
355 0.49
356 0.55
357 0.65
358 0.71
359 0.75
360 0.78
361 0.8
362 0.82
363 0.88
364 0.89
365 0.88
366 0.87
367 0.86
368 0.84
369 0.84
370 0.84
371 0.87
372 0.87
373 0.83
374 0.84
375 0.84
376 0.84
377 0.84
378 0.82
379 0.82
380 0.83
381 0.88
382 0.9
383 0.89
384 0.86
385 0.79
386 0.73
387 0.67
388 0.62
389 0.56
390 0.46
391 0.38
392 0.32
393 0.29
394 0.25
395 0.2
396 0.13
397 0.09
398 0.09
399 0.08
400 0.08
401 0.08
402 0.1
403 0.09
404 0.09
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.08
409 0.11
410 0.09
411 0.08
412 0.07
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.06
418 0.05
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.07