Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5AGA2

Protein Details
Accession Q5AGA2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MEEPTKRVTRVNRGQNMKRHIEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012921  SPOC_C  
IPR036575  TFIIS_cen_dom_sf  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
KEGG cal:CAALFM_C502620CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PF07744  SPOC  
Amino Acid Sequences MEEPTKRVTRVNRGQNMKRHIEELLSNDVKYFSSQSTESTNKKQRVEKDVKVTKSDTEDHADTSSQDEYDGEVRCRPCGATKDNYDEDEDTLGDMVQCDQCKTWQHAKCMGYKTKRSIPNIHKCDVCTGKPIPQSKRTSNTKTIKEEEEEEEENDDDDIIEITDVKEKKSFANLKDEVRISTFKAFYNFFKKVIPKDGDNTTEEAIESRVNDMALEIESIIHENFSGKAYPTEARRILFVLKKHFMQEIFDRTITFKDVVHKTPQEINADIAKIEKQNKKNIKNIILTENDNTQIIRRTHKGEIIKENDFERSNQIDESITTRKVDHRHFSPDIVPESNFISHTKSQSKSYNNLNPRFDEDDEEDTATRENEEQEEEEKEEGTKATTEVVESENSETNQLQGENKSTPKSSESLSDVDSPNHNEADDGRLYSFLSGVDNPVTGERKVENKHVWSGRITFPEFATFKAKGEFYTSTDYNDKPMDHLINTTKDILHLPAYTILGRLDRHVADKYLPKVIGSRDFYFVQILNDDANDDQFQKLYQYLLIKNKVGVLSGQPSFVKDSYLIPIDFRDENLPPFLKNSRRDLRIGLFALFVVRKDYQPRARSFETNGNNHHQHAKEKENEEEEEEKGRNQSLSEVGHFTSNGVQSIGNKQETQDHRLDDILSQLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.83
3 0.83
4 0.8
5 0.72
6 0.63
7 0.55
8 0.49
9 0.44
10 0.4
11 0.41
12 0.35
13 0.32
14 0.31
15 0.31
16 0.27
17 0.25
18 0.24
19 0.15
20 0.18
21 0.18
22 0.2
23 0.27
24 0.33
25 0.37
26 0.45
27 0.53
28 0.56
29 0.62
30 0.67
31 0.68
32 0.72
33 0.75
34 0.73
35 0.74
36 0.76
37 0.74
38 0.72
39 0.65
40 0.59
41 0.55
42 0.51
43 0.43
44 0.41
45 0.38
46 0.35
47 0.35
48 0.31
49 0.26
50 0.25
51 0.22
52 0.15
53 0.14
54 0.12
55 0.13
56 0.17
57 0.2
58 0.19
59 0.23
60 0.24
61 0.25
62 0.26
63 0.25
64 0.26
65 0.31
66 0.35
67 0.38
68 0.44
69 0.51
70 0.53
71 0.53
72 0.5
73 0.44
74 0.39
75 0.31
76 0.25
77 0.17
78 0.14
79 0.13
80 0.09
81 0.08
82 0.09
83 0.12
84 0.12
85 0.13
86 0.14
87 0.18
88 0.23
89 0.3
90 0.38
91 0.41
92 0.46
93 0.53
94 0.56
95 0.6
96 0.63
97 0.66
98 0.65
99 0.66
100 0.67
101 0.68
102 0.72
103 0.7
104 0.72
105 0.73
106 0.75
107 0.74
108 0.71
109 0.64
110 0.57
111 0.59
112 0.55
113 0.46
114 0.41
115 0.37
116 0.4
117 0.44
118 0.51
119 0.5
120 0.53
121 0.6
122 0.61
123 0.68
124 0.7
125 0.71
126 0.73
127 0.75
128 0.74
129 0.73
130 0.7
131 0.65
132 0.59
133 0.55
134 0.48
135 0.45
136 0.38
137 0.32
138 0.29
139 0.25
140 0.22
141 0.18
142 0.14
143 0.09
144 0.07
145 0.07
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.12
151 0.12
152 0.13
153 0.15
154 0.16
155 0.18
156 0.28
157 0.34
158 0.31
159 0.41
160 0.43
161 0.44
162 0.49
163 0.48
164 0.4
165 0.36
166 0.35
167 0.27
168 0.28
169 0.27
170 0.23
171 0.25
172 0.26
173 0.27
174 0.34
175 0.33
176 0.29
177 0.32
178 0.35
179 0.36
180 0.43
181 0.41
182 0.36
183 0.38
184 0.42
185 0.4
186 0.37
187 0.36
188 0.27
189 0.24
190 0.21
191 0.17
192 0.14
193 0.11
194 0.1
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.11
217 0.14
218 0.17
219 0.23
220 0.24
221 0.23
222 0.23
223 0.24
224 0.26
225 0.27
226 0.28
227 0.29
228 0.3
229 0.3
230 0.31
231 0.32
232 0.28
233 0.27
234 0.28
235 0.27
236 0.27
237 0.27
238 0.25
239 0.24
240 0.25
241 0.23
242 0.19
243 0.14
244 0.18
245 0.22
246 0.24
247 0.29
248 0.29
249 0.3
250 0.34
251 0.36
252 0.31
253 0.28
254 0.28
255 0.24
256 0.23
257 0.2
258 0.16
259 0.14
260 0.15
261 0.22
262 0.27
263 0.3
264 0.39
265 0.48
266 0.53
267 0.59
268 0.62
269 0.61
270 0.58
271 0.57
272 0.52
273 0.46
274 0.41
