Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5A960

Protein Details
Accession Q5A960    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
781-806SNGHDDFSKRPRKKFGRVIKAKTDGLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
789-797KRPRKKFGR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 15, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019154  Arb2_domain  
IPR000286  His_deacetylse  
IPR023801  His_deacetylse_dom  
IPR037138  His_deacetylse_dom_sf  
IPR017321  Hist_deAcase_II_yeast  
IPR017320  Histone_deAcase_II_euk  
IPR023696  Ureohydrolase_dom_sf  
Gene Ontology GO:0099115  C:chromosome, subtelomeric region  
GO:0070823  C:HDA1 complex  
GO:1990342  C:heterochromatin island  
GO:0000118  C:histone deacetylase complex  
GO:0031934  C:mating-type region heterochromatin  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005721  C:pericentric heterochromatin  
GO:0033553  C:rDNA heterochromatin  
GO:0070824  C:SHREC complex  
GO:0110129  C:SHREC2 complex  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0004407  F:histone deacetylase activity  
GO:0031078  F:histone H3K14 deacetylase activity  
GO:0042802  F:identical protein binding  
GO:0071469  P:cellular response to alkaline pH  
GO:0009267  P:cellular response to starvation  
GO:0030447  P:filamentous growth  
GO:0036180  P:filamentous growth of a population of unicellular organisms in response to biotic stimulus  
GO:0036177  P:filamentous growth of a population of unicellular organisms in response to pH  
GO:0036170  P:filamentous growth of a population of unicellular organisms in response to starvation  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0010621  P:negative regulation of transcription by transcription factor localization  
GO:0036166  P:phenotypic switching  
GO:1900445  P:positive regulation of filamentous growth of a population of unicellular organisms in response to biotic stimulus  
GO:1900743  P:positive regulation of filamentous growth of a population of unicellular organisms in response to pH  
GO:1900436  P:positive regulation of filamentous growth of a population of unicellular organisms in response to starvation  
GO:0090053  P:positive regulation of pericentric heterochromatin formation  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0000183  P:rDNA heterochromatin formation  
GO:1900239  P:regulation of phenotypic switching  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0030466  P:silent mating-type cassette heterochromatin formation  
KEGG cal:CAALFM_CR02050CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09757  Arb2  
PF00850  Hist_deacetyl  
Amino Acid Sequences MSTGQEEHLDSKLENQISEEENQSQNQNFPTAIEDSIQASIEKLDEVDDEINPIEVKDEFPTTIGTTYDILHPREPFPKRIKLEETETEPDSNGIADNDQTMVVVPPKKPQLFYTPLKTGLVYDVRMRYHAKVFTSYSEYIDPHPEDPRRIYRIYKKLVEAGIVLDPSLAGINEIGPFMLKIPIREATSEEILQVHSEDHLKFIQSTEDMSRDQLLKETETGDSIYVNNDSYLSAKLSCGGTIEACKAVIEGRVKNSLAIVRPPGHHAEPNTPAGFCLFSNVAVAAKNMLKNYPESVRRIVIVDWDIHHGNGTQKAFYNDPRVLYISLHRFENGKFYPGTKYGDLNQVGEGPGEGFTINIPWRSSGMHDGDYVYAFNKIIQPVISEFDPDLIIVSSGFDAADGDVIGACHVTPAGYGYMTHTLKGIARGKLAVILEGGYNLDSISKSALAVAKVLVGEPPENTITLRPQAEAIEVVDEVIKIQSKYFKSLRNGIPNGIFEDVYDLADVEKSNYKLVNIADPIRSHQVEKLFNEKEFINIPIISSPSNGEKPPFTTDLPDQLEDLIVASPDIYNCTTIILTIHDPPEIWANINPTNGVIETNSTMVLEHPLVQIMDKIQKEKDPENQEKFGYLDINIPSFQLPIPGTTSESSTYNPIIFAQEVLLYIWDNYIAYFQQLKNLVMVGFGDSYQSIVNLYGKRPSNEIKDLIKGTVAFLNRTTLKPLIPVMDESMVDWYYQNSIIFTSNFNTCWTGGSGAGNGNGNGNGNNGNSSNGGGNKSADSNGHDDFSKRPRKKFGRVIKAKTDGLCDVIQEKFDEGVDFILDSIEDYSSSED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.27
