Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

R1ECN1

Protein Details
Accession R1ECN1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
153-181EEEAKEERRERRRARRKRKEEKAANGDADBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
158-174EERRERRRARRKRKEEK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012860  Afi1_N  
IPR037516  Tripartite_DENN  
KEGG npa:UCRNP2_8033  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07792  Afi1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50211  DENN  
Amino Acid Sequences MASVQVQRPPPPSSTTITTPTAPKPHRQSSLSSFPPSRSPSTLSRPSRSPAPNLIPRDYSPSASSRVVKPYSESSRMGRPLRSQYPSNSHENHVEYILVASFDIDRGSIMEHQYPGPISGDEHMLADLMLPDQAHVRSQDWTIFFLHKDTEAEEEAKEERRERRRARRKRKEEKAANGDADGEDGAAAEEEEEEDDDDLDSESSEESEDEGFEGPPLIYVLNLVNTKQDNTVKRGAVCKAMAICTRHSFLHIYKVRQLSPSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.4
3 0.41
4 0.4
5 0.4
6 0.39
7 0.42
8 0.46
9 0.44
10 0.48
11 0.52
12 0.58
13 0.62
14 0.6
15 0.61
16 0.59
17 0.66
18 0.62
19 0.6
20 0.53
21 0.47
22 0.52
23 0.5
24 0.46
25 0.39
26 0.38
27 0.39
28 0.46
29 0.54
30 0.54
31 0.54
32 0.53
33 0.53
34 0.58
35 0.54
36 0.51
37 0.49
38 0.5
39 0.54
40 0.55
41 0.55
42 0.49
43 0.47
44 0.5
45 0.43
46 0.37
47 0.31
48 0.29
49 0.29
50 0.3
51 0.32
52 0.27
53 0.32
54 0.32
55 0.3
56 0.31
57 0.35
58 0.38
59 0.39
60 0.38
61 0.34
62 0.4
63 0.46
64 0.45
65 0.4
66 0.39
67 0.43
68 0.47
69 0.49
70 0.44
71 0.43
72 0.48
73 0.49
74 0.5
75 0.44
76 0.4
77 0.4
78 0.39
79 0.35
80 0.27
81 0.23
82 0.17
83 0.14
84 0.12
85 0.08
86 0.05
87 0.05
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.05
95 0.07
96 0.08
97 0.09
98 0.1
99 0.1
100 0.11
101 0.11
102 0.1
103 0.09
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.03
116 0.04
117 0.03
118 0.04
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.07
123 0.08
124 0.09
125 0.1
126 0.13
127 0.12
128 0.14
129 0.14
130 0.14
131 0.13
132 0.13
133 0.13
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.1
138 0.11
139 0.11
140 0.1
141 0.11
142 0.12
143 0.16
144 0.16
145 0.18
146 0.25
147 0.33
148 0.42
149 0.5
150 0.6
151 0.67
152 0.78
153 0.85
154 0.89
155 0.92
156 0.93
157 0.95
158 0.94
159 0.93
160 0.92
161 0.88
162 0.82
163 0.72
164 0.61
165 0.51
166 0.39
167 0.3
168 0.2
169 0.11
170 0.06
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.06
205 0.05
206 0.06
207 0.07
208 0.11
209 0.12
210 0.12
211 0.16
212 0.17
213 0.19
214 0.24
215 0.3
216 0.29
217 0.34
218 0.41
219 0.4
220 0.42
221 0.46
222 0.43
223 0.42
224 0.38
225 0.37
226 0.32
227 0.34
228 0.36
229 0.34
230 0.36
231 0.34
232 0.37
233 0.33
234 0.33
235 0.32
236 0.29
237 0.37
238 0.39
239 0.39
240 0.44
241 0.5
242 0.5