Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1GMZ7

Protein Details
Accession R1GMZ7    Localization Confidence Low Confidence Score 6.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
394-413ITVVPRRKWLKGRERRVSASHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 10, cyto_mito 9.333, cyto_nucl 8.333, mito 7.5, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010977  Aromatic_deC  
IPR002129  PyrdxlP-dep_de-COase  
IPR015424  PyrdxlP-dep_Trfase  
IPR015421  PyrdxlP-dep_Trfase_major  
IPR015422  PyrdxlP-dep_Trfase_small  
Gene Ontology GO:0016831  F:carboxy-lyase activity  
GO:0030170  F:pyridoxal phosphate binding  
GO:0006520  P:amino acid metabolic process  
KEGG npa:UCRNP2_3536  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00282  Pyridoxal_deC  
Amino Acid Sequences MDSNQFREAAHAAIEEIIQYYDTIESRRVLSDVSPGYLRELIPSSAPQTPEPWSAIQPDIERVIMPGLTHWQSPNFMAFFPAHATYPGMLGELYSAAFTAPAFNWLCSPAVTELETVVLDWLAQLLGLPEVYLSKGEGGGVIQGSASEAIVTAMVAARERVLRSLSEGLEGKEKEDKIDSLRGKLVALGSEHSHSSTQKGAIIAGTKYRSVAAGRADDFAMTGKGLRRMLEDCEKDGLIPYYLTVTLGTTSTCAVDKFEEIAEVLKDYPNVWVHVDAAFDMNMHKWLLTNFDASCLFVKKRSDLTTALSITPSYLRNSFSDSGLVTDYRDWQIPLGRRFRSLKVWFVLRSYGAERLKAHIRKHIKFGELFNELARSRADLFELVSGPSFALNVITVVPRRKWLKGRERRVSASQPDPNHEAYLNDFTSDAENHALLDANEITKEVYETINTRGEIFLTSGIVGGVYIIRVVASTPRVEERHIRKAFDILVKTAEEVLNSKTGSANGTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.1
3 0.1
4 0.09
5 0.08
6 0.08
7 0.08
8 0.1
9 0.11
10 0.12
11 0.14
12 0.16
13 0.17
14 0.19
15 0.18
16 0.17
17 0.17
18 0.23
19 0.23
20 0.24
21 0.23
22 0.22
23 0.25
24 0.26
25 0.25
26 0.2
27 0.21
28 0.19
29 0.2
30 0.22
31 0.22
32 0.24
33 0.26
34 0.24
35 0.24
36 0.27
37 0.29
38 0.29
39 0.28
40 0.26
41 0.27
42 0.28
43 0.29
44 0.26
45 0.26
46 0.25
47 0.23
48 0.21
49 0.18
50 0.17
51 0.14
52 0.12
53 0.11
54 0.15
55 0.16
56 0.18
57 0.18
58 0.19
59 0.2
60 0.22
61 0.25
62 0.2
63 0.18
64 0.19
65 0.18
66 0.17
67 0.19
68 0.18
69 0.15
70 0.14
71 0.16
72 0.14
73 0.14
74 0.13
75 0.1
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.06
80 0.06
81 0.05
82 0.05
83 0.04
84 0.05
85 0.05
86 0.07
87 0.06
88 0.12
89 0.13
90 0.13
91 0.14
92 0.16
93 0.16
94 0.14
95 0.16
96 0.12
97 0.13
98 0.14
99 0.13
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.09
104 0.08
105 0.06
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.03
135 0.03
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.03
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.08
146 0.08
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.14
151 0.17
152 0.17
153 0.18
154 0.19
155 0.18
156 0.23
157 0.23
158 0.21
159 0.22
160 0.22
161 0.2
162 0.21
163 0.21
164 0.19
165 0.27
166 0.27
167 0.25
168 0.27
169 0.26
