Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1EMJ0

Protein Details
Accession R1EMJ0    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
332-352EIKAVVPKDNKKNNKGGKHGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
341-357NKKNNKGGKHGGHGHGG
367-368KK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034215  RBM42_RRM  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG npa:UCRNP2_4250  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12383  RRM_RBM42  
Amino Acid Sequences MSNPPPPGYKSNSSTPQPHPSLPARPPPPAQPAAFSKFSNTSAANGKSQGAGGYGAFTGFKPRSVASNTQAWQSQPPTVSAGPQPSSAYPAAQSSYAGGGYQQPAYQQQPSYYQQPSADPYSQATPPQIRNPFPAPGQNQGGSYGAGNSPYDPEYEAQIAQWQSAYANRDDTAAKGAKGRADMPANANNTPLGEKAGGQAALSNKELQSAVSSDTGVAAVVSGPDGKQKTVVRQGGGQTWSDTSLLEWDPAHFRLFVGNLAGEVTDESLYKAFSRFTSIQKARVVRDKRTTKSKGYGFVSFSNGDDYFQAAKEMQGKYIGSHPVLVKRSTTEIKAVVPKDNKKNNKGGKHGGHGHGGHANTGAGVQKKQSKTKGGLKILG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.63
3 0.65
4 0.62
5 0.59
6 0.57
7 0.55
8 0.58
9 0.57
10 0.6
11 0.55
12 0.56
13 0.58
14 0.58
15 0.6
16 0.57
17 0.51
18 0.47
19 0.5
20 0.5
21 0.5
22 0.43
23 0.4
24 0.37
25 0.38
26 0.36
27 0.3
28 0.27
29 0.31
30 0.34
31 0.32
32 0.3
33 0.29
34 0.25
35 0.25
36 0.22
37 0.15
38 0.13
39 0.1
40 0.1
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.15
46 0.14
47 0.16
48 0.17
49 0.17
50 0.22
51 0.27
52 0.33
53 0.3
54 0.38
55 0.37
56 0.38
57 0.39
58 0.35
59 0.35
60 0.32
61 0.32
62 0.24
63 0.25
64 0.26
65 0.24
66 0.26
67 0.24
68 0.27
69 0.24
70 0.25
71 0.25
72 0.21
73 0.25
74 0.23
75 0.2
76 0.15
77 0.16
78 0.15
79 0.14
80 0.14
81 0.1
82 0.11
83 0.1
84 0.09
85 0.08
86 0.1
87 0.11
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.15
92 0.18
93 0.21
94 0.19
95 0.19
96 0.24
97 0.27
98 0.32
99 0.3
100 0.3
101 0.27
102 0.29
103 0.31
104 0.29
105 0.28
106 0.23
107 0.23
108 0.24
109 0.24
110 0.23
111 0.23
112 0.23
113 0.24
114 0.31
115 0.35
116 0.33
117 0.37
118 0.39
119 0.38
120 0.35
121 0.38
122 0.33
123 0.33
124 0.34
125 0.31
126 0.28
127 0.26
128 0.25
129 0.18
130 0.16
131 0.12
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.11
143 0.11
144 0.09
145 0.12
146 0.12
147 0.11
148 0.11
149 0.09
150 0.08
151 0.11
152 0.13
153 0.1
154 0.11
155 0.11
156 0.13
157 0.13
158 0.13
159 0.15
160 0.14
161 0.14
162 0.15
163 0.16
164 0.16
165 0.17
166 0.17
167 0.16
168 0.16
169 0.17
170 0.18
171 0.22
172 0.23
173 0.22
174 0.21
175 0.18
176 0.16
177 0.16
178 0.12
179 0.09
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.09
184 0.08
185 0.07
186 0.09
187 0.09
188 0.11
189 0.12
190 0.12
191 0.1
192 0.12
193 0.12
194 0.1
195 0.09
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.06
204 0.05
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.14
215 0.15
216 0.21
217 0.29
218 0.32
219 0.29
220 0.32
221 0.34
222 0.33
223 0.33
224 0.28
225 0.21
226 0.18
227 0.18
228 0.15
229 0.13
230 0.08
231 0.1
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.13
237 0.14
238 0.15
239 0.12
240 0.11
241 0.12
242 0.13
243 0.12
244 0.1
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.05
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.09
260 0.09
261 0.16
262 0.18
263 0.22
264 0.33
265 0.34
266 0.39
267 0.44
268 0.48
269 0.45
270 0.51
271 0.52
272 0.49
273 0.57
274 0.6
275 0.61
276 0.67
277 0.69
278 0.66
279 0.69
280 0.66
281 0.64
282 0.6
283 0.58
284 0.52
285 0.48
286 0.46
287 0.38
288 0.33
289 0.29
290 0.25
291 0.21
292 0.17
293 0.18
294 0.15
295 0.14
296 0.15
297 0.11
298 0.13
299 0.19
300 0.2
301 0.18
302 0.2
303 0.2
304 0.2
305 0.26
306 0.28
307 0.22
308 0.25
309 0.27
310 0.31
311 0.34
312 0.34
313 0.29
314 0.28
315 0.34
316 0.34
317 0.33
318 0.3
319 0.29
320 0.33
321 0.39
322 0.39
323 0.41
324 0.46
325 0.53
326 0.59
327 0.67
328 0.71
329 0.71
330 0.79
331 0.8
332 0.81
333 0.8
334 0.8
335 0.77
336 0.77
337 0.78
338 0.71
339 0.69
340 0.6
341 0.55
342 0.49
343 0.42
344 0.34
345 0.26
346 0.23
347 0.15
348 0.16
349 0.17
350 0.15
351 0.16
352 0.21
353 0.29
354 0.36
355 0.45
356 0.51
357 0.55
358 0.6
359 0.69
360 0.73