FuNGI

R1GED7

Protein Details

Accession

R1GED7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
140-169	REPNCPKPAAKNGKKTQQKKEKPYGWDKPH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
153-154	KK

Subcellular Location(s)

cyto 16, nucl 6, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR018606 Arb1 IPR045180 La_dom_prot IPR006630 La_HTH IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0033167 C:ARC complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
KEGG	npa:UCRNP2_6666 -
Pfam	View protein in Pfam PF09692 Arb1 PF05383 La
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA

Amino Acid Sequences

MSEPPARQLAPDQSEASQAAAAEGLPEIWGPPSTAQEHPKGDEIRRQVEFYFSDQNLPTDRHLLEKCQGRLNVPVSIKSICGFKKMRQYRPFTQVVQSLKQSAFLDVVEGNRIKRKVPFIGKTVLDEDDNDSDANVESDREPNCPKPAAKNGKKTQQKKEKPYGWDKPHGFEEFFADAPVTPAEFKEEGSMYDPGISFRLRMEVAIQRYKSRRTMHQHFLNVFSKFMKYGGVDQTQRQFTGGIKDAELEERDAQDIALMMASHTIDPDKDDEDKWPVDFEAVAKGFLSSSWPTLVFYDIADIRLASTVLKNFYNYLLYHNVCPEHNNGIYAARRVCELTEIEFPKVTATASKLPGDFNVACSTLFDGFYKDKYTRIGDWDELESEEQRGRFSTHTKEKSGIILKAAIGAHGTEEHMEALETGFSTISCTGTADGIGLEVTGVEMPSAEVLEIYATINTQMKGRFALEPLGKLYCRPWDIPDFGTYDLPAWRLRELEKEKADKRYEFWVEANILESCFVGMKMQACVRTLSLGIMCLDQIQEVYCSFYSYLPNELMWRWKEPNLAVNTTEEEPEQEAGDDDDSDAE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.36
3	0.31
4	0.22
5	0.17
6	0.14
7	0.12
8	0.11
9	0.08
10	0.07
11	0.06
12	0.05
13	0.06
14	0.06
15	0.07
16	0.08
17	0.09
18	0.1
19	0.15
20	0.19
21	0.25
22	0.29
23	0.35
24	0.38
25	0.39
26	0.45
27	0.46
28	0.46
29	0.48
30	0.49
31	0.5
32	0.48
33	0.48
34	0.41
35	0.41
36	0.39
37	0.36
38	0.38
39	0.31
40	0.34
41	0.32
42	0.34
43	0.32
44	0.33
45	0.3
46	0.27
47	0.27
48	0.29
49	0.3
50	0.32
51	0.36
52	0.42
53	0.44
54	0.46
55	0.47
56	0.41
57	0.47
58	0.45
59	0.46
60	0.39
61	0.38
62	0.33
63	0.33
64	0.31
65	0.25
66	0.29
67	0.22
68	0.28
69	0.29
70	0.32
71	0.42
72	0.51
73	0.6
74	0.63
75	0.71
76	0.71
77	0.75
78	0.76
79	0.67
80	0.63
81	0.59
82	0.56
83	0.52
84	0.46
85	0.42
86	0.36
87	0.38
88	0.33
89	0.28
90	0.23
91	0.18
92	0.18
93	0.15
94	0.15
95	0.16
96	0.17
97	0.17
98	0.23
99	0.24
100	0.24
101	0.28
102	0.33
103	0.37
104	0.46
105	0.49
106	0.47
107	0.53
108	0.52
109	0.5
110	0.47
111	0.39
112	0.29
113	0.25
114	0.24
115	0.19
116	0.19
117	0.16
118	0.13
119	0.12
120	0.12
121	0.11
122	0.08
123	0.08
124	0.08
125	0.12
126	0.14
127	0.17
128	0.21
129	0.24
130	0.28
131	0.31
132	0.32
133	0.35
134	0.45
135	0.53
136	0.58
137	0.64
138	0.68
139	0.73
140	0.81
141	0.82
142	0.82
143	0.82
144	0.84
145	0.83
146	0.86
147	0.84
148	0.82
149	0.84
150	0.83
151	0.79
152	0.79
153	0.71
154	0.65
155	0.62
156	0.56
157	0.46
158	0.36
159	0.34
160	0.26
161	0.24
162	0.2
163	0.15
164	0.12
165	0.13
166	0.13
167	0.08
168	0.06
169	0.06
170	0.1
171	0.1
172	0.11
173	0.12
174	0.12
175	0.13
176	0.16
177	0.16
178	0.12
179	0.14
180	0.14
181	0.12
182	0.13
183	0.12
184	0.1
185	0.09
186	0.12
187	0.1
188	0.1
189	0.13
190	0.17
191	0.22
192	0.28
193	0.28
194	0.31
195	0.35
196	0.39
197	0.42
198	0.41
199	0.45
200	0.48
201	0.56
202	0.6
203	0.64
204	0.66
205	0.6
206	0.62
207	0.58
208	0.49
209	0.41
210	0.32
211	0.25
212	0.2
213	0.18
214	0.14
215	0.1
216	0.14
217	0.18
218	0.23
219	0.23
220	0.25
221	0.31
222	0.3
223	0.29
224	0.25
225	0.21
226	0.17
