Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1GQ72

Protein Details
Accession R1GQ72    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-37DDHPHARTRGKGRRQWRTLPGNQGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-26RKRKAPADDHPHARTRGKGRR
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 8, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004114  THUMP_dom  
IPR040183  THUMPD1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006400  P:tRNA modification  
KEGG npa:UCRNP2_5143  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02926  THUMP  
CDD cd11717  THUMP_THUMPD1_like  
Amino Acid Sequences MSDGSRKRKAPADDHPHARTRGKGRRQWRTLPGNQGGGSIEAGDSGIWATCNMGREAKAVAELKDMFEECVSRMYGGASRDGGDEEDDAPAAHEDADVEAEIAKELEDIRKPAKEPPFRHVRVDTDCIMFFKTQAPIEPVEFVRRICEDAMASSERKTGRFVKRLTPMTLMGKATEKGLEEVSAKVLAPHFHTEGSAGKKASTSTSSIVFPGLFFPFAIRPNIRNHKSMTRDQVIKTVAAAVGPGHKVDLKEYDLLILVDIYKASGAESWVEACRLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.73
3 0.72
4 0.69
5 0.63
6 0.6
7 0.61
8 0.62
9 0.64
10 0.67
11 0.71
12 0.78
13 0.82
14 0.83
15 0.83
16 0.82
17 0.79
18 0.8
19 0.75
20 0.69
21 0.61
22 0.53
23 0.44
24 0.35
25 0.28
26 0.18
27 0.13
28 0.08
29 0.08
30 0.06
31 0.05
32 0.04
33 0.05
34 0.04
35 0.05
36 0.06
37 0.08
38 0.1
39 0.12
40 0.14
41 0.14
42 0.15
43 0.16
44 0.15
45 0.19
46 0.19
47 0.18
48 0.2
49 0.2
50 0.19
51 0.2
52 0.2
53 0.16
54 0.14
55 0.14
56 0.1
57 0.12
58 0.12
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.13
63 0.13
64 0.14
65 0.12
66 0.13
67 0.13
68 0.13
69 0.12
70 0.1
71 0.1
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.06
79 0.05
80 0.05
81 0.04
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.05
93 0.07
94 0.08
95 0.1
96 0.13
97 0.15
98 0.16
99 0.22
100 0.31
101 0.37
102 0.39
103 0.43
104 0.52
105 0.52
106 0.54
107 0.5
108 0.45
109 0.41
110 0.42
111 0.37
112 0.28
113 0.27
114 0.23
115 0.22
116 0.18
117 0.13
118 0.12
119 0.12
120 0.11
121 0.12
122 0.13
123 0.13
124 0.13
125 0.15
126 0.13
127 0.14
128 0.14
129 0.13
130 0.13
131 0.12
132 0.13
133 0.11
134 0.12
135 0.09
136 0.09
137 0.11
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.14
142 0.14
143 0.15
144 0.18
145 0.24
146 0.3
147 0.37
148 0.39
149 0.42
150 0.5
151 0.53
152 0.52
153 0.46
154 0.41
155 0.37
156 0.38
157 0.31
158 0.24
159 0.22
160 0.19
161 0.17
162 0.16
163 0.13
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.1
168 0.1
169 0.11
170 0.1
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.1
175 0.12
176 0.15
177 0.15
178 0.14
179 0.15
180 0.15
181 0.19
182 0.22
183 0.23
184 0.2
185 0.19
186 0.2
187 0.21
188 0.22
189 0.19
190 0.17
191 0.15
192 0.18
193 0.18
194 0.17
195 0.18
196 0.15
197 0.13
198 0.13
199 0.12
200 0.1
201 0.09
202 0.11
203 0.13
204 0.15
205 0.2
206 0.2
207 0.22
208 0.31
209 0.42
210 0.43
211 0.44
212 0.47
213 0.51
214 0.55
215 0.6
216 0.59
217 0.56
218 0.58
219 0.56
220 0.57
221 0.5
222 0.44
223 0.36
224 0.3
225 0.22
226 0.17
227 0.16
228 0.1
229 0.13
230 0.13
231 0.13
232 0.12
233 0.14
234 0.15
235 0.17
236 0.21
237 0.19
238 0.21
239 0.21
240 0.21
241 0.2
242 0.19
243 0.17
244 0.13
245 0.1
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.08
254 0.09
255 0.1
256 0.13
257 0.14