Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1ETR5

Protein Details
Accession R1ETR5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
304-326DNGRGAGAKKKRRKDFAAGSPLGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
308-317GAGAKKKRRK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, mito 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG npa:UCRNP2_2281  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MSQPSNTNAFPTPASSAGTASFASKADGGDARMADDPMDVVAAPATRDVEMGNDGDHRQTGHDRTGTGSSASGGVGPDNRLQSGSGPFYKLSETPYAMSRPHVSQNLVSLYGLDRITQSVARFDPKTGEKINKLRKSYESHVKDFKISGGKSRPENSPGQLMNLLEFPDEEYYLQRIRGNELESASQRILAKLNGGALKMNPGKLSKEEDSRWKTRIGTDDGISAKRPAGEAFDGAAKKLKQGGQVMQGRNSATSSPAMRPSPGAKAVARPDRNGKKRSYVESSFKGYGEGFGDDVGESTGGEDNGRGAGAKKKRRKDFAAGSPLGFDERRGNYNVGMVGVRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.2
3 0.19
4 0.18
5 0.19
6 0.16
7 0.14
8 0.14
9 0.12
10 0.13
11 0.13
12 0.12
13 0.14
14 0.15
15 0.15
16 0.18
17 0.17
18 0.18
19 0.19
20 0.19
21 0.16
22 0.14
23 0.12
24 0.09
25 0.09
26 0.07
27 0.05
28 0.06
29 0.07
30 0.07
31 0.08
32 0.09
33 0.08
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.12
41 0.12
42 0.13
43 0.14
44 0.13
45 0.14
46 0.19
47 0.22
48 0.25
49 0.26
50 0.26
51 0.28
52 0.3
53 0.28
54 0.23
55 0.2
56 0.15
57 0.13
58 0.13
59 0.11
60 0.08
61 0.08
62 0.09
63 0.11
64 0.14
65 0.14
66 0.15
67 0.14
68 0.15
69 0.16
70 0.19
71 0.21
72 0.2
73 0.21
74 0.2
75 0.21
76 0.22
77 0.21
78 0.2
79 0.19
80 0.19
81 0.18
82 0.21
83 0.23
84 0.22
85 0.24
86 0.23
87 0.22
88 0.26
89 0.27
90 0.26
91 0.24
92 0.27
93 0.27
94 0.24
95 0.21
96 0.17
97 0.14
98 0.16
99 0.15
100 0.12
101 0.1
102 0.1
103 0.11
104 0.13
105 0.12
106 0.12
107 0.13
108 0.17
109 0.18
110 0.17
111 0.21
112 0.22
113 0.26
114 0.26
115 0.3
116 0.33
117 0.42
118 0.51
119 0.53
120 0.54
121 0.52
122 0.53
123 0.55
124 0.55
125 0.56
126 0.52
127 0.5
128 0.53
129 0.5
130 0.47
131 0.4
132 0.37
133 0.33
134 0.27
135 0.29
136 0.29
137 0.32
138 0.34
139 0.37
140 0.36
141 0.33
142 0.35
143 0.3
144 0.3
145 0.27
146 0.25
147 0.23
148 0.21
149 0.17
150 0.16
151 0.14
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.08
160 0.09
161 0.1
162 0.11
163 0.11
164 0.13
165 0.15
166 0.16
167 0.16
168 0.16
169 0.17
170 0.16
171 0.18
172 0.16
173 0.16
174 0.14
175 0.13
176 0.14
177 0.11
178 0.12
179 0.1
180 0.13
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.16
186 0.16
187 0.17
188 0.15
189 0.15
190 0.17
191 0.19
192 0.24
193 0.21
194 0.26
195 0.28
196 0.36
197 0.41
198 0.43
199 0.43
200 0.39
201 0.37
202 0.36
203 0.39
204 0.35
205 0.32
206 0.29
207 0.32
208 0.31
209 0.31
210 0.28
211 0.23
212 0.17
213 0.15
214 0.15
215 0.11
216 0.12
217 0.12
218 0.12
219 0.12
220 0.16
221 0.16
222 0.15
223 0.2
224 0.16
225 0.17
226 0.21
227 0.22
228 0.22
229 0.26
230 0.3
231 0.34
232 0.42
233 0.43
234 0.41
235 0.41
236 0.36
237 0.33
238 0.3
239 0.22
240 0.15
241 0.16
242 0.16
243 0.17
244 0.22
245 0.22
246 0.22
247 0.24
248 0.25
249 0.28
250 0.28
251 0.28
252 0.24
253 0.29
254 0.37
255 0.44
256 0.44
257 0.42
258 0.5
259 0.57
260 0.64
261 0.64
262 0.6
263 0.6
264 0.64
265 0.67
266 0.65
267 0.62
268 0.62
269 0.62
270 0.64
271 0.56
272 0.5
273 0.44
274 0.36
275 0.3
276 0.24
277 0.19
278 0.13
279 0.11
280 0.12
281 0.1
282 0.1
283 0.08
284 0.06
285 0.05
286 0.06
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.09
294 0.08
295 0.08
296 0.17
297 0.27
298 0.37
299 0.46
300 0.56
301 0.66
302 0.74
303 0.79
304 0.81
305 0.82
306 0.82
307 0.83
308 0.75
309 0.66
310 0.58
311 0.52
312 0.45
313 0.34
314 0.26
315 0.22
316 0.24
317 0.27
318 0.29
319 0.31
320 0.28
321 0.32
322 0.31
323 0.25