Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

R1GFB1

Protein Details
Accession R1GFB1    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
184-226MNPDKDPWEKRKRQQGDRRNGGDGYNRKRYDDREQRRRRDNEABasic
308-327STAHRRARRRSYSPPSNRGNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
262-267RRGRGR
488-497IKGRGGPRRK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
KEGG npa:UCRNP2_8667  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MESNNVQPAAFAADALNADMDIDMDIDLTAADDIDAFDTEGITLDAQPAAFAPARATDPAPTAQEPQLEKVNVEGVDNLTTAQVKAYACEHYPSDQYVRIEWVDDSHANVVYETSEAALAALRSFIHPNLGDPLTLSGTLPMALVQREAKDFFANPDIKLKVRLAVVSDVKAPRAHEASRFYLMNPDKDPWEKRKRQQGDRRNGGDGYNRKRYDDREQRRRRDNEAYDVDMYDEEAGAARSQTGSRRGRRGSLSDDSMDDRRRGRGRGTRSKNLDDLLPSKSDGRLRDRSASPLRDGDGRYGFEEEDSTAHRRARRRSYSPPSNRGNATKELFPNRGGNTTKELFPNQGSRSTLLSSSASSPNPSTNSNTEKDLFPGKAQHTQKRSRELFPHKTSHSNHRRQDAFDSRDYTEEAINKPRSLEERITGGPNQNGRTNGRSNGDQGFSVKGSADAPGFSIRGAADVKELFPMKTGGGGSNAGKELFSEKIKGRGGPRRKAEDMFF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.12
4 0.07
5 0.08
6 0.07
7 0.07
8 0.05
9 0.05
10 0.05
11 0.05
12 0.05
13 0.05
14 0.05
15 0.05
16 0.05
17 0.04
18 0.04
19 0.04
20 0.05
21 0.06
22 0.07
23 0.06
24 0.06
25 0.06
26 0.07
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.06
31 0.07
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.11
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.13
41 0.15
42 0.17
43 0.18
44 0.16
45 0.18
46 0.21
47 0.24
48 0.23
49 0.25
50 0.26
51 0.31
52 0.31
53 0.31
54 0.35
55 0.32
56 0.3
57 0.27
58 0.29
59 0.23
60 0.22
61 0.2
62 0.15
63 0.15
64 0.15
65 0.14
66 0.11
67 0.11
68 0.1
69 0.09
70 0.11
71 0.1
72 0.12
73 0.13
74 0.15
75 0.16
76 0.18
77 0.2
78 0.19
79 0.21
80 0.23
81 0.24
82 0.26
83 0.26
84 0.25
85 0.27
86 0.24
87 0.23
88 0.2
89 0.19
90 0.18
91 0.17
92 0.18
93 0.16
94 0.17
95 0.16
96 0.16
97 0.14
98 0.1
99 0.1
100 0.08
101 0.07
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.06
106 0.05
107 0.05
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.09
112 0.09
113 0.12
114 0.12
115 0.14
116 0.18
117 0.18
118 0.17
119 0.15
120 0.17
121 0.14
122 0.14
123 0.13
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.09
132 0.1
133 0.11
134 0.13
135 0.14
136 0.14
137 0.15
138 0.15
139 0.16
140 0.22
141 0.22
142 0.21
143 0.26
144 0.27
145 0.26
146 0.28
147 0.26
148 0.22
149 0.21
150 0.22
151 0.18
152 0.22
153 0.23
154 0.21
155 0.25
156 0.22
157 0.23
158 0.23
159 0.22
160 0.19
161 0.21
162 0.21
163 0.21
164 0.25
165 0.28
166 0.29
167 0.29
168 0.26
169 0.31
170 0.31
171 0.3
172 0.27
173 0.25
174 0.25
175 0.29
176 0.34
177 0.35
178 0.44
179 0.49
180 0.54
181 0.64
182 0.7
183 0.76
184 0.82
185 0.82
186 0.82
187 0.83
188 0.8
189 0.71
190 0.63
191 0.54
192 0.51
193 0.48
194 0.44
195 0.45
196 0.42
197 0.41
198 0.43
199 0.46
200 0.49
201 0.52
202 0.56
203 0.58
204 0.67
205 0.74
206 0.81
207 0.81
208 0.76
209 0.75
210 0.68
211 0.65
212 0.59
213 0.53
214 0.44
215 0.4
216 0.34
217 0.24
218 0.2
219 0.11
220 0.08
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.08
230 0.16
231 0.23
232 0.27
233 0.34
234 0.35
235 0.39
236 0.41
237 0.41
238 0.39
239 0.35
240 0.33
241 0.27
242 0.27
243 0.25
244 0.26
245 0.25
246 0.2
247 0.18
248 0.21
249 0.23
250 0.24
251 0.28
252 0.32
253 0.4
254 0.49
255 0.56
256 0.58
257 0.61
258 0.62
259 0.57
260 0.51
261 0.43
262 0.34
263 0.29
264 0.23
265 0.18
266 0.16
267 0.15
268 0.17
269 0.19
270 0.2
271 0.25
272 0.29
273 0.31
274 0.36
275 0.37
276 0.42
277 0.45
278 0.43
279 0.39
280 0.34
281 0.32
282 0.3
283 0.3
284 0.26
285 0.23
286 0.21
287 0.2
288 0.19
289 0.18
290 0.14
291 0.14
292 0.11
293 0.09
294 0.11
295 0.13
296 0.15
297 0.18
298 0.22
299 0.27
300 0.35
301 0.45
302 0.51
303 0.55
304 0.63
305 0.7
306 0.77
307 0.8
308 0.8
309 0.75
310 0.7
311 0.66
312 0.6
313 0.54
314 0.49
315 0.42
316 0.38
317 0.38
318 0.39
319 0.38
320 0.35
321 0.35
322 0.31
323 0.35
324 0.32
325 0.29
326 0.3
327 0.3
328 0.3
329 0.29
330 0.28
331 0.25
332 0.26
333 0.3
334 0.26
335 0.28
336 0.27
337 0.26
338 0.27
339 0.26
340 0.24
341 0.19
342 0.18
343 0.15
344 0.17
345 0.2
346 0.18
347 0.18
348 0.19
349 0.2
350 0.22
351 0.23
352 0.23
353 0.25
354 0.3
355 0.3
356 0.32
357 0.31
358 0.29
359 0.3
360 0.3
361 0.26
362 0.22
363 0.27
364 0.27
365 0.34
366 0.4
367 0.46
368 0.49
369 0.58
370 0.63
371 0.66
372 0.68
373 0.65
374 0.69
375 0.71
376 0.73
377 0.69
378 0.7
379 0.63
380 0.67
381 0.65
382 0.67
383 0.67
384 0.67
385 0.66
386 0.68
387 0.67
388 0.62
389 0.67
390 0.66
391 0.6
392 0.56
393 0.54
394 0.47
395 0.45
396 0.43
397 0.35
398 0.28
399 0.27
400 0.25
401 0.3
402 0.32
403 0.31
404 0.3
405 0.33
406 0.33
407 0.35
408 0.36
409 0.29
410 0.31
411 0.33
412 0.36
413 0.35
414 0.36
415 0.35
416 0.36
417 0.36
418 0.35
419 0.36
420 0.37
421 0.4
422 0.4
423 0.4
424 0.39
425 0.39
426 0.38
427 0.39
428 0.37
429 0.32
430 0.29
431 0.27
432 0.23
433 0.22
434 0.19
435 0.15
436 0.13
437 0.14
438 0.14
439 0.1
440 0.12
441 0.13
442 0.13
443 0.12
444 0.13
445 0.11
446 0.13
447 0.14
448 0.13
449 0.14
450 0.15
451 0.16
452 0.2
453 0.21
454 0.18
455 0.19
456 0.2
457 0.16
458 0.19
459 0.19
460 0.15
461 0.17
462 0.2
463 0.19
464 0.22
465 0.23
466 0.2
467 0.19
468 0.18
469 0.18
470 0.2
471 0.21
472 0.22
473 0.23
474 0.32
475 0.35
476 0.4
477 0.46
478 0.52
479 0.59
480 0.64
481 0.71
482 0.71
483 0.73