227	0.21
228	0.22
229	0.17
230	0.16
231	0.17
232	0.17
233	0.18
234	0.17
235	0.13
236	0.1
237	0.1
238	0.1
239	0.1
240	0.09
241	0.08
242	0.07
243	0.05
244	0.05
245	0.04
246	0.03
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.05
252	0.04
253	0.05
254	0.07
255	0.08
256	0.09
257	0.1
258	0.11
259	0.15
260	0.15
261	0.15
262	0.14
263	0.12
264	0.11
265	0.11
266	0.09
267	0.11
268	0.11
269	0.1
270	0.1
271	0.1
272	0.1
273	0.09
274	0.12
275	0.07
276	0.08
277	0.08
278	0.09
279	0.09
280	0.09
281	0.1
282	0.08
283	0.07
284	0.08
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.07
289	0.06
290	0.06
291	0.07
292	0.05
293	0.06
294	0.07
295	0.09
296	0.09
297	0.09
298	0.1
299	0.11
300	0.12
301	0.12
302	0.14
303	0.17
304	0.17
305	0.18
306	0.18
307	0.19
308	0.17
309	0.18
310	0.17
311	0.16
312	0.15
313	0.15
314	0.14
315	0.16
316	0.17
317	0.18
318	0.16
319	0.12
320	0.12
321	0.12
322	0.12
323	0.11
324	0.11
325	0.11
326	0.18
327	0.19
328	0.19
329	0.19
330	0.19
331	0.17
332	0.17
333	0.14
334	0.08
335	0.1
336	0.14
337	0.16
338	0.18
339	0.18
340	0.18
341	0.19
342	0.23
343	0.19
344	0.16
345	0.16
346	0.15
347	0.14
348	0.14
349	0.15
350	0.11
351	0.11
352	0.1
353	0.11
354	0.11
355	0.13
356	0.16
357	0.15
358	0.15
359	0.18
360	0.21
361	0.2
362	0.23
363	0.25
364	0.24
365	0.25
366	0.25
367	0.22
368	0.2
369	0.19
370	0.15
371	0.13
372	0.14
373	0.12
374	0.11
375	0.11
376	0.12
377	0.14
378	0.17
379	0.25
380	0.33
381	0.38
382	0.39
383	0.41
384	0.4
385	0.45
386	0.46
387	0.38
388	0.29
389	0.26
390	0.23
391	0.25
392	0.24
393	0.17
394	0.12
395	0.11
396	0.1
397	0.09
398	0.09
399	0.06
400	0.06
401	0.06
402	0.06
403	0.06
404	0.06
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.04
411	0.06
412	0.07
413	0.07
414	0.07
415	0.07
416	0.08
417	0.08
418	0.08
419	0.07
420	0.06
421	0.05
422	0.05
423	0.04
424	0.03
425	0.03
426	0.03
427	0.03
428	0.03
429	0.03
430	0.03
431	0.03
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.03
436	0.03
437	0.04
438	0.04
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.06
443	0.09
444	0.09
445	0.12
446	0.13
447	0.13
448	0.15
449	0.18
450	0.18
451	0.17
452	0.24
453	0.23
454	0.24
455	0.25
456	0.27
457	0.25
458	0.24
459	0.25
460	0.24
461	0.26
462	0.26
463	0.28
464	0.31
465	0.34
466	0.35
467	0.35
468	0.31
469	0.29
470	0.28
471	0.23
472	0.19
473	0.17
474	0.17
475	0.17
476	0.16
477	0.16
478	0.17
479	0.18
480	0.27
481	0.32
482	0.39
483	0.44
484	0.51
485	0.55
486	0.62
487	0.67
488	0.58
489	0.55
490	0.56
491	0.53
492	0.47
493	0.43
494	0.39
495	0.35
496	0.33
497	0.33
498	0.23
499	0.19
500	0.16
501	0.15
502	0.1
503	0.09
504	0.09
505	0.07
506	0.09
507	0.1
508	0.14
509	0.18
510	0.2
511	0.2
512	0.22
513	0.22
514	0.22
515	0.2
516	0.19
517	0.16
518	0.15
519	0.15
520	0.14
521	0.13
522	0.12
523	0.11
524	0.09
525	0.09
526	0.08
527	0.09
528	0.09
529	0.13
530	0.12
531	0.14
532	0.14
533	0.16
534	0.2
535	0.2
536	0.24
537	0.21
538	0.22
539	0.23
540	0.24
541	0.3
542	0.29
543	0.34
544	0.34
545	0.36
546	0.41
547	0.41
548	0.47
549	0.45
550	0.45
551	0.4
552	0.39
553	0.39
554	0.35
555	0.34
556	0.25
557	0.21
558	0.2
559	0.2
560	0.17
561	0.14
562	0.13
563	0.13
564	0.14
565	0.12

R1GED7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer