Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1EDU4

Protein Details
Accession R1EDU4    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-69KAAASKSDKKSKKAKAPTPEPESDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-61ATKPTKGASKAETPKKVAAVKEGRVTKASQTPKSKAKETAKAAASKSDKKSKKAKA
456-496GGRGGGRGGSRGGFGGRGGGRGGSGFGGRGGGRGGARGGRG
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG npa:UCRNP2_7644  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAKVKATKPTKGASKAETPKKVAAVKEGRVTKASQTPKSKAKETAKAAASKSDKKSKKAKAPTPEPESDSDEEMTSDSSASSDSESDSDSSASEVESKPTPKANGAAKKAAKEASSDSSSEEDSDSSDSDAEVPAKANGTAKKAAAKDDSSDSSDSDSSEDEAPAPKKAAAKAESSDSDSDSDSSEDEAPKAKKAKAAASSDDSDASSDSSDSDSGSDSDEEASEESTSSEEAPSKKRKAETEAAPVTKKNKTQNAEGNGSPNLFVGNLSWNVDEDWLGREFEEYAPKAVRIVTDRATGRSKGFGYVEFETVEAATAALNAMKGSDLDGRPLNLDYSTPRPEGQNPRDRANDRSSRFGDVPNKPSDTLFVGNLSFDATPDIVTELFQEYGTITRVSLPTKPEDGMPKGFGYVGFSSVEEAQGAFDALQGADLSGRPVRLDFAAPRSNDGGSRGSFGGRGGGRGGSRGGFGGRGGGRGGSGFGGRGGGRGGARGGRGGFSTNRGGFGDFQGKKTSFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.68
3 0.73
4 0.72
5 0.68
6 0.64
7 0.65
8 0.64
9 0.55
10 0.56
11 0.54
12 0.52
13 0.55
14 0.56
15 0.52
16 0.49
17 0.49
18 0.45
19 0.46
20 0.49
21 0.5
22 0.53
23 0.58
24 0.64
25 0.69
26 0.68
27 0.69
28 0.7
29 0.7
30 0.68
31 0.7
32 0.67
33 0.66
34 0.62
35 0.61
36 0.59
37 0.58
38 0.59
39 0.61
40 0.61
41 0.63
42 0.72
43 0.73
44 0.77
45 0.79
46 0.8
47 0.8
48 0.85
49 0.87
50 0.85
51 0.8
52 0.72
53 0.65
54 0.62
55 0.53
56 0.46
57 0.37
58 0.29
59 0.24
60 0.21
61 0.18
62 0.13
63 0.11
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.1
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.1
77 0.1
78 0.09
79 0.09
80 0.11
81 0.11
82 0.13
83 0.17
84 0.19
85 0.21
86 0.25
87 0.26
88 0.25
89 0.31
90 0.37
91 0.42
92 0.45
93 0.52
94 0.5
95 0.51
96 0.52
97 0.49
98 0.4
99 0.34
100 0.32
101 0.29
102 0.28
103 0.26
104 0.25
105 0.23
106 0.23
107 0.21
108 0.18
109 0.12
110 0.11
111 0.12
112 0.11
113 0.09
114 0.09
115 0.08
116 0.08
117 0.1
118 0.09
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.11
124 0.14
125 0.16
126 0.2
127 0.22
128 0.22
129 0.27
130 0.27
131 0.3
132 0.3
133 0.28
134 0.27
135 0.28
136 0.3
137 0.27
138 0.26
139 0.23
140 0.21
141 0.2
142 0.18
143 0.14
144 0.12
145 0.12
146 0.12
147 0.12
148 0.1
149 0.15
150 0.15
151 0.16
152 0.16
153 0.16
154 0.18
155 0.21
156 0.26
157 0.24
158 0.26
159 0.26
160 0.29
161 0.28
162 0.28
163 0.27
164 0.21
165 0.2
166 0.17
167 0.16
168 0.13
169 0.12
170 0.09
171 0.1
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.16
176 0.16
177 0.2
178 0.24
179 0.24
180 0.24
181 0.27
182 0.32
183 0.34
184 0.37
185 0.36
186 0.36
187 0.37
188 0.34
189 0.32
