Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1GBI4

Protein Details
Accession R1GBI4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-58RAAIEDEKKRNPKYRRARGPNRATRVKLGBasic
346-368DKVEEKQKTSRSRSRSPIKEAISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-54KKRNPKYRRARGPNRATR
Subcellular Location(s) cyto 17, nucl 6, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG npa:UCRNP2_7749  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MGISSAQVLRDVEQQFNKSALFAPLLAAERAAIEDEKKRNPKYRRARGPNRATRVKLGHGGTLDPLATGVLITGVGAGTKALGRFLGECTKTYEATVLFGCATDTYDNTGKVIRRAPYQHVTKDAVEAALAKYRGPGEQIPPVYSALKFGGKKAYEIMREGGERPEMKPRPVTVHALELVEWMEPGTHAWKFPTEELEASEEEKDAILGVSASNKSEDAQASAGSKRKREEDEAAENSPKKTKTEAGPEPVHSNPDGSSAPAALIRMTVSSGFYVRTLCHDLGIDVGSFGCMTYLVRSEQGEFKLGKNVLEYEELEKGEEVWGPKVQGFLEDWMAREEGKNGDTADKVEEKQKTSRSRSRSPIKEAIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.34
3 0.35
4 0.33
5 0.26
6 0.26
7 0.22
8 0.19
9 0.16
10 0.15
11 0.17
12 0.19
13 0.18
14 0.16
15 0.13
16 0.12
17 0.12
18 0.13
19 0.11
20 0.12
21 0.19
22 0.25
23 0.35
24 0.43
25 0.5
26 0.58
27 0.65
28 0.73
29 0.77
30 0.82
31 0.84
32 0.86
33 0.9
34 0.92
35 0.94
36 0.94
37 0.92
38 0.89
39 0.81
40 0.77
41 0.71
42 0.65
43 0.6
44 0.52
45 0.46
46 0.38
47 0.36
48 0.29
49 0.26
50 0.21
51 0.14
52 0.12
53 0.08
54 0.07
55 0.06
56 0.04
57 0.03
58 0.03
59 0.03
60 0.03
61 0.03
62 0.03
63 0.03
64 0.03
65 0.04
66 0.05
67 0.05
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.08
72 0.12
73 0.19
74 0.19
75 0.19
76 0.24
77 0.27
78 0.26
79 0.25
80 0.25
81 0.17
82 0.18
83 0.17
84 0.13
85 0.11
86 0.1
87 0.1
88 0.08
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.11
93 0.14
94 0.14
95 0.14
96 0.18
97 0.18
98 0.2
99 0.25
100 0.24
101 0.27
102 0.31
103 0.37
104 0.42
105 0.46
106 0.45
107 0.45
108 0.46
109 0.4
110 0.38
111 0.32
112 0.23
113 0.17
114 0.16
115 0.12
116 0.12
117 0.12
118 0.1
119 0.11
120 0.12
121 0.12
122 0.14
123 0.15
124 0.14
125 0.2
126 0.21
127 0.21
128 0.22
129 0.23
130 0.21
131 0.19
132 0.17
133 0.13
134 0.18
135 0.17
136 0.17
137 0.23
138 0.22
139 0.22
140 0.24
141 0.27
142 0.23
143 0.25
144 0.25
145 0.2
146 0.2
147 0.21
148 0.18
149 0.17
150 0.16
151 0.16
152 0.24
153 0.24
154 0.25
155 0.26
156 0.26
157 0.29
158 0.31
159 0.34
160 0.25
161 0.26
162 0.26
163 0.23
164 0.22
165 0.16
166 0.14
167 0.09
168 0.08
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.09
178 0.1
179 0.11
180 0.14
181 0.12
182 0.12
183 0.13
184 0.15
185 0.14
186 0.13
187 0.13
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.07
192 0.05
193 0.04
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.1
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.1
208 0.11
209 0.14
210 0.19
211 0.19
212 0.22
213 0.23
214 0.27
215 0.3
216 0.33
217 0.36
218 0.38
219 0.44
220 0.46
221 0.46
222 0.45
223 0.43
224 0.39
225 0.38
226 0.32
227 0.24
228 0.24
229 0.26
230 0.28
231 0.36
232 0.41
233 0.43
234 0.46
235 0.46
236 0.47
237 0.42
238 0.39
239 0.29
240 0.24
241 0.17
242 0.17
243 0.16
244 0.12
245 0.12
246 0.1
247 0.11
248 0.1
249 0.1
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.13
264 0.17
265 0.16
266 0.17
267 0.17
268 0.16
269 0.16
270 0.17
271 0.12
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.06
281 0.08
282 0.09
283 0.12
284 0.13
285 0.15
286 0.2
287 0.21
288 0.24
289 0.23
290 0.23
291 0.29
292 0.29
293 0.27
294 0.24
295 0.25
296 0.22
297 0.24
298 0.24
299 0.2
300 0.23
301 0.22
302 0.21
303 0.19
304 0.17
305 0.16
306 0.17
307 0.15
308 0.14
309 0.16
310 0.17
311 0.18
312 0.19
313 0.17
314 0.17
315 0.17
316 0.17
317 0.22
318 0.21
319 0.22
320 0.22
321 0.23
322 0.21
323 0.2
324 0.2
325 0.17
326 0.16
327 0.18
328 0.17
329 0.2
330 0.2
331 0.21
332 0.23
333 0.24
334 0.25
335 0.3
336 0.34
337 0.35
338 0.42
339 0.5
340 0.54
341 0.6
342 0.67
343 0.68
344 0.73
345 0.79
346 0.82
347 0.82
348 0.81