Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1EYZ4

Protein Details
Accession R1EYZ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
403-435IPDVLLVKKHYTRKKKNKRNWRVKRMAKEESEMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
411-430KHYTRKKKNKRNWRVKRMAK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039768  Nmd3  
IPR007064  Nmd3_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0043023  F:ribosomal large subunit binding  
GO:0015031  P:protein transport  
KEGG npa:UCRNP2_232  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04981  NMD3  
Amino Acid Sequences MSMDLDGGAVSFQPQAANAATILCCNCGAPIDGTTAAGALCYDCIKLTVDISEGIQREAVLHSCRDCDRWMSPPNQWLVAQPESRELLALCLRKLRGLNKVRIIDASFIWTEPHSRRVKVKITIQQEAFQNTILQQSFEVEYVLANQQCPDCAKSYTHNTWRACVQVRQKVTHKRTFLFLEQLILKHSAHKDTINIKETHEGIDFFFAARNQAEKFVDFLKSVVPVFSKKSQELISMDTHTSIKSYKFTFSVEIVPLCKDDLVVLPIKLAKQLGNIPPMTLCSRIGTAVQVLDPQTLQTADISPDVYWRSPFTSLADVTELVEFVVLDIEPLGPVKGRYVLAEATVARASDLGSNDQTFYTRTHLGGLLNVGDSVMGYHLEGSNFNNELFDELENSKQYSATIPDVLLVKKHYTRKKKNKRNWRVKRMAKEESEMLPRKQDQERLERDFEMFLRDVEEDEDFRAGIALYKSQHAPRPAEPEEMDEDDEEEDEGIKIPMDQLLEEMEDLNMDDGDEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.1
3 0.11
4 0.12
5 0.11
6 0.13
7 0.13
8 0.15
9 0.15
10 0.14
11 0.13
12 0.12
13 0.13
14 0.12
15 0.14
16 0.13
17 0.14
18 0.16
19 0.16
20 0.16
21 0.16
22 0.14
23 0.12
24 0.1
25 0.09
26 0.05
27 0.06
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.08
32 0.11
33 0.11
34 0.12
35 0.12
36 0.13
37 0.13
38 0.15
39 0.19
40 0.17
41 0.17
42 0.16
43 0.15
44 0.15
45 0.16
46 0.19
47 0.16
48 0.18
49 0.19
50 0.22
51 0.24
52 0.25
53 0.25
54 0.26
55 0.27
56 0.32
57 0.38
58 0.39
59 0.42
60 0.46
61 0.47
62 0.44
63 0.41
64 0.37
65 0.36
66 0.37
67 0.35
68 0.29
69 0.3
70 0.29
71 0.28
72 0.26
73 0.2
74 0.18
75 0.22
76 0.23
77 0.2
78 0.24
79 0.24
80 0.27
81 0.31
82 0.32
83 0.36
84 0.42
85 0.49
86 0.53
87 0.55
88 0.53
89 0.51
90 0.48
91 0.4
92 0.32
93 0.28
94 0.2
95 0.17
96 0.17
97 0.15
98 0.18
99 0.18
100 0.27
101 0.27
102 0.3
103 0.36
104 0.42
105 0.5
106 0.52
107 0.58
108 0.57
109 0.59
110 0.63
111 0.59
112 0.56
113 0.52
114 0.47
115 0.39
116 0.31
117 0.25
118 0.19
119 0.22
120 0.17
121 0.15
122 0.12
123 0.14
124 0.14
125 0.13
126 0.13
127 0.08
128 0.08
129 0.1
130 0.13
131 0.12
132 0.11
133 0.12
134 0.12
135 0.13
136 0.15
137 0.15
138 0.14
139 0.15
140 0.18
141 0.22
142 0.3
143 0.37
144 0.43
145 0.49
146 0.48
147 0.48
148 0.47
149 0.47
150 0.42
151 0.4
152 0.41
153 0.4
154 0.43
155 0.47
156 0.53
157 0.59
158 0.63
159 0.64
160 0.6
161 0.53
162 0.54
163 0.53
164 0.47
165 0.41
166 0.34
167 0.3
168 0.27
169 0.26
170 0.23
171 0.21
172 0.18
173 0.18
174 0.2
175 0.19
176 0.19
177 0.19
178 0.22
179 0.27
180 0.33
181 0.34
182 0.33
183 0.32
184 0.33
185 0.33
186 0.3
187 0.25
188 0.19
189 0.14
190 0.14
191 0.13
192 0.1
193 0.11
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.09
199 0.12
200 0.12
201 0.12
202 0.13
203 0.13
204 0.14
205 0.13
206 0.13
207 0.1
208 0.11
209 0.11
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.14
214 0.19
215 0.21
216 0.2
217 0.23
218 0.23
219 0.25
220 0.24
221 0.24
222 0.2
223 0.19
224 0.19
225 0.17
226 0.17
227 0.14
228 0.13
229 0.11
230 0.1
231 0.11
232 0.12
233 0.13
234 0.14
235 0.15
236 0.16
237 0.16
238 0.18
239 0.16
240 0.15
241 0.14
242 0.14
243 0.13
244 0.11
245 0.1
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.1
257 0.08
258 0.09
259 0.14
260 0.17
261 0.2
262 0.2
263 0.19
264 0.18
265 0.2
266 0.19
267 0.15
268 0.13
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.11
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.07
291 0.09
292 0.11
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.12
297 0.13
298 0.14
299 0.14
300 0.16
301 0.15
302 0.16
303 0.16
304 0.14
305 0.13
306 0.13
307 0.1
308 0.07
309 0.06
310 0.05
311 0.04
312 0.04
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.05
322 0.06
323 0.08
324 0.09
325 0.1
326 0.12
327 0.12
328 0.12
329 0.14
330 0.13
331 0.12
332 0.12
333 0.11
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.11
339 0.11
340 0.12
341 0.13
342 0.14
343 0.14
344 0.14
345 0.12
346 0.13
347 0.14
348 0.15
349 0.14
350 0.15
351 0.17
352 0.17
353 0.16
354 0.16
355 0.13
356 0.11
357 0.1
358 0.08
359 0.07
360 0.06
361 0.05
362 0.05
363 0.04
364 0.04
365 0.05
366 0.06
367 0.07
368 0.08
369 0.09
370 0.13
371 0.13
372 0.13
373 0.13
374 0.11
375 0.12
376 0.13
377 0.11
378 0.11
379 0.12
380 0.14
381 0.15
382 0.16
383 0.15
384 0.14
385 0.14
386 0.13
387 0.16
388 0.16
389 0.16
390 0.15
391 0.17
392 0.19
393 0.19
394 0.18
395 0.18
396 0.2
397 0.25
398 0.34
399 0.42
400 0.5
401 0.61
402 0.71
403 0.8
404 0.87
405 0.91
406 0.94
407 0.96
408 0.96
409 0.96
410 0.96
411 0.95
412 0.94
413 0.94
414 0.91
415 0.88
416 0.8
417 0.73
418 0.66
419 0.6
420 0.6
421 0.54
422 0.47
423 0.45
424 0.44
425 0.45
426 0.46
427 0.48
428 0.45
429 0.51
430 0.58
431 0.58
432 0.59
433 0.54
434 0.5
435 0.46
436 0.4
437 0.35
438 0.27
439 0.2
440 0.19
441 0.18
442 0.17
443 0.16
444 0.17
445 0.13
446 0.14
447 0.14
448 0.12
449 0.11
450 0.11
451 0.09
452 0.11
453 0.12
454 0.14
455 0.15
456 0.19
457 0.23
458 0.27
459 0.33
460 0.35
461 0.39
462 0.41
463 0.48
464 0.48
465 0.5
466 0.46
467 0.44
468 0.44
469 0.41
470 0.37
471 0.28
472 0.27
473 0.21
474 0.2
475 0.16
476 0.11
477 0.09
478 0.08
479 0.09
480 0.08
481 0.08
482 0.07
483 0.08
484 0.1
485 0.1
486 0.1
487 0.1
488 0.11
489 0.12
490 0.12
491 0.12
492 0.1
493 0.09
494 0.09
495 0.09
496 0.07