FuNGI

R1GP41

Protein Details

Accession

R1GP41

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
34-53	QSQSRFKTVKWNHKPKATGN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
247-286	PKAKQALKPAPKPAVKQSSTTQASRKRKSPEPEKAAAKPK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019194 Tscrpt_elong_fac_Eaf_N
KEGG	npa:UCRNP2_5460 -
Pfam	View protein in Pfam PF09816 EAF

Amino Acid Sequences

MASPQPAEAHVALNPHQNARYTIKLSERITNPSQSQSRFKTVKWNHKPKATGNVRTTTIKPASAGDNQFTLCMRDKESATSTKSSTYEYNGQRRELKKTYVLLFDKDSQTATLEPLDETYAFNLKTAPWEKDPAKLAEQYQQVRPRSEKPGRPSAASDDADDLFSDGSDTPSVNESVFGDGPSDDEDPEEGNPFDFRRFVKEADQSEGFASPYSQSGTPLRTTTNSGTTTAAPPPARTTPLPQTDRPKAKQALKPAPKPAVKQSSTTQASRKRKSPEPEKAAAKPKATTSSATGTTKAQPTPAIRLDRRASTRPNESALSASAPAAAPPSTQSSKSSSRTSREPTPDEDEDDDQFGGLEIDWGGSDKSASRGRPRRSIALAFEQGVTGDGPVSLRSAADSASPNSRLHTPSMRATSGRGTAYRQDVIEFDVGGDEDEEDEEEEEAHRPLREQDDDDAEQEDEEQQEDDGYAEDDEDADGDVDPLTLGSPAADTLQQQQLHQQQVELADDDDEDDDDDDDRGDDFEDDFEAEMAQALASAAEEEGQVAHEESEEESEEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.29
3	0.3
4	0.31
5	0.34
6	0.37
7	0.42
8	0.37
9	0.4
10	0.43
11	0.49
12	0.49
13	0.53
14	0.51
15	0.51
16	0.52
17	0.54
18	0.49
19	0.5
20	0.54
21	0.5
22	0.55
23	0.54
24	0.59
25	0.56
26	0.54
27	0.57
28	0.6
29	0.66
30	0.69
31	0.74
32	0.72
33	0.77
34	0.82
35	0.76
36	0.77
37	0.75
38	0.74
39	0.69
40	0.67
41	0.63
42	0.61
43	0.57
44	0.55
45	0.48
46	0.4
47	0.35
48	0.31
49	0.32
50	0.35
51	0.36
52	0.29
53	0.29
54	0.28
55	0.28
56	0.26
57	0.25
58	0.23
59	0.22
60	0.23
61	0.25
62	0.26
63	0.3
64	0.34
65	0.37
66	0.36
67	0.37
68	0.35
69	0.36
70	0.36
71	0.34
72	0.31
73	0.3
74	0.35
75	0.4
76	0.49
77	0.48
78	0.51
79	0.56
80	0.57
81	0.6
82	0.56
83	0.53
84	0.5
85	0.52
86	0.52
87	0.53
88	0.52
89	0.46
90	0.45
91	0.45
92	0.41
93	0.36
94	0.32
95	0.24
96	0.23
97	0.21
98	0.18
99	0.14
100	0.13
101	0.12
102	0.12
103	0.13
104	0.11
105	0.11
106	0.12
107	0.14
108	0.13
109	0.13
110	0.13
111	0.12
112	0.2
113	0.23
114	0.25
115	0.24
116	0.32
117	0.33
118	0.38
119	0.42
120	0.37
121	0.37
122	0.36
123	0.35
124	0.35
125	0.41
126	0.38
127	0.42
128	0.46
129	0.45
130	0.46
131	0.48
132	0.47
133	0.51
134	0.56
135	0.56
136	0.55
137	0.63
138	0.61
139	0.59
140	0.56
141	0.51
142	0.5
143	0.43
144	0.38
145	0.29
146	0.28
147	0.26
148	0.23
149	0.17
150	0.09
151	0.08
152	0.08
153	0.06
154	0.07
155	0.07
156	0.07
157	0.07
158	0.09
159	0.1
160	0.09
161	0.09
162	0.09
163	0.11
164	0.11
165	0.11
166	0.1
167	0.09
168	0.1
169	0.11
170	0.11
171	0.08
172	0.08
173	0.09
174	0.09
175	0.09
176	0.11
177	0.08
178	0.08
179	0.09
180	0.1
181	0.1
182	0.12
183	0.12
184	0.17
185	0.2
186	0.21
187	0.26
188	0.32
189	0.33
190	0.36
191	0.36
192	0.3
193	0.28
194	0.27
195	0.21
196	0.14
197	0.12
198	0.08
199	0.08
200	0.09
201	0.09
202	0.1
203	0.12
204	0.14
205	0.15
206	0.16
207	0.16
208	0.16
209	0.19
210	0.19
211	0.22
212	0.21
213	0.21
214	0.22
215	0.22
216	0.22
217	0.2
218	0.22
219	0.17
220	0.16
221	0.19
222	0.19
223	0.2
224	0.19
225	0.23
226	0.26
227	0.35
228	0.38
