Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1EMD2

Protein Details
Accession R1EMD2    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
211-232EEAPVKPKKARATKKAPKAPTPHydrophilic
245-267EEPVPAPKPKKARGKKAAKGAVDBasic
299-318VEEAPKAKSAPQKRGRKAKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
137-145SKTKKRSRK
159-174PAPKKARGKKGAKAVK
187-202PAPKKARAKKATKTAK
214-229PVKPKKARATKKAPKA
250-285APKPKKARGKKAAKGAVDGEEEPKPAAKGRKAKAKA
304-318KAKSAPQKRGRKAKA
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001510  Znf_PARP  
IPR036957  Znf_PARP_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG npa:UCRNP2_4304  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00645  zf-PARP  
Amino Acid Sequences MPSGYRVEVSPNKRAGCKNSECKNAGIKIQKGELRFATMVTIQEQQSWAYKHWGCTTPKVIANVKEFIDGDLTMIDGYEDLPEDMQAKLDTAFAQGHVDDEDWKGDVEKNRPGQNGMRLTKADKKRLGIDDDEGGGSKTKKRSRKAADDEDEGEEEEAPAPKKARGKKGAKAVKNEEPADVEEDEAPAPKKARAKKATKTAKPDEENEEVEEAPVKPKKARATKKAPKAPTPEDDQDELAAEEDEEPVPAPKPKKARGKKAAKGAVDGEEEPKPAAKGRKAKAKAAPVAEENGTDEEVVEEAPKAKSAPQKRGRKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.57
3 0.58
4 0.62
5 0.64
6 0.66
7 0.73
8 0.69
9 0.67
10 0.68
11 0.61
12 0.59
13 0.57
14 0.53
15 0.48
16 0.52
17 0.51
18 0.45
19 0.47
20 0.4
21 0.38
22 0.33
23 0.29
24 0.25
25 0.24
26 0.23
27 0.2
28 0.23
29 0.18
30 0.19
31 0.2
32 0.19
33 0.22
34 0.23
35 0.22
36 0.27
37 0.29
38 0.31
39 0.37
40 0.43
41 0.41
42 0.46
43 0.48
44 0.46
45 0.47
46 0.49
47 0.47
48 0.45
49 0.46
50 0.42
51 0.38
52 0.35
53 0.32
54 0.27
55 0.24
56 0.18
57 0.14
58 0.1
59 0.1
60 0.07
61 0.06
62 0.06
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.05
67 0.04
68 0.05
69 0.05
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.08
87 0.09
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.12
93 0.16
94 0.19
95 0.25
96 0.3
97 0.34
98 0.35
99 0.37
100 0.37
101 0.4
102 0.45
103 0.4
104 0.38
105 0.34
106 0.37
107 0.43
108 0.46
109 0.46
110 0.4
111 0.41
112 0.44
113 0.46
114 0.46
115 0.39
116 0.34
117 0.28
118 0.25
119 0.23
120 0.17
121 0.13
122 0.12
123 0.11
124 0.13
125 0.19
126 0.25
127 0.32
128 0.37
129 0.47
130 0.53
131 0.63
132 0.68
133 0.71
134 0.68
135 0.64
136 0.61
137 0.52
138 0.44
139 0.34
140 0.25
141 0.15
142 0.11
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.11
149 0.17
150 0.23
151 0.31
152 0.39
153 0.45
154 0.5
155 0.59
156 0.65
157 0.64
158 0.65
159 0.62
160 0.6
161 0.59
162 0.54
163 0.44
164 0.37
165 0.33
166 0.29
167 0.23
168 0.16
169 0.11
170 0.11
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.1
176 0.12
177 0.18
178 0.24
179 0.34
180 0.42
181 0.5
182 0.56
183 0.66
184 0.73
185 0.73
186 0.76
187 0.73
188 0.73
189 0.68
190 0.64
191 0.59
192 0.52
193 0.47
194 0.4
195 0.33
196 0.24
197 0.21
198 0.2
199 0.14
200 0.15
201 0.17
202 0.17
203 0.18
204 0.23
205 0.32
206 0.41
207 0.5
208 0.54
209 0.63
210 0.71
211 0.8
212 0.84
213 0.81
214 0.78
215 0.76
216 0.72
217 0.65
218 0.63
219 0.58
220 0.52
221 0.49
222 0.42
223 0.34
224 0.28
225 0.24
226 0.17
227 0.12
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.09
236 0.14
237 0.16
238 0.21
239 0.3
240 0.38
241 0.49
242 0.58
243 0.67
244 0.73
245 0.82
246 0.83
247 0.86
248 0.85
249 0.75
250 0.69
251 0.6
252 0.53
253 0.46
254 0.39
255 0.32
256 0.25
257 0.24
258 0.21
259 0.2
260 0.17
261 0.19
262 0.26
263 0.31
264 0.39
265 0.46
266 0.56
267 0.6
268 0.67
269 0.69
270 0.71
271 0.7
272 0.65
273 0.62
274 0.54
275 0.53
276 0.46
277 0.38
278 0.31
279 0.26
280 0.21
281 0.16
282 0.14
283 0.11
284 0.1
285 0.1
286 0.08
287 0.07
288 0.1
289 0.1
290 0.11
291 0.12
292 0.17
293 0.27
294 0.35
295 0.45
296 0.53
297 0.63
298 0.72