Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R1END3

Protein Details
Accession R1END3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
235-261EAPSGPKKTKGRKGQRKGKKGKANESDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-256GPKKTKGRKGQRKGKKGK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
KEGG npa:UCRNP2_4227  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MSAEANGTSVHDVASNGEIADAGDEGSSSLSDPEESIEDRDEAALREPASPTVDENDSEAETERIDSTPRKLTRTATDVRNGSEGPAGRSPSKLAKVMTAEQDSFSQSPALPTRQRRTDSETGDVSDEEDEPLADNTHDVEPDADDSATAEGSDRKRKRSSSALSSIADDLDNDQPARKRPSPTRPFELNGDPMELDDEVEEPVAEEDEDHTSKEVEPLAEEEDNEEAAHEAVNEAPSGPKKTKGRKGQRKGKKGKANESDEQVATPLEAEEEEAPEGELEGEDTAVIEEERGRKYNALEELNKIEKQFLTFQKKRLDEQLDRLSLELDQLRQPNSTHHEYLLMLQAVDKRRDEKIRQEDVRLALKRDIIRKQFVAMRNSIHGQYAHDVAEVRMNSLTQCNQRITQLQRERRYWGTNEADFTVKFTPKRSQQVQQQTAYNLEVSILSGIAKHVGFPAAPDLSTARSPEMDQDLAAMGVSVLIAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.1
4 0.1
5 0.1
6 0.09
7 0.09
8 0.07
9 0.06
10 0.05
11 0.05
12 0.05
13 0.06
14 0.06
15 0.06
16 0.06
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.09
21 0.11
22 0.13
23 0.14
24 0.16
25 0.16
26 0.16
27 0.17
28 0.17
29 0.15
30 0.17
31 0.18
32 0.17
33 0.19
34 0.19
35 0.2
36 0.21
37 0.21
38 0.19
39 0.2
40 0.21
41 0.19
42 0.19
43 0.2
44 0.17
45 0.17
46 0.17
47 0.13
48 0.12
49 0.13
50 0.12
51 0.11
52 0.14
53 0.16
54 0.2
55 0.29
56 0.32
57 0.35
58 0.37
59 0.41
60 0.44
61 0.48
62 0.51
63 0.47
64 0.51
65 0.49
66 0.48
67 0.47
68 0.4
69 0.34
70 0.31
71 0.26
72 0.23
73 0.25
74 0.26
75 0.24
76 0.25
77 0.27
78 0.3
79 0.33
80 0.32
81 0.29
82 0.31
83 0.34
84 0.37
85 0.4
86 0.37
87 0.33
88 0.3
89 0.31
90 0.29
91 0.25
92 0.21
93 0.17
94 0.13
95 0.17
96 0.2
97 0.25
98 0.28
99 0.36
100 0.44
101 0.5
102 0.54
103 0.54
104 0.59
105 0.61
106 0.57
107 0.54
108 0.48
109 0.42
110 0.39
111 0.35
112 0.27
113 0.2
114 0.16
115 0.11
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.06
123 0.08
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.1
130 0.11
131 0.08
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.1
139 0.14
140 0.25
141 0.27
142 0.33
143 0.39
144 0.41
145 0.46
146 0.51
147 0.54
148 0.53
149 0.56
150 0.55
151 0.5
152 0.49
153 0.44
154 0.35
155 0.27
156 0.18
157 0.14
158 0.11
159 0.12
160 0.1
161 0.13
162 0.15
163 0.2
164 0.27
165 0.29
166 0.34
167 0.41
168 0.52
169 0.59
170 0.64
171 0.66
172 0.63
173 0.61
174 0.59
175 0.54
176 0.46
177 0.37
178 0.32
179 0.24
180 0.19
181 0.18
182 0.14
183 0.1
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.03
194 0.05
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.11
202 0.11
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.11
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.07
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.04
218 0.03
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.07
225 0.1
226 0.11
227 0.17
228 0.23
229 0.32
230 0.41
231 0.51
232 0.61
233 0.69
234 0.78
235 0.83
236 0.86
237 0.88
238 0.89
239 0.88
240 0.86
241 0.81
242 0.81
243 0.79
244 0.76
245 0.68
246 0.62
247 0.55
248 0.46
249 0.39
250 0.3
251 0.2
252 0.13
253 0.1
254 0.07
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.04
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.04
266 0.04
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.05
277 0.09
278 0.11
279 0.13
280 0.13
281 0.15
282 0.16
283 0.21
284 0.24
285 0.26
286 0.26
287 0.27
288 0.31
289 0.33
290 0.33
291 0.28
292 0.24
293 0.2
294 0.21
295 0.25
296 0.29
297 0.36
298 0.39
299 0.45
300 0.51
301 0.53
302 0.53
303 0.54
304 0.53
305 0.47
306 0.51
307 0.53
308 0.47
309 0.45
310 0.43
311 0.35
312 0.27
313 0.25
314 0.19
315 0.12
316 0.14
317 0.16
318 0.17
319 0.18
320 0.19
321 0.21
322 0.26
323 0.3
324 0.28
325 0.26
326 0.26
327 0.26
328 0.27
329 0.26
330 0.2
331 0.15
332 0.15
333 0.19
334 0.22
335 0.24
336 0.24
337 0.22
338 0.28
339 0.35
340 0.38
341 0.44
342 0.5
343 0.57
344 0.58
345 0.59
346 0.58
347 0.55
348 0.6
349 0.52
350 0.44
351 0.37
352 0.39
353 0.4
354 0.42
355 0.46
356 0.42
357 0.45
358 0.43
359 0.45
360 0.46
361 0.48
362 0.46
363 0.41
364 0.38
365 0.36
366 0.38
367 0.35
368 0.3
369 0.25
370 0.22
371 0.22
372 0.21
373 0.18
374 0.16
375 0.16
376 0.14
377 0.19
378 0.17
379 0.16
380 0.14
381 0.14
382 0.14
383 0.17
384 0.22
385 0.23
386 0.27
387 0.29
388 0.3
389 0.33
390 0.4
391 0.42
392 0.47
393 0.51
394 0.56
395 0.61
396 0.63
397 0.65
398 0.63
399 0.64
400 0.56
401 0.55
402 0.53
403 0.48
404 0.47
405 0.44
406 0.41
407 0.35
408 0.35
409 0.31
410 0.29
411 0.27
412 0.29
413 0.35
414 0.41
415 0.51
416 0.54
417 0.57
418 0.63
419 0.73
420 0.76
421 0.72
422 0.68
423 0.61
424 0.57
425 0.49
426 0.4
427 0.28
428 0.21
429 0.16
430 0.12
431 0.1
432 0.08
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.1
437 0.09
438 0.09
439 0.1
440 0.12
441 0.11
442 0.12
443 0.18
444 0.16
445 0.16
446 0.17
447 0.17
448 0.19
449 0.21
450 0.22
451 0.19
452 0.19
453 0.19
454 0.23
455 0.27
456 0.24
457 0.22
458 0.21
459 0.2
460 0.18
461 0.17
462 0.12
463 0.06
464 0.06