Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1EF64

Protein Details
Accession R1EF64    Localization Confidence Low Confidence Score 7.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-102GVPGARKSRKQQHRYNHQHSASHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 9.5, cyto_nucl 9.333, cyto_mito 8.166, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013085  U1-CZ_Znf_C2H2  
IPR017340  U1_snRNP-C  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
KEGG npa:UCRNP2_7135  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06220  zf-U1  
Amino Acid Sequences MSVRKAHNSGRNHLRNVVEYYQQIGHEKAQSVIDSITSSYAAEGQANPMLQHAHMGGPGFGPPPPFGFPGGMPPPPFGMAGVPGARKSRKQQHRYNHQHSASNSNFFHHTAPAGRGMPPNMPPNLPFPPPGAAGAPPPGAPGSLPFPPPFPAGQPGSAGSPPAGLPFPPPGMPPPAGMPANFPFPPPGAMPPQSGASPVPPPGAFQPPPGMAPPPGPPGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.56
3 0.56
4 0.5
5 0.43
6 0.36
7 0.36
8 0.33
9 0.32
10 0.3
11 0.25
12 0.25
13 0.25
14 0.25
15 0.23
16 0.23
17 0.21
18 0.2
19 0.19
20 0.16
21 0.13
22 0.12
23 0.11
24 0.09
25 0.09
26 0.08
27 0.09
28 0.08
29 0.09
30 0.09
31 0.1
32 0.12
33 0.12
34 0.12
35 0.12
36 0.12
37 0.1
38 0.11
39 0.1
40 0.08
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.08
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.11
51 0.13
52 0.14
53 0.14
54 0.15
55 0.14
56 0.2
57 0.23
58 0.22
59 0.21
60 0.2
61 0.2
62 0.2
63 0.2
64 0.13
65 0.1
66 0.09
67 0.1
68 0.11
69 0.11
70 0.11
71 0.15
72 0.16
73 0.19
74 0.25
75 0.34
76 0.43
77 0.51
78 0.58
79 0.65
80 0.75
81 0.82
82 0.83
83 0.81
84 0.73
85 0.7
86 0.62
87 0.6
88 0.5
89 0.45
90 0.37
91 0.29
92 0.28
93 0.24
94 0.23
95 0.15
96 0.14
97 0.1
98 0.11
99 0.13
100 0.12
101 0.13
102 0.13
103 0.14
104 0.15
105 0.17
106 0.19
107 0.18
108 0.17
109 0.17
110 0.21
111 0.23
112 0.22
113 0.2
114 0.18
115 0.19
116 0.19
117 0.19
118 0.15
119 0.12
120 0.12
121 0.13
122 0.12
123 0.1
124 0.1
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.1
130 0.11
131 0.13
132 0.13
133 0.14
134 0.16
135 0.18
136 0.17
137 0.15
138 0.18
139 0.19
140 0.19
141 0.19
142 0.18
143 0.19
144 0.18
145 0.17
146 0.12
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.08
152 0.09
153 0.12
154 0.14
155 0.13
156 0.15
157 0.15
158 0.2
159 0.2
160 0.2
161 0.19
162 0.23
163 0.23
164 0.23
165 0.25
166 0.22
167 0.27
168 0.26
169 0.24
170 0.21
171 0.21
172 0.23
173 0.2
174 0.22
175 0.22
176 0.25
177 0.26
178 0.26
179 0.27
180 0.25
181 0.25
182 0.22
183 0.19
184 0.19
185 0.19
186 0.21
187 0.19
188 0.21
189 0.24
190 0.31
191 0.29
192 0.28
193 0.33
194 0.31
195 0.33
196 0.33
197 0.32
198 0.25
199 0.27
200 0.29