229	0.39
230	0.45
231	0.51
232	0.58
233	0.55
234	0.55
235	0.53
236	0.57
237	0.57
238	0.59
239	0.61
240	0.61
241	0.64
242	0.61
243	0.63
244	0.57
245	0.56
246	0.54
247	0.52
248	0.46
249	0.44
250	0.4
251	0.42
252	0.42
253	0.42
254	0.41
255	0.41
256	0.49
257	0.5
258	0.54
259	0.51
260	0.55
261	0.62
262	0.65
263	0.66
264	0.64
265	0.66
266	0.64
267	0.64
268	0.66
269	0.61
270	0.52
271	0.43
272	0.37
273	0.35
274	0.32
275	0.27
276	0.21
277	0.21
278	0.23
279	0.23
280	0.22
281	0.2
282	0.22
283	0.23
284	0.2
285	0.18
286	0.17
287	0.18
288	0.22
289	0.26
290	0.3
291	0.27
292	0.33
293	0.35
294	0.37
295	0.4
296	0.39
297	0.38
298	0.36
299	0.41
300	0.37
301	0.38
302	0.33
303	0.29
304	0.26
305	0.22
306	0.19
307	0.13
308	0.11
309	0.09
310	0.08
311	0.08
312	0.08
313	0.07
314	0.06
315	0.07
316	0.12
317	0.13
318	0.14
319	0.16
320	0.2
321	0.26
322	0.3
323	0.36
324	0.36
325	0.38
326	0.43
327	0.47
328	0.5
329	0.5
330	0.49
331	0.47
332	0.49
333	0.46
334	0.43
335	0.4
336	0.33
337	0.27
338	0.26
339	0.21
340	0.14
341	0.12
342	0.1
343	0.07
344	0.05
345	0.05
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.05
350	0.04
351	0.04
352	0.05
353	0.05
354	0.1
355	0.14
356	0.17
357	0.26
358	0.35
359	0.41
360	0.49
361	0.53
362	0.54
363	0.55
364	0.56
365	0.51
366	0.49
367	0.46
368	0.38
369	0.34
370	0.28
371	0.23
372	0.2
373	0.15
374	0.08
375	0.06
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.06
380	0.05
381	0.05
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.09
386	0.11
387	0.12
388	0.16
389	0.19
390	0.19
391	0.2
392	0.23
393	0.22
394	0.24
395	0.28
396	0.28
397	0.32
398	0.36
399	0.36
400	0.33
401	0.33
402	0.33
403	0.31
404	0.29
405	0.24
406	0.23
407	0.26
408	0.29
409	0.3
410	0.26
411	0.23
412	0.21
413	0.22
414	0.2
415	0.15
416	0.11
417	0.1
418	0.09
419	0.09
420	0.08
421	0.06
422	0.05
423	0.05
424	0.06
425	0.06
426	0.06
427	0.06
428	0.06
429	0.07
430	0.08
431	0.09
432	0.1
433	0.1
434	0.1
435	0.14
436	0.2
437	0.22
438	0.24
439	0.27
440	0.32
441	0.33
442	0.33
443	0.31
444	0.25
445	0.22
446	0.2
447	0.18
448	0.11
449	0.1
450	0.1
451	0.08
452	0.08
453	0.08
454	0.08
455	0.07
456	0.07
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.06
461	0.06
462	0.06
463	0.06
464	0.05
465	0.05
466	0.05
467	0.06
468	0.05
469	0.05
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.04
474	0.04
475	0.05
476	0.05
477	0.07
478	0.07
479	0.08
480	0.13
481	0.21
482	0.22
483	0.22
484	0.29
485	0.35
486	0.4
487	0.39
488	0.34
489	0.29
490	0.31
491	0.32
492	0.26
493	0.19
494	0.14
495	0.13
496	0.14
497	0.12
498	0.1
499	0.09
500	0.08
501	0.08
502	0.09
503	0.09
504	0.08
505	0.08
506	0.08
507	0.08
508	0.08
509	0.09
510	0.08
511	0.09
512	0.1
513	0.1
514	0.1
515	0.09
516	0.09
517	0.08
518	0.08
519	0.07
520	0.06
521	0.05
522	0.05
523	0.05
524	0.04
525	0.05
526	0.05
527	0.05
528	0.05
529	0.05
530	0.06
531	0.07
532	0.08
533	0.08
534	0.08
535	0.08
536	0.09
537	0.1
538	0.12

R1GP41

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer