Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1EVL7

Protein Details
Accession R1EVL7    Localization Confidence Low Confidence Score 8.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-48YSKYHGLHRRDRKARLDQQLTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 9, cyto 8, pero 5, cyto_mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
IPR010304  SMN_Tudor  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0097504  C:Gemini of coiled bodies  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG npa:UCRNP2_1551  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06003  SMN  
CDD cd22852  SMN_C  
Amino Acid Sequences MSGIDIFDRGAWDDRALVRGWNQQVKEYSKYHGLHRRDRKARLDQQLTQEEIFGLSELADPEELEEMGIRLTDAQPGAKPNESQDATMENDDTAYQAHADEQQDISLTDAVSGAANSVDTDAAERQLMQEAHEQQQQFNQHRTQDPAAVPQVPPIPGPAFAAAPGGDDALKNMMMSWYYAGYYQGIYETKQHAGQPSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.2
3 0.19
4 0.19
5 0.19
6 0.26
7 0.32
8 0.35
9 0.35
10 0.38
11 0.44
12 0.47
13 0.48
14 0.43
15 0.4
16 0.43
17 0.44
18 0.47
19 0.5
20 0.53
21 0.57
22 0.66
23 0.73
24 0.72
25 0.78
26 0.77
27 0.79
28 0.81
29 0.8
30 0.77
31 0.71
32 0.71
33 0.69
34 0.63
35 0.52
36 0.43
37 0.33
38 0.26
39 0.21
40 0.13
41 0.07
42 0.05
43 0.06
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.05
48 0.06
49 0.07
50 0.06
51 0.05
52 0.05
53 0.04
54 0.04
55 0.05
56 0.04
57 0.04
58 0.04
59 0.06
60 0.06
61 0.07
62 0.08
63 0.11
64 0.13
65 0.14
66 0.14
67 0.14
68 0.21
69 0.21
70 0.2
71 0.19
72 0.19
73 0.19
74 0.19
75 0.17
76 0.1
77 0.09
78 0.09
79 0.08
80 0.06
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.05
85 0.07
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.07
94 0.06
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.04
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.04
105 0.03
106 0.03
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.16
117 0.19
118 0.22
119 0.25
120 0.25
121 0.21
122 0.26
123 0.32
124 0.3
125 0.32
126 0.32
127 0.33
128 0.35
129 0.4
130 0.37
131 0.35
132 0.32
133 0.33
134 0.32
135 0.3
136 0.27
137 0.25
138 0.26
139 0.21
140 0.21
141 0.18
142 0.17
143 0.16
144 0.17
145 0.15
146 0.13
147 0.12
148 0.13
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.09
153 0.08
154 0.07
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.1
167 0.11
168 0.11
169 0.1
170 0.1
171 0.12
172 0.12
173 0.13
174 0.18
175 0.2
176 0.23
177 0.25
178 0.28