Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1E7Q3

Protein Details
Accession R1E7Q3    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
221-242RFLPNFKKRHTAKRRVPFKVADHydrophilic
268-291EYFLGKQAKERKEKERREDAMREKBasic
305-340APKEDVGGKEKKRKRKEEDGEKKKKKKKRASDESDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
227-241KKRHTAKRRVPFKVA
274-334QAKERKEKERREDAMREKMEEKRKSRAKEFEAPKEDVGGKEKKRKRKEEDGEKKKKKKKRA
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041174  KH_8  
IPR004087  KH_dom  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR024166  rRNA_assembly_KRR1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG npa:UCRNP2_9854  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17903  KH_8  
CDD cd22393  KH-I_KRR1_rpt1  
cd22394  KH-I_KRR1_rpt2  
Amino Acid Sequences MPSTYKKDKPWDTDDIDKWKIDEFKPEDNLGGTFAEESSFATLFPKYREVYLREAWPVITRALEKQGIACTLDLVEGSMTVKTTRKTYDPAAILKARDLVKLLARSVPAPQALKILEDGQACDIIKIRNLVRNKERFVKRRQRILGPDGSTLKALELLTGCYILVQGNTVSCMGGYKGLKEVRRVIEDCMANIHPIYHIKELMIKRELQKDPELVNESWDRFLPNFKKRHTAKRRVPFKVADKSKKVYTPFPPAQEKSKVDLQIESGEYFLGKQAKERKEKERREDAMREKMEEKRKSRAKEFEAPKEDVGGKEKKRKRKEEDGEKKKKKKKRASDESDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.68
3 0.63
4 0.55
5 0.49
6 0.46
7 0.46
8 0.38
9 0.41
10 0.38
11 0.43
12 0.47
13 0.47
14 0.43
15 0.38
16 0.37
17 0.29
18 0.23
19 0.16
20 0.12
21 0.1
22 0.1
23 0.08
24 0.09
25 0.1
26 0.09
27 0.09
28 0.1
29 0.12
30 0.14
31 0.17
32 0.21
33 0.19
34 0.24
35 0.29
36 0.32
37 0.37
38 0.39
39 0.41
40 0.38
41 0.37
42 0.34
43 0.31
44 0.29
45 0.23
46 0.21
47 0.18
48 0.18
49 0.23
50 0.23
51 0.2
52 0.21
53 0.23
54 0.22
55 0.21
56 0.18
57 0.14
58 0.12
59 0.12
60 0.1
61 0.08
62 0.06
63 0.05
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.08
68 0.11
69 0.12
70 0.15
71 0.18
72 0.2
73 0.24
74 0.27
75 0.33
76 0.34
77 0.36
78 0.38
79 0.38
80 0.35
81 0.32
82 0.34
83 0.27
84 0.23
85 0.22
86 0.18
87 0.2
88 0.22
89 0.22
90 0.2
91 0.19
92 0.19
93 0.2
94 0.21
95 0.19
96 0.18
97 0.17
98 0.18
99 0.17
100 0.17
101 0.16
102 0.14
103 0.15
104 0.14
105 0.14
106 0.12
107 0.14
108 0.13
109 0.12
110 0.13
111 0.1
112 0.11
113 0.14
114 0.15
115 0.19
116 0.22
117 0.29
118 0.36
119 0.42
120 0.44
121 0.51
122 0.58
123 0.59
124 0.66
125 0.7
126 0.68
127 0.72
128 0.72
129 0.7
130 0.67
131 0.66
132 0.62
133 0.53
134 0.5
135 0.42
136 0.38
137 0.31
138 0.25
139 0.19
140 0.14
141 0.11
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.05
156 0.05
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.13
165 0.17
166 0.19
167 0.21
168 0.26
169 0.25
170 0.3
171 0.3
172 0.27
173 0.29
174 0.28
175 0.26
176 0.23
177 0.21
178 0.17
179 0.15
180 0.14
181 0.09
182 0.11
183 0.14
184 0.12
185 0.12
186 0.12
187 0.19
188 0.2
189 0.23
190 0.23
191 0.23
192 0.25
193 0.34
194 0.35
195 0.32
196 0.34
197 0.32
198 0.31
199 0.33
200 0.34
201 0.25
202 0.27
203 0.26
204 0.25
205 0.22
206 0.22
207 0.19
208 0.14
209 0.22
210 0.27
211 0.32
212 0.38
213 0.39
214 0.49
215 0.53
216 0.64
217 0.67
218 0.7
219 0.72
220 0.76
221 0.84
222 0.8
223 0.8
224 0.76
225 0.74
226 0.73
227 0.73
228 0.71
229 0.67
230 0.65
231 0.65
232 0.62
233 0.57
234 0.54
235 0.5
236 0.52
237 0.51
238 0.54
239 0.57
240 0.54
241 0.57
242 0.57
243 0.54
244 0.48
245 0.5
246 0.46
247 0.4
248 0.38
249 0.34
250 0.31
251 0.29
252 0.25
253 0.19
254 0.15
255 0.14
256 0.13
257 0.14
258 0.14
259 0.12
260 0.18
261 0.28
262 0.36
263 0.46
264 0.52
265 0.6
266 0.67
267 0.77
268 0.8
269 0.82
270 0.79
271 0.78
272 0.81
273 0.78
274 0.78
275 0.7
276 0.64
277 0.57
278 0.6
279 0.61
280 0.61
281 0.57
282 0.57
283 0.63
284 0.67
285 0.72
286 0.73
287 0.71
288 0.73
289 0.77
290 0.77
291 0.75
292 0.71
293 0.63
294 0.57
295 0.52
296 0.44
297 0.42
298 0.4
299 0.41
300 0.49
301 0.56
302 0.62
303 0.71
304 0.79
305 0.82
306 0.84
307 0.87
308 0.88
309 0.92
310 0.92
311 0.93
312 0.94
313 0.95
314 0.94
315 0.92
316 0.91
317 0.91
318 0.91
319 0.91
320 0.91