FuNGI

R1GA36

Protein Details

Accession

R1GA36

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
121-148	EAASEKKQGKEKKEKKEKIPPKPLQEAP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
126-143	KKQGKEKKEKKEKIPPKP

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 11.5, cyto 7.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006607 DM15 IPR045180 La_dom_prot IPR006630 La_HTH IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	npa:UCRNP2_4833 -
Pfam	View protein in Pfam PF05383 La
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA
CDD	cd07323 LAM

Amino Acid Sequences

MSTTATPATQSKAPSGATTPALTAEPTGINWADDGEAPSHVLENGAEAAAKMDEAVANGVQKHAVSAHQPGESGISSPSVAASSTTTKEDDASSIPNASSESTWDNKSQASNAERSNDQAEAASEKKQGKEKKEKKEKIPPKPLQEAPIPHVNIWKQRAEANAAKAKANPTAPAVKPVTSAAKPSTQAPATKASDSTKTSAAKKGKDGADDNDGGKAVGGRSRDEDQSGRRAQGDAPRARRGPQNASLQHPPPVKDQESWPTPDVVQGEDRRKAQEKTEKSDKDRPVAAPKGKNEWVSLPYTPTVVFNTPMPNTGARRGGRGGGRGGAQVGGRPNPGTTNGVSSAEKDSASTAGSGRERGENRGRGSMRGRNGNHGYQNGHHGSFANGHASFSLPRSPPSFEQHAPFFGQGTQQQQRGYRGNRSQSLQTDSMYGRPHPGYANGQALPPLQTYMNGVYDYSMQPMSAVPYPPYVADPWHLLRTVSMQLEYYFSVDNLCKDMFMRKHMDSQGFVFLDFIAGFNRVKALTTDISFLKYVCTQSSIIDYKSGSDGKDRLRRREGWEQWVLTTSERDPSAQNDGPDELHQPSVAPPSPFDPRYIMQYPGSPVDMPTSPSHGGAFQPLNGIAQGVSPVNGGPAGSDLPNGGHYPEGGASQFSSMNVGAVPAFAPNPSPNGINPEADSFSDAQSKGLTVIVRKREQAAEKPAFHSEASRTFSDGSIDSRSIADELHKVDAKQTGPQTNGHGPVEANEGRRSDVLTRSKSPSSQSSNSAMRLFWVKDQESPVQSESLPADANVVLYTELYKSALKQRDAVPVGNCPYDLVVLYQFWSHFLIRNFNTGMYDEFRRLAFEDFAQRSSDMGMKCLLKYYGEALSSQSDIRQRVARHYVDLVMTEGPDHDRPAFTQLKTAWRDGSLNEGNRLTISSFVDSELQASLEQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.28
3	0.28
4	0.28
5	0.27
6	0.24
7	0.22
8	0.21
9	0.19
10	0.17
11	0.15
12	0.13
13	0.12
14	0.15
15	0.14
16	0.13
17	0.13
18	0.13
19	0.12
20	0.12
21	0.14
22	0.11
23	0.12
24	0.12
25	0.13
26	0.13
27	0.12
28	0.11
29	0.09
30	0.09
31	0.1
32	0.09
33	0.09
34	0.08
35	0.09
36	0.09
37	0.09
38	0.07
39	0.06
40	0.07
41	0.07
42	0.1
43	0.09
44	0.11
45	0.12
46	0.13
47	0.13
48	0.12
49	0.13
50	0.12
51	0.13
52	0.14
53	0.2
54	0.23
55	0.23
56	0.24
57	0.23
58	0.25
59	0.23
60	0.21
61	0.15
62	0.13
63	0.12
64	0.12
65	0.12
66	0.09
67	0.09
68	0.08
69	0.11
70	0.14
71	0.16
72	0.18
73	0.19
74	0.19
75	0.2
76	0.2
77	0.19
78	0.17
79	0.18
80	0.18
81	0.18
82	0.18
83	0.17
84	0.17
85	0.16
86	0.14
87	0.14
88	0.17
89	0.19
90	0.22
91	0.23
92	0.24
93	0.25
94	0.27
95	0.26
96	0.29
97	0.3
98	0.33
99	0.34
100	0.37
101	0.35
102	0.36
103	0.36
104	0.29
105	0.25
106	0.2
107	0.18