170 0.24
171 0.24
172 0.21
173 0.14
174 0.13
175 0.12
176 0.11
177 0.12
178 0.12
179 0.12
180 0.12
181 0.11
182 0.12
183 0.13
184 0.13
185 0.13
186 0.13
187 0.13
188 0.12
189 0.14
190 0.13
191 0.14
192 0.14
193 0.13
194 0.13
195 0.13
196 0.13
197 0.11
198 0.13
199 0.13
200 0.15
201 0.16
202 0.17
203 0.17
204 0.15
205 0.15
206 0.13
207 0.1
208 0.06
209 0.07
210 0.08
211 0.11
212 0.12
213 0.13
214 0.14
215 0.15
216 0.19
217 0.26
218 0.25
219 0.23
220 0.24
221 0.23
222 0.21
223 0.21
224 0.17
225 0.1
226 0.09
227 0.07
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.09
256 0.1
257 0.11
258 0.11
259 0.1
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.08
264 0.08
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.1
275 0.11
276 0.13
277 0.11
278 0.14
279 0.14
280 0.14
281 0.15
282 0.14
283 0.13
284 0.15
285 0.17
286 0.17
287 0.22
288 0.24
289 0.26
290 0.25
291 0.28
292 0.3
293 0.3
294 0.28
295 0.23
296 0.2
297 0.17
298 0.18
299 0.16
300 0.12
301 0.12
302 0.14
303 0.14
304 0.2
305 0.2
306 0.19
307 0.19
308 0.16
309 0.16
310 0.16
311 0.15
312 0.1
313 0.1
314 0.12
315 0.12
316 0.13
317 0.11
318 0.12
319 0.17
320 0.23
321 0.29
322 0.34
323 0.34
324 0.38
325 0.42
326 0.43
327 0.48
328 0.45
329 0.44
330 0.4
331 0.44
332 0.39
333 0.37
334 0.36
335 0.27
336 0.26
337 0.22
338 0.26
339 0.22
340 0.25
341 0.24
342 0.26
343 0.35
344 0.38
345 0.38
346 0.39
347 0.48
348 0.47
349 0.55
350 0.56
351 0.51
352 0.48
353 0.49
354 0.46
355 0.39
356 0.37
357 0.29
358 0.28
359 0.24
360 0.22
361 0.2
362 0.15
363 0.14
364 0.15
365 0.15
366 0.11
367 0.12
368 0.13
369 0.14
370 0.12
371 0.11
372 0.11
373 0.09
374 0.09
375 0.08
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.08
382 0.12
383 0.16
384 0.17
385 0.23
386 0.27
387 0.33
388 0.4
389 0.49
390 0.57
391 0.64
392 0.74
393 0.77
394 0.8
395 0.8
396 0.79
397 0.77
398 0.72
399 0.71
400 0.66
401 0.59
402 0.57
403 0.55
404 0.49
405 0.43
406 0.36
407 0.28
408 0.25
409 0.28
410 0.23
411 0.2
412 0.18
413 0.17
414 0.19
415 0.19
416 0.16
417 0.12
418 0.12
419 0.11
420 0.12
421 0.12
422 0.1
423 0.12
424 0.11
425 0.11
426 0.11
427 0.11
428 0.11
429 0.1
430 0.11
431 0.09
432 0.09
433 0.11
434 0.13
435 0.17
436 0.21
437 0.21
438 0.21
439 0.2
440 0.2
441 0.19
442 0.18
443 0.15
444 0.11
445 0.11
446 0.1
447 0.09
448 0.08
449 0.07
450 0.06
451 0.05
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.05
458 0.09
459 0.12
460 0.13
461 0.16
462 0.22
463 0.24
464 0.28
465 0.37
466 0.41
467 0.49
468 0.52
469 0.52
470 0.47
471 0.51
472 0.53
473 0.51
474 0.47
475 0.38
476 0.37
477 0.35
478 0.34
479 0.33
480 0.27
481 0.2
482 0.19
483 0.19
484 0.21
485 0.2
486 0.2
487 0.18
488 0.19