4 0.28
5 0.31
6 0.29
7 0.26
8 0.28
9 0.3
10 0.32
11 0.29
12 0.3
13 0.29
14 0.28
15 0.23
16 0.21
17 0.23
18 0.21
19 0.2
20 0.17
21 0.17
22 0.17
23 0.18
24 0.18
25 0.14
26 0.12
27 0.12
28 0.12
29 0.11
30 0.09
31 0.08
32 0.08
33 0.11
34 0.12
35 0.12
36 0.13
37 0.13
38 0.14
39 0.13
40 0.12
41 0.11
42 0.1
43 0.11
44 0.12
45 0.14
46 0.14
47 0.14
48 0.17
49 0.16
50 0.17
51 0.16
52 0.15
53 0.14
54 0.15
55 0.21
56 0.24
57 0.25
58 0.28
59 0.3
60 0.32
61 0.41
62 0.44
63 0.46
64 0.48
65 0.56
66 0.56
67 0.62
68 0.64
69 0.6
70 0.64
71 0.62
72 0.61
73 0.56
74 0.54
75 0.47
76 0.4
77 0.35
78 0.28
79 0.21
80 0.15
81 0.11
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.08
89 0.09
90 0.14
91 0.18
92 0.18
93 0.24
94 0.33
95 0.36
96 0.37
97 0.39
98 0.42
99 0.46
100 0.51
101 0.52
102 0.48
103 0.48
104 0.47
105 0.44
106 0.36
107 0.34
108 0.31
109 0.25
110 0.26
111 0.28
112 0.28
113 0.31
114 0.33
115 0.3
116 0.33
117 0.35
118 0.32
119 0.32
120 0.33
121 0.35
122 0.38
123 0.36
124 0.32
125 0.31
126 0.3
127 0.27
128 0.31
129 0.29
130 0.25
131 0.31
132 0.32
133 0.33
134 0.38
135 0.44
136 0.43
137 0.44
138 0.51
139 0.53
140 0.6
141 0.64
142 0.63
143 0.58
144 0.58
145 0.56
146 0.49
147 0.39
148 0.31
149 0.25
150 0.2
151 0.17
152 0.11
153 0.1
154 0.09
155 0.08
156 0.06
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.05
164 0.06
165 0.06
166 0.11
167 0.11
168 0.11
169 0.15
170 0.19
171 0.2
172 0.21
173 0.22
174 0.22
175 0.24
176 0.23
177 0.2
178 0.17
179 0.16
180 0.16
181 0.14
182 0.1
183 0.08
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.13
188 0.14
189 0.14
190 0.14
191 0.15
192 0.12
193 0.15
194 0.15
195 0.17
196 0.16
197 0.17
198 0.19
199 0.18
200 0.18
201 0.19
202 0.18
203 0.16
204 0.17
205 0.17
206 0.15
207 0.15
208 0.15
209 0.12
210 0.11
211 0.1
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.1
220 0.1
221 0.09
222 0.09
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.13
231 0.11
232 0.1
233 0.1
234 0.09
235 0.09
236 0.13
237 0.15
238 0.17
239 0.19
240 0.23
241 0.23
242 0.23
243 0.24
244 0.23
245 0.21
246 0.21
247 0.22
248 0.21
249 0.22
250 0.25
251 0.27
252 0.26
253 0.27
254 0.27
255 0.28
256 0.29
257 0.33
258 0.3
259 0.26
260 0.24
261 0.22
262 0.2
263 0.14
264 0.13
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.1
274 0.12
275 0.12
276 0.13
277 0.13
278 0.14
279 0.17
280 0.21
281 0.23
282 0.25
283 0.27
284 0.27
285 0.27
286 0.27
287 0.24
288 0.21
289 0.18
290 0.16
291 0.14
292 0.16
293 0.16
294 0.14
295 0.15
296 0.13
297 0.13
298 0.17
299 0.17
300 0.15
301 0.16
302 0.18
303 0.2
304 0.21
305 0.25
306 0.22
307 0.22
308 0.23
309 0.23
310 0.22
311 0.2
312 0.23
313 0.23
314 0.23
315 0.22
316 0.21
317 0.21
318 0.2
319 0.27
320 0.22
321 0.19
322 0.18
323 0.19
324 0.22
325 0.23
326 0.26
327 0.2
328 0.21
329 0.21
330 0.27
331 0.27
332 0.24
333 0.22
334 0.19
335 0.18
336 0.16
337 0.14
338 0.07
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.04
343 0.04
344 0.06
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.09
350 0.09
351 0.11
352 0.14
353 0.15
354 0.15
355 0.15
356 0.15
357 0.15
358 0.15
359 0.14
360 0.09
361 0.08
362 0.07
363 0.07
364 0.09
365 0.08
366 0.09
367 0.08
368 0.09
369 0.09
370 0.11
371 0.1
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.07
377 0.07
378 0.05
379 0.05
380 0.04
381 0.05
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.02
397 0.02
398 0.02
399 0.02
400 0.03
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.06
405 0.12
406 0.13
407 0.13
408 0.12
409 0.12
410 0.13
411 0.19
412 0.22
413 0.17
414 0.17
415 0.18
416 0.17
417 0.19
418 0.19
419 0.13
420 0.08
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.05
432 0.05
433 0.04
434 0.06
435 0.08
436 0.07
437 0.08
438 0.07
439 0.08
440 0.07
441 0.08
442 0.07
443 0.06
444 0.06
445 0.06
446 0.08
447 0.07
448 0.08
449 0.08
450 0.09
451 0.1
452 0.13
453 0.13
454 0.11
455 0.12
456 0.12
457 0.12
458 0.12
459 0.1
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.06
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.06
468 0.06
469 0.07
470 0.13
471 0.14
472 0.2
473 0.24
474 0.3
475 0.32
476 0.41
477 0.46
478 0.49
479 0.5
480 0.46
481 0.44
482 0.38
483 0.36
484 0.29
485 0.22
486 0.13
487 0.14
488 0.12
489 0.1
490 0.09
491 0.07
492 0.06
493 0.07
494 0.08
495 0.07
496 0.1
497 0.1
498 0.12
499 0.12
500 0.12
501 0.15
502 0.15
503 0.18
504 0.16
505 0.18
506 0.19
507 0.19
508 0.22
509 0.23
510 0.23
511 0.2
512 0.21
513 0.24
514 0.27
515 0.28
516 0.34
517 0.32
518 0.31
519 0.32
520 0.29
521 0.25
522 0.22
523 0.21
524 0.15
525 0.13
526 0.13
527 0.12
528 0.13
529 0.12
530 0.11
531 0.11
532 0.13
533 0.15
534 0.15
535 0.16
536 0.16
537 0.18
538 0.22
539 0.23
540 0.2
541 0.21
542 0.22
543 0.29
544 0.3
545 0.28
546 0.24
547 0.21
548 0.21
549 0.17
550 0.16
551 0.08
552 0.05
553 0.04
554 0.04
555 0.05
556 0.05
557 0.07
558 0.07
559 0.07
560 0.07
561 0.08
562 0.08
563 0.08
564 0.08
565 0.09
566 0.1
567 0.12
568 0.13
569 0.12
570 0.12
571 0.13
572 0.17
573 0.15
574 0.15
575 0.14
576 0.17
577 0.2
578 0.2
579 0.19
580 0.15
581 0.15
582 0.14
583 0.13
584 0.09
585 0.08
586 0.09
587 0.09
588 0.09
589 0.08
590 0.08
591 0.08
592 0.09
593 0.08
594 0.09
595 0.09
596 0.1
597 0.1
598 0.1
599 0.1
600 0.11
601 0.17
602 0.16
603 0.19
604 0.2
605 0.23
606 0.27
607 0.31
608 0.37
609 0.41
610 0.49
611 0.53
612 0.54
613 0.52
614 0.48
615 0.44
616 0.37
617 0.28
618 0.2
619 0.18
620 0.16
621 0.17
622 0.16
623 0.16
624 0.15
625 0.14
626 0.13
627 0.12
628 0.11
629 0.11
630 0.14
631 0.14
632 0.16
633 0.16
634 0.18
635 0.16
636 0.17
637 0.17
638 0.17
639 0.17
640 0.15
641 0.15
642 0.14
643 0.14
644 0.13
645 0.12
646 0.1
647 0.09
648 0.09
649 0.09
650 0.09
651 0.07
652 0.07
653 0.07
654 0.06
655 0.06
656 0.05
657 0.07
658 0.06
659 0.09
660 0.13
661 0.13
662 0.19
663 0.22
664 0.22
665 0.21
666 0.22
667 0.2
668 0.15
669 0.16
670 0.12
671 0.09
672 0.09
673 0.09
674 0.07
675 0.08
676 0.08
677 0.08
678 0.06
679 0.07
680 0.13
681 0.14
682 0.16
683 0.22
684 0.26
685 0.28
686 0.32
687 0.36
688 0.39
689 0.42
690 0.46
691 0.42
692 0.44
693 0.45
694 0.41
695 0.37
696 0.3
697 0.26
698 0.25
699 0.23
700 0.18
701 0.17
702 0.23
703 0.23
704 0.24
705 0.27
706 0.24
707 0.23
708 0.25
709 0.26
710 0.23
711 0.22
712 0.23
713 0.21
714 0.22
715 0.21
716 0.19
717 0.2
718 0.17
719 0.15
720 0.14
721 0.12
722 0.11
723 0.13
724 0.13
725 0.1
726 0.12
727 0.14
728 0.15
729 0.16
730 0.17
731 0.17
732 0.18
733 0.19
734 0.2
735 0.18
736 0.19
737 0.19
738 0.18
739 0.16
740 0.17
741 0.17
742 0.16
743 0.18
744 0.17
745 0.15
746 0.15
747 0.15
748 0.14
749 0.13
750 0.13
751 0.13
752 0.12
753 0.15
754 0.14
755 0.15
756 0.14
757 0.15
758 0.17
759 0.18
760 0.2
761 0.19
762 0.2
763 0.2
764 0.21
765 0.21
766 0.2
767 0.2
768 0.23
769 0.23
770 0.23
771 0.23
772 0.22
773 0.27
774 0.36
775 0.43
776 0.45
777 0.51
778 0.6
779 0.69
780 0.78
781 0.82
782 0.83
783 0.84
784 0.87
785 0.89
786 0.87
787 0.85
788 0.79
789 0.71
790 0.65
791 0.55
792 0.48
793 0.4
794 0.32
795 0.27
796 0.24
797 0.23
798 0.19
799 0.19
800 0.16
801 0.16
802 0.16
803 0.13
804 0.13
805 0.12
806 0.11
807 0.09
808 0.08
809 0.08
810 0.07
811 0.08
812 0.07
813 0.07