190 0.26
191 0.19
192 0.15
193 0.12
194 0.08
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.07
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.08
219 0.1
220 0.17
221 0.24
222 0.27
223 0.31
224 0.34
225 0.36
226 0.4
227 0.45
228 0.44
229 0.45
230 0.48
231 0.46
232 0.44
233 0.43
234 0.4
235 0.36
236 0.35
237 0.32
238 0.34
239 0.35
240 0.4
241 0.46
242 0.48
243 0.47
244 0.43
245 0.39
246 0.32
247 0.3
248 0.23
249 0.16
250 0.11
251 0.07
252 0.07
253 0.05
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.08
262 0.07
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.09
269 0.1
270 0.14
271 0.12
272 0.13
273 0.14
274 0.14
275 0.14
276 0.13
277 0.13
278 0.12
279 0.14
280 0.15
281 0.19
282 0.2
283 0.23
284 0.26
285 0.25
286 0.23
287 0.24
288 0.22
289 0.19
290 0.19
291 0.18
292 0.19
293 0.19
294 0.2
295 0.16
296 0.16
297 0.13
298 0.12
299 0.11
300 0.06
301 0.05
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.04
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.04
311 0.05
312 0.11
313 0.1
314 0.13
315 0.14
316 0.14
317 0.15
318 0.16
319 0.15
320 0.1
321 0.11
322 0.11
323 0.16
324 0.19
325 0.19
326 0.2
327 0.21
328 0.29
329 0.38
330 0.44
331 0.48
332 0.48
333 0.52
334 0.58
335 0.58
336 0.56
337 0.54
338 0.54
339 0.47
340 0.51
341 0.49
342 0.46
343 0.45
344 0.46
345 0.46
346 0.44
347 0.47
348 0.44
349 0.44
350 0.4
351 0.39
352 0.35
353 0.29
354 0.24
355 0.2
356 0.17
357 0.15
358 0.14
359 0.14
360 0.13
361 0.09
362 0.08
363 0.08
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.08
372 0.09
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.09
377 0.11
378 0.1
379 0.08
380 0.11
381 0.13
382 0.15
383 0.18
384 0.19
385 0.22
386 0.24
387 0.25
388 0.25
389 0.3
390 0.32
391 0.33
392 0.32
393 0.28
394 0.26
395 0.26
396 0.23
397 0.21
398 0.17
399 0.15
400 0.13
401 0.13
402 0.14
403 0.14
404 0.14
405 0.1
406 0.09
407 0.08
408 0.07
409 0.08
410 0.05
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.07
419 0.09
420 0.1
421 0.1
422 0.1
423 0.11
424 0.12
425 0.13
426 0.17
427 0.18
428 0.24
429 0.3
430 0.3
431 0.33
432 0.33
433 0.33
434 0.3
435 0.29
436 0.26
437 0.2
438 0.24
439 0.21
440 0.2
441 0.19
442 0.18
443 0.22
444 0.18
445 0.19
446 0.17
447 0.19
448 0.19
449 0.2
450 0.21
451 0.15
452 0.15
453 0.15
454 0.14
455 0.12
456 0.12
457 0.17
458 0.16
459 0.17
460 0.17
461 0.16
462 0.15
463 0.15
464 0.16
465 0.1
466 0.1
467 0.09
468 0.09
469 0.11
470 0.11
471 0.11
472 0.11
473 0.13
474 0.13
475 0.14
476 0.16
477 0.16
478 0.17
479 0.2
480 0.2
481 0.18
482 0.19
483 0.21
484 0.21
485 0.23
486 0.3
487 0.28
488 0.29
489 0.29
490 0.3
491 0.28
492 0.32
493 0.38
494 0.31
495 0.33
496 0.39