275 0.36
276 0.31
277 0.24
278 0.2
279 0.17
280 0.13
281 0.17
282 0.16
283 0.19
284 0.2
285 0.24
286 0.25
287 0.3
288 0.34
289 0.33
290 0.39
291 0.4
292 0.4
293 0.37
294 0.36
295 0.34
296 0.3
297 0.25
298 0.21
299 0.18
300 0.17
301 0.15
302 0.15
303 0.12
304 0.12
305 0.16
306 0.15
307 0.14
308 0.13
309 0.14
310 0.18
311 0.23
312 0.27
313 0.28
314 0.28
315 0.35
316 0.35
317 0.36
318 0.35
319 0.32
320 0.3
321 0.27
322 0.23
323 0.17
324 0.17
325 0.16
326 0.14
327 0.11
328 0.13
329 0.14
330 0.18
331 0.22
332 0.23
333 0.26
334 0.32
335 0.35
336 0.35
337 0.41
338 0.46
339 0.49
340 0.53
341 0.51
342 0.46
343 0.46
344 0.45
345 0.38
346 0.33
347 0.27
348 0.24
349 0.23
350 0.23
351 0.19
352 0.15
353 0.15
354 0.12
355 0.1
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.08
360 0.09
361 0.1
362 0.12
363 0.12
364 0.12
365 0.11
366 0.11
367 0.1
368 0.09
369 0.08
370 0.07
371 0.06
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.11
380 0.11
381 0.11
382 0.13
383 0.11
384 0.11
385 0.11
386 0.11
387 0.11
388 0.1
389 0.13
390 0.15
391 0.17
392 0.18
393 0.18
394 0.18
395 0.19
396 0.19
397 0.17
398 0.18
399 0.19
400 0.19
401 0.2
402 0.23
403 0.22
404 0.22
405 0.23
406 0.22
407 0.2
408 0.19
409 0.16
410 0.13
411 0.12
412 0.15
413 0.14
414 0.12
415 0.11
416 0.11
417 0.11
418 0.11
419 0.1
420 0.06
421 0.07
422 0.07
423 0.08
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.1
428 0.12
429 0.11
430 0.12
431 0.13
432 0.19
433 0.22
434 0.28
435 0.3
436 0.31
437 0.39
438 0.4
439 0.4
440 0.36
441 0.38
442 0.35
443 0.36
444 0.34
445 0.28
446 0.25
447 0.3
448 0.27
449 0.25
450 0.26
451 0.22
452 0.21
453 0.23
454 0.22
455 0.17
456 0.21
457 0.21
458 0.19
459 0.25
460 0.24
461 0.25
462 0.28
463 0.28
464 0.26
465 0.26
466 0.23
467 0.18
468 0.22
469 0.21
470 0.18
471 0.22
472 0.23
473 0.24
474 0.26
475 0.26
476 0.22
477 0.2
478 0.21
479 0.19
480 0.16
481 0.13
482 0.13
483 0.14
484 0.15
485 0.14
486 0.14
487 0.13
488 0.13
489 0.13
490 0.14
491 0.15
492 0.15
493 0.18
494 0.19
495 0.2
496 0.21
497 0.27
498 0.28
499 0.3
500 0.29
501 0.26
502 0.28
503 0.31
504 0.35
505 0.34
506 0.34
507 0.32
508 0.33
509 0.33
510 0.32
511 0.29
512 0.22
513 0.17
514 0.15
515 0.12
516 0.11
517 0.11
518 0.09
519 0.1
520 0.1
521 0.1
522 0.1
523 0.1
524 0.1
525 0.11
526 0.11
527 0.1
528 0.13
529 0.17
530 0.23
531 0.3
532 0.35
533 0.34
534 0.34
535 0.37
536 0.34
537 0.29
538 0.24
539 0.2
540 0.21
541 0.21
542 0.23
543 0.2
544 0.21
545 0.24
546 0.22
547 0.2
548 0.16
549 0.17
550 0.19
551 0.22
552 0.21
553 0.18
554 0.19
555 0.21
556 0.21
557 0.2
558 0.2
559 0.18
560 0.2
561 0.25
562 0.25
563 0.21
564 0.25
565 0.31
566 0.34
567 0.38
568 0.46
569 0.49
570 0.52
571 0.54
572 0.56
573 0.53
574 0.53
575 0.49
576 0.4
577 0.32
578 0.28
579 0.29
580 0.24
581 0.2
582 0.17
583 0.17
584 0.19
585 0.24
586 0.34
587 0.39
588 0.47
589 0.52
590 0.55
591 0.59
592 0.6
593 0.59
594 0.6
595 0.59
596 0.58
597 0.58
598 0.59
599 0.56
600 0.55
601 0.57
602 0.5
603 0.49
604 0.49
605 0.52
606 0.52
607 0.54
608 0.58
609 0.55
610 0.54
611 0.52
612 0.48
613 0.42
614 0.39
615 0.36
616 0.31
617 0.29
618 0.29
619 0.24
620 0.22
621 0.23
622 0.23
623 0.25
624 0.26
625 0.27
626 0.25
627 0.26
628 0.26
629 0.24
630 0.24
631 0.22
632 0.19
633 0.17
634 0.18
635 0.19
636 0.27
637 0.32
638 0.3
639 0.28
640 0.29
641 0.37
642 0.41
643 0.45
644 0.43
645 0.4
646 0.38
647 0.39
648 0.39
649 0.31