108	0.19
109	0.2
110	0.2
111	0.23
112	0.26
113	0.3
114	0.38
115	0.44
116	0.49
117	0.59
118	0.66
119	0.71
120	0.79
121	0.84
122	0.86
123	0.9
124	0.9
125	0.9
126	0.92
127	0.89
128	0.86
129	0.85
130	0.79
131	0.72
132	0.69
133	0.62
134	0.56
135	0.56
136	0.49
137	0.4
138	0.43
139	0.42
140	0.43
141	0.42
142	0.4
143	0.33
144	0.35
145	0.37
146	0.38
147	0.39
148	0.4
149	0.42
150	0.4
151	0.4
152	0.4
153	0.39
154	0.37
155	0.33
156	0.27
157	0.25
158	0.31
159	0.3
160	0.35
161	0.35
162	0.31
163	0.31
164	0.32
165	0.34
166	0.26
167	0.29
168	0.25
169	0.28
170	0.28
171	0.29
172	0.33
173	0.29
174	0.31
175	0.3
176	0.35
177	0.33
178	0.34
179	0.34
180	0.3
181	0.33
182	0.34
183	0.34
184	0.31
185	0.32
186	0.34
187	0.4
188	0.44
189	0.42
190	0.44
191	0.49
192	0.46
193	0.48
194	0.48
195	0.43
196	0.43
197	0.41
198	0.37
199	0.3
200	0.27
201	0.21
202	0.18
203	0.15
204	0.1
205	0.11
206	0.11
207	0.11
208	0.15
209	0.19
210	0.2
211	0.22
212	0.25
213	0.27
214	0.34
215	0.35
216	0.33
217	0.31
218	0.31
219	0.31
220	0.34
221	0.4
222	0.39
223	0.42
224	0.47
225	0.47
226	0.49
227	0.52
228	0.5
229	0.48
230	0.48
231	0.52
232	0.49
233	0.53
234	0.56
235	0.52
236	0.53
237	0.49
238	0.43
239	0.39
240	0.42
241	0.39
242	0.35
243	0.38
244	0.39
245	0.4
246	0.42
247	0.37
248	0.32
249	0.3
250	0.3
251	0.27
252	0.21
253	0.23
254	0.25
255	0.29
256	0.32
257	0.33
258	0.35
259	0.39
260	0.39
261	0.41
262	0.45
263	0.45
264	0.49
265	0.59
266	0.6
267	0.63
268	0.71
269	0.66
270	0.61
271	0.6
272	0.55
273	0.53
274	0.55
275	0.55
276	0.51
277	0.5
278	0.53
279	0.52
280	0.5
281	0.43
282	0.38
283	0.33
284	0.3
285	0.28
286	0.24
287	0.2
288	0.2
289	0.18
290	0.16
291	0.16
292	0.14
293	0.14
294	0.13
295	0.17
296	0.16
297	0.18
298	0.18
299	0.18
300	0.19
301	0.22
302	0.28
303	0.24
304	0.26
305	0.26
306	0.29
307	0.28
308	0.28
309	0.26
310	0.21
311	0.21
312	0.19
313	0.18
314	0.15
315	0.12
316	0.12
317	0.13
318	0.12
319	0.12
320	0.12
321	0.12
322	0.12
323	0.14
324	0.14
325	0.12
326	0.14
327	0.15
328	0.17
329	0.17
330	0.18
331	0.18
332	0.17
333	0.16
334	0.13
335	0.12
336	0.1
337	0.11
338	0.1
339	0.08
340	0.11
341	0.12
342	0.13
343	0.13
344	0.18
345	0.19
346	0.24
347	0.31
348	0.33
349	0.34
350	0.41
351	0.4
352	0.38
353	0.42
354	0.42
355	0.4
356	0.43
357	0.42
358	0.42
359	0.45
360	0.45
361	0.43
362	0.39
363	0.37
364	0.29
365	0.34
366	0.28
367	0.25
368	0.21
369	0.18
370	0.17
371	0.18
372	0.17
373	0.14
374	0.12
375	0.12
376	0.12
377	0.12
378	0.12
379	0.11
380	0.16
381	0.13
382	0.14
383	0.17
384	0.2
385	0.22
386	0.26
387	0.3
388	0.27
389	0.29
390	0.29
391	0.28
392	0.26
393	0.23
394	0.19
395	0.14
396	0.14
397	0.13
398	0.19
399	0.2
400	0.22
401	0.24
402	0.25
403	0.3
404	0.34
405	0.35
406	0.37
407	0.39
408	0.42
409	0.44
410	0.44
411	0.43
412	0.39
413	0.41
414	0.34
415	0.28
416	0.26
417	0.23
418	0.24
419	0.21
420	0.19
421	0.16
422	0.15
423	0.16
424	0.14
425	0.16
426	0.16
427	0.17
428	0.2
429	0.17
430	0.17
431	0.17
432	0.17
433	0.16
434	0.12
435	0.11
436	0.07
437	0.07
438	0.08
439	0.09
440	0.1
441	0.09
442	0.08
443	0.08
444	0.1
445	0.1
446	0.1
447	0.08
448	0.07
449	0.07
450	0.07
451	0.09
452	0.09
453	0.09
454	0.09
455	0.09
456	0.1
457	0.1
458	0.11
459	0.09
460	0.08
461	0.08
462	0.11
463	0.12
464	0.13
465	0.13
466	0.12
467	0.12
468	0.13
469	0.15
470	0.13
471	0.11
472	0.1
473	0.1
474	0.12
475	0.12
476	0.1
477	0.07
478	0.07
479	0.08
480	0.08
481	0.08
482	0.09
483	0.09
484	0.08
485	0.08
486	0.14
487	0.14
488	0.18
489	0.23
490	0.22
491	0.28
492	0.31
493	0.32
494	0.27
495	0.27
496	0.27
497	0.22
498	0.21
499	0.16
500	0.12
501	0.11
502	0.1
503	0.09
504	0.05
505	0.06
506	0.06
507	0.06
508	0.07
509	0.06
510	0.07
511	0.07
512	0.1
513	0.1
514	0.11
515	0.13
516	0.13
517	0.14
518	0.14
519	0.14
520	0.12
521	0.12
522	0.12
523	0.1
524	0.12
525	0.11
526	0.12
527	0.17
528	0.17
529	0.16
530	0.17
531	0.16
532	0.15
533	0.17
534	0.17
535	0.13
536	0.14
537	0.17
538	0.23
539	0.32
540	0.35
541	0.39
542	0.44
543	0.48
544	0.52
545	0.59
546	0.57
547	0.56
548	0.57
549	0.51
550	0.45
551	0.43
552	0.37
553	0.27
554	0.23
555	0.16
556	0.14
557	0.14
558	0.14
559	0.13
560	0.15
561	0.21
562	0.22
563	0.21
564	0.19
565	0.2
566	0.2
567	0.2
568	0.2
569	0.14
570	0.12
571	0.11
572	0.1
573	0.11
574	0.15
575	0.16
576	0.14
577	0.14
578	0.16
579	0.22
580	0.22
581	0.23
582	0.21
583	0.2
584	0.26
585	0.28
586	0.27
587	0.23
588	0.25
589	0.25
590	0.23
591	0.23
592	0.16
593	0.14
594	0.15
595	0.15
596	0.15
597	0.14
598	0.17
599	0.17
600	0.17
601	0.17
602	0.15
603	0.15
604	0.16
605	0.16
606	0.12
607	0.12
608	0.12
609	0.12
610	0.11
611	0.11
612	0.06
613	0.06
614	0.07
615	0.05
616	0.06
617	0.05
618	0.05
619	0.05
620	0.05
621	0.05
622	0.04
623	0.05
624	0.06
625	0.06
626	0.06
627	0.06
628	0.07
629	0.08
630	0.09
631	0.08
632	0.07
633	0.07
634	0.08
635	0.08
636	0.08
637	0.07
638	0.07
639	0.07
640	0.08
641	0.09
642	0.08
643	0.09
644	0.08
645	0.08
646	0.07
647	0.07
648	0.06
649	0.06
650	0.06
651	0.05
652	0.05
653	0.05
654	0.07
655	0.07
656	0.1
657	0.11
658	0.12
659	0.12
660	0.18
661	0.2
662	0.19
663	0.2
664	0.2
665	0.2
666	0.19
667	0.2
668	0.14
669	0.14
670	0.18
671	0.17
672	0.15
673	0.14
674	0.14
675	0.12
676	0.14
677	0.14
678	0.13
679	0.2
680	0.28
681	0.3
682	0.31
683	0.34
684	0.37
685	0.41
686	0.45
687	0.48
688	0.48
689	0.47
690	0.49
691	0.48
692	0.43
693	0.38
694	0.33
695	0.27
696	0.26
697	0.28
698	0.26
699	0.25
700	0.24
701	0.25
702	0.24
703	0.21
704	0.17
705	0.17
706	0.17
707	0.16
708	0.15
709	0.15
710	0.14
711	0.13
712	0.12
713	0.12
714	0.14
715	0.18
716	0.19
717	0.19
718	0.21
719	0.25
720	0.24
721	0.27
722	0.31
723	0.31
724	0.31
725	0.33
726	0.36
727	0.37
728	0.4
729	0.35
730	0.3
731	0.25
732	0.25
733	0.29
734	0.26
735	0.24
736	0.23
737	0.23
738	0.23
739	0.24
740	0.24
741	0.21
742	0.27
743	0.32
744	0.35
745	0.39
746	0.43
747	0.46
748	0.46
749	0.47
750	0.47
751	0.47
752	0.45
753	0.45
754	0.46
755	0.47
756	0.48
757	0.45
758	0.36
759	0.3
760	0.31
761	0.28
762	0.26
763	0.28
764	0.26
765	0.29
766	0.34
767	0.38
768	0.35
769	0.37
770	0.34
771	0.29
772	0.27
773	0.26
774	0.22
775	0.18
776	0.16
777	0.13
778	0.13
779	0.12
780	0.12
781	0.09
782	0.09
783	0.07
784	0.07
785	0.08
786	0.07
787	0.08
788	0.09
789	0.09
790	0.12
791	0.21
792	0.28
793	0.29
794	0.33
795	0.37
796	0.45
797	0.48
798	0.49
799	0.42
800	0.41
801	0.43
802	0.39
803	0.35
804	0.25
805	0.23
806	0.19
807	0.18
808	0.13
809	0.11
810	0.11
811	0.12
812	0.13
813	0.12
814	0.13
815	0.15
816	0.15
817	0.18
818	0.2
819	0.28
820	0.28
821	0.33
822	0.33
823	0.31
824	0.31
825	0.27
826	0.28
827	0.23
828	0.25
829	0.21
830	0.22
831	0.21
832	0.22
833	0.22
834	0.22
835	0.2
836	0.2
837	0.28
838	0.29
839	0.3
840	0.3
841	0.29
842	0.26
843	0.26
844	0.28
845	0.19
846	0.18
847	0.21
848	0.21
849	0.22
850	0.25
851	0.24
852	0.19
853	0.21
854	0.22
855	0.22
856	0.21
857	0.21
858	0.2
859	0.21
860	0.22
861	0.21
862	0.21
863	0.22
864	0.23
865	0.27
866	0.3
867	0.3
868	0.37
869	0.45
870	0.43
871	0.42
872	0.43
873	0.42
874	0.37
875	0.36
876	0.29
877	0.22
878	0.2
879	0.16
880	0.15
881	0.16
882	0.16
883	0.18
884	0.17
885	0.18
886	0.19
887	0.27
888	0.32
889	0.28
890	0.34
891	0.35
892	0.43
893	0.45
894	0.47
895	0.42
896	0.39
897	0.4
898	0.34
899	0.39
900	0.38
901	0.37
902	0.39
903	0.37
904	0.35
905	0.33
906	0.34
907	0.25
908	0.21
909	0.2
910	0.18
911	0.18
912	0.19
913	0.21
914	0.19
915	0.2
916	0.17

R1